MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010581	TGA	2	6	286872	286877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677248
6002	NC_010581	TCG	2	6	286878	286883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677248
6003	NC_010581	CG	3	6	286932	286937	0 %	0 %	50 %	50 %	182677248
6004	NC_010581	GTT	2	6	286939	286944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677248
6005	NC_010581	A	6	6	286959	286964	100 %	0 %	0 %	0 %	182677248
6006	NC_010581	ATG	2	6	287111	287116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010581	TC	3	6	287185	287190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_010581	GAAG	2	8	287236	287243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_010581	GGC	2	6	287345	287350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_010581	CTT	2	6	287404	287409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677249
6011	NC_010581	GGCAC	2	10	287422	287431	20 %	0 %	40 %	40 %	182677249
6012	NC_010581	GGC	2	6	287454	287459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677249
6013	NC_010581	CGG	2	6	287471	287476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677249
6014	NC_010581	CGG	2	6	287558	287563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677249
6015	NC_010581	GC	3	6	287645	287650	0 %	0 %	50 %	50 %	182677249
6016	NC_010581	ATG	2	6	287709	287714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677249
6017	NC_010581	TCG	2	6	287716	287721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677249
6018	NC_010581	ACCGGC	2	12	287748	287759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677249
6019	NC_010581	CGG	2	6	287813	287818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677249
6020	NC_010581	GGC	2	6	287831	287836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677249
6021	NC_010581	GCC	2	6	287901	287906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677249
6022	NC_010581	ATCGA	2	10	287940	287949	40 %	20 %	20 %	20 %	182677249
6023	NC_010581	TCT	2	6	287981	287986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_010581	T	6	6	287992	287997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_010581	TCG	2	6	288060	288065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677250
6026	NC_010581	GAG	2	6	288146	288151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677250
6027	NC_010581	TGA	2	6	288171	288176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677250
6028	NC_010581	CGA	2	6	288258	288263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677250
6029	NC_010581	GTCG	2	8	288385	288392	0 %	25 %	50 %	25 %	182677250
6030	NC_010581	CG	3	6	288441	288446	0 %	0 %	50 %	50 %	182677250
6031	NC_010581	GGA	2	6	288481	288486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677250
6032	NC_010581	GCG	2	6	288560	288565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677250
6033	NC_010581	CCA	2	6	288615	288620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677250
6034	NC_010581	GCA	2	6	288630	288635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677250
6035	NC_010581	AGG	2	6	288642	288647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677250
6036	NC_010581	CG	3	6	288648	288653	0 %	0 %	50 %	50 %	182677250
6037	NC_010581	ATC	2	6	288701	288706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677250
6038	NC_010581	CATT	2	8	288715	288722	25 %	50 %	0 %	25 %	182677250
6039	NC_010581	AAT	2	6	288731	288736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677250
6040	NC_010581	GC	3	6	288771	288776	0 %	0 %	50 %	50 %	182677250
6041	NC_010581	GGC	2	6	288788	288793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677250
6042	NC_010581	TCT	2	6	288826	288831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677250
6043	NC_010581	CCA	2	6	288858	288863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677250
6044	NC_010581	GCT	2	6	288979	288984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677250
6045	NC_010581	CCG	2	6	289006	289011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677250
6046	NC_010581	CTGA	2	8	289016	289023	25 %	25 %	25 %	25 %	182677250
6047	NC_010581	AGTC	2	8	289030	289037	25 %	25 %	25 %	25 %	182677250
6048	NC_010581	GC	3	6	289158	289163	0 %	0 %	50 %	50 %	182677250
6049	NC_010581	ACGATC	2	12	289235	289246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182677250
6050	NC_010581	GCC	2	6	289250	289255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677250
6051	NC_010581	GAA	2	6	289264	289269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677250
6052	NC_010581	T	6	6	289358	289363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010581	A	6	6	289385	289390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_010581	GA	3	6	289391	289396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010581	AG	3	6	289471	289476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010581	GAAAA	2	10	289495	289504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010581	GCT	2	6	289516	289521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_010581	TGC	2	6	289586	289591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677251
6059	NC_010581	CCTT	2	8	289592	289599	0 %	50 %	0 %	50 %	182677251
6060	NC_010581	TCA	2	6	289628	289633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677251
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6062	NC_010581	ATT	2	6	289744	289749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677251
6063	NC_010581	CTT	2	6	289846	289851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677251
6064	NC_010581	GGC	2	6	289909	289914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677251
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6067	NC_010581	TCG	2	6	290315	290320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_010581	GAA	2	6	290414	290419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677252
6069	NC_010581	GGCGA	2	10	290420	290429	20 %	0 %	60 %	20 %	182677252
6070	NC_010581	CAT	2	6	290431	290436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677252
6071	NC_010581	CGT	2	6	290448	290453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677252
6072	NC_010581	AGC	2	6	290504	290509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677252
6073	NC_010581	GA	3	6	290544	290549	50 %	0 %	50 %	0 %	182677252
6074	NC_010581	GA	3	6	290591	290596	50 %	0 %	50 %	0 %	182677252
6075	NC_010581	TCC	2	6	290648	290653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677252
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6079	NC_010581	TCA	2	6	291041	291046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677252
6080	NC_010581	CAT	2	6	291051	291056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677252
6081	NC_010581	GAG	2	6	291067	291072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677252
6082	NC_010581	GCCG	2	8	291103	291110	0 %	0 %	50 %	50 %	182677252
6083	NC_010581	GC	3	6	291126	291131	0 %	0 %	50 %	50 %	182677252
6084	NC_010581	CGT	2	6	291187	291192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677252
6085	NC_010581	CAT	2	6	291222	291227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677252
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6087	NC_010581	TA	3	6	291349	291354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_010581	CAGTC	2	10	291410	291419	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6089	NC_010581	TCC	2	6	291428	291433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_010581	TTG	2	6	291442	291447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_010581	TTTTAA	2	12	291461	291472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010581	GAT	2	6	291564	291569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010581	ATG	2	6	291612	291617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010581	TAT	2	6	291719	291724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010581	TGC	2	6	291770	291775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_010581	GCCTC	2	10	291781	291790	0 %	20 %	20 %	60 %	182677253
6097	NC_010581	GCG	2	6	291817	291822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677253
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6099	NC_010581	CGT	2	6	291930	291935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677253
6100	NC_010581	GCC	2	6	292059	292064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677253
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6102	NC_010581	CGA	2	6	292130	292135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677253
6103	NC_010581	CCA	2	6	292136	292141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677253
6104	NC_010581	GAT	2	6	292226	292231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677253
6105	NC_010581	TTG	2	6	292239	292244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677253
6106	NC_010581	AAG	2	6	292266	292271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677253
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6108	NC_010581	TCCGG	2	10	292369	292378	0 %	20 %	40 %	40 %	182677253
6109	NC_010581	TCA	2	6	292391	292396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677253
6110	NC_010581	GCC	2	6	292493	292498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677254
6111	NC_010581	T	6	6	292513	292518	0 %	100 %	0 %	0 %	182677254
6112	NC_010581	TCC	2	6	292593	292598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677254
6113	NC_010581	GAG	2	6	292604	292609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677254
6114	NC_010581	AG	3	6	292608	292613	50 %	0 %	50 %	0 %	182677254
6115	NC_010581	GATC	2	8	292615	292622	25 %	25 %	25 %	25 %	182677254
6116	NC_010581	GCC	3	9	292670	292678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677254
6117	NC_010581	CAT	2	6	292766	292771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677254
6118	NC_010581	GATCT	2	10	292810	292819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6119	NC_010581	GC	3	6	292849	292854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_010581	CATCG	2	10	293000	293009	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6121	NC_010581	GC	3	6	293023	293028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_010581	CAT	3	9	293070	293078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677255
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6124	NC_010581	GGCG	2	8	293125	293132	0 %	0 %	75 %	25 %	182677255
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6496	NC_010581	GCC	2	6	311030	311035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677267
6497	NC_010581	GGAAGG	2	12	311095	311106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677267
6498	NC_010581	GTC	2	6	311117	311122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677267
6499	NC_010581	GATT	2	8	311148	311155	25 %	50 %	25 %	0 %	182677267
6500	NC_010581	CGC	2	6	311254	311259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677267

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