MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010816	ACC	2	6	44624	44629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438899
1002	NC_010816	GC	3	6	44640	44645	0 %	0 %	50 %	50 %	189438899
1003	NC_010816	CAG	2	6	44666	44671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438899
1004	NC_010816	GCA	2	6	44691	44696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438899
1005	NC_010816	CG	4	8	44703	44710	0 %	0 %	50 %	50 %	189438899
1006	NC_010816	CATCA	2	10	44774	44783	40 %	20 %	0 %	40 %	189438899
1007	NC_010816	GTTC	2	8	44838	44845	0 %	50 %	25 %	25 %	189438899
1008	NC_010816	GCG	2	6	44862	44867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438899
1009	NC_010816	TGG	2	6	44916	44921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438899
1010	NC_010816	CCG	2	6	44980	44985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438899
1011	NC_010816	GACGA	2	10	45086	45095	40 %	0 %	40 %	20 %	189438899
1012	NC_010816	CCA	2	6	45105	45110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438899
1013	NC_010816	GGT	2	6	45121	45126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438899
1014	NC_010816	CCG	2	6	45156	45161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438899
1015	NC_010816	CCG	2	6	45180	45185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438899
1016	NC_010816	GACG	2	8	45280	45287	25 %	0 %	50 %	25 %	189438899
1017	NC_010816	GCA	2	6	45330	45335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438899
1018	NC_010816	CAG	2	6	45344	45349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438899
1019	NC_010816	GTTG	2	8	45385	45392	0 %	50 %	50 %	0 %	189438899
1020	NC_010816	ATG	2	6	45447	45452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438899
1021	NC_010816	GC	3	6	45455	45460	0 %	0 %	50 %	50 %	189438899
1022	NC_010816	ATG	2	6	45503	45508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010816	CGA	2	6	45510	45515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010816	CGGT	2	8	45521	45528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_010816	GAT	2	6	45529	45534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010816	CTT	2	6	45599	45604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438900
1027	NC_010816	CGGG	2	8	45619	45626	0 %	0 %	75 %	25 %	189438900
1028	NC_010816	GA	3	6	45656	45661	50 %	0 %	50 %	0 %	189438900
1029	NC_010816	GATG	2	8	45768	45775	25 %	25 %	50 %	0 %	189438900
1030	NC_010816	GCT	2	6	45793	45798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438900
1031	NC_010816	CAG	2	6	45802	45807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438900
1032	NC_010816	AGA	2	6	45932	45937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438900
1033	NC_010816	GCA	2	6	45975	45980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010816	GCAA	2	8	46010	46017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_010816	ATTGG	2	10	46021	46030	20 %	40 %	40 %	0 %	189438901
1036	NC_010816	TCA	2	6	46158	46163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438901
1037	NC_010816	CAA	2	6	46171	46176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438901
1038	NC_010816	CAG	2	6	46222	46227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438901
1039	NC_010816	TCGAC	2	10	46269	46278	20 %	20 %	20 %	40 %	189438901
1040	NC_010816	CAA	2	6	46306	46311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438901
1041	NC_010816	GAC	3	9	46426	46434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438902
1042	NC_010816	AAC	2	6	46495	46500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438902
1043	NC_010816	GCG	2	6	46621	46626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438902
1044	NC_010816	GCC	2	6	46662	46667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438902
1045	NC_010816	CCA	2	6	46686	46691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438902
1046	NC_010816	CTC	2	6	46779	46784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438902
1047	NC_010816	CGG	2	6	46840	46845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438902
1048	NC_010816	TGC	2	6	46856	46861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438902
1049	NC_010816	GGC	2	6	46885	46890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438902
1050	NC_010816	GAG	2	6	46963	46968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438902
1051	NC_010816	GCC	2	6	47143	47148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438902
1052	NC_010816	GAA	2	6	47191	47196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438902
1053	NC_010816	A	6	6	47200	47205	100 %	0 %	0 %	0 %	189438902
1054	NC_010816	GAT	2	6	47224	47229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438902
1055	NC_010816	CCA	2	6	47231	47236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438902
1056	NC_010816	GCC	2	6	47332	47337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438902
1057	NC_010816	CTG	2	6	47398	47403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438902
1058	NC_010816	CAC	2	6	47406	47411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438902
1059	NC_010816	GAA	2	6	47415	47420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438902
1060	NC_010816	CGA	2	6	47463	47468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438902
1061	NC_010816	GCC	2	6	47474	47479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438902
1062	NC_010816	TCC	2	6	47495	47500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_010816	CCGC	2	8	47543	47550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_010816	GGC	2	6	47579	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010816	GCC	2	6	47589	47594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_010816	GGC	2	6	47655	47660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438903
1067	NC_010816	CGA	2	6	47707	47712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1068	NC_010816	ACGA	2	8	47718	47725	50 %	0 %	25 %	25 %	189438903
1069	NC_010816	TTC	2	6	47726	47731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438903
1070	NC_010816	TGG	2	6	47850	47855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1071	NC_010816	CGC	2	6	47872	47877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1072	NC_010816	GCC	2	6	47889	47894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1073	NC_010816	TTC	2	6	47939	47944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438903
1074	NC_010816	ATC	2	6	48020	48025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438903
1075	NC_010816	TGC	2	6	48026	48031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1076	NC_010816	CCG	2	6	48033	48038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1077	NC_010816	ATT	2	6	48111	48116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438903
1078	NC_010816	CTG	2	6	48182	48187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1079	NC_010816	CGC	2	6	48276	48281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1080	NC_010816	A	6	6	48324	48329	100 %	0 %	0 %	0 %	189438903
1081	NC_010816	CGC	2	6	48391	48396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1082	NC_010816	CAC	2	6	48487	48492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438903
1083	NC_010816	CTG	2	6	48518	48523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1084	NC_010816	CATC	2	8	48538	48545	25 %	25 %	0 %	50 %	189438903
1085	NC_010816	TGC	2	6	48555	48560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1086	NC_010816	CCG	2	6	48568	48573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1087	NC_010816	CAG	2	6	48593	48598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1088	NC_010816	CTG	2	6	48602	48607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1089	NC_010816	GTG	2	6	48665	48670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1090	NC_010816	GCC	2	6	48708	48713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1091	NC_010816	GC	3	6	48715	48720	0 %	0 %	50 %	50 %	189438903
1092	NC_010816	CCA	2	6	48730	48735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438903
1093	NC_010816	GAA	2	6	48850	48855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438903
1094	NC_010816	AAG	2	6	48860	48865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438903
1095	NC_010816	AAG	2	6	48875	48880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438903
1096	NC_010816	GCG	2	6	49005	49010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438903
1097	NC_010816	GCCCGT	2	12	49013	49024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189438903
1098	NC_010816	CGA	2	6	49027	49032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1099	NC_010816	CGA	2	6	49039	49044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1100	NC_010816	CGA	2	6	49090	49095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1101	NC_010816	CGG	2	6	49150	49155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438903
1102	NC_010816	ACT	2	6	49161	49166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438903
1103	NC_010816	GAC	2	6	49187	49192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1104	NC_010816	CTG	2	6	49223	49228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1105	NC_010816	TGC	2	6	49320	49325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1106	NC_010816	ACT	2	6	49497	49502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438903
1107	NC_010816	GTG	2	6	49520	49525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1108	NC_010816	TGG	2	6	49533	49538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1109	NC_010816	ACA	2	6	49575	49580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438903
1110	NC_010816	GC	3	6	49637	49642	0 %	0 %	50 %	50 %	189438903
1111	NC_010816	GCC	2	6	49648	49653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1112	NC_010816	CAT	2	6	49681	49686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438903
1113	NC_010816	CTC	2	6	49720	49725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438903
1114	NC_010816	TGG	2	6	49728	49733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1115	NC_010816	GGT	2	6	49813	49818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438903
1116	NC_010816	CGT	2	6	49826	49831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1117	NC_010816	CCG	2	6	49864	49869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438903
1118	NC_010816	GC	3	6	49908	49913	0 %	0 %	50 %	50 %	189438903
1119	NC_010816	CGA	2	6	49960	49965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1120	NC_010816	CTA	2	6	49966	49971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438903
1121	NC_010816	CGA	2	6	49972	49977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1122	NC_010816	GC	3	6	50006	50011	0 %	0 %	50 %	50 %	189438903
1123	NC_010816	ACG	2	6	50049	50054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438903
1124	NC_010816	GAT	2	6	50084	50089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438903
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1126	NC_010816	CT	3	6	50209	50214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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