MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010581	TTTA	2	8	46210	46217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010581	GGCCG	2	10	46244	46253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_010581	CT	3	6	46371	46376	0 %	50 %	0 %	50 %	182677048
1004	NC_010581	CGG	2	6	46381	46386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677048
1005	NC_010581	GTCGAG	2	12	46422	46433	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182677048
1006	NC_010581	CGT	2	6	46496	46501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677048
1007	NC_010581	CCGG	2	8	46510	46517	0 %	0 %	50 %	50 %	182677048
1008	NC_010581	CGC	2	6	46591	46596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_010581	AGCCC	2	10	46696	46705	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1010	NC_010581	A	6	6	46714	46719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010581	GCC	2	6	46754	46759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677049
1012	NC_010581	TCG	2	6	46800	46805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677049
1013	NC_010581	GCC	2	6	46944	46949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677049
1014	NC_010581	TGA	2	6	46969	46974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677049
1015	NC_010581	GGT	2	6	46975	46980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677049
1016	NC_010581	TGCC	2	8	46987	46994	0 %	25 %	25 %	50 %	182677049
1017	NC_010581	T	6	6	47026	47031	0 %	100 %	0 %	0 %	182677049
1018	NC_010581	CGG	2	6	47041	47046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677049
1019	NC_010581	CATC	2	8	47071	47078	25 %	25 %	0 %	50 %	182677049
1020	NC_010581	CTTC	2	8	47116	47123	0 %	50 %	0 %	50 %	182677049
1021	NC_010581	CAT	2	6	47128	47133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677049
1022	NC_010581	ATT	2	6	47177	47182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677049
1023	NC_010581	CAT	2	6	47225	47230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677049
1024	NC_010581	ATCGA	2	10	47304	47313	40 %	20 %	20 %	20 %	182677049
1025	NC_010581	TGA	3	9	47401	47409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677049
1026	NC_010581	GCC	3	9	47423	47431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677049
1027	NC_010581	TCC	2	6	47442	47447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677049
1028	NC_010581	AGGA	2	8	47454	47461	50 %	0 %	50 %	0 %	182677049
1029	NC_010581	AG	3	6	47529	47534	50 %	0 %	50 %	0 %	182677049
1030	NC_010581	CAT	2	6	47557	47562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677049
1031	NC_010581	GC	3	6	47595	47600	0 %	0 %	50 %	50 %	182677049
1032	NC_010581	TGG	2	6	47646	47651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677049
1033	NC_010581	GGCGCC	2	12	47693	47704	0 %	0 %	50 %	50 %	182677049
1034	NC_010581	ATC	2	6	47712	47717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677049
1035	NC_010581	GAT	2	6	47774	47779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677049
1036	NC_010581	GCGG	2	8	47852	47859	0 %	0 %	75 %	25 %	182677049
1037	NC_010581	GGA	2	6	47908	47913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677049
1038	NC_010581	CTC	2	6	47924	47929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677049
1039	NC_010581	GCG	2	6	48000	48005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677049
1040	NC_010581	GCG	2	6	48032	48037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677049
1041	NC_010581	CTG	2	6	48077	48082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677049
1042	NC_010581	CAG	2	6	48099	48104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677049
1043	NC_010581	TGG	2	6	48124	48129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677049
1044	NC_010581	GCC	2	6	48144	48149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677049
1045	NC_010581	ATG	2	6	48162	48167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677049
1046	NC_010581	GAC	2	6	48227	48232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677049
1047	NC_010581	TGA	2	6	48274	48279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677049
1048	NC_010581	T	7	7	48343	48349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010581	GCG	2	6	48350	48355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010581	GACA	2	8	48384	48391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_010581	TGA	2	6	48434	48439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010581	GT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010581	AAAG	2	8	48535	48542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010581	ACTA	2	8	48545	48552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_010581	GAG	2	6	48680	48685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677050
1056	NC_010581	CG	3	6	48786	48791	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1057	NC_010581	TC	3	6	48796	48801	0 %	50 %	0 %	50 %	182677050
1058	NC_010581	CG	3	6	48876	48881	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1059	NC_010581	CGC	2	6	48895	48900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677050
1060	NC_010581	CGG	2	6	48954	48959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677050
1061	NC_010581	CG	3	6	48960	48965	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1062	NC_010581	GC	3	6	49067	49072	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1063	NC_010581	GCC	2	6	49097	49102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677050
1064	NC_010581	GCC	2	6	49112	49117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677050
1065	NC_010581	GC	3	6	49168	49173	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1066	NC_010581	GCCGCT	2	12	49195	49206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182677050
1067	NC_010581	ATC	3	9	49239	49247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677050
1068	NC_010581	TGA	2	6	49257	49262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677050
1069	NC_010581	GGC	2	6	49300	49305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677050
1070	NC_010581	CGG	2	6	49330	49335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677050
1071	NC_010581	CGA	2	6	49342	49347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677050
1072	NC_010581	CGA	2	6	49372	49377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677050
1073	NC_010581	ATT	2	6	49413	49418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677050
1074	NC_010581	TGA	2	6	49431	49436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677050
1075	NC_010581	GGC	2	6	49495	49500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677050
1076	NC_010581	TGGC	2	8	49599	49606	0 %	25 %	50 %	25 %	182677050
1077	NC_010581	ATC	2	6	49721	49726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677050
1078	NC_010581	GC	3	6	49844	49849	0 %	0 %	50 %	50 %	182677050
1079	NC_010581	GCC	2	6	49914	49919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677050
1080	NC_010581	A	6	6	50068	50073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010581	GAT	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010581	ACG	2	6	50169	50174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_010581	CTTG	2	8	50208	50215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_010581	CCT	2	6	50262	50267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677051
1085	NC_010581	CGGC	2	8	50289	50296	0 %	0 %	50 %	50 %	182677051
1086	NC_010581	GCC	2	6	50301	50306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677051
1087	NC_010581	GCC	3	9	50310	50318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677051
1088	NC_010581	GC	3	6	50330	50335	0 %	0 %	50 %	50 %	182677051
1089	NC_010581	GGC	2	6	50407	50412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677051
1090	NC_010581	CGG	2	6	50433	50438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677051
1091	NC_010581	A	6	6	50506	50511	100 %	0 %	0 %	0 %	182677051
1092	NC_010581	TCTT	2	8	50512	50519	0 %	75 %	0 %	25 %	182677051
1093	NC_010581	ATC	2	6	50585	50590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010581	GC	3	6	50623	50628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_010581	TCG	2	6	50630	50635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010581	CAT	2	6	50757	50762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677052
1097	NC_010581	CGA	2	6	50857	50862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677052
1098	NC_010581	GGC	2	6	50888	50893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677052
1099	NC_010581	TGC	2	6	50953	50958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677052
1100	NC_010581	GTC	2	6	50991	50996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677052
1101	NC_010581	CG	3	6	51021	51026	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1102	NC_010581	GCCG	2	8	51035	51042	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1103	NC_010581	GC	3	6	51285	51290	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1104	NC_010581	GCGG	2	8	51398	51405	0 %	0 %	75 %	25 %	182677052
1105	NC_010581	GCCAT	2	10	51436	51445	20 %	20 %	20 %	40 %	182677052
1106	NC_010581	TGA	2	6	51494	51499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677052
1107	NC_010581	ATC	2	6	51534	51539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677052
1108	NC_010581	TGG	2	6	51551	51556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677052
1109	NC_010581	CGGC	2	8	51584	51591	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1110	NC_010581	TCG	2	6	51595	51600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677052
1111	NC_010581	TCG	2	6	51667	51672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677052
1112	NC_010581	GCG	2	6	51675	51680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677052
1113	NC_010581	ATGA	2	8	51681	51688	50 %	25 %	25 %	0 %	182677052
1114	NC_010581	GCC	2	6	51740	51745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677052
1115	NC_010581	CG	3	6	51818	51823	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1116	NC_010581	CCG	2	6	51868	51873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677052
1117	NC_010581	GGTGC	2	10	51882	51891	0 %	20 %	60 %	20 %	182677052
1118	NC_010581	CG	3	6	51967	51972	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
1119	NC_010581	TTC	2	6	52027	52032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_010581	CTT	2	6	52042	52047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010581	CCG	2	6	52097	52102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677053
1122	NC_010581	CGG	3	9	52106	52114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677053
1123	NC_010581	TGA	2	6	52128	52133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677053
1124	NC_010581	CGG	2	6	52141	52146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677053
1125	NC_010581	CGC	2	6	52256	52261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677053
1126	NC_010581	TC	3	6	52302	52307	0 %	50 %	0 %	50 %	182677053
1127	NC_010581	GCCT	2	8	52309	52316	0 %	25 %	25 %	50 %	182677053
1128	NC_010581	CGG	2	6	52345	52350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677053
1129	NC_010581	CAT	2	6	52390	52395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677053
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1131	NC_010581	TCG	2	6	52529	52534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677053
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1134	NC_010581	CGG	2	6	52625	52630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677053
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1137	NC_010581	CCGG	2	8	52706	52713	0 %	0 %	50 %	50 %	182677053
1138	NC_010581	CGG	2	6	52730	52735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677053
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1143	NC_010581	CG	3	6	53045	53050	0 %	0 %	50 %	50 %	182677053
1144	NC_010581	GAT	2	6	53092	53097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677053
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1242	NC_010581	CCA	2	6	57651	57656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677056
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1246	NC_010581	AAG	2	6	57917	57922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_010581	AAC	2	6	57976	57981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_010581	GAT	2	6	58017	58022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_010581	GAT	2	6	58037	58042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_010581	GATG	2	8	58051	58058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_010581	GA	3	6	58573	58578	50 %	0 %	50 %	0 %	182677057
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1255	NC_010581	GCC	2	6	58648	58653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677057
1256	NC_010581	GCG	2	6	58654	58659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677057
1257	NC_010581	GAT	2	6	58676	58681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677057
1258	NC_010581	GAT	2	6	58745	58750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677057
1259	NC_010581	CGG	2	6	58768	58773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677057
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1313	NC_010581	TA	3	6	62385	62390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1362	NC_010581	GAGTTG	2	12	64761	64772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	182677064
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1368	NC_010581	GAT	2	6	65174	65179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1369	NC_010581	CCT	2	6	65240	65245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1370	NC_010581	TCT	2	6	65307	65312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1371	NC_010581	CCGC	3	12	65405	65416	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1372	NC_010581	CAT	2	6	65426	65431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1374	NC_010581	AGTG	2	8	65474	65481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_010581	GCC	2	6	65648	65653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677065
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1377	NC_010581	CG	3	6	65754	65759	0 %	0 %	50 %	50 %	182677065
1378	NC_010581	GCC	2	6	65831	65836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677065
1379	NC_010581	CAT	2	6	65912	65917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677065
1380	NC_010581	GAA	2	6	65922	65927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677065
1381	NC_010581	CGC	3	9	65936	65944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677065
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