MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella avium 197N chromosome

Total Repeats: 83799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010645	GCG	2	6	249474	249479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476756
5502	NC_010645	GC	3	6	249486	249491	0 %	0 %	50 %	50 %	187476756
5503	NC_010645	GCC	2	6	249531	249536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476756
5504	NC_010645	GCG	2	6	249553	249558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476756
5505	NC_010645	GCG	2	6	249609	249614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476756
5506	NC_010645	CTTT	2	8	249616	249623	0 %	75 %	0 %	25 %	187476756
5507	NC_010645	ATC	2	6	249629	249634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476756
5508	NC_010645	GGCC	2	8	249664	249671	0 %	0 %	50 %	50 %	187476756
5509	NC_010645	GCGCC	2	10	249751	249760	0 %	0 %	40 %	60 %	187476756
5510	NC_010645	GAG	2	6	249788	249793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187476756
5511	NC_010645	CCACGG	2	12	249808	249819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187476756
5512	NC_010645	CCGGA	2	10	249899	249908	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5513	NC_010645	CG	3	6	250030	250035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_010645	CTGG	2	8	250113	250120	0 %	25 %	50 %	25 %	187476757
5515	NC_010645	GTCG	2	8	250142	250149	0 %	25 %	50 %	25 %	187476757
5516	NC_010645	CCG	2	6	250159	250164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476757
5517	NC_010645	GC	3	6	250228	250233	0 %	0 %	50 %	50 %	187476757
5518	NC_010645	GGC	2	6	250299	250304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476757
5519	NC_010645	TGAA	2	8	250305	250312	50 %	25 %	25 %	0 %	187476757
5520	NC_010645	GCC	2	6	250355	250360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476757
5521	NC_010645	CGA	2	6	250369	250374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476757
5522	NC_010645	GCGCC	2	10	250390	250399	0 %	0 %	40 %	60 %	187476757
5523	NC_010645	CGA	2	6	250429	250434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476757
5524	NC_010645	TGC	2	6	250527	250532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476757
5525	NC_010645	GCCG	2	8	250568	250575	0 %	0 %	50 %	50 %	187476757
5526	NC_010645	CGC	2	6	250588	250593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476757
5527	NC_010645	GC	3	6	250609	250614	0 %	0 %	50 %	50 %	187476757
5528	NC_010645	GAC	2	6	250643	250648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476757
5529	NC_010645	TCG	2	6	250653	250658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476757
5530	NC_010645	GCC	2	6	250742	250747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476757
5531	NC_010645	GCG	2	6	250757	250762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476757
5532	NC_010645	GGC	2	6	250765	250770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476757
5533	NC_010645	AAG	2	6	250793	250798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476757
5534	NC_010645	GGC	2	6	250844	250849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
5535	NC_010645	GCCG	2	8	250856	250863	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5536	NC_010645	GGC	2	6	250871	250876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
5537	NC_010645	CAG	2	6	250917	250922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476758
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5539	NC_010645	GGC	2	6	250991	250996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
5540	NC_010645	GCTG	2	8	251054	251061	0 %	25 %	50 %	25 %	187476758
5541	NC_010645	GCC	2	6	251109	251114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476758
5542	NC_010645	CG	3	6	251142	251147	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5543	NC_010645	GTAT	2	8	251258	251265	25 %	50 %	25 %	0 %	187476758
5544	NC_010645	CGC	2	6	251346	251351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476758
5545	NC_010645	GGC	2	6	251393	251398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
5546	NC_010645	AGAA	2	8	251413	251420	75 %	0 %	25 %	0 %	187476758
5547	NC_010645	GC	3	6	251465	251470	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5548	NC_010645	GGC	2	6	251474	251479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
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5552	NC_010645	GC	3	6	251570	251575	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5553	NC_010645	CGC	2	6	251589	251594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476758
5554	NC_010645	GAA	2	6	251601	251606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476758
5555	NC_010645	GC	3	6	251607	251612	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5556	NC_010645	GAA	2	6	251619	251624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476758
5557	NC_010645	GC	3	6	251679	251684	0 %	0 %	50 %	50 %	187476758
5558	NC_010645	CGG	2	6	251700	251705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
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5562	NC_010645	GCG	2	6	251787	251792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
5563	NC_010645	GCGCGG	2	12	251798	251809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
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5570	NC_010645	TGG	2	6	251995	252000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476758
5571	NC_010645	ACG	2	6	252017	252022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476758
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5574	NC_010645	GCG	2	6	252085	252090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476758
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5580	NC_010645	CGT	2	6	252467	252472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476759
5581	NC_010645	TCCGCT	2	12	252524	252535	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	187476759
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5588	NC_010645	TCA	3	9	252823	252831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476759
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5591	NC_010645	ATC	2	6	252934	252939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476759
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5595	NC_010645	GC	3	6	253099	253104	0 %	0 %	50 %	50 %	187476759
5596	NC_010645	CCT	2	6	253145	253150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187476759
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5602	NC_010645	TCGGC	2	10	253342	253351	0 %	20 %	40 %	40 %	187476759
5603	NC_010645	TGGC	2	8	253369	253376	0 %	25 %	50 %	25 %	187476759
5604	NC_010645	GC	3	6	253394	253399	0 %	0 %	50 %	50 %	187476759
5605	NC_010645	CGG	2	6	253468	253473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476759
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5607	NC_010645	GAAGT	2	10	253638	253647	40 %	20 %	40 %	0 %	187476759
5608	NC_010645	ACA	2	6	253660	253665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476759
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5612	NC_010645	GCAA	2	8	253861	253868	50 %	0 %	25 %	25 %	187476759
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5622	NC_010645	GTC	3	9	254159	254167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476760
5623	NC_010645	GGC	2	6	254215	254220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476760
5624	NC_010645	TGC	2	6	254240	254245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476760
5625	NC_010645	CGCCA	2	10	254261	254270	20 %	0 %	20 %	60 %	187476760
5626	NC_010645	TGCG	2	8	254282	254289	0 %	25 %	50 %	25 %	187476760
5627	NC_010645	ACG	2	6	254328	254333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476760
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5633	NC_010645	CAT	2	6	254458	254463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476760
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5636	NC_010645	GTC	2	6	254604	254609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476760
5637	NC_010645	GC	3	6	254625	254630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5638	NC_010645	CCTG	2	8	254637	254644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5639	NC_010645	AAT	2	6	254673	254678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_010645	TCGC	2	8	254725	254732	0 %	25 %	25 %	50 %	187476761
5641	NC_010645	CAGCG	2	10	254819	254828	20 %	0 %	40 %	40 %	187476761
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5644	NC_010645	GCG	3	9	255003	255011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476761
5645	NC_010645	GGC	2	6	255014	255019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476761
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5647	NC_010645	GC	3	6	255044	255049	0 %	0 %	50 %	50 %	187476761
5648	NC_010645	CCA	2	6	255077	255082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476761
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5652	NC_010645	CAC	2	6	255209	255214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476761
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5654	NC_010645	GC	4	8	255249	255256	0 %	0 %	50 %	50 %	187476761
5655	NC_010645	CGCTG	2	10	255323	255332	0 %	20 %	40 %	40 %	187476761
5656	NC_010645	TC	3	6	255375	255380	0 %	50 %	0 %	50 %	187476761
5657	NC_010645	CCAGGC	2	12	255512	255523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187476762
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5660	NC_010645	TCCGT	2	10	255691	255700	0 %	40 %	20 %	40 %	187476762
5661	NC_010645	TGG	2	6	255721	255726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476762
5662	NC_010645	GCCG	2	8	255774	255781	0 %	0 %	50 %	50 %	187476762
5663	NC_010645	CTG	2	6	255783	255788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476762
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5676	NC_010645	GTCCC	2	10	256571	256580	0 %	20 %	20 %	60 %	187476762
5677	NC_010645	CG	3	6	256591	256596	0 %	0 %	50 %	50 %	187476762
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5693	NC_010645	ATC	2	6	257419	257424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476763
5694	NC_010645	GC	3	6	257428	257433	0 %	0 %	50 %	50 %	187476763
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5697	NC_010645	CCA	2	6	257601	257606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476763
5698	NC_010645	GCCG	2	8	257643	257650	0 %	0 %	50 %	50 %	187476763
5699	NC_010645	CACG	2	8	257666	257673	25 %	0 %	25 %	50 %	187476763
5700	NC_010645	GCA	2	6	257696	257701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476763
5701	NC_010645	ACG	3	9	257728	257736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476763
5702	NC_010645	CAG	2	6	257745	257750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476763
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5704	NC_010645	CAT	2	6	257829	257834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5706	NC_010645	GCGTG	2	10	258064	258073	0 %	20 %	60 %	20 %	187476764
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5708	NC_010645	GGCT	2	8	258183	258190	0 %	25 %	50 %	25 %	187476764
5709	NC_010645	ACG	2	6	258279	258284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476764
5710	NC_010645	CGA	2	6	258292	258297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476764
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5726	NC_010645	TGC	2	6	259012	259017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476765
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5731	NC_010645	ATC	2	6	259455	259460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476765
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5743	NC_010645	GC	3	6	260277	260282	0 %	0 %	50 %	50 %	187476765
5744	NC_010645	GGCGC	2	10	260399	260408	0 %	0 %	60 %	40 %	187476765
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5993	NC_010645	GAA	2	6	272483	272488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476778
5994	NC_010645	ATGGC	2	10	272539	272548	20 %	20 %	40 %	20 %	187476778
5995	NC_010645	ATGTTC	2	12	272574	272585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187476778
5996	NC_010645	GCA	2	6	272658	272663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_010645	GGC	2	6	272678	272683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5998	NC_010645	CCT	2	6	272686	272691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5999	NC_010645	AGGC	2	8	272758	272765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6000	NC_010645	A	7	7	272791	272797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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