MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	CT	3	6	298	303	0 %	50 %	0 %	50 %	182676826
2	NC_010580	CG	3	6	590	595	0 %	0 %	50 %	50 %	182676827
3	NC_010580	GC	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	182676827
4	NC_010580	TC	3	6	1321	1326	0 %	50 %	0 %	50 %	182676827
5	NC_010580	CG	3	6	1376	1381	0 %	0 %	50 %	50 %	182676827
6	NC_010580	GC	3	6	1610	1615	0 %	0 %	50 %	50 %	182676828
7	NC_010580	CT	3	6	3518	3523	0 %	50 %	0 %	50 %	182676831
8	NC_010580	GT	3	6	4191	4196	0 %	50 %	50 %	0 %	182676832
9	NC_010580	CT	3	6	4701	4706	0 %	50 %	0 %	50 %	182676832
10	NC_010580	CG	3	6	4891	4896	0 %	0 %	50 %	50 %	182676832
11	NC_010580	GC	4	8	4909	4916	0 %	0 %	50 %	50 %	182676832
12	NC_010580	CT	3	6	5010	5015	0 %	50 %	0 %	50 %	182676832
13	NC_010580	CG	3	6	5628	5633	0 %	0 %	50 %	50 %	182676834
14	NC_010580	GC	4	8	5789	5796	0 %	0 %	50 %	50 %	182676834
15	NC_010580	GC	3	6	5935	5940	0 %	0 %	50 %	50 %	182676835
16	NC_010580	CT	3	6	7340	7345	0 %	50 %	0 %	50 %	182676835
17	NC_010580	GA	3	6	8126	8131	50 %	0 %	50 %	0 %	182676835
18	NC_010580	CG	3	6	8691	8696	0 %	0 %	50 %	50 %	182676837
19	NC_010580	CG	4	8	10812	10819	0 %	0 %	50 %	50 %	182676839
20	NC_010580	GA	3	6	11756	11761	50 %	0 %	50 %	0 %	182676841
21	NC_010580	CG	3	6	12180	12185	0 %	0 %	50 %	50 %	182676841
22	NC_010580	GC	3	6	12623	12628	0 %	0 %	50 %	50 %	182676841
23	NC_010580	GC	3	6	12956	12961	0 %	0 %	50 %	50 %	182676841
24	NC_010580	GC	3	6	13349	13354	0 %	0 %	50 %	50 %	182676841
25	NC_010580	AG	3	6	13429	13434	50 %	0 %	50 %	0 %	182676841
26	NC_010580	CA	3	6	15193	15198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010580	GC	3	6	15445	15450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010580	AG	3	6	15572	15577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010580	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	182676843
30	NC_010580	TA	3	6	15899	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	182676843
31	NC_010580	TA	4	8	15926	15933	50 %	50 %	0 %	0 %	182676843
32	NC_010580	TA	3	6	15952	15957	50 %	50 %	0 %	0 %	182676843
33	NC_010580	GC	3	6	16544	16549	0 %	0 %	50 %	50 %	182676844
34	NC_010580	GC	3	6	16868	16873	0 %	0 %	50 %	50 %	182676844
35	NC_010580	GC	3	6	17063	17068	0 %	0 %	50 %	50 %	182676844
36	NC_010580	TC	3	6	17626	17631	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
37	NC_010580	CT	3	6	18441	18446	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
38	NC_010580	CT	3	6	18814	18819	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
39	NC_010580	GT	4	8	19440	19447	0 %	50 %	50 %	0 %	182676844
40	NC_010580	CG	4	8	20172	20179	0 %	0 %	50 %	50 %	182676844
41	NC_010580	TC	3	6	21207	21212	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
42	NC_010580	CT	3	6	21902	21907	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
43	NC_010580	CT	3	6	21926	21931	0 %	50 %	0 %	50 %	182676844
44	NC_010580	CG	3	6	21948	21953	0 %	0 %	50 %	50 %	182676844
45	NC_010580	AC	3	6	22556	22561	50 %	0 %	0 %	50 %	182676844
46	NC_010580	CG	3	6	25355	25360	0 %	0 %	50 %	50 %	182676845
47	NC_010580	GC	3	6	27060	27065	0 %	0 %	50 %	50 %	182676845
48	NC_010580	AC	3	6	28581	28586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010580	CT	3	6	29330	29335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010580	GC	3	6	29378	29383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010580	GT	3	6	29443	29448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010580	GA	3	6	29776	29781	50 %	0 %	50 %	0 %	182676848
53	NC_010580	CG	4	8	29868	29875	0 %	0 %	50 %	50 %	182676848
54	NC_010580	GA	3	6	30104	30109	50 %	0 %	50 %	0 %	182676848
55	NC_010580	TA	3	6	30161	30166	50 %	50 %	0 %	0 %	182676848
56	NC_010580	CA	3	6	31276	31281	50 %	0 %	0 %	50 %	182676850
57	NC_010580	GA	3	6	32536	32541	50 %	0 %	50 %	0 %	182676851
58	NC_010580	TG	3	6	33088	33093	0 %	50 %	50 %	0 %	182676852
59	NC_010580	CA	3	6	33336	33341	50 %	0 %	0 %	50 %	182676852
60	NC_010580	AG	3	6	33823	33828	50 %	0 %	50 %	0 %	182676854
61	NC_010580	CT	3	6	34126	34131	0 %	50 %	0 %	50 %	182676854
62	NC_010580	AG	3	6	35373	35378	50 %	0 %	50 %	0 %	182676856
63	NC_010580	AG	3	6	36122	36127	50 %	0 %	50 %	0 %	182676858
64	NC_010580	GC	4	8	37084	37091	0 %	0 %	50 %	50 %	182676861
65	NC_010580	GT	3	6	38051	38056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010580	GT	3	6	38185	38190	0 %	50 %	50 %	0 %	182676863
67	NC_010580	GC	3	6	38220	38225	0 %	0 %	50 %	50 %	182676863
68	NC_010580	GC	3	6	39270	39275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010580	GA	3	6	39894	39899	50 %	0 %	50 %	0 %	182676866
70	NC_010580	GA	3	6	40475	40480	50 %	0 %	50 %	0 %	182676867
71	NC_010580	TG	3	6	40855	40860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010580	TG	3	6	41167	41172	0 %	50 %	50 %	0 %	182676869
73	NC_010580	GC	3	6	41958	41963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010580	GC	3	6	42062	42067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010580	GA	4	8	42217	42224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010580	GA	3	6	42491	42496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010580	CG	3	6	42808	42813	0 %	0 %	50 %	50 %	182676870
78	NC_010580	CT	3	6	43250	43255	0 %	50 %	0 %	50 %	182676870
79	NC_010580	GA	3	6	43552	43557	50 %	0 %	50 %	0 %	182676871
80	NC_010580	GC	4	8	44975	44982	0 %	0 %	50 %	50 %	182676875
81	NC_010580	GC	3	6	45076	45081	0 %	0 %	50 %	50 %	182676875
82	NC_010580	GC	3	6	47227	47232	0 %	0 %	50 %	50 %	182676878
83	NC_010580	GC	3	6	47281	47286	0 %	0 %	50 %	50 %	182676878
84	NC_010580	TC	4	8	47749	47756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010580	TG	3	6	48378	48383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010580	CG	3	6	48533	48538	0 %	0 %	50 %	50 %	182676879
87	NC_010580	TG	3	6	48890	48895	0 %	50 %	50 %	0 %	182676879
88	NC_010580	GC	3	6	49372	49377	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
89	NC_010580	CG	3	6	49577	49582	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
90	NC_010580	CG	3	6	49713	49718	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
91	NC_010580	GC	3	6	50183	50188	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
92	NC_010580	AG	3	6	50453	50458	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
93	NC_010580	GC	3	6	50915	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
94	NC_010580	CG	3	6	51671	51676	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
95	NC_010580	CG	3	6	51735	51740	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
96	NC_010580	GC	3	6	51853	51858	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
97	NC_010580	GT	3	6	52112	52117	0 %	50 %	50 %	0 %	182676880
98	NC_010580	GA	3	6	52152	52157	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
99	NC_010580	GC	3	6	52581	52586	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
100	NC_010580	CG	3	6	52837	52842	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
101	NC_010580	GA	3	6	53043	53048	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
102	NC_010580	CG	3	6	53188	53193	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
103	NC_010580	GC	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
104	NC_010580	CG	3	6	53502	53507	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
105	NC_010580	AG	3	6	54085	54090	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
106	NC_010580	GC	3	6	54222	54227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010580	CG	3	6	54307	54312	0 %	0 %	50 %	50 %	182676881
108	NC_010580	CG	3	6	55037	55042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010580	GC	3	6	55333	55338	0 %	0 %	50 %	50 %	182676883
110	NC_010580	GC	4	8	56152	56159	0 %	0 %	50 %	50 %	182676885
111	NC_010580	GA	3	6	56480	56485	50 %	0 %	50 %	0 %	182676885
112	NC_010580	CG	3	6	56654	56659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010580	CT	3	6	56722	56727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010580	GT	4	8	57691	57698	0 %	50 %	50 %	0 %	182676889
115	NC_010580	TG	3	6	57699	57704	0 %	50 %	50 %	0 %	182676889
116	NC_010580	CG	3	6	59005	59010	0 %	0 %	50 %	50 %	182676891
117	NC_010580	GA	3	6	60110	60115	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
118	NC_010580	GC	3	6	60302	60307	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
119	NC_010580	CG	3	6	60375	60380	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
120	NC_010580	GC	4	8	60753	60760	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
121	NC_010580	GC	3	6	60823	60828	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
122	NC_010580	GC	4	8	60861	60868	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
123	NC_010580	AG	3	6	60930	60935	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
124	NC_010580	CG	3	6	61297	61302	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
125	NC_010580	GA	3	6	61652	61657	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
126	NC_010580	GC	4	8	61793	61800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010580	TG	3	6	61804	61809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010580	GA	3	6	62103	62108	50 %	0 %	50 %	0 %	182676894
129	NC_010580	GC	3	6	63253	63258	0 %	0 %	50 %	50 %	182676896
130	NC_010580	GC	3	6	63293	63298	0 %	0 %	50 %	50 %	182676896
131	NC_010580	CG	3	6	63800	63805	0 %	0 %	50 %	50 %	182676897
132	NC_010580	GC	3	6	63872	63877	0 %	0 %	50 %	50 %	182676897
133	NC_010580	GC	3	6	63984	63989	0 %	0 %	50 %	50 %	182676897
134	NC_010580	GA	3	6	64900	64905	50 %	0 %	50 %	0 %	182676899
135	NC_010580	CG	3	6	65465	65470	0 %	0 %	50 %	50 %	182676899
136	NC_010580	GC	3	6	65669	65674	0 %	0 %	50 %	50 %	182676899
137	NC_010580	GC	4	8	65688	65695	0 %	0 %	50 %	50 %	182676899
138	NC_010580	CG	3	6	68624	68629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010580	GC	4	8	69131	69138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010580	TC	3	6	69769	69774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010580	GA	3	6	69779	69784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010580	TC	3	6	71367	71372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010580	CG	3	6	71729	71734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010580	AT	3	6	71915	71920	50 %	50 %	0 %	0 %	182676905
145	NC_010580	CG	3	6	71947	71952	0 %	0 %	50 %	50 %	182676905
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.