MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella avium 197N chromosome

Total Repeats: 83799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010645	GTT	2	6	25649	25654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187476533
502	NC_010645	TCG	2	6	25703	25708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476533
503	NC_010645	CTG	2	6	25769	25774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476533
504	NC_010645	TCG	2	6	25784	25789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476533
505	NC_010645	TGCGTT	2	12	25817	25828	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187476533
506	NC_010645	GCG	2	6	25838	25843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476533
507	NC_010645	TGC	2	6	25848	25853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476533
508	NC_010645	CGA	2	6	25869	25874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476533
509	NC_010645	GCTGGC	2	12	25896	25907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187476533
510	NC_010645	GGC	2	6	26007	26012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476533
511	NC_010645	C	6	6	26012	26017	0 %	0 %	0 %	100 %	187476533
512	NC_010645	CGCTGT	2	12	26027	26038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476533
513	NC_010645	AACG	2	8	26044	26051	50 %	0 %	25 %	25 %	187476533
514	NC_010645	CGTG	2	8	26058	26065	0 %	25 %	50 %	25 %	187476533
515	NC_010645	GCA	2	6	26159	26164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476533
516	NC_010645	G	6	6	26273	26278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010645	GCTT	2	8	26292	26299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_010645	CAG	2	6	26328	26333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010645	CTAA	2	8	26337	26344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_010645	TGC	2	6	26390	26395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_010645	ACCCC	2	10	26449	26458	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
522	NC_010645	GGA	2	6	26647	26652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010645	CG	3	6	26734	26739	0 %	0 %	50 %	50 %	187476534
524	NC_010645	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476534
525	NC_010645	CAAGAG	2	12	26753	26764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187476534
526	NC_010645	ACC	3	9	26817	26825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476534
527	NC_010645	AAG	2	6	26829	26834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476534
528	NC_010645	CGG	2	6	26903	26908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476534
529	NC_010645	AAGC	2	8	27033	27040	50 %	0 %	25 %	25 %	187476534
530	NC_010645	GAA	2	6	27068	27073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476534
531	NC_010645	GCA	2	6	27165	27170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_010645	A	6	6	27209	27214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010645	CGT	2	6	27255	27260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476535
534	NC_010645	CAA	2	6	27446	27451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476535
535	NC_010645	TCG	2	6	27463	27468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476535
536	NC_010645	GCC	2	6	27478	27483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476535
537	NC_010645	GCC	2	6	27532	27537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476535
538	NC_010645	GCC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476535
539	NC_010645	AAG	2	6	27573	27578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476535
540	NC_010645	CTGG	2	8	27606	27613	0 %	25 %	50 %	25 %	187476535
541	NC_010645	GAA	2	6	27653	27658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476535
542	NC_010645	CAA	2	6	27689	27694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476535
543	NC_010645	CCA	2	6	27733	27738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
544	NC_010645	ACC	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
545	NC_010645	ATG	2	6	27868	27873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
546	NC_010645	CCA	2	6	27880	27885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
547	NC_010645	TGGA	2	8	27891	27898	25 %	25 %	50 %	0 %	187476536
548	NC_010645	GCAAGA	2	12	27899	27910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187476536
549	NC_010645	CGG	2	6	27931	27936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476536
550	NC_010645	ACG	2	6	27939	27944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
551	NC_010645	CAT	2	6	27992	27997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476536
552	NC_010645	GTGG	2	8	28083	28090	0 %	25 %	75 %	0 %	187476536
553	NC_010645	GCCAA	2	10	28120	28129	40 %	0 %	20 %	40 %	187476536
554	NC_010645	CTT	2	6	28187	28192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187476536
555	NC_010645	AGC	2	6	28204	28209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
556	NC_010645	GC	3	6	28223	28228	0 %	0 %	50 %	50 %	187476536
557	NC_010645	TCCCG	2	10	28232	28241	0 %	20 %	20 %	60 %	187476536
558	NC_010645	TGAT	2	8	28282	28289	25 %	50 %	25 %	0 %	187476536
559	NC_010645	CAT	2	6	28307	28312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476536
560	NC_010645	AGCC	2	8	28322	28329	25 %	0 %	25 %	50 %	187476536
561	NC_010645	GAA	2	6	28383	28388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
562	NC_010645	GCC	3	9	28410	28418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
563	NC_010645	GTC	2	6	28421	28426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
564	NC_010645	TGA	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
565	NC_010645	GAA	2	6	28467	28472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
566	NC_010645	ATCC	2	8	28518	28525	25 %	25 %	0 %	50 %	187476536
567	NC_010645	CGAT	2	8	28603	28610	25 %	25 %	25 %	25 %	187476536
568	NC_010645	CCG	2	6	28614	28619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
569	NC_010645	CGT	2	6	28656	28661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
570	NC_010645	GAC	2	6	28665	28670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
571	NC_010645	TGA	2	6	28702	28707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
572	NC_010645	AAGA	2	8	28797	28804	75 %	0 %	25 %	0 %	187476536
573	NC_010645	AAC	2	6	28836	28841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476536
574	NC_010645	GAA	2	6	28845	28850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
575	NC_010645	CGC	2	6	28877	28882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
576	NC_010645	GTG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
577	NC_010645	ACC	2	6	28905	28910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
578	NC_010645	TCACG	2	10	28937	28946	20 %	20 %	20 %	40 %	187476536
579	NC_010645	CGT	2	6	29059	29064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
580	NC_010645	ATT	2	6	29100	29105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187476536
581	NC_010645	TCG	2	6	29137	29142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
582	NC_010645	CGA	2	6	29225	29230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
583	NC_010645	GTG	2	6	29283	29288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
584	NC_010645	TCG	2	6	29329	29334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
585	NC_010645	CCG	2	6	29374	29379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
586	NC_010645	CTG	2	6	29407	29412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
587	NC_010645	CTGG	2	8	29418	29425	0 %	25 %	50 %	25 %	187476536
588	NC_010645	CGT	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
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590	NC_010645	CGAA	2	8	29485	29492	50 %	0 %	25 %	25 %	187476536
591	NC_010645	AAGG	2	8	29526	29533	50 %	0 %	50 %	0 %	187476536
592	NC_010645	GAT	2	6	29567	29572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
593	NC_010645	GTTGAA	2	12	29577	29588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
594	NC_010645	TGG	2	6	29606	29611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
595	NC_010645	TCGCG	2	10	29631	29640	0 %	20 %	40 %	40 %	187476536
596	NC_010645	GAC	2	6	29658	29663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
597	NC_010645	CGG	3	9	29669	29677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476536
598	NC_010645	ATC	2	6	29682	29687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476536
599	NC_010645	CCA	2	6	29725	29730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
600	NC_010645	CGC	2	6	29822	29827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
601	NC_010645	ACG	2	6	29992	29997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476537
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605	NC_010645	CGG	2	6	30036	30041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476537
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608	NC_010645	TGG	2	6	30227	30232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476537
609	NC_010645	GCT	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
610	NC_010645	CTG	2	6	30277	30282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
611	NC_010645	GCC	2	6	30284	30289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476537
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