MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 3706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010580	TCG	2	6	47882	47887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010580	TCG	2	6	48013	48018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010580	GCT	2	6	48071	48076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_010580	GGC	2	6	48211	48216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010580	GAA	2	6	48250	48255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010580	AGC	2	6	48261	48266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010580	GCG	2	6	48293	48298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010580	TGA	2	6	48343	48348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010580	TG	3	6	48378	48383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010580	GGGGC	2	10	48432	48441	0 %	0 %	80 %	20 %	182676879
1011	NC_010580	CG	3	6	48533	48538	0 %	0 %	50 %	50 %	182676879
1012	NC_010580	ACG	3	9	48623	48631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676879
1013	NC_010580	CGG	2	6	48711	48716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676879
1014	NC_010580	CTT	2	6	48802	48807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676879
1015	NC_010580	TCC	2	6	48827	48832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676879
1016	NC_010580	GGC	2	6	48862	48867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676879
1017	NC_010580	CGG	2	6	48873	48878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676879
1018	NC_010580	TG	3	6	48890	48895	0 %	50 %	50 %	0 %	182676879
1019	NC_010580	CGC	2	6	48946	48951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676879
1020	NC_010580	AGG	2	6	49053	49058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010580	GGC	2	6	49064	49069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1022	NC_010580	TCT	2	6	49095	49100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676880
1023	NC_010580	GTC	2	6	49166	49171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1024	NC_010580	GGCG	2	8	49204	49211	0 %	0 %	75 %	25 %	182676880
1025	NC_010580	CAGG	2	8	49219	49226	25 %	0 %	50 %	25 %	182676880
1026	NC_010580	CGG	2	6	49240	49245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1027	NC_010580	TGCC	2	8	49250	49257	0 %	25 %	25 %	50 %	182676880
1028	NC_010580	GC	3	6	49372	49377	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1029	NC_010580	CG	3	6	49577	49582	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1030	NC_010580	T	6	6	49619	49624	0 %	100 %	0 %	0 %	182676880
1031	NC_010580	CG	3	6	49713	49718	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1032	NC_010580	GGCGAA	2	12	49778	49789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	182676880
1033	NC_010580	CGG	2	6	49821	49826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1034	NC_010580	GAG	2	6	49877	49882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676880
1035	NC_010580	GAT	2	6	50014	50019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1036	NC_010580	GCT	2	6	50035	50040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1037	NC_010580	CTT	2	6	50138	50143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676880
1038	NC_010580	TCGC	2	8	50166	50173	0 %	25 %	25 %	50 %	182676880
1039	NC_010580	CGC	2	6	50179	50184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676880
1040	NC_010580	GC	3	6	50183	50188	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1041	NC_010580	ATC	2	6	50268	50273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676880
1042	NC_010580	GCG	2	6	50277	50282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1043	NC_010580	CTGG	2	8	50308	50315	0 %	25 %	50 %	25 %	182676880
1044	NC_010580	CCAG	2	8	50338	50345	25 %	0 %	25 %	50 %	182676880
1045	NC_010580	TTG	2	6	50370	50375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676880
1046	NC_010580	TTG	2	6	50379	50384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676880
1047	NC_010580	GATC	2	8	50419	50426	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1048	NC_010580	TGA	2	6	50446	50451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1049	NC_010580	AG	3	6	50453	50458	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
1050	NC_010580	GCG	2	6	50513	50518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1051	NC_010580	TGA	2	6	50566	50571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1052	NC_010580	CGG	2	6	50577	50582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1053	NC_010580	GAC	2	6	50633	50638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1054	NC_010580	GCC	2	6	50763	50768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676880
1055	NC_010580	CGGC	2	8	50889	50896	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1056	NC_010580	GC	3	6	50915	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1057	NC_010580	TCG	2	6	51021	51026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1058	NC_010580	GAT	2	6	51029	51034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1059	NC_010580	CAG	2	6	51170	51175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1060	NC_010580	GTT	2	6	51211	51216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676880
1061	NC_010580	GGC	2	6	51221	51226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1062	NC_010580	TGA	2	6	51259	51264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1063	NC_010580	CGCGG	2	10	51287	51296	0 %	0 %	60 %	40 %	182676880
1064	NC_010580	TCG	2	6	51336	51341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1065	NC_010580	CGA	2	6	51343	51348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1066	NC_010580	AGC	2	6	51369	51374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1067	NC_010580	GGC	2	6	51386	51391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1068	NC_010580	TGA	2	6	51433	51438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1069	NC_010580	ATG	2	6	51459	51464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1070	NC_010580	GCC	2	6	51468	51473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676880
1071	NC_010580	TGA	2	6	51529	51534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1072	NC_010580	TGA	2	6	51571	51576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1073	NC_010580	TTG	2	6	51633	51638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676880
1074	NC_010580	GGC	2	6	51655	51660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1075	NC_010580	CG	3	6	51671	51676	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1076	NC_010580	CG	3	6	51735	51740	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1077	NC_010580	TGA	2	6	51790	51795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1078	NC_010580	GC	3	6	51853	51858	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1079	NC_010580	CGG	2	6	51883	51888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1080	NC_010580	ATCG	2	8	51911	51918	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1081	NC_010580	TGA	2	6	51942	51947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1082	NC_010580	GTT	2	6	51951	51956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676880
1083	NC_010580	GT	3	6	52112	52117	0 %	50 %	50 %	0 %	182676880
1084	NC_010580	GA	3	6	52152	52157	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
1085	NC_010580	TCG	2	6	52273	52278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1086	NC_010580	GCAG	2	8	52303	52310	25 %	0 %	50 %	25 %	182676880
1087	NC_010580	CGG	2	6	52324	52329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1088	NC_010580	GGA	2	6	52360	52365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676880
1089	NC_010580	CTTG	2	8	52387	52394	0 %	50 %	25 %	25 %	182676880
1090	NC_010580	TCGA	2	8	52407	52414	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1091	NC_010580	TCGA	2	8	52422	52429	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1092	NC_010580	CCAG	2	8	52435	52442	25 %	0 %	25 %	50 %	182676880
1093	NC_010580	ATC	2	6	52451	52456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676880
1094	NC_010580	CTGCG	2	10	52479	52488	0 %	20 %	40 %	40 %	182676880
1095	NC_010580	GGT	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676880
1096	NC_010580	GGC	2	6	52577	52582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1097	NC_010580	GC	3	6	52581	52586	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1098	NC_010580	GGC	2	6	52588	52593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1099	NC_010580	GAT	2	6	52676	52681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1100	NC_010580	CCTT	2	8	52704	52711	0 %	50 %	0 %	50 %	182676880
1101	NC_010580	GAT	2	6	52754	52759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1102	NC_010580	TCA	2	6	52773	52778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676880
1103	NC_010580	AGG	2	6	52779	52784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676880
1104	NC_010580	CCTT	2	8	52794	52801	0 %	50 %	0 %	50 %	182676880
1105	NC_010580	CGG	2	6	52816	52821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1106	NC_010580	CGA	2	6	52828	52833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676880
1107	NC_010580	CG	3	6	52837	52842	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1108	NC_010580	TGA	2	6	52850	52855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676880
1109	NC_010580	CTGG	2	8	52865	52872	0 %	25 %	50 %	25 %	182676880
1110	NC_010580	CGGC	2	8	52945	52952	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1111	NC_010580	GGC	2	6	52996	53001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1112	NC_010580	GA	3	6	53043	53048	50 %	0 %	50 %	0 %	182676880
1113	NC_010580	GAA	2	6	53135	53140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676880
1114	NC_010580	GCCG	2	8	53165	53172	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1115	NC_010580	CG	3	6	53188	53193	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1116	NC_010580	GGC	2	6	53204	53209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1117	NC_010580	GGC	2	6	53288	53293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1118	NC_010580	TCGA	2	8	53316	53323	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1119	NC_010580	GC	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1120	NC_010580	AAT	2	6	53335	53340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676880
1121	NC_010580	CAT	2	6	53371	53376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676880
1122	NC_010580	AAC	2	6	53484	53489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676880
1123	NC_010580	CG	3	6	53502	53507	0 %	0 %	50 %	50 %	182676880
1124	NC_010580	GAA	2	6	53573	53578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676880
1125	NC_010580	GCC	2	6	53612	53617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676880
1126	NC_010580	TCAG	2	8	53745	53752	25 %	25 %	25 %	25 %	182676880
1127	NC_010580	GGC	2	6	53785	53790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676880
1128	NC_010580	CTT	2	6	53875	53880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676880
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1151	NC_010580	CGGC	2	8	55078	55085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1153	NC_010580	TCTT	2	8	55118	55125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1164	NC_010580	TGA	2	6	55628	55633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_010580	GA	3	6	60110	60115	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
1256	NC_010580	CTT	2	6	60162	60167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676893
1257	NC_010580	ATGGCC	2	12	60176	60187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1258	NC_010580	CCGCG	2	10	60200	60209	0 %	0 %	40 %	60 %	182676893
1259	NC_010580	TGA	2	6	60216	60221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676893
1260	NC_010580	CGC	2	6	60224	60229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676893
1261	NC_010580	CGT	2	6	60259	60264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1262	NC_010580	GC	3	6	60302	60307	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1263	NC_010580	CGA	2	6	60327	60332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1264	NC_010580	CTC	2	6	60364	60369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676893
1265	NC_010580	CG	3	6	60375	60380	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1266	NC_010580	AGA	2	6	60381	60386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676893
1267	NC_010580	TTG	2	6	60389	60394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676893
1268	NC_010580	CGA	2	6	60456	60461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1269	NC_010580	TGGC	2	8	60508	60515	0 %	25 %	50 %	25 %	182676893
1270	NC_010580	TTG	2	6	60524	60529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676893
1271	NC_010580	GCG	2	6	60661	60666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676893
1272	NC_010580	CCGCG	2	10	60681	60690	0 %	0 %	40 %	60 %	182676893
1273	NC_010580	TCA	2	6	60710	60715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676893
1274	NC_010580	AGA	2	6	60726	60731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676893
1275	NC_010580	GC	4	8	60753	60760	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1276	NC_010580	TCG	2	6	60797	60802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1277	NC_010580	GC	3	6	60823	60828	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1278	NC_010580	GGC	2	6	60844	60849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676893
1279	NC_010580	GC	4	8	60861	60868	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1280	NC_010580	GCT	2	6	60921	60926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1281	NC_010580	AG	3	6	60930	60935	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
1282	NC_010580	GGC	2	6	60946	60951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676893
1283	NC_010580	GGAT	2	8	60968	60975	25 %	25 %	50 %	0 %	182676893
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1285	NC_010580	AGGC	2	8	61020	61027	25 %	0 %	50 %	25 %	182676893
1286	NC_010580	AGA	2	6	61043	61048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676893
1287	NC_010580	ATC	2	6	61076	61081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676893
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1289	NC_010580	GGCG	2	8	61236	61243	0 %	0 %	75 %	25 %	182676893
1290	NC_010580	CG	3	6	61297	61302	0 %	0 %	50 %	50 %	182676893
1291	NC_010580	GCGAT	2	10	61382	61391	20 %	20 %	40 %	20 %	182676893
1292	NC_010580	GCCA	2	8	61435	61442	25 %	0 %	25 %	50 %	182676893
1293	NC_010580	ACG	2	6	61445	61450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676893
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1296	NC_010580	GAG	2	6	61625	61630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676893
1297	NC_010580	GA	3	6	61652	61657	50 %	0 %	50 %	0 %	182676893
1298	NC_010580	TCG	2	6	61683	61688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676893
1299	NC_010580	GC	4	8	61793	61800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1300	NC_010580	TG	3	6	61804	61809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_010580	TCG	2	6	61924	61929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676894
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1305	NC_010580	GA	3	6	62103	62108	50 %	0 %	50 %	0 %	182676894
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1332	NC_010580	CGA	2	6	63443	63448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676896
1333	NC_010580	T	6	6	63449	63454	0 %	100 %	0 %	0 %	182676896
1334	NC_010580	CGC	3	9	63492	63500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676896
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1342	NC_010580	GCCG	2	8	63902	63909	0 %	0 %	50 %	50 %	182676897
1343	NC_010580	CGC	2	6	63974	63979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676897
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1345	NC_010580	GCG	2	6	63999	64004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676897
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1375	NC_010580	GC	4	8	65688	65695	0 %	0 %	50 %	50 %	182676899
1376	NC_010580	TGA	2	6	65815	65820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676899
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1378	NC_010580	GGCA	2	8	65876	65883	25 %	0 %	50 %	25 %	182676899
1379	NC_010580	ATT	2	6	65982	65987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_010580	CAC	3	9	65993	66001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1381	NC_010580	AAG	2	6	66054	66059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676900
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