MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010581	GCC	3	9	146003	146011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677125
3002	NC_010581	CAA	2	6	146076	146081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677125
3003	NC_010581	GC	3	6	146146	146151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_010581	ATA	2	6	146216	146221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010581	GTC	2	6	146309	146314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010581	CAAT	2	8	146391	146398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_010581	CAA	2	6	146444	146449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010581	GTTT	2	8	146812	146819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010581	TTC	2	6	146847	146852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_010581	AT	3	6	146883	146888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010581	CGC	2	6	146956	146961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_010581	CTT	2	6	146998	147003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010581	GA	3	6	147005	147010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010581	GA	3	6	147122	147127	50 %	0 %	50 %	0 %	182677126
3015	NC_010581	GCG	2	6	147128	147133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677126
3016	NC_010581	GGATC	2	10	147161	147170	20 %	20 %	40 %	20 %	182677126
3017	NC_010581	G	7	7	147176	147182	0 %	0 %	100 %	0 %	182677126
3018	NC_010581	CATGG	2	10	147227	147236	20 %	20 %	40 %	20 %	182677126
3019	NC_010581	CG	3	6	147278	147283	0 %	0 %	50 %	50 %	182677126
3020	NC_010581	TCG	2	6	147306	147311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677126
3021	NC_010581	GCC	2	6	147350	147355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677126
3022	NC_010581	GC	3	6	147413	147418	0 %	0 %	50 %	50 %	182677126
3023	NC_010581	CGC	2	6	147423	147428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677126
3024	NC_010581	CAT	2	6	147433	147438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677126
3025	NC_010581	GCG	2	6	147465	147470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677126
3026	NC_010581	GC	4	8	147638	147645	0 %	0 %	50 %	50 %	182677126
3027	NC_010581	CTC	2	6	147650	147655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677126
3028	NC_010581	GGA	2	6	147685	147690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677126
3029	NC_010581	GC	3	6	147726	147731	0 %	0 %	50 %	50 %	182677126
3030	NC_010581	CGC	2	6	147787	147792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677126
3031	NC_010581	GCG	3	9	147830	147838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677126
3032	NC_010581	TCA	2	6	147907	147912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677126
3033	NC_010581	CT	3	6	147921	147926	0 %	50 %	0 %	50 %	182677126
3034	NC_010581	GC	3	6	147982	147987	0 %	0 %	50 %	50 %	182677127
3035	NC_010581	CG	3	6	147993	147998	0 %	0 %	50 %	50 %	182677127
3036	NC_010581	CAA	2	6	148010	148015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677127
3037	NC_010581	CCG	2	6	148266	148271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677127
3038	NC_010581	GAGC	2	8	148276	148283	25 %	0 %	50 %	25 %	182677127
3039	NC_010581	CGC	2	6	148340	148345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677127
3040	NC_010581	GTG	2	6	148359	148364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677127
3041	NC_010581	TGG	2	6	148384	148389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677127
3042	NC_010581	GGC	2	6	148487	148492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677127
3043	NC_010581	CAT	2	6	148501	148506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677127
3044	NC_010581	TGA	2	6	148507	148512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677127
3045	NC_010581	ATA	2	6	148547	148552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677127
3046	NC_010581	GAG	2	6	148561	148566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677127
3047	NC_010581	GCG	2	6	148629	148634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677127
3048	NC_010581	A	6	6	148647	148652	100 %	0 %	0 %	0 %	182677127
3049	NC_010581	CCG	2	6	148653	148658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677127
3050	NC_010581	CG	3	6	148750	148755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_010581	A	6	6	148791	148796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010581	A	6	6	148807	148812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010581	GTG	2	6	148815	148820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010581	TG	3	6	148819	148824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010581	GCG	3	9	148853	148861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677128
3056	NC_010581	TCT	2	6	148931	148936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677128
3057	NC_010581	TCA	2	6	148979	148984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677128
3058	NC_010581	AGC	2	6	148997	149002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677128
3059	NC_010581	GC	4	8	149006	149013	0 %	0 %	50 %	50 %	182677128
3060	NC_010581	CTT	3	9	149046	149054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677128
3061	NC_010581	CTTC	2	8	149220	149227	0 %	50 %	0 %	50 %	182677128
3062	NC_010581	TGC	2	6	149238	149243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677128
3063	NC_010581	CGACA	2	10	149271	149280	40 %	0 %	20 %	40 %	182677128
3064	NC_010581	CGG	3	9	149283	149291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677128
3065	NC_010581	TGGC	2	8	149304	149311	0 %	25 %	50 %	25 %	182677128
3066	NC_010581	AGCAC	2	10	149324	149333	40 %	0 %	20 %	40 %	182677128
3067	NC_010581	TCA	2	6	149337	149342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677128
3068	NC_010581	CGG	2	6	149394	149399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677128
3069	NC_010581	TCG	2	6	149429	149434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677128
3070	NC_010581	CGA	2	6	149436	149441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677128
3071	NC_010581	CG	3	6	149460	149465	0 %	0 %	50 %	50 %	182677128
3072	NC_010581	GTG	2	6	149498	149503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677128
3073	NC_010581	ACGGG	2	10	149612	149621	20 %	0 %	60 %	20 %	182677128
3074	NC_010581	GGCG	2	8	149653	149660	0 %	0 %	75 %	25 %	182677128
3075	NC_010581	CCA	2	6	149681	149686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677128
3076	NC_010581	CGG	2	6	149739	149744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677128
3077	NC_010581	CTT	2	6	149858	149863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_010581	GAT	2	6	149902	149907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010581	CAA	2	6	149910	149915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_010581	A	6	6	149926	149931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010581	AC	3	6	149949	149954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_010581	GTGAA	2	10	150069	150078	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010581	T	6	6	150079	150084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010581	TA	3	6	150151	150156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010581	CG	3	6	150175	150180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_010581	GGC	2	6	150212	150217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_010581	TCCG	2	8	150222	150229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_010581	GGT	2	6	150257	150262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010581	GGTAA	2	10	150292	150301	40 %	20 %	40 %	0 %	182677129
3090	NC_010581	CAC	2	6	150318	150323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677129
3091	NC_010581	GAC	2	6	150351	150356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3092	NC_010581	TCG	2	6	150434	150439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3093	NC_010581	CTT	2	6	150483	150488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677129
3094	NC_010581	AAG	2	6	150535	150540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
3095	NC_010581	TCC	2	6	150644	150649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677129
3096	NC_010581	AGA	2	6	150650	150655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
3097	NC_010581	CCG	2	6	150665	150670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677129
3098	NC_010581	TCA	2	6	150704	150709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677129
3099	NC_010581	ACG	2	6	150728	150733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3100	NC_010581	CCA	2	6	150746	150751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677129
3101	NC_010581	ATC	2	6	150790	150795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677129
3102	NC_010581	GCC	2	6	150808	150813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677129
3103	NC_010581	AAG	2	6	150835	150840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
3104	NC_010581	CGG	2	6	150870	150875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677129
3105	NC_010581	CGG	2	6	150954	150959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677129
3106	NC_010581	TCG	2	6	150980	150985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3107	NC_010581	AAGA	2	8	151006	151013	75 %	0 %	25 %	0 %	182677129
3108	NC_010581	AAG	2	6	151030	151035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
3109	NC_010581	GAAG	2	8	151059	151066	50 %	0 %	50 %	0 %	182677129
3110	NC_010581	CCG	2	6	151133	151138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677129
3111	NC_010581	CG	3	6	151175	151180	0 %	0 %	50 %	50 %	182677129
3112	NC_010581	CGA	2	6	151200	151205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3113	NC_010581	AGA	2	6	151214	151219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
3114	NC_010581	TC	3	6	151257	151262	0 %	50 %	0 %	50 %	182677129
3115	NC_010581	GGCG	2	8	151263	151270	0 %	0 %	75 %	25 %	182677129
3116	NC_010581	GTC	2	6	151282	151287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677129
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3119	NC_010581	GGT	2	6	151380	151385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677129
3120	NC_010581	CGGCG	2	10	151392	151401	0 %	0 %	60 %	40 %	182677129
3121	NC_010581	CTC	2	6	151444	151449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677129
3122	NC_010581	CTCG	2	8	151464	151471	0 %	25 %	25 %	50 %	182677129
3123	NC_010581	ACG	2	6	151519	151524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677129
3124	NC_010581	AAG	2	6	151534	151539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677129
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3126	NC_010581	ACA	2	6	151622	151627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677129
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3236	NC_010581	CGA	2	6	156424	156429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677134
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3249	NC_010581	GGA	2	6	156772	156777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677134
3250	NC_010581	TCA	2	6	156792	156797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677134
3251	NC_010581	GC	4	8	156813	156820	0 %	0 %	50 %	50 %	182677134
3252	NC_010581	GATC	2	8	156829	156836	25 %	25 %	25 %	25 %	182677134
3253	NC_010581	TTGG	2	8	156851	156858	0 %	50 %	50 %	0 %	182677134
3254	NC_010581	CGA	2	6	156861	156866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677134
3255	NC_010581	CGGG	2	8	156869	156876	0 %	0 %	75 %	25 %	182677134
3256	NC_010581	ACG	2	6	156884	156889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677134
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3260	NC_010581	GGT	2	6	157214	157219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677134
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3262	NC_010581	CG	3	6	157260	157265	0 %	0 %	50 %	50 %	182677134
3263	NC_010581	ACGC	2	8	157318	157325	25 %	0 %	25 %	50 %	182677134
3264	NC_010581	CG	3	6	157326	157331	0 %	0 %	50 %	50 %	182677134
3265	NC_010581	CGC	2	6	157344	157349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677134
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3270	NC_010581	TTC	2	6	157589	157594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677135
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3282	NC_010581	GC	3	6	158245	158250	0 %	0 %	50 %	50 %	182677135
3283	NC_010581	TCG	2	6	158257	158262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677135
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3290	NC_010581	TGA	2	6	158512	158517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677135
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3293	NC_010581	CGC	2	6	158627	158632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677135
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3299	NC_010581	GAT	2	6	159062	159067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677135
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3332	NC_010581	TTCT	2	8	161015	161022	0 %	75 %	0 %	25 %	182677137
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3335	NC_010581	AGG	2	6	161216	161221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3336	NC_010581	GGC	2	6	161263	161268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
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3343	NC_010581	TGGCA	2	10	161526	161535	20 %	20 %	40 %	20 %	182677138
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3353	NC_010581	TGC	2	6	161887	161892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677138
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3357	NC_010581	CAC	2	6	162072	162077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677138
3358	NC_010581	CTGGC	2	10	162111	162120	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
3359	NC_010581	CTGGC	2	10	162321	162330	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
3360	NC_010581	GCCTG	2	10	162337	162346	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
3361	NC_010581	CG	3	6	162394	162399	0 %	0 %	50 %	50 %	182677138
3362	NC_010581	GCC	2	6	162430	162435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677138
3363	NC_010581	CGA	2	6	162470	162475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677138
3364	NC_010581	CGGCG	2	10	162495	162504	0 %	0 %	60 %	40 %	182677138
3365	NC_010581	TGG	2	6	162524	162529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677138
3366	NC_010581	GCG	2	6	162533	162538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
3367	NC_010581	CGG	2	6	162551	162556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
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3370	NC_010581	CGG	3	9	162633	162641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
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3372	NC_010581	GCG	3	9	162719	162727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
3373	NC_010581	GGC	2	6	162730	162735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
3374	NC_010581	GGC	2	6	162760	162765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
3375	NC_010581	GAGGCG	2	12	162785	162796	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	182677138
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3393	NC_010581	CGG	2	6	163814	163819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677138
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3398	NC_010581	TGAA	2	8	164065	164072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3474	NC_010581	CGG	2	6	167236	167241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
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3478	NC_010581	CG	3	6	167472	167477	0 %	0 %	50 %	50 %	182677140
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3482	NC_010581	CGC	2	6	167625	167630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677140
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3486	NC_010581	CAT	2	6	167866	167871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677140
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3489	NC_010581	T	6	6	167996	168001	0 %	100 %	0 %	0 %	182677140
3490	NC_010581	CGG	2	6	168023	168028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677140
3491	NC_010581	TTC	2	6	168197	168202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677140
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3493	NC_010581	TGA	2	6	168290	168295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3494	NC_010581	GAT	2	6	168313	168318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
3495	NC_010581	GAT	2	6	168322	168327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677140
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