MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010581	ACG	2	6	262374	262379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677223
5502	NC_010581	GGC	2	6	262385	262390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677223
5503	NC_010581	GATC	2	8	262546	262553	25 %	25 %	25 %	25 %	182677223
5504	NC_010581	CCGC	2	8	262584	262591	0 %	0 %	25 %	75 %	182677223
5505	NC_010581	GCAG	2	8	262615	262622	25 %	0 %	50 %	25 %	182677223
5506	NC_010581	CAG	2	6	262628	262633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677223
5507	NC_010581	GA	3	6	262634	262639	50 %	0 %	50 %	0 %	182677223
5508	NC_010581	CCG	2	6	262685	262690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677223
5509	NC_010581	TCC	2	6	262718	262723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677224
5510	NC_010581	TCT	2	6	262739	262744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677224
5511	NC_010581	CGG	2	6	262790	262795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5512	NC_010581	CTCG	2	8	262812	262819	0 %	25 %	25 %	50 %	182677224
5513	NC_010581	CG	3	6	262823	262828	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5514	NC_010581	GC	3	6	262843	262848	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5515	NC_010581	CGA	2	6	262889	262894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5516	NC_010581	CAT	2	6	262983	262988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677224
5517	NC_010581	GCC	2	6	263017	263022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5518	NC_010581	CGC	2	6	263079	263084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5519	NC_010581	GCC	2	6	263194	263199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5520	NC_010581	CGC	2	6	263244	263249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5521	NC_010581	GCC	2	6	263270	263275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5522	NC_010581	CGG	2	6	263340	263345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5523	NC_010581	GC	3	6	263367	263372	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5524	NC_010581	TCG	2	6	263401	263406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5525	NC_010581	CTTCGA	2	12	263424	263435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182677224
5526	NC_010581	GCG	2	6	263490	263495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5527	NC_010581	CAC	2	6	263571	263576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677224
5528	NC_010581	TG	3	6	263584	263589	0 %	50 %	50 %	0 %	182677224
5529	NC_010581	GAA	2	6	263652	263657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677224
5530	NC_010581	GGA	2	6	263675	263680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677224
5531	NC_010581	AT	3	6	263701	263706	50 %	50 %	0 %	0 %	182677224
5532	NC_010581	CGT	2	6	263742	263747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5533	NC_010581	GC	3	6	263778	263783	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5534	NC_010581	CGA	2	6	263801	263806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5535	NC_010581	GCCGG	2	10	263831	263840	0 %	0 %	60 %	40 %	182677224
5536	NC_010581	CCGC	2	8	263841	263848	0 %	0 %	25 %	75 %	182677224
5537	NC_010581	TCG	2	6	263905	263910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5538	NC_010581	GC	3	6	263947	263952	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5539	NC_010581	GGCACG	2	12	263953	263964	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182677224
5540	NC_010581	AATCGG	2	12	263988	263999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182677224
5541	NC_010581	GGC	2	6	264087	264092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5542	NC_010581	CCG	2	6	264099	264104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5543	NC_010581	CCT	2	6	264122	264127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677224
5544	NC_010581	TCA	2	6	264205	264210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677224
5545	NC_010581	ACC	2	6	264232	264237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677224
5546	NC_010581	TCA	2	6	264370	264375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677224
5547	NC_010581	TCT	2	6	264413	264418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677224
5548	NC_010581	TGA	2	6	264467	264472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677224
5549	NC_010581	GAT	2	6	264518	264523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677224
5550	NC_010581	CGG	2	6	264524	264529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5551	NC_010581	GCA	3	9	264629	264637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5552	NC_010581	CCAAT	2	10	264652	264661	40 %	20 %	0 %	40 %	182677224
5553	NC_010581	GCT	2	6	264770	264775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5554	NC_010581	CGA	2	6	264776	264781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5555	NC_010581	CGTC	2	8	264802	264809	0 %	25 %	25 %	50 %	182677224
5556	NC_010581	CG	3	6	264956	264961	0 %	0 %	50 %	50 %	182677224
5557	NC_010581	TGG	2	6	265004	265009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677224
5558	NC_010581	CGG	2	6	265031	265036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5559	NC_010581	GGC	2	6	265056	265061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677224
5560	NC_010581	CCG	2	6	265067	265072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5561	NC_010581	CGGA	2	8	265190	265197	25 %	0 %	50 %	25 %	182677224
5562	NC_010581	GCC	2	6	265261	265266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677224
5563	NC_010581	TCC	2	6	265267	265272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677224
5564	NC_010581	TCT	2	6	265277	265282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677224
5565	NC_010581	CTG	2	6	265357	265362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677224
5566	NC_010581	ATT	2	6	265378	265383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677224
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5568	NC_010581	GC	3	6	265519	265524	0 %	0 %	50 %	50 %	182677225
5569	NC_010581	CG	3	6	265534	265539	0 %	0 %	50 %	50 %	182677225
5570	NC_010581	CGG	2	6	265607	265612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677225
5571	NC_010581	AGG	2	6	265643	265648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677225
5572	NC_010581	GCCT	2	8	265662	265669	0 %	25 %	25 %	50 %	182677225
5573	NC_010581	T	7	7	265746	265752	0 %	100 %	0 %	0 %	182677225
5574	NC_010581	AGA	2	6	265811	265816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677225
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5578	NC_010581	GC	3	6	266105	266110	0 %	0 %	50 %	50 %	182677225
5579	NC_010581	GC	3	6	266117	266122	0 %	0 %	50 %	50 %	182677225
5580	NC_010581	TCC	2	6	266161	266166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_010581	TAT	2	6	266265	266270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010581	CAG	2	6	266303	266308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_010581	CTTG	2	8	266391	266398	0 %	50 %	25 %	25 %	182677226
5584	NC_010581	GGC	2	6	266507	266512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677226
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5586	NC_010581	CCA	2	6	266737	266742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677226
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5588	NC_010581	GC	3	6	266786	266791	0 %	0 %	50 %	50 %	182677226
5589	NC_010581	CG	3	6	266795	266800	0 %	0 %	50 %	50 %	182677226
5590	NC_010581	CGA	2	6	266831	266836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677226
5591	NC_010581	GCGCC	2	10	266976	266985	0 %	0 %	40 %	60 %	182677226
5592	NC_010581	ATG	2	6	267006	267011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677226
5593	NC_010581	CGT	2	6	267095	267100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677226
5594	NC_010581	ATTC	2	8	267137	267144	25 %	50 %	0 %	25 %	182677226
5595	NC_010581	CG	3	6	267185	267190	0 %	0 %	50 %	50 %	182677226
5596	NC_010581	ATATCG	2	12	267199	267210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	182677226
5597	NC_010581	GTGCG	2	10	267220	267229	0 %	20 %	60 %	20 %	182677226
5598	NC_010581	TCG	3	9	267316	267324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677226
5599	NC_010581	CGAT	2	8	267406	267413	25 %	25 %	25 %	25 %	182677226
5600	NC_010581	CGC	2	6	267452	267457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_010581	CG	3	6	267610	267615	0 %	0 %	50 %	50 %	182677227
5602	NC_010581	GAT	2	6	267635	267640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677227
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5604	NC_010581	TGGC	2	8	267703	267710	0 %	25 %	50 %	25 %	182677227
5605	NC_010581	ATC	2	6	267746	267751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677227
5606	NC_010581	GCA	2	6	267772	267777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677227
5607	NC_010581	AGC	2	6	267837	267842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677227
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5609	NC_010581	CG	3	6	267949	267954	0 %	0 %	50 %	50 %	182677227
5610	NC_010581	CGG	2	6	267967	267972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677227
5611	NC_010581	CCG	2	6	268012	268017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677227
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5613	NC_010581	ACC	2	6	268147	268152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_010581	ATT	2	6	268181	268186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010581	GA	3	6	268210	268215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_010581	T	6	6	268246	268251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010581	ATT	2	6	268276	268281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_010581	T	6	6	268280	268285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010581	TTCA	2	8	268382	268389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_010581	GAG	2	6	268462	268467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_010581	ACTC	2	8	268490	268497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_010581	TCG	2	6	268526	268531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677228
5623	NC_010581	GAT	2	6	268534	268539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677228
5624	NC_010581	CCG	2	6	268601	268606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677228
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5638	NC_010581	GCT	2	6	269236	269241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5732	NC_010581	CGAGA	2	10	274180	274189	40 %	0 %	40 %	20 %	182677234
5733	NC_010581	TGAG	2	8	274196	274203	25 %	25 %	50 %	0 %	182677234
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5737	NC_010581	TCCT	2	8	274312	274319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5741	NC_010581	A	7	7	274629	274635	100 %	0 %	0 %	0 %	182677235
5742	NC_010581	CG	3	6	274653	274658	0 %	0 %	50 %	50 %	182677235
5743	NC_010581	CCG	2	6	274686	274691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677235
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5991	NC_010581	AGC	3	9	286216	286224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677247
5992	NC_010581	CG	4	8	286274	286281	0 %	0 %	50 %	50 %	182677247
5993	NC_010581	GC	4	8	286338	286345	0 %	0 %	50 %	50 %	182677247
5994	NC_010581	GCC	2	6	286348	286353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677247
5995	NC_010581	G	6	6	286413	286418	0 %	0 %	100 %	0 %	182677247
5996	NC_010581	AGAT	2	8	286420	286427	50 %	25 %	25 %	0 %	182677247
5997	NC_010581	GTC	2	6	286474	286479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677248
5998	NC_010581	GAT	2	6	286569	286574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677248
5999	NC_010581	GTG	2	6	286638	286643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677248
6000	NC_010581	GGC	2	6	286729	286734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677248

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