MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010816	TTCCT	2	10	256384	256393	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5502	NC_010816	GGTG	2	8	256408	256415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010816	GCG	2	6	256428	256433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_010816	CAT	2	6	256490	256495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439063
5505	NC_010816	CG	3	6	256516	256521	0 %	0 %	50 %	50 %	189439063
5506	NC_010816	TTGG	2	8	256527	256534	0 %	50 %	50 %	0 %	189439063
5507	NC_010816	ATC	2	6	256535	256540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439063
5508	NC_010816	CA	3	6	256662	256667	50 %	0 %	0 %	50 %	189439063
5509	NC_010816	GGC	2	6	256674	256679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5510	NC_010816	GCG	2	6	256684	256689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5511	NC_010816	TCG	2	6	256734	256739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5512	NC_010816	AGC	2	6	256743	256748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5513	NC_010816	GCC	2	6	256806	256811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439063
5514	NC_010816	AGG	2	6	256816	256821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439063
5515	NC_010816	GTC	2	6	256832	256837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5516	NC_010816	TC	3	6	256885	256890	0 %	50 %	0 %	50 %	189439063
5517	NC_010816	TCG	2	6	256900	256905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5518	NC_010816	GCG	2	6	256940	256945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5519	NC_010816	GCG	2	6	256962	256967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5520	NC_010816	CCG	2	6	256992	256997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439063
5521	NC_010816	CAC	2	6	257021	257026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439063
5522	NC_010816	GCG	2	6	257028	257033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5523	NC_010816	CGT	2	6	257071	257076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5524	NC_010816	GAA	2	6	257177	257182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439063
5525	NC_010816	TCT	2	6	257230	257235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439063
5526	NC_010816	AGG	2	6	257392	257397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439063
5527	NC_010816	CTG	2	6	257456	257461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5528	NC_010816	GTC	3	9	257492	257500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5529	NC_010816	GGC	2	6	257504	257509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439063
5530	NC_010816	CGT	2	6	257593	257598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439063
5531	NC_010816	GTG	2	6	257613	257618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439063
5532	NC_010816	GGT	2	6	257729	257734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439063
5533	NC_010816	CTT	2	6	257749	257754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_010816	ATT	2	6	257787	257792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_010816	A	6	6	257858	257863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010816	TTC	2	6	257961	257966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439064
5537	NC_010816	TCAG	2	8	258015	258022	25 %	25 %	25 %	25 %	189439064
5538	NC_010816	CGA	2	6	258034	258039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439064
5539	NC_010816	GAA	2	6	258080	258085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439065
5540	NC_010816	GAA	2	6	258171	258176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439065
5541	NC_010816	AGC	2	6	258182	258187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439065
5542	NC_010816	GAA	2	6	258195	258200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439065
5543	NC_010816	ATG	2	6	258214	258219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439065
5544	NC_010816	TCT	2	6	258236	258241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439065
5545	NC_010816	TGA	2	6	258242	258247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439065
5546	NC_010816	GCG	2	6	258373	258378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_010816	CCAC	2	8	258458	258465	25 %	0 %	0 %	75 %	189439066
5548	NC_010816	T	6	6	258508	258513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010816	GATC	3	12	258536	258547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_010816	GAT	2	6	258552	258557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_010816	TGGA	2	8	258694	258701	25 %	25 %	50 %	0 %	189439067
5552	NC_010816	GTT	2	6	258837	258842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439067
5553	NC_010816	GTA	2	6	258912	258917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439067
5554	NC_010816	GGC	2	6	259148	259153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439068
5555	NC_010816	CAG	2	6	259196	259201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5556	NC_010816	GCGG	2	8	259205	259212	0 %	0 %	75 %	25 %	189439068
5557	NC_010816	GAT	2	6	259304	259309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439068
5558	NC_010816	CGG	2	6	259327	259332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439068
5559	NC_010816	GCA	3	9	259420	259428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5560	NC_010816	TCG	2	6	259437	259442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5561	NC_010816	GCC	2	6	259461	259466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439068
5562	NC_010816	GAG	2	6	259469	259474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439068
5563	NC_010816	AGT	2	6	259495	259500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439068
5564	NC_010816	CGC	2	6	259504	259509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439068
5565	NC_010816	GAA	2	6	259523	259528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439068
5566	NC_010816	AGC	2	6	259557	259562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5567	NC_010816	TGG	2	6	259570	259575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439068
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5569	NC_010816	TCG	2	6	259803	259808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5570	NC_010816	TTC	2	6	259857	259862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439068
5571	NC_010816	GCC	2	6	259892	259897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439068
5572	NC_010816	GCA	2	6	259915	259920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5573	NC_010816	CAG	2	6	259928	259933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439068
5574	NC_010816	TGGT	2	8	259966	259973	0 %	50 %	50 %	0 %	189439068
5575	NC_010816	TTCCT	2	10	259974	259983	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5576	NC_010816	GAA	2	6	260051	260056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439069
5577	NC_010816	CACTGC	2	12	260084	260095	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189439069
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5579	NC_010816	CGG	2	6	260119	260124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439069
5580	NC_010816	GC	3	6	260190	260195	0 %	0 %	50 %	50 %	189439069
5581	NC_010816	GAT	3	9	260240	260248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439069
5582	NC_010816	TCG	2	6	260334	260339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439069
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5584	NC_010816	GGC	2	6	260494	260499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439069
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5586	NC_010816	TGA	2	6	260554	260559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439069
5587	NC_010816	ATA	2	6	260606	260611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439069
5588	NC_010816	GTC	2	6	260621	260626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439069
5589	NC_010816	TCG	2	6	260721	260726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439069
5590	NC_010816	CGG	2	6	260767	260772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439069
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5592	NC_010816	TGG	2	6	260862	260867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439069
5593	NC_010816	AGCG	2	8	260967	260974	25 %	0 %	50 %	25 %	189439069
5594	NC_010816	GAT	2	6	260990	260995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439069
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5597	NC_010816	GC	3	6	261148	261153	0 %	0 %	50 %	50 %	189439069
5598	NC_010816	GTGG	2	8	261233	261240	0 %	25 %	75 %	0 %	189439069
5599	NC_010816	TGTT	2	8	261241	261248	0 %	75 %	25 %	0 %	189439069
5600	NC_010816	TCC	2	6	261264	261269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_010816	GTT	2	6	261288	261293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010816	ATTG	2	8	261340	261347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010816	CAAT	2	8	261351	261358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_010816	GT	3	6	261369	261374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010816	GTC	2	6	261388	261393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_010816	GAA	2	6	261461	261466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010816	GGA	2	6	261471	261476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010816	TCG	2	6	261628	261633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439070
5609	NC_010816	ATCGGT	2	12	261681	261692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189439070
5610	NC_010816	ACG	2	6	261814	261819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439070
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5614	NC_010816	CGGC	2	8	261961	261968	0 %	0 %	50 %	50 %	189439070
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5618	NC_010816	GC	3	6	262160	262165	0 %	0 %	50 %	50 %	189439070
5619	NC_010816	TCA	2	6	262213	262218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439070
5620	NC_010816	CCGGC	2	10	262326	262335	0 %	0 %	40 %	60 %	189439070
5621	NC_010816	GCC	2	6	262377	262382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439070
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5623	NC_010816	GT	3	6	262619	262624	0 %	50 %	50 %	0 %	189439071
5624	NC_010816	GGC	2	6	262645	262650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439071
5625	NC_010816	TGA	2	6	262689	262694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439071
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5651	NC_010816	TCG	2	6	263735	263740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5653	NC_010816	TG	3	6	263783	263788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_010816	GGT	2	6	263880	263885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5991	NC_010816	ATG	2	6	277865	277870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439081
5992	NC_010816	GTG	2	6	277925	277930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439081
5993	NC_010816	GCCG	2	8	277963	277970	0 %	0 %	50 %	50 %	189439081
5994	NC_010816	CCTG	2	8	278032	278039	0 %	25 %	25 %	50 %	189439081
5995	NC_010816	CCG	2	6	278052	278057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439081
5996	NC_010816	CCG	2	6	278133	278138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439081
5997	NC_010816	ACGC	2	8	278142	278149	25 %	0 %	25 %	50 %	189439081
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5999	NC_010816	AGGC	2	8	278183	278190	25 %	0 %	50 %	25 %	189439081
6000	NC_010816	TCA	2	6	278200	278205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439081

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