MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010816	TGTCGA	2	12	90333	90344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2002	NC_010816	GTC	2	6	90429	90434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_010816	GCGCA	2	10	90475	90484	20 %	0 %	40 %	40 %	189438933
2004	NC_010816	CCGCC	2	10	90492	90501	0 %	0 %	20 %	80 %	189438933
2005	NC_010816	AACC	2	8	90506	90513	50 %	0 %	0 %	50 %	189438933
2006	NC_010816	CG	3	6	90524	90529	0 %	0 %	50 %	50 %	189438933
2007	NC_010816	CAC	2	6	90539	90544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438933
2008	NC_010816	CTG	2	6	90555	90560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438933
2009	NC_010816	CGT	2	6	90566	90571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438933
2010	NC_010816	TTC	2	6	90576	90581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438933
2011	NC_010816	GAT	2	6	90593	90598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438933
2012	NC_010816	CCG	2	6	90604	90609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438933
2013	NC_010816	CG	3	6	90616	90621	0 %	0 %	50 %	50 %	189438933
2014	NC_010816	ATT	2	6	90681	90686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438933
2015	NC_010816	TTC	2	6	90693	90698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438933
2016	NC_010816	GGC	2	6	90780	90785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438933
2017	NC_010816	ATC	2	6	90786	90791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438933
2018	NC_010816	ATC	3	9	90798	90806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438933
2019	NC_010816	CAA	2	6	90827	90832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438933
2020	NC_010816	TGC	2	6	90868	90873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438933
2021	NC_010816	TTC	2	6	90900	90905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438933
2022	NC_010816	TCA	2	6	91030	91035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438933
2023	NC_010816	GTC	2	6	91109	91114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438933
2024	NC_010816	CCA	2	6	91126	91131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438933
2025	NC_010816	CGG	2	6	91145	91150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438933
2026	NC_010816	GGT	3	9	91184	91192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438933
2027	NC_010816	TTC	2	6	91194	91199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438933
2028	NC_010816	CAT	2	6	91217	91222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438933
2029	NC_010816	GAC	2	6	91232	91237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438933
2030	NC_010816	GCC	2	6	91259	91264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_010816	GGC	2	6	91294	91299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_010816	ATA	2	6	91335	91340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_010816	AGC	2	6	91548	91553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2034	NC_010816	GCG	2	6	91578	91583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438934
2035	NC_010816	CCGT	2	8	91587	91594	0 %	25 %	25 %	50 %	189438934
2036	NC_010816	GCC	2	6	91643	91648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438934
2037	NC_010816	GGGTGC	2	12	91672	91683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189438934
2038	NC_010816	TG	4	8	91728	91735	0 %	50 %	50 %	0 %	189438934
2039	NC_010816	CGTG	2	8	91795	91802	0 %	25 %	50 %	25 %	189438934
2040	NC_010816	GAT	2	6	91849	91854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438934
2041	NC_010816	CTGC	2	8	91879	91886	0 %	25 %	25 %	50 %	189438934
2042	NC_010816	GC	3	6	91915	91920	0 %	0 %	50 %	50 %	189438934
2043	NC_010816	TGACG	2	10	91930	91939	20 %	20 %	40 %	20 %	189438934
2044	NC_010816	CG	3	6	91938	91943	0 %	0 %	50 %	50 %	189438934
2045	NC_010816	CGA	2	6	91953	91958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2046	NC_010816	CGA	2	6	92089	92094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2047	NC_010816	CAT	2	6	92095	92100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438934
2048	NC_010816	CAC	2	6	92123	92128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438934
2049	NC_010816	CCGT	2	8	92230	92237	0 %	25 %	25 %	50 %	189438934
2050	NC_010816	CGAA	2	8	92248	92255	50 %	0 %	25 %	25 %	189438934
2051	NC_010816	CA	3	6	92264	92269	50 %	0 %	0 %	50 %	189438934
2052	NC_010816	CGC	2	6	92328	92333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438934
2053	NC_010816	TGG	2	6	92359	92364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438934
2054	NC_010816	GCA	2	6	92460	92465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2055	NC_010816	TGC	2	6	92538	92543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2056	NC_010816	CGA	2	6	92587	92592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2057	NC_010816	GCC	3	9	92622	92630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438934
2058	NC_010816	CGTG	3	12	92647	92658	0 %	25 %	50 %	25 %	189438934
2059	NC_010816	TTC	2	6	92666	92671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438934
2060	NC_010816	TGG	2	6	92745	92750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438934
2061	NC_010816	CGA	2	6	92893	92898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2062	NC_010816	CTCG	2	8	92921	92928	0 %	25 %	25 %	50 %	189438934
2063	NC_010816	CTGGAA	2	12	92978	92989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189438934
2064	NC_010816	CCGGCA	2	12	92997	93008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189438934
2065	NC_010816	CG	3	6	93091	93096	0 %	0 %	50 %	50 %	189438934
2066	NC_010816	CCG	2	6	93097	93102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438934
2067	NC_010816	ACG	2	6	93133	93138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2068	NC_010816	TTGA	2	8	93158	93165	25 %	50 %	25 %	0 %	189438934
2069	NC_010816	GAG	2	6	93207	93212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438934
2070	NC_010816	GCT	2	6	93226	93231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2071	NC_010816	GTT	2	6	93256	93261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438934
2072	NC_010816	CTG	2	6	93281	93286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438934
2073	NC_010816	TGGC	2	8	93291	93298	0 %	25 %	50 %	25 %	189438934
2074	NC_010816	CGCGC	2	10	93351	93360	0 %	0 %	40 %	60 %	189438934
2075	NC_010816	GCC	2	6	93368	93373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438934
2076	NC_010816	TGTGG	2	10	93454	93463	0 %	40 %	60 %	0 %	189438934
2077	NC_010816	G	6	6	93499	93504	0 %	0 %	100 %	0 %	189438934
2078	NC_010816	CTG	2	6	93522	93527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2079	NC_010816	TGC	2	6	93587	93592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2080	NC_010816	T	6	6	93640	93645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_010816	TG	3	6	93662	93667	0 %	50 %	50 %	0 %	189438935
2082	NC_010816	GAA	2	6	93693	93698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438935
2083	NC_010816	CGA	2	6	93744	93749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438935
2084	NC_010816	ACA	2	6	93770	93775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438935
2085	NC_010816	GCCA	2	8	93802	93809	25 %	0 %	25 %	50 %	189438935
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2087	NC_010816	CAC	2	6	93939	93944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438935
2088	NC_010816	TCAA	2	8	93983	93990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2089	NC_010816	AGC	2	6	93993	93998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_010816	ACC	2	6	94044	94049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2091	NC_010816	CCA	2	6	94053	94058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2092	NC_010816	AGC	2	6	94062	94067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_010816	GAT	2	6	94095	94100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438936
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2095	NC_010816	CCA	2	6	94157	94162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438936
2096	NC_010816	GTG	2	6	94195	94200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438936
2097	NC_010816	CGATA	2	10	94207	94216	40 %	20 %	20 %	20 %	189438936
2098	NC_010816	CAC	2	6	94248	94253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438936
2099	NC_010816	GT	4	8	94274	94281	0 %	50 %	50 %	0 %	189438936
2100	NC_010816	CGA	2	6	94332	94337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438936
2101	NC_010816	GTC	2	6	94447	94452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438936
2102	NC_010816	TGA	2	6	94611	94616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438936
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2106	NC_010816	CCA	2	6	94862	94867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438936
2107	NC_010816	GCC	2	6	94912	94917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438936
2108	NC_010816	TTC	2	6	94981	94986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438936
2109	NC_010816	TGG	2	6	95096	95101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438936
2110	NC_010816	GCC	2	6	95116	95121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438936
2111	NC_010816	CTG	2	6	95152	95157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438936
2112	NC_010816	CG	3	6	95204	95209	0 %	0 %	50 %	50 %	189438936
2113	NC_010816	CGT	2	6	95211	95216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438936
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2115	NC_010816	GCCT	2	8	95320	95327	0 %	25 %	25 %	50 %	189438936
2116	NC_010816	GC	3	6	95332	95337	0 %	0 %	50 %	50 %	189438936
2117	NC_010816	CGG	2	6	95349	95354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438936
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2119	NC_010816	ATGGC	2	10	95402	95411	20 %	20 %	40 %	20 %	189438936
2120	NC_010816	CCT	2	6	95441	95446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438936
2121	NC_010816	CGGCTT	2	12	95448	95459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438936
2122	NC_010816	CGG	2	6	95475	95480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438936
2123	NC_010816	CGA	2	6	95595	95600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438936
2124	NC_010816	GAA	2	6	95610	95615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438936
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2252	NC_010816	GCC	2	6	100928	100933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2253	NC_010816	CCA	2	6	100938	100943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438943
2254	NC_010816	TGT	2	6	100977	100982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438943
2255	NC_010816	CGC	2	6	100998	101003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2256	NC_010816	GGCA	2	8	101037	101044	25 %	0 %	50 %	25 %	189438944
2257	NC_010816	TCGCGT	2	12	101045	101056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2258	NC_010816	GCC	2	6	101062	101067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2259	NC_010816	GCC	2	6	101093	101098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2260	NC_010816	CGTC	2	8	101128	101135	0 %	25 %	25 %	50 %	189438944
2261	NC_010816	CGG	2	6	101136	101141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438944
2262	NC_010816	GCGGAT	2	12	101148	101159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189438944
2263	NC_010816	GTC	3	9	101217	101225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2264	NC_010816	TCG	2	6	101242	101247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2265	NC_010816	CAG	2	6	101250	101255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438944
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2269	NC_010816	GC	3	6	101329	101334	0 %	0 %	50 %	50 %	189438944
2270	NC_010816	CGT	2	6	101370	101375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2271	NC_010816	TCG	2	6	101386	101391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
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2275	NC_010816	CTG	2	6	101520	101525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2276	NC_010816	CGC	2	6	101537	101542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2277	NC_010816	GCCGGA	2	12	101619	101630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438944
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2279	NC_010816	CGA	2	6	101645	101650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2280	NC_010816	CGC	2	6	101654	101659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2281	NC_010816	TCG	2	6	101698	101703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2282	NC_010816	CCG	2	6	101705	101710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2283	NC_010816	GAA	2	6	101751	101756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438944
2284	NC_010816	ATA	2	6	101833	101838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_010816	TTTGAA	2	12	101872	101883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_010816	ACT	2	6	101906	101911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438945
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2288	NC_010816	TCG	2	6	102045	102050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438945
2289	NC_010816	ACC	2	6	102155	102160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438945
2290	NC_010816	GATCA	2	10	102164	102173	40 %	20 %	20 %	20 %	189438945
2291	NC_010816	ACG	2	6	102246	102251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438945
2292	NC_010816	TCA	2	6	102393	102398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438945
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2294	NC_010816	GAC	2	6	102481	102486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2295	NC_010816	CAG	3	9	102508	102516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2297	NC_010816	CGA	2	6	102568	102573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2298	NC_010816	A	6	6	102573	102578	100 %	0 %	0 %	0 %	189438946
2299	NC_010816	TC	3	6	102589	102594	0 %	50 %	0 %	50 %	189438946
2300	NC_010816	CGT	2	6	102683	102688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438946
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2313	NC_010816	GCC	2	6	103146	103151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2329	NC_010816	GCT	2	6	104081	104086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2331	NC_010816	GCT	2	6	104141	104146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2333	NC_010816	ACG	3	9	104353	104361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
2334	NC_010816	ACC	2	6	104410	104415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438947
2335	NC_010816	GCA	2	6	104424	104429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2338	NC_010816	CCA	2	6	104660	104665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
2339	NC_010816	GACC	2	8	104670	104677	25 %	0 %	25 %	50 %	189438948
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2345	NC_010816	CCGC	2	8	104933	104940	0 %	0 %	25 %	75 %	189438948
2346	NC_010816	GAG	3	9	105058	105066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438948
2347	NC_010816	CGCCGG	2	12	105078	105089	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
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2350	NC_010816	TCGAGC	2	12	105152	105163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2351	NC_010816	CGT	2	6	105186	105191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2352	NC_010816	GTC	2	6	105193	105198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2353	NC_010816	GACC	2	8	105273	105280	25 %	0 %	25 %	50 %	189438948
2354	NC_010816	CAT	2	6	105315	105320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2355	NC_010816	CGTGG	2	10	105322	105331	0 %	20 %	60 %	20 %	189438948
2356	NC_010816	CGG	2	6	105342	105347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438948
2357	NC_010816	CAT	2	6	105387	105392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2358	NC_010816	CG	3	6	105410	105415	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
2359	NC_010816	TCC	2	6	105424	105429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438948
2360	NC_010816	CCA	2	6	105473	105478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
2361	NC_010816	CGA	2	6	105501	105506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2362	NC_010816	CCT	2	6	105539	105544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438948
2363	NC_010816	CGCTT	2	10	105583	105592	0 %	40 %	20 %	40 %	189438948
2364	NC_010816	ACC	2	6	105625	105630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
2365	NC_010816	CCG	2	6	105752	105757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438948
2366	NC_010816	AAG	2	6	105758	105763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438948
2367	NC_010816	CCGA	2	8	105793	105800	25 %	0 %	25 %	50 %	189438948
2368	NC_010816	GC	3	6	105822	105827	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
2369	NC_010816	CCA	2	6	105866	105871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
2370	NC_010816	TCA	2	6	105905	105910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2371	NC_010816	GCT	2	6	105957	105962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2372	NC_010816	AAG	2	6	105964	105969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438948
2373	NC_010816	GCC	2	6	106102	106107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438948
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2375	NC_010816	TAC	3	9	106129	106137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2376	NC_010816	GCT	2	6	106139	106144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438948
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2486	NC_010816	CGAT	2	8	111029	111036	25 %	25 %	25 %	25 %	189438952
2487	NC_010816	TCGGC	2	10	111069	111078	0 %	20 %	40 %	40 %	189438952
2488	NC_010816	GGCC	2	8	111144	111151	0 %	0 %	50 %	50 %	189438952
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2492	NC_010816	GAT	2	6	111305	111310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438952
2493	NC_010816	GT	3	6	111398	111403	0 %	50 %	50 %	0 %	189438952
2494	NC_010816	CCG	2	6	111507	111512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438952
2495	NC_010816	CGGC	2	8	111528	111535	0 %	0 %	50 %	50 %	189438952
2496	NC_010816	ATG	2	6	111600	111605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438952
2497	NC_010816	GAG	2	6	111632	111637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438952
2498	NC_010816	CGG	2	6	111660	111665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
2499	NC_010816	GAT	2	6	111695	111700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438952
2500	NC_010816	TCA	2	6	111717	111722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952

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