MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010581	TGA	2	6	168462	168467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3502	NC_010581	CAGC	2	8	168474	168481	25 %	0 %	25 %	50 %	182677140
3503	NC_010581	CG	3	6	168540	168545	0 %	0 %	50 %	50 %	182677140
3504	NC_010581	TG	4	8	168672	168679	0 %	50 %	50 %	0 %	182677140
3505	NC_010581	CGC	2	6	168685	168690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3506	NC_010581	CTT	2	6	168763	168768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677140
3507	NC_010581	GCT	2	6	168783	168788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677140
3508	NC_010581	GCC	2	6	168789	168794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
3509	NC_010581	GCCA	2	8	168911	168918	25 %	0 %	25 %	50 %	182677140
3510	NC_010581	AGA	2	6	168984	168989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677140
3511	NC_010581	GTTTG	2	10	169038	169047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_010581	ATC	2	6	169076	169081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010581	CGA	2	6	169106	169111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_010581	GATC	2	8	169124	169131	25 %	25 %	25 %	25 %	182677141
3515	NC_010581	CAT	2	6	169228	169233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677141
3516	NC_010581	TTA	2	6	169284	169289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677141
3517	NC_010581	TCG	2	6	169290	169295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677141
3518	NC_010581	GCTC	2	8	169410	169417	0 %	25 %	25 %	50 %	182677141
3519	NC_010581	GGTC	2	8	169426	169433	0 %	25 %	50 %	25 %	182677141
3520	NC_010581	AGC	2	6	169464	169469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677141
3521	NC_010581	TTC	2	6	169515	169520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677141
3522	NC_010581	GAG	2	6	169550	169555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677141
3523	NC_010581	CGC	2	6	169568	169573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677141
3524	NC_010581	TTC	2	6	169622	169627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677141
3525	NC_010581	GCTTC	2	10	169859	169868	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3526	NC_010581	TCGGG	2	10	169891	169900	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_010581	CAT	2	6	169967	169972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_010581	AGG	2	6	169987	169992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_010581	CTCA	2	8	170055	170062	25 %	25 %	0 %	50 %	182677142
3530	NC_010581	TCG	2	6	170224	170229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3531	NC_010581	CGCA	2	8	170233	170240	25 %	0 %	25 %	50 %	182677142
3532	NC_010581	GC	3	6	170254	170259	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3533	NC_010581	TCT	2	6	170263	170268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677142
3534	NC_010581	AAT	2	6	170273	170278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677142
3535	NC_010581	GGC	2	6	170362	170367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3536	NC_010581	ACG	2	6	170374	170379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3537	NC_010581	GCA	2	6	170450	170455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3538	NC_010581	TCGGCG	2	12	170531	170542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182677142
3539	NC_010581	TTC	2	6	170544	170549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677142
3540	NC_010581	GAC	2	6	170559	170564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3541	NC_010581	CAC	2	6	170577	170582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677142
3542	NC_010581	CAGG	2	8	170615	170622	25 %	0 %	50 %	25 %	182677142
3543	NC_010581	CGATC	2	10	170630	170639	20 %	20 %	20 %	40 %	182677142
3544	NC_010581	CCAGCG	2	12	170661	170672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677142
3545	NC_010581	GCG	2	6	170705	170710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3546	NC_010581	GA	3	6	170740	170745	50 %	0 %	50 %	0 %	182677142
3547	NC_010581	CG	3	6	170915	170920	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3548	NC_010581	GCC	2	6	170963	170968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3549	NC_010581	CGA	2	6	170999	171004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3550	NC_010581	CTG	2	6	171033	171038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3551	NC_010581	CTG	2	6	171077	171082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3552	NC_010581	AGGG	2	8	171103	171110	25 %	0 %	75 %	0 %	182677142
3553	NC_010581	CG	3	6	171127	171132	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3554	NC_010581	GATC	2	8	171158	171165	25 %	25 %	25 %	25 %	182677142
3555	NC_010581	GCTT	2	8	171174	171181	0 %	50 %	25 %	25 %	182677142
3556	NC_010581	CGA	2	6	171194	171199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3557	NC_010581	GCC	2	6	171226	171231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3558	NC_010581	GCC	3	9	171319	171327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677142
3559	NC_010581	GCG	2	6	171352	171357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3560	NC_010581	CG	3	6	171398	171403	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3561	NC_010581	TGGC	2	8	171518	171525	0 %	25 %	50 %	25 %	182677142
3562	NC_010581	GC	3	6	171626	171631	0 %	0 %	50 %	50 %	182677142
3563	NC_010581	GACC	2	8	171633	171640	25 %	0 %	25 %	50 %	182677142
3564	NC_010581	GT	3	6	171644	171649	0 %	50 %	50 %	0 %	182677142
3565	NC_010581	TCG	2	6	171655	171660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3566	NC_010581	TGA	2	6	171686	171691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677142
3567	NC_010581	GCT	2	6	171733	171738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677142
3568	NC_010581	ATC	2	6	171808	171813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677142
3569	NC_010581	AGGCG	2	10	171818	171827	20 %	0 %	60 %	20 %	182677142
3570	NC_010581	CGG	2	6	171842	171847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677142
3571	NC_010581	ATTC	2	8	171918	171925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_010581	GGC	2	6	172050	172055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3573	NC_010581	GC	3	6	172182	172187	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3574	NC_010581	GAT	2	6	172230	172235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677143
3575	NC_010581	TCA	3	9	172273	172281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677143
3576	NC_010581	CG	3	6	172334	172339	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3577	NC_010581	G	6	6	172361	172366	0 %	0 %	100 %	0 %	182677143
3578	NC_010581	CGG	2	6	172368	172373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3579	NC_010581	GCG	2	6	172402	172407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3580	NC_010581	AGC	2	6	172516	172521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3581	NC_010581	TCC	2	6	172561	172566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677143
3582	NC_010581	ATGG	2	8	172638	172645	25 %	25 %	50 %	0 %	182677143
3583	NC_010581	ATA	2	6	172662	172667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677143
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3585	NC_010581	GATCG	2	10	172767	172776	20 %	20 %	40 %	20 %	182677143
3586	NC_010581	GC	3	6	172795	172800	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3587	NC_010581	GCC	2	6	172857	172862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677143
3588	NC_010581	CGA	2	6	172871	172876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3589	NC_010581	GGAT	2	8	172934	172941	25 %	25 %	50 %	0 %	182677143
3590	NC_010581	CGA	2	6	172943	172948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3591	NC_010581	GC	3	6	172961	172966	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3592	NC_010581	TGA	2	6	172979	172984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677143
3593	NC_010581	GA	3	6	173005	173010	50 %	0 %	50 %	0 %	182677143
3594	NC_010581	GAG	2	6	173061	173066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677143
3595	NC_010581	GA	3	6	173152	173157	50 %	0 %	50 %	0 %	182677143
3596	NC_010581	GCG	2	6	173181	173186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3597	NC_010581	ACG	2	6	173263	173268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677143
3598	NC_010581	CGG	2	6	173273	173278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3599	NC_010581	GC	3	6	173284	173289	0 %	0 %	50 %	50 %	182677143
3600	NC_010581	GGC	2	6	173292	173297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3601	NC_010581	CCTT	2	8	173353	173360	0 %	50 %	0 %	50 %	182677143
3602	NC_010581	AGA	2	6	173419	173424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677143
3603	NC_010581	GCG	2	6	173429	173434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3604	NC_010581	GGC	2	6	173552	173557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677143
3605	NC_010581	ATC	3	9	173568	173576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677143
3606	NC_010581	GATC	2	8	173642	173649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_010581	GCTC	2	8	173655	173662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_010581	CTC	2	6	173687	173692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_010581	CGATCG	2	12	173802	173813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010581	GAA	2	6	173863	173868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_010581	TTC	2	6	173899	173904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_010581	T	6	6	173979	173984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_010581	CG	3	6	174139	174144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_010581	GAT	2	6	174148	174153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_010581	GTC	2	6	174166	174171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_010581	ATG	2	6	174211	174216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_010581	GAC	2	6	174217	174222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_010581	TTTCGC	2	12	174317	174328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182677144
3619	NC_010581	GCG	2	6	174348	174353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677144
3620	NC_010581	G	6	6	174359	174364	0 %	0 %	100 %	0 %	182677144
3621	NC_010581	GCG	2	6	174510	174515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677144
3622	NC_010581	GAA	2	6	174519	174524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677144
3623	NC_010581	T	6	6	174748	174753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3625	NC_010581	TCG	2	6	174825	174830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677145
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3747	NC_010581	GCC	2	6	179894	179899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3990	NC_010581	GCAG	2	8	191342	191349	25 %	0 %	50 %	25 %	182677162
3991	NC_010581	CTGG	2	8	191375	191382	0 %	25 %	50 %	25 %	182677162
3992	NC_010581	CG	3	6	191401	191406	0 %	0 %	50 %	50 %	182677162
3993	NC_010581	GCCT	2	8	191408	191415	0 %	25 %	25 %	50 %	182677162
3994	NC_010581	CGATCT	2	12	191441	191452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182677162
3995	NC_010581	CG	3	6	191539	191544	0 %	0 %	50 %	50 %	182677162
3996	NC_010581	GA	3	6	191560	191565	50 %	0 %	50 %	0 %	182677162
3997	NC_010581	CTCTCG	2	12	191668	191679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182677163
3998	NC_010581	TCT	2	6	191799	191804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677163
3999	NC_010581	TGT	2	6	191876	191881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677163
4000	NC_010581	TCG	2	6	191907	191912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677163

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