MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 111947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010681	AGCGA	2	10	233981	233990	40 %	0 %	40 %	20 %	187922229
5002	NC_010681	GGT	2	6	234014	234019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922229
5003	NC_010681	TGA	2	6	234029	234034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5004	NC_010681	TGA	2	6	234098	234103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5005	NC_010681	GC	3	6	234104	234109	0 %	0 %	50 %	50 %	187922229
5006	NC_010681	AGCA	2	8	234115	234122	50 %	0 %	25 %	25 %	187922229
5007	NC_010681	GAT	2	6	234125	234130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5008	NC_010681	GAC	2	6	234147	234152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5009	NC_010681	GTC	2	6	234165	234170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5010	NC_010681	CAGC	2	8	234234	234241	25 %	0 %	25 %	50 %	187922229
5011	NC_010681	GA	3	6	234339	234344	50 %	0 %	50 %	0 %	187922229
5012	NC_010681	TTC	2	6	234366	234371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922229
5013	NC_010681	GAT	2	6	234378	234383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5014	NC_010681	TCACG	2	10	234484	234493	20 %	20 %	20 %	40 %	187922229
5015	NC_010681	T	8	8	234699	234706	0 %	100 %	0 %	0 %	187922229
5016	NC_010681	CTT	2	6	234782	234787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922229
5017	NC_010681	TCC	2	6	234805	234810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922229
5018	NC_010681	CGG	2	6	234832	234837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922229
5019	NC_010681	CGCGCT	2	12	234848	234859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187922229
5020	NC_010681	TCA	2	6	234865	234870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922229
5021	NC_010681	GCG	2	6	234871	234876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922229
5022	NC_010681	CGA	2	6	234922	234927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5023	NC_010681	GTG	2	6	235137	235142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922229
5024	NC_010681	CGT	2	6	235231	235236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5025	NC_010681	TTTC	2	8	235248	235255	0 %	75 %	0 %	25 %	187922229
5026	NC_010681	CG	4	8	235258	235265	0 %	0 %	50 %	50 %	187922229
5027	NC_010681	TGC	2	6	235277	235282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5028	NC_010681	CTT	2	6	235308	235313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922229
5029	NC_010681	AGG	2	6	235414	235419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922229
5030	NC_010681	GGA	2	6	235472	235477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922229
5031	NC_010681	TGA	2	6	235486	235491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5032	NC_010681	AAC	2	6	235551	235556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922229
5033	NC_010681	GCA	2	6	235597	235602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922229
5034	NC_010681	GCG	2	6	235655	235660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922229
5035	NC_010681	AAG	2	6	235735	235740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922229
5036	NC_010681	GAT	2	6	235827	235832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922229
5037	NC_010681	CCAG	2	8	235852	235859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_010681	GCA	2	6	235943	235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_010681	GTA	2	6	235954	235959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010681	GCC	2	6	235962	235967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_010681	CCG	2	6	235978	235983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_010681	AGC	2	6	236033	236038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010681	CGGA	2	8	236083	236090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_010681	CCG	2	6	236115	236120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_010681	CTG	2	6	236139	236144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_010681	CTC	2	6	236148	236153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_010681	CG	3	6	236203	236208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_010681	GTTG	2	8	236215	236222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_010681	TCGA	2	8	236258	236265	25 %	25 %	25 %	25 %	187922230
5050	NC_010681	ATC	2	6	236291	236296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922230
5051	NC_010681	CG	3	6	236359	236364	0 %	0 %	50 %	50 %	187922230
5052	NC_010681	GTG	2	6	236393	236398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922230
5053	NC_010681	ACGC	2	8	236410	236417	25 %	0 %	25 %	50 %	187922230
5054	NC_010681	GA	3	6	236443	236448	50 %	0 %	50 %	0 %	187922230
5055	NC_010681	CGG	2	6	236472	236477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922230
5056	NC_010681	GTC	2	6	236534	236539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922230
5057	NC_010681	CAT	2	6	236563	236568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922230
5058	NC_010681	GCA	2	6	236582	236587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922230
5059	NC_010681	CAT	2	6	236621	236626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922230
5060	NC_010681	GCA	2	6	236653	236658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922230
5061	NC_010681	GCA	2	6	236681	236686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922230
5062	NC_010681	GCG	2	6	236690	236695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922230
5063	NC_010681	CGG	2	6	236802	236807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_010681	GCC	2	6	236846	236851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_010681	GCG	2	6	236926	236931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_010681	TTCG	2	8	236961	236968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_010681	TGC	2	6	236998	237003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_010681	CGC	2	6	237010	237015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_010681	TATG	2	8	237025	237032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010681	CGT	2	6	237096	237101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_010681	TTC	2	6	237344	237349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922231
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5073	NC_010681	TCG	2	6	237459	237464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922231
5074	NC_010681	GC	3	6	237509	237514	0 %	0 %	50 %	50 %	187922231
5075	NC_010681	A	6	6	237641	237646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_010681	CATGA	2	10	237691	237700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_010681	ATC	2	6	237705	237710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_010681	CGAG	2	8	237747	237754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_010681	GCA	2	6	237801	237806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_010681	TG	3	6	237825	237830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_010681	GAT	2	6	237873	237878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_010681	TGCC	2	8	237892	237899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_010681	GGGCA	2	10	237903	237912	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_010681	GCA	2	6	237935	237940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922232
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5088	NC_010681	TTCC	2	8	238366	238373	0 %	50 %	0 %	50 %	187922232
5089	NC_010681	CTA	2	6	238383	238388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922232
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5091	NC_010681	TTG	2	6	238423	238428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922233
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5093	NC_010681	ACA	2	6	238523	238528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922233
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5098	NC_010681	CAG	2	6	238665	238670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922233
5099	NC_010681	TGC	2	6	238744	238749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922233
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5102	NC_010681	TGC	2	6	238851	238856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5104	NC_010681	AAC	2	6	239134	239139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922234
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5106	NC_010681	TTG	3	9	239215	239223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922234
5107	NC_010681	GCC	2	6	239407	239412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_010681	ACGT	2	8	239431	239438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_010681	GCG	2	6	239451	239456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_010681	CTG	2	6	239499	239504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010681	GCG	4	12	239531	239542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_010681	AAG	2	6	239640	239645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922235
5113	NC_010681	CGC	2	6	239797	239802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922236
5114	NC_010681	GCG	3	9	239835	239843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922236
5115	NC_010681	ACG	2	6	239859	239864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922236
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5119	NC_010681	ACG	2	6	239962	239967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922236
5120	NC_010681	GCC	2	6	239975	239980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922236
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5124	NC_010681	CGTGC	2	10	240149	240158	0 %	20 %	40 %	40 %	187922236
5125	NC_010681	GAT	2	6	240182	240187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922236
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5130	NC_010681	CAG	2	6	240296	240301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922236
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5237	NC_010681	T	6	6	244983	244988	0 %	100 %	0 %	0 %	187922240
5238	NC_010681	CGG	2	6	245014	245019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922240
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5240	NC_010681	ATC	2	6	245087	245092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922240
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5242	NC_010681	ATCGG	2	10	245126	245135	20 %	20 %	40 %	20 %	187922240
5243	NC_010681	CCTT	2	8	245144	245151	0 %	50 %	0 %	50 %	187922240
5244	NC_010681	AGC	2	6	245162	245167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922240
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5246	NC_010681	TCGT	2	8	245180	245187	0 %	50 %	25 %	25 %	187922240
5247	NC_010681	GCA	2	6	245199	245204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922240
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5251	NC_010681	TGAA	2	8	245519	245526	50 %	25 %	25 %	0 %	187922240
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5261	NC_010681	GCC	2	6	245825	245830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5263	NC_010681	CCG	2	6	245995	246000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5265	NC_010681	ACT	2	6	246119	246124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922241
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5350	NC_010681	A	6	6	250565	250570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_010681	GTC	2	6	250585	250590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5352	NC_010681	GTT	2	6	250621	250626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_010681	CGA	2	6	250834	250839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5354	NC_010681	A	7	7	250940	250946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_010681	GGCT	2	8	251063	251070	0 %	25 %	50 %	25 %	187922245
5356	NC_010681	CG	4	8	251110	251117	0 %	0 %	50 %	50 %	187922245
5357	NC_010681	GAT	2	6	251210	251215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922245
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5359	NC_010681	GAT	2	6	251462	251467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922245
5360	NC_010681	TGC	2	6	251473	251478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922245
5361	NC_010681	TCA	2	6	251485	251490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922245
5362	NC_010681	GC	3	6	251532	251537	0 %	0 %	50 %	50 %	187922245
5363	NC_010681	CGA	2	6	251557	251562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922245
5364	NC_010681	ACCGC	2	10	251575	251584	20 %	0 %	20 %	60 %	187922245
5365	NC_010681	GGGC	2	8	251614	251621	0 %	0 %	75 %	25 %	187922245
5366	NC_010681	CATGAC	2	12	251686	251697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187922245
5367	NC_010681	TCC	2	6	251751	251756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922245
5368	NC_010681	GC	3	6	251760	251765	0 %	0 %	50 %	50 %	187922245
5369	NC_010681	CCG	2	6	251788	251793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922245
5370	NC_010681	CAG	2	6	251843	251848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922245
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5372	NC_010681	CG	3	6	251899	251904	0 %	0 %	50 %	50 %	187922245
5373	NC_010681	GACA	2	8	251983	251990	50 %	0 %	25 %	25 %	187922245
5374	NC_010681	GGCT	2	8	251999	252006	0 %	25 %	50 %	25 %	187922245
5375	NC_010681	GTC	2	6	252054	252059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922245
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5378	NC_010681	GTC	2	6	252185	252190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5380	NC_010681	CAT	2	6	252232	252237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5382	NC_010681	ACG	2	6	252398	252403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5393	NC_010681	GGC	2	6	252958	252963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_010681	TGC	3	9	252976	252984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5396	NC_010681	CGC	2	6	253118	253123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5397	NC_010681	TCG	2	6	253232	253237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_010681	CCGGG	2	10	253249	253258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5399	NC_010681	GC	3	6	253283	253288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5400	NC_010681	CGG	2	6	253303	253308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5401	NC_010681	T	6	6	253342	253347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_010681	CG	3	6	253350	253355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5403	NC_010681	GCATG	2	10	253561	253570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5410	NC_010681	CG	3	6	253837	253842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5411	NC_010681	CGG	2	6	253847	253852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5413	NC_010681	GGT	2	6	253952	253957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5477	NC_010681	CG	3	6	255986	255991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5478	NC_010681	CCCGA	2	10	256000	256009	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5485	NC_010681	GAT	2	6	256244	256249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922250
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5489	NC_010681	GCG	2	6	256330	256335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5490	NC_010681	GC	3	6	256383	256388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5491	NC_010681	CG	3	6	256425	256430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5492	NC_010681	TCG	2	6	256440	256445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922251
5493	NC_010681	ATC	2	6	256515	256520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922251
5494	NC_010681	ATGCGG	2	12	256659	256670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187922251
5495	NC_010681	CG	3	6	256826	256831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5496	NC_010681	CGG	2	6	256907	256912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_010681	CTCCA	2	10	256941	256950	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5498	NC_010681	TCG	2	6	256978	256983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_010681	GCG	2	6	256993	256998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_010681	CGT	3	9	257012	257020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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