MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010581	TTGCC	2	10	509570	509579	0 %	40 %	20 %	40 %	182677449
10502	NC_010581	CCG	2	6	509618	509623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677449
10503	NC_010581	TCT	2	6	509658	509663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677449
10504	NC_010581	TCG	2	6	509733	509738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677449
10505	NC_010581	GCCGAC	2	12	509767	509778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677449
10506	NC_010581	GCC	2	6	509797	509802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677449
10507	NC_010581	TGC	2	6	509828	509833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677449
10508	NC_010581	GTC	2	6	509941	509946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677449
10509	NC_010581	TTG	2	6	510008	510013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677449
10510	NC_010581	TCC	2	6	510083	510088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677449
10511	NC_010581	GGC	3	9	510141	510149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677449
10512	NC_010581	GA	3	6	510154	510159	50 %	0 %	50 %	0 %	182677449
10513	NC_010581	AAG	2	6	510195	510200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_010581	GAG	2	6	510243	510248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_010581	CG	3	6	510368	510373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_010581	ATC	2	6	510398	510403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_010581	CCT	2	6	510435	510440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_010581	GC	3	6	510477	510482	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10519	NC_010581	CGA	2	6	510541	510546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10520	NC_010581	CGG	2	6	510628	510633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677450
10521	NC_010581	GCT	2	6	510649	510654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10522	NC_010581	GT	4	8	510691	510698	0 %	50 %	50 %	0 %	182677450
10523	NC_010581	ATC	3	9	510741	510749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677450
10524	NC_010581	GCG	2	6	510824	510829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677450
10525	NC_010581	ATG	2	6	510879	510884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677450
10526	NC_010581	CG	3	6	510892	510897	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10527	NC_010581	CG	3	6	510934	510939	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10528	NC_010581	CGC	2	6	510970	510975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677450
10529	NC_010581	ACG	3	9	511026	511034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10530	NC_010581	GAC	2	6	511061	511066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10531	NC_010581	AC	3	6	511132	511137	50 %	0 %	0 %	50 %	182677450
10532	NC_010581	CGC	2	6	511192	511197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677450
10533	NC_010581	CCG	2	6	511221	511226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677450
10534	NC_010581	CCT	2	6	511264	511269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677450
10535	NC_010581	CG	4	8	511278	511285	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10536	NC_010581	GATC	2	8	511369	511376	25 %	25 %	25 %	25 %	182677450
10537	NC_010581	GC	3	6	511408	511413	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10538	NC_010581	CGA	2	6	511456	511461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10539	NC_010581	CGGCTT	2	12	511468	511479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10540	NC_010581	CCA	2	6	511540	511545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677450
10541	NC_010581	CATTGC	2	12	511546	511557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182677450
10542	NC_010581	CAAG	2	8	511645	511652	50 %	0 %	25 %	25 %	182677450
10543	NC_010581	TCG	2	6	511684	511689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10544	NC_010581	TCG	2	6	511812	511817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10545	NC_010581	GCG	2	6	511830	511835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677450
10546	NC_010581	CAC	2	6	511856	511861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677450
10547	NC_010581	GC	3	6	511871	511876	0 %	0 %	50 %	50 %	182677450
10548	NC_010581	CGA	2	6	511903	511908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10549	NC_010581	CGA	2	6	511981	511986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10550	NC_010581	GA	3	6	512010	512015	50 %	0 %	50 %	0 %	182677450
10551	NC_010581	CGC	2	6	512029	512034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677450
10552	NC_010581	CGA	2	6	512059	512064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10553	NC_010581	TTG	2	6	512195	512200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677450
10554	NC_010581	AGG	2	6	512202	512207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677450
10555	NC_010581	CCA	2	6	512212	512217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677450
10556	NC_010581	GTC	2	6	512220	512225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677450
10557	NC_010581	GAT	2	6	512246	512251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677450
10558	NC_010581	CCG	2	6	512308	512313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_010581	CG	3	6	512312	512317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_010581	GAA	2	6	512393	512398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_010581	ACA	2	6	512515	512520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_010581	T	6	6	512521	512526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_010581	TGA	2	6	512659	512664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_010581	GCA	2	6	512727	512732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_010581	GCT	2	6	512739	512744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_010581	GCC	3	9	512959	512967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_010581	GGCT	2	8	513015	513022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_010581	CGAAT	2	10	513034	513043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10569	NC_010581	TTTTA	2	10	513140	513149	20 %	80 %	0 %	0 %	182677451
10570	NC_010581	CGG	2	6	513171	513176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677451
10571	NC_010581	GCC	3	9	513244	513252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677451
10572	NC_010581	GC	4	8	513281	513288	0 %	0 %	50 %	50 %	182677451
10573	NC_010581	TTC	2	6	513541	513546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677451
10574	NC_010581	CATCA	2	10	513558	513567	40 %	20 %	0 %	40 %	182677451
10575	NC_010581	TGG	2	6	513599	513604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677451
10576	NC_010581	ATC	2	6	513633	513638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677451
10577	NC_010581	TCC	2	6	513640	513645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677451
10578	NC_010581	CGG	2	6	513739	513744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677451
10579	NC_010581	CTG	2	6	513753	513758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10580	NC_010581	GCA	2	6	513779	513784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10581	NC_010581	TGGC	2	8	513842	513849	0 %	25 %	50 %	25 %	182677451
10582	NC_010581	GCG	2	6	513908	513913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677451
10583	NC_010581	GCA	3	9	513914	513922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10584	NC_010581	AGA	2	6	513949	513954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677451
10585	NC_010581	GCA	2	6	513956	513961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10586	NC_010581	CAG	2	6	514029	514034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10587	NC_010581	GAC	2	6	514071	514076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10588	NC_010581	CAG	2	6	514098	514103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10589	NC_010581	GGT	3	9	514143	514151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677451
10590	NC_010581	GCCGA	2	10	514171	514180	20 %	0 %	40 %	40 %	182677451
10591	NC_010581	CAG	2	6	514305	514310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10592	NC_010581	TGA	2	6	514379	514384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677451
10593	NC_010581	GAGGCC	2	12	514416	514427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182677451
10594	NC_010581	GTGCC	2	10	514465	514474	0 %	20 %	40 %	40 %	182677451
10595	NC_010581	AGC	2	6	514504	514509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10596	NC_010581	AGGAC	2	10	514532	514541	40 %	0 %	40 %	20 %	182677451
10597	NC_010581	GTC	2	6	514555	514560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10598	NC_010581	ATG	2	6	514579	514584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677451
10599	NC_010581	AGG	2	6	514625	514630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677451
10600	NC_010581	TCA	2	6	514634	514639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677451
10601	NC_010581	TGCTG	2	10	514647	514656	0 %	40 %	40 %	20 %	182677451
10602	NC_010581	GCCGC	2	10	514728	514737	0 %	0 %	40 %	60 %	182677451
10603	NC_010581	CGC	2	6	514763	514768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677451
10604	NC_010581	AGC	2	6	514795	514800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677451
10605	NC_010581	GATC	2	8	514861	514868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10606	NC_010581	GAC	2	6	514898	514903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_010581	CCGTC	2	10	514922	514931	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10608	NC_010581	GT	3	6	515061	515066	0 %	50 %	50 %	0 %	182677452
10609	NC_010581	GCC	2	6	515077	515082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677452
10610	NC_010581	CGC	2	6	515139	515144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677452
10611	NC_010581	CGC	2	6	515208	515213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677452
10612	NC_010581	GCG	2	6	515399	515404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677452
10613	NC_010581	GTCG	2	8	515412	515419	0 %	25 %	50 %	25 %	182677452
10614	NC_010581	CG	3	6	515438	515443	0 %	0 %	50 %	50 %	182677452
10615	NC_010581	GAT	2	6	515498	515503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677452
10616	NC_010581	C	6	6	515525	515530	0 %	0 %	0 %	100 %	182677452
10617	NC_010581	CAAT	2	8	515551	515558	50 %	25 %	0 %	25 %	182677452
10618	NC_010581	GGC	2	6	515559	515564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677452
10619	NC_010581	CCGAG	2	10	515576	515585	20 %	0 %	40 %	40 %	182677452
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10987	NC_010581	CCG	2	6	534762	534767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677469
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