MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pTGL1

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010802	GCGTG	2	10	2056	2065	0 %	20 %	60 %	20 %	189348763
2	NC_010802	CTCGT	2	10	2500	2509	0 %	40 %	20 %	40 %	189348763
3	NC_010802	CGATG	2	10	6327	6336	20 %	20 %	40 %	20 %	189348766
4	NC_010802	CTGTT	2	10	6391	6400	0 %	60 %	20 %	20 %	189348766
5	NC_010802	CTGCG	2	10	8023	8032	0 %	20 %	40 %	40 %	189348768
6	NC_010802	CCATG	2	10	11285	11294	20 %	20 %	20 %	40 %	189348770
7	NC_010802	AATTC	2	10	12278	12287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010802	AATTA	2	10	14494	14503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010802	GCTTG	2	10	16099	16108	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010802	CCGAC	2	10	18032	18041	20 %	0 %	20 %	60 %	189348776
11	NC_010802	TGCAA	2	10	20131	20140	40 %	20 %	20 %	20 %	189348778
12	NC_010802	AGCAA	2	10	20984	20993	60 %	0 %	20 %	20 %	189348779
13	NC_010802	CCAAG	2	10	25446	25455	40 %	0 %	20 %	40 %	189348782
14	NC_010802	GTCGA	2	10	26329	26338	20 %	20 %	40 %	20 %	189348782
15	NC_010802	ATCCG	2	10	29304	29313	20 %	20 %	20 %	40 %	189348785
16	NC_010802	ACGCG	2	10	31774	31783	20 %	0 %	40 %	40 %	189348786
17	NC_010802	GCAAC	2	10	32113	32122	40 %	0 %	20 %	40 %	189348786
18	NC_010802	CCGCG	2	10	34616	34625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010802	CACTT	2	10	34694	34703	20 %	40 %	0 %	40 %	189348787
20	NC_010802	GCACG	2	10	35572	35581	20 %	0 %	40 %	40 %	189348788
21	NC_010802	CGGAG	2	10	36058	36067	20 %	0 %	60 %	20 %	189348788
22	NC_010802	CGACC	2	10	37543	37552	20 %	0 %	20 %	60 %	189348789
23	NC_010802	GGGAG	2	10	38463	38472	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010802	TGGGC	2	10	38862	38871	0 %	20 %	60 %	20 %	189348790
25	NC_010802	TTCCC	2	10	40071	40080	0 %	40 %	0 %	60 %	189348791
26	NC_010802	CGGCG	2	10	42603	42612	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010802	CGGGC	2	10	42842	42851	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010802	GGACA	2	10	42953	42962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010802	CGAAG	2	10	43124	43133	40 %	0 %	40 %	20 %	189348792
30	NC_010802	AATGA	2	10	44429	44438	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010802	ACCGT	2	10	46047	46056	20 %	20 %	20 %	40 %	189348793
32	NC_010802	CTCGA	2	10	46218	46227	20 %	20 %	20 %	40 %	189348793
33	NC_010802	CGAAA	2	10	46463	46472	60 %	0 %	20 %	20 %	189348793
34	NC_010802	AGCAA	2	10	46816	46825	60 %	0 %	20 %	20 %	189348793
35	NC_010802	GCGCG	2	10	48359	48368	0 %	0 %	60 %	40 %	189348795
36	NC_010802	ATCTG	2	10	48821	48830	20 %	40 %	20 %	20 %	189348795
37	NC_010802	CGACC	2	10	49617	49626	20 %	0 %	20 %	60 %	189348795
38	NC_010802	CGATG	2	10	49902	49911	20 %	20 %	40 %	20 %	189348795
39	NC_010802	TCGTG	2	10	50070	50079	0 %	40 %	40 %	20 %	189348795
40	NC_010802	CGACC	2	10	50814	50823	20 %	0 %	20 %	60 %	189348795
41	NC_010802	CCCGA	2	10	51619	51628	20 %	0 %	20 %	60 %	189348795
42	NC_010802	GCCAG	2	10	53992	54001	20 %	0 %	40 %	40 %	189348797
43	NC_010802	TCCAT	2	10	54479	54488	20 %	40 %	0 %	40 %	189348798
44	NC_010802	GGTCG	2	10	55034	55043	0 %	20 %	60 %	20 %	189348798
45	NC_010802	GCGTC	2	10	55470	55479	0 %	20 %	40 %	40 %	189348798
46	NC_010802	CCGCG	2	10	57919	57928	0 %	0 %	40 %	60 %	189348799
47	NC_010802	CGCCA	2	10	58402	58411	20 %	0 %	20 %	60 %	189348799
48	NC_010802	GAATC	2	10	58500	58509	40 %	20 %	20 %	20 %	189348799
49	NC_010802	GCGCC	2	10	60998	61007	0 %	0 %	40 %	60 %	189348800
50	NC_010802	CGCGG	2	10	64112	64121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010802	GCGGA	2	10	64388	64397	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010802	TTCGA	2	10	64595	64604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010802	GCGAA	2	10	65534	65543	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010802	AGCGA	2	10	65793	65802	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010802	GCGAA	2	10	68340	68349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010802	CTTCA	2	10	68483	68492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010802	AGGTG	2	10	71582	71591	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010802	GCAGG	2	10	71730	71739	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010802	GCGAC	2	10	71787	71796	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_010802	AGCGA	2	10	71818	71827	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010802	GCACG	2	10	71873	71882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010802	GTGCG	2	10	73877	73886	0 %	20 %	60 %	20 %	189348811
63	NC_010802	TCGGC	2	10	76360	76369	0 %	20 %	40 %	40 %	189348812
64	NC_010802	TTGGG	2	10	77870	77879	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010802	GCATG	2	10	78552	78561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010802	GCGTC	2	10	78737	78746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010802	CGCCT	2	10	80960	80969	0 %	20 %	20 %	60 %	189348813
68	NC_010802	CGCTT	2	10	81763	81772	0 %	40 %	20 %	40 %	189348814
69	NC_010802	AATGA	2	10	82021	82030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010802	GCTTC	2	10	86088	86097	0 %	40 %	20 %	40 %	189348817
71	NC_010802	GACGG	2	10	86498	86507	20 %	0 %	60 %	20 %	189348817
72	NC_010802	TCGGC	2	10	88420	88429	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010802	ACGGA	2	10	88471	88480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010802	CTTCG	2	10	92011	92020	0 %	40 %	20 %	40 %	189348823
75	NC_010802	GTGAA	2	10	92438	92447	40 %	20 %	40 %	0 %	189348824
76	NC_010802	CGGCG	2	10	94676	94685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010802	GCAAG	2	10	95940	95949	40 %	0 %	40 %	20 %	189348829
78	NC_010802	GGCAA	2	10	96083	96092	40 %	0 %	40 %	20 %	189348829
79	NC_010802	AGGCG	2	10	97369	97378	20 %	0 %	60 %	20 %	189348830
80	NC_010802	TCCGG	2	10	97399	97408	0 %	20 %	40 %	40 %	189348830
81	NC_010802	CGCGC	2	10	98005	98014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_010802	GCCGC	2	10	99469	99478	0 %	0 %	40 %	60 %	189348833
83	NC_010802	GCCGC	2	10	99792	99801	0 %	0 %	40 %	60 %	189348833
84	NC_010802	GCGAC	2	10	100369	100378	20 %	0 %	40 %	40 %	189348834
85	NC_010802	CGGGC	2	10	100883	100892	0 %	0 %	60 %	40 %	189348834
86	NC_010802	GCCCA	2	10	101793	101802	20 %	0 %	20 %	60 %	189348834
87	NC_010802	TCGCC	2	10	103992	104001	0 %	20 %	20 %	60 %	189348835
88	NC_010802	TGCGC	2	10	105097	105106	0 %	20 %	40 %	40 %	189348836
89	NC_010802	GCCAC	2	10	105146	105155	20 %	0 %	20 %	60 %	189348836
90	NC_010802	CGGCG	2	10	106187	106196	0 %	0 %	60 %	40 %	189348836
91	NC_010802	GCCGT	2	10	106846	106855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010802	CACTA	2	10	106865	106874	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010802	TGCCG	2	10	109402	109411	0 %	20 %	40 %	40 %	189348837
94	NC_010802	GCTGC	2	10	110037	110046	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010802	CGTCT	2	10	110193	110202	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_010802	CTTTC	2	10	110664	110673	0 %	60 %	0 %	40 %	189348838
97	NC_010802	GCGCG	2	10	111004	111013	0 %	0 %	60 %	40 %	189348839
98	NC_010802	TGGTG	2	10	115431	115440	0 %	40 %	60 %	0 %	189348845
99	NC_010802	CCGCC	2	10	115882	115891	0 %	0 %	20 %	80 %	189348846
100	NC_010802	TCTCA	2	10	116476	116485	20 %	40 %	0 %	40 %	189348847
101	NC_010802	TGACG	2	10	117072	117081	20 %	20 %	40 %	20 %	189348848
102	NC_010802	GCGCT	2	10	119041	119050	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010802	GTGTC	2	10	119635	119644	0 %	40 %	40 %	20 %	189348850
104	NC_010802	CGGCG	2	10	119807	119816	0 %	0 %	60 %	40 %	189348851
105	NC_010802	CCCGA	2	10	119856	119865	20 %	0 %	20 %	60 %	189348851
106	NC_010802	GCGAA	2	10	120272	120281	40 %	0 %	40 %	20 %	189348852
107	NC_010802	CCGCA	2	10	121500	121509	20 %	0 %	20 %	60 %	189348852
108	NC_010802	CAAAG	2	10	123057	123066	60 %	0 %	20 %	20 %	189348854
109	NC_010802	TGCTC	2	10	123913	123922	0 %	40 %	20 %	40 %	189348856
110	NC_010802	AGCGA	2	10	125196	125205	40 %	0 %	40 %	20 %	189348857
111	NC_010802	CCAGA	2	10	125352	125361	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010802	CGTCT	2	10	126502	126511	0 %	40 %	20 %	40 %	189348859
113	NC_010802	CGACG	2	10	128744	128753	20 %	0 %	40 %	40 %	189348861
114	NC_010802	ACCGT	2	10	132140	132149	20 %	20 %	20 %	40 %	189348862
115	NC_010802	GCTTC	2	10	133128	133137	0 %	40 %	20 %	40 %	189348864
116	NC_010802	GGACT	2	10	135648	135657	20 %	20 %	40 %	20 %	189348866
117	NC_010802	GTCGT	2	10	136349	136358	0 %	40 %	40 %	20 %	189348868
118	NC_010802	CGCGC	2	10	137798	137807	0 %	0 %	40 %	60 %	189348871
119	NC_010802	TTGAT	2	10	140687	140696	20 %	60 %	20 %	0 %	189348872
120	NC_010802	AGCGG	2	10	140711	140720	20 %	0 %	60 %	20 %	189348872
121	NC_010802	CGCGC	2	10	141011	141020	0 %	0 %	40 %	60 %	189348872
122	NC_010802	CGCTG	2	10	142178	142187	0 %	20 %	40 %	40 %	189348873
123	NC_010802	GCTGA	2	10	143300	143309	20 %	20 %	40 %	20 %	189348874
124	NC_010802	ACGCG	2	10	143692	143701	20 %	0 %	40 %	40 %	189348874
125	NC_010802	CGTCG	2	10	144254	144263	0 %	20 %	40 %	40 %	189348875
126	NC_010802	GACGC	2	10	144700	144709	20 %	0 %	40 %	40 %	189348875
127	NC_010802	CGAAG	2	10	145505	145514	40 %	0 %	40 %	20 %	189348876
128	NC_010802	GAACT	2	10	146307	146316	40 %	20 %	20 %	20 %	189348876
129	NC_010802	GGCGC	2	10	148341	148350	0 %	0 %	60 %	40 %	189348876
130	NC_010802	GCTCG	2	10	148433	148442	0 %	20 %	40 %	40 %	189348876
131	NC_010802	AGTCC	2	10	148654	148663	20 %	20 %	20 %	40 %	189348877
132	NC_010802	CAAGT	2	10	149819	149828	40 %	20 %	20 %	20 %	189348878
133	NC_010802	CGCTT	2	10	150900	150909	0 %	40 %	20 %	40 %	189348880
134	NC_010802	GCCGC	2	10	153525	153534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_010802	TCGCT	2	10	158130	158139	0 %	40 %	20 %	40 %	189348885
136	NC_010802	TGCGC	2	10	158409	158418	0 %	20 %	40 %	40 %	189348885
137	NC_010802	CCGTA	2	10	163037	163046	20 %	20 %	20 %	40 %	189348889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.