MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010581	GAG	2	6	23295	23300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677022
502	NC_010581	GCC	2	6	23385	23390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677022
503	NC_010581	CGA	2	6	23426	23431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677022
504	NC_010581	GCA	2	6	23445	23450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677022
505	NC_010581	AGGA	2	8	23467	23474	50 %	0 %	50 %	0 %	182677022
506	NC_010581	GCCG	2	8	23543	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	182677022
507	NC_010581	TCC	2	6	23689	23694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677022
508	NC_010581	GTG	2	6	23746	23751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677022
509	NC_010581	CCG	2	6	23752	23757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677022
510	NC_010581	GCC	2	6	23778	23783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677022
511	NC_010581	CAGC	2	8	23793	23800	25 %	0 %	25 %	50 %	182677022
512	NC_010581	GCA	2	6	23801	23806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677022
513	NC_010581	G	7	7	23970	23976	0 %	0 %	100 %	0 %	182677022
514	NC_010581	TGA	2	6	24185	24190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677023
515	NC_010581	ATGG	2	8	24202	24209	25 %	25 %	50 %	0 %	182677023
516	NC_010581	GC	3	6	24294	24299	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
517	NC_010581	CCT	2	6	24300	24305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677023
518	NC_010581	GC	3	6	24306	24311	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
519	NC_010581	GCG	3	9	24325	24333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677023
520	NC_010581	GCG	2	6	24412	24417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677023
521	NC_010581	GTC	2	6	24418	24423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677023
522	NC_010581	GAT	2	6	24442	24447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677023
523	NC_010581	CGAT	2	8	24461	24468	25 %	25 %	25 %	25 %	182677023
524	NC_010581	CCGG	2	8	24501	24508	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
525	NC_010581	GCCT	2	8	24563	24570	0 %	25 %	25 %	50 %	182677023
526	NC_010581	GCC	2	6	24589	24594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677023
527	NC_010581	CGGC	2	8	24602	24609	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
528	NC_010581	GGC	2	6	24697	24702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677023
529	NC_010581	GAT	2	6	24778	24783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677023
530	NC_010581	GC	3	6	24789	24794	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
531	NC_010581	CG	3	6	24834	24839	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
532	NC_010581	CTT	2	6	24885	24890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677023
533	NC_010581	CG	4	8	24892	24899	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
534	NC_010581	CCG	2	6	24992	24997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677023
535	NC_010581	TTC	2	6	25022	25027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677023
536	NC_010581	CCT	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677023
537	NC_010581	CG	3	6	25042	25047	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
538	NC_010581	GC	4	8	25064	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
539	NC_010581	TGA	2	6	25079	25084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677023
540	NC_010581	GGTC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	50 %	25 %	182677023
541	NC_010581	CGC	2	6	25189	25194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677023
542	NC_010581	CAC	2	6	25224	25229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677023
543	NC_010581	GGT	2	6	25252	25257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677023
544	NC_010581	TTC	2	6	25374	25379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010581	CCG	2	6	25435	25440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677024
546	NC_010581	TTC	2	6	25609	25614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677024
547	NC_010581	CGA	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677024
548	NC_010581	GCC	2	6	25795	25800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677025
549	NC_010581	GC	3	6	25815	25820	0 %	0 %	50 %	50 %	182677025
550	NC_010581	CAT	2	6	25854	25859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677025
551	NC_010581	CGT	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677025
552	NC_010581	TGA	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677025
553	NC_010581	CCG	2	6	25945	25950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677025
554	NC_010581	CGG	2	6	25956	25961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677025
555	NC_010581	GCTT	2	8	26015	26022	0 %	50 %	25 %	25 %	182677025
556	NC_010581	CGG	2	6	26073	26078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010581	CGCA	2	8	26105	26112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_010581	GCAA	2	8	26160	26167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_010581	CTGG	2	8	26187	26194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_010581	TGG	2	6	26267	26272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010581	TTCC	2	8	26318	26325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_010581	CAG	2	6	26337	26342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010581	AAC	2	6	26398	26403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010581	AAT	2	6	26442	26447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010581	T	6	6	26464	26469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_010581	ATG	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010581	CGCCT	2	10	26601	26610	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
568	NC_010581	CGG	3	9	26671	26679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677026
569	NC_010581	GGGCCA	2	12	26716	26727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182677026
570	NC_010581	TG	3	6	26738	26743	0 %	50 %	50 %	0 %	182677026
571	NC_010581	CCGG	2	8	26757	26764	0 %	0 %	50 %	50 %	182677026
572	NC_010581	TCG	2	6	26838	26843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677026
573	NC_010581	CCAT	2	8	26883	26890	25 %	25 %	0 %	50 %	182677026
574	NC_010581	GAC	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677026
575	NC_010581	CGT	2	6	26926	26931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677026
576	NC_010581	ATC	2	6	26986	26991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677026
577	NC_010581	CGACC	2	10	27010	27019	20 %	0 %	20 %	60 %	182677026
578	NC_010581	ATG	2	6	27081	27086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677026
579	NC_010581	ATC	2	6	27123	27128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677026
580	NC_010581	CGT	2	6	27205	27210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677026
581	NC_010581	CTG	2	6	27233	27238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677026
582	NC_010581	TGA	2	6	27324	27329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677026
583	NC_010581	CGAA	2	8	27372	27379	50 %	0 %	25 %	25 %	182677026
584	NC_010581	CAT	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677026
585	NC_010581	GAT	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677026
586	NC_010581	TGGC	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	182677026
587	NC_010581	AGC	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677026
588	NC_010581	ACA	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_010581	AGC	2	6	27699	27704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010581	CAG	2	6	27770	27775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677027
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592	NC_010581	GAG	2	6	27849	27854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677027
593	NC_010581	CTT	2	6	27870	27875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677027
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595	NC_010581	CGT	2	6	27889	27894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677027
596	NC_010581	A	6	6	27936	27941	100 %	0 %	0 %	0 %	182677027
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598	NC_010581	ATCG	3	12	27997	28008	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
599	NC_010581	GTTCA	2	10	28021	28030	20 %	40 %	20 %	20 %	182677027
600	NC_010581	GGC	2	6	28060	28065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677027
601	NC_010581	GGC	2	6	28093	28098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677027
602	NC_010581	A	6	6	28151	28156	100 %	0 %	0 %	0 %	182677027
603	NC_010581	ATCG	2	8	28159	28166	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
604	NC_010581	GT	3	6	28191	28196	0 %	50 %	50 %	0 %	182677027
605	NC_010581	CAT	2	6	28228	28233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
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609	NC_010581	GGGA	2	8	28397	28404	25 %	0 %	75 %	0 %	182677027
610	NC_010581	TCCC	2	8	28425	28432	0 %	25 %	0 %	75 %	182677027
611	NC_010581	GGCA	2	8	28497	28504	25 %	0 %	50 %	25 %	182677027
612	NC_010581	CAT	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
613	NC_010581	CG	3	6	28609	28614	0 %	0 %	50 %	50 %	182677027
614	NC_010581	ATG	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677027
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616	NC_010581	ATC	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677027
617	NC_010581	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677027
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619	NC_010581	T	6	6	28843	28848	0 %	100 %	0 %	0 %	182677027
620	NC_010581	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010581	AT	3	6	29012	29017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010581	GCG	2	6	29165	29170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010581	GCA	2	6	29190	29195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010581	AG	3	6	29225	29230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010581	GC	3	6	29301	29306	0 %	0 %	50 %	50 %	182677028
626	NC_010581	GGA	2	6	29333	29338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677028
627	NC_010581	CGG	2	6	29378	29383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677028
628	NC_010581	CTG	2	6	29414	29419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677028
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630	NC_010581	GA	4	8	29457	29464	50 %	0 %	50 %	0 %	182677028
631	NC_010581	CGG	2	6	29507	29512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677028
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