MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010581	GAT	2	6	191965	191970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4002	NC_010581	TC	3	6	191994	191999	0 %	50 %	0 %	50 %	182677163
4003	NC_010581	GC	3	6	192045	192050	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4004	NC_010581	CTC	2	6	192064	192069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677163
4005	NC_010581	GCT	2	6	192106	192111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677163
4006	NC_010581	GAG	2	6	192226	192231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4007	NC_010581	GCGA	2	8	192232	192239	25 %	0 %	50 %	25 %	182677163
4008	NC_010581	GAT	2	6	192268	192273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4009	NC_010581	CT	3	6	192321	192326	0 %	50 %	0 %	50 %	182677163
4010	NC_010581	CGC	2	6	192389	192394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4011	NC_010581	GACG	2	8	192409	192416	25 %	0 %	50 %	25 %	182677163
4012	NC_010581	CG	3	6	192507	192512	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4013	NC_010581	GTT	2	6	192618	192623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677163
4014	NC_010581	CG	3	6	192665	192670	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4015	NC_010581	GAAG	2	8	192690	192697	50 %	0 %	50 %	0 %	182677163
4016	NC_010581	GCG	2	6	192713	192718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4017	NC_010581	GGA	2	6	192750	192755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4018	NC_010581	CCG	2	6	192770	192775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4019	NC_010581	TCA	2	6	192797	192802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677163
4020	NC_010581	GCC	2	6	192814	192819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4021	NC_010581	AGG	2	6	192857	192862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4022	NC_010581	GGC	2	6	193029	193034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4023	NC_010581	GAT	2	6	193066	193071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4024	NC_010581	GAG	2	6	193156	193161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4025	NC_010581	CG	3	6	193244	193249	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4026	NC_010581	GGC	2	6	193260	193265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4027	NC_010581	GC	4	8	193271	193278	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4028	NC_010581	CGC	2	6	193356	193361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4029	NC_010581	GAT	2	6	193387	193392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4030	NC_010581	CG	3	6	193402	193407	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4031	NC_010581	GAA	2	6	193465	193470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677163
4032	NC_010581	GCG	3	9	193626	193634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4033	NC_010581	GGA	2	6	193764	193769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4034	NC_010581	GGC	2	6	193796	193801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4035	NC_010581	GC	4	8	193832	193839	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4036	NC_010581	CGC	2	6	193845	193850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4037	NC_010581	GAGC	2	8	193905	193912	25 %	0 %	50 %	25 %	182677163
4038	NC_010581	CGC	2	6	193969	193974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4039	NC_010581	TAA	2	6	194046	194051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677163
4040	NC_010581	CGT	2	6	194059	194064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677163
4041	NC_010581	TGC	2	6	194227	194232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677163
4042	NC_010581	CGC	2	6	194313	194318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4043	NC_010581	CG	4	8	194331	194338	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4044	NC_010581	CAG	2	6	194410	194415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677163
4045	NC_010581	GGC	2	6	194466	194471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4046	NC_010581	GGA	2	6	194514	194519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677163
4047	NC_010581	GCG	2	6	194580	194585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4048	NC_010581	GCG	3	9	194634	194642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4049	NC_010581	GCTG	2	8	194661	194668	0 %	25 %	50 %	25 %	182677163
4050	NC_010581	GC	3	6	194671	194676	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4051	NC_010581	GAA	2	6	194688	194693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677163
4052	NC_010581	GGC	2	6	194698	194703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4053	NC_010581	GC	3	6	194715	194720	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4054	NC_010581	CG	6	12	194726	194737	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4055	NC_010581	GCG	2	6	194760	194765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4056	NC_010581	CG	3	6	194764	194769	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4057	NC_010581	G	6	6	194793	194798	0 %	0 %	100 %	0 %	182677163
4058	NC_010581	GCC	2	6	194806	194811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677163
4059	NC_010581	CG	3	6	194945	194950	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4060	NC_010581	GC	3	6	195000	195005	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4061	NC_010581	GAT	2	6	195028	195033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4062	NC_010581	GAT	2	6	195049	195054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677163
4063	NC_010581	GC	4	8	195075	195082	0 %	0 %	50 %	50 %	182677163
4064	NC_010581	GGC	2	6	195084	195089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4065	NC_010581	CAT	4	12	195124	195135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677163
4066	NC_010581	GTC	2	6	195136	195141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677163
4067	NC_010581	GGC	2	6	195153	195158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677163
4068	NC_010581	TAT	2	6	195285	195290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010581	TAT	2	6	195300	195305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_010581	TCA	2	6	195400	195405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_010581	AGAGAA	2	12	195421	195432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010581	GATC	2	8	195441	195448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_010581	CGG	2	6	195459	195464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_010581	CCT	2	6	195491	195496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677164
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4076	NC_010581	TG	3	6	195593	195598	0 %	50 %	50 %	0 %	182677164
4077	NC_010581	GAG	2	6	195615	195620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677164
4078	NC_010581	TTGC	2	8	195636	195643	0 %	50 %	25 %	25 %	182677164
4079	NC_010581	GCG	2	6	195653	195658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677164
4080	NC_010581	TTC	3	9	195696	195704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677164
4081	NC_010581	G	6	6	195718	195723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010581	CGAA	2	8	195758	195765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_010581	A	6	6	195841	195846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_010581	CGC	2	6	195905	195910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677165
4085	NC_010581	ATC	2	6	195983	195988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677165
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4087	NC_010581	ACG	2	6	196215	196220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677165
4088	NC_010581	GCC	2	6	196256	196261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677165
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4090	NC_010581	AGG	2	6	196350	196355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677165
4091	NC_010581	CGG	2	6	196359	196364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677165
4092	NC_010581	GCG	2	6	196395	196400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677165
4093	NC_010581	GTC	2	6	196465	196470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677165
4094	NC_010581	TCG	2	6	196509	196514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677165
4095	NC_010581	AAC	2	6	196536	196541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677165
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4097	NC_010581	CGA	2	6	196597	196602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677165
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4099	NC_010581	GC	3	6	196687	196692	0 %	0 %	50 %	50 %	182677165
4100	NC_010581	CGA	2	6	196750	196755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677165
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4102	NC_010581	A	7	7	196910	196916	100 %	0 %	0 %	0 %	182677165
4103	NC_010581	ATCGC	2	10	196941	196950	20 %	20 %	20 %	40 %	182677165
4104	NC_010581	GGC	2	6	196962	196967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677165
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4106	NC_010581	GCTTCT	2	12	197057	197068	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182677165
4107	NC_010581	ACG	2	6	197083	197088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_010581	CGC	2	6	197178	197183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_010581	GCG	2	6	197250	197255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_010581	TGG	2	6	197288	197293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_010581	AGCGC	2	10	197316	197325	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4112	NC_010581	AGTC	2	8	197336	197343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_010581	TGCG	2	8	197347	197354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_010581	AGG	2	6	197359	197364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010581	GCG	2	6	197382	197387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010581	TTTG	2	8	197429	197436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_010581	GAT	2	6	197460	197465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010581	GGC	2	6	197468	197473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_010581	GCC	2	6	197477	197482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_010581	GACA	2	8	197520	197527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_010581	CT	4	8	197569	197576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_010581	ATCAG	2	10	197589	197598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4123	NC_010581	TTC	2	6	197669	197674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_010581	GC	4	8	197852	197859	0 %	0 %	50 %	50 %	182677166
4125	NC_010581	GC	3	6	197868	197873	0 %	0 %	50 %	50 %	182677166
4126	NC_010581	CG	4	8	197901	197908	0 %	0 %	50 %	50 %	182677166
4127	NC_010581	ACA	2	6	197959	197964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677166
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4129	NC_010581	TTA	2	6	198071	198076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677166
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4224	NC_010581	CGA	2	6	202274	202279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4237	NC_010581	GA	3	6	203050	203055	50 %	0 %	50 %	0 %	182677171
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4241	NC_010581	GCG	2	6	203320	203325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4242	NC_010581	ATT	3	9	203381	203389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_010581	T	9	9	203412	203420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_010581	GTAAA	2	10	203421	203430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_010581	TTC	2	6	203441	203446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_010581	AG	4	8	203466	203473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_010581	AAGCG	2	10	203527	203536	40 %	0 %	40 %	20 %	182677172
4248	NC_010581	GAA	2	6	203555	203560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677172
4249	NC_010581	CGT	2	6	203695	203700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677172
4250	NC_010581	TCCTG	2	10	203746	203755	0 %	40 %	20 %	40 %	182677172
4251	NC_010581	AAG	2	6	203757	203762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677172
4252	NC_010581	TCG	2	6	203769	203774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677172
4253	NC_010581	CAGC	2	8	203857	203864	25 %	0 %	25 %	50 %	182677172
4254	NC_010581	CCAT	2	8	203942	203949	25 %	25 %	0 %	50 %	182677172
4255	NC_010581	ATG	2	6	204057	204062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677172
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4257	NC_010581	CATG	2	8	204088	204095	25 %	25 %	25 %	25 %	182677172
4258	NC_010581	ATC	2	6	204131	204136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677172
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4262	NC_010581	GTCG	2	8	204388	204395	0 %	25 %	50 %	25 %	182677172
4263	NC_010581	TGAGGC	2	12	204418	204429	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182677172
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4269	NC_010581	CGT	2	6	204811	204816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677172
4270	NC_010581	TCGCC	2	10	204847	204856	0 %	20 %	20 %	60 %	182677172
4271	NC_010581	AC	3	6	204924	204929	50 %	0 %	0 %	50 %	182677172
4272	NC_010581	GCA	2	6	204944	204949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677172
4273	NC_010581	GTC	2	6	205043	205048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677172
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4277	NC_010581	GGCTT	2	10	205214	205223	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4278	NC_010581	CG	3	6	205336	205341	0 %	0 %	50 %	50 %	182677173
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4285	NC_010581	GC	3	6	205661	205666	0 %	0 %	50 %	50 %	182677173
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4296	NC_010581	ATC	2	6	206261	206266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4346	NC_010581	GGA	2	6	209204	209209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4347	NC_010581	GAC	2	6	209218	209223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677176
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4361	NC_010581	GT	3	6	209898	209903	0 %	50 %	50 %	0 %	182677176
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4365	NC_010581	TCA	2	6	210156	210161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677176
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4368	NC_010581	CGG	2	6	210219	210224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677176
4369	NC_010581	TCG	2	6	210276	210281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677176
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4371	NC_010581	TCG	2	6	210321	210326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677176
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4477	NC_010581	TGG	2	6	214995	215000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677180
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4481	NC_010581	GAC	2	6	215240	215245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4492	NC_010581	GATC	2	8	215759	215766	25 %	25 %	25 %	25 %	182677181
4493	NC_010581	C	6	6	215840	215845	0 %	0 %	0 %	100 %	182677181
4494	NC_010581	CTT	2	6	215849	215854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677181
4495	NC_010581	GCT	2	6	215911	215916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677181
4496	NC_010581	ATG	2	6	215943	215948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677181
4497	NC_010581	TCC	2	6	215952	215957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677181
4498	NC_010581	GCG	2	6	215977	215982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677181
4499	NC_010581	CTG	2	6	216068	216073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677181
4500	NC_010581	CCA	2	6	216082	216087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677181

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