MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 6708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010553	ACGA	2	8	138495	138502	50 %	0 %	25 %	25 %	172064658
3002	NC_010553	CGAC	2	8	138532	138539	25 %	0 %	25 %	50 %	172064658
3003	NC_010553	GAA	2	6	138548	138553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064658
3004	NC_010553	ACC	2	6	138615	138620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064658
3005	NC_010553	CCA	2	6	138625	138630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064658
3006	NC_010553	TGC	2	6	138682	138687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064658
3007	NC_010553	AGA	2	6	138703	138708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064658
3008	NC_010553	CAT	2	6	138755	138760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064658
3009	NC_010553	GC	3	6	138813	138818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_010553	GC	3	6	138826	138831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_010553	AAG	2	6	138888	138893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064659
3012	NC_010553	CCG	2	6	138940	138945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
3013	NC_010553	GCC	2	6	138965	138970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
3014	NC_010553	CAT	2	6	138983	138988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
3015	NC_010553	ACG	2	6	138997	139002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3016	NC_010553	GAG	2	6	139080	139085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064659
3017	NC_010553	CGG	3	9	139126	139134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3018	NC_010553	GC	3	6	139173	139178	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3019	NC_010553	ACG	2	6	139258	139263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3020	NC_010553	CG	3	6	139294	139299	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3021	NC_010553	GAG	2	6	139314	139319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064659
3022	NC_010553	TCA	2	6	139370	139375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
3023	NC_010553	GGC	2	6	139467	139472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3024	NC_010553	GCC	2	6	139516	139521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
3025	NC_010553	CTA	2	6	139538	139543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
3026	NC_010553	CAG	2	6	139556	139561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3027	NC_010553	GGCC	2	8	139577	139584	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3028	NC_010553	CGG	2	6	139616	139621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3029	NC_010553	TGC	2	6	139639	139644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3030	NC_010553	GCGT	2	8	139663	139670	0 %	25 %	50 %	25 %	172064659
3031	NC_010553	ACG	2	6	139677	139682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3032	NC_010553	GCA	2	6	139709	139714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3033	NC_010553	GCT	3	9	139730	139738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3034	NC_010553	CG	3	6	139741	139746	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3035	NC_010553	GCT	2	6	139778	139783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3036	NC_010553	GCG	3	9	139921	139929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3037	NC_010553	GC	3	6	139935	139940	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3038	NC_010553	GC	3	6	139984	139989	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3039	NC_010553	CGGA	2	8	139990	139997	25 %	0 %	50 %	25 %	172064659
3040	NC_010553	GCC	3	9	140001	140009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
3041	NC_010553	CGGC	2	8	140069	140076	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3042	NC_010553	CCG	2	6	140134	140139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
3043	NC_010553	ACG	2	6	140161	140166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3044	NC_010553	CG	3	6	140170	140175	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3045	NC_010553	GCA	2	6	140183	140188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3046	NC_010553	TTCG	2	8	140192	140199	0 %	50 %	25 %	25 %	172064659
3047	NC_010553	GCG	2	6	140239	140244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3048	NC_010553	GCCG	2	8	140258	140265	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3049	NC_010553	GCT	2	6	140284	140289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3050	NC_010553	ACA	2	6	140356	140361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064659
3051	NC_010553	GTC	2	6	140424	140429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3052	NC_010553	CG	4	8	140449	140456	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3053	NC_010553	CGGT	2	8	140475	140482	0 %	25 %	50 %	25 %	172064659
3054	NC_010553	GCG	2	6	140539	140544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3055	NC_010553	CGG	2	6	140558	140563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3056	NC_010553	CGG	2	6	140632	140637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3057	NC_010553	ACG	2	6	140667	140672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3058	NC_010553	AACTGG	2	12	140694	140705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172064659
3059	NC_010553	GCG	2	6	140845	140850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3060	NC_010553	CAA	2	6	140852	140857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064659
3061	NC_010553	TCG	3	9	140880	140888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3062	NC_010553	CGA	2	6	140978	140983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3063	NC_010553	GGC	2	6	140996	141001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3064	NC_010553	CG	3	6	141051	141056	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3065	NC_010553	TGC	2	6	141058	141063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3066	NC_010553	GAC	2	6	141086	141091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3067	NC_010553	ACG	2	6	141100	141105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3068	NC_010553	GGC	3	9	141116	141124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
3069	NC_010553	GTT	2	6	141164	141169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064659
3070	NC_010553	AAC	2	6	141246	141251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064659
3071	NC_010553	GAT	2	6	141296	141301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064659
3072	NC_010553	TCG	2	6	141355	141360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3073	NC_010553	GATGC	2	10	141377	141386	20 %	20 %	40 %	20 %	172064659
3074	NC_010553	CAG	2	6	141405	141410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3075	NC_010553	TGA	2	6	141418	141423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064659
3076	NC_010553	TGC	2	6	141463	141468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3077	NC_010553	GCT	2	6	141503	141508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
3078	NC_010553	GC	3	6	141539	141544	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
3079	NC_010553	GC	3	6	141581	141586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_010553	CGG	2	6	141589	141594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_010553	TGC	2	6	141603	141608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_010553	GCTG	2	8	141685	141692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_010553	CGGCG	2	10	141700	141709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3084	NC_010553	CG	3	6	141771	141776	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
3085	NC_010553	GC	3	6	141783	141788	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
3086	NC_010553	CGA	2	6	141811	141816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064660
3087	NC_010553	GGC	2	6	141824	141829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
3088	NC_010553	ACC	2	6	141884	141889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064660
3089	NC_010553	G	8	8	141935	141942	0 %	0 %	100 %	0 %	172064660
3090	NC_010553	TCA	2	6	141951	141956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064660
3091	NC_010553	CAA	3	9	142042	142050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064660
3092	NC_010553	CA	3	6	142062	142067	50 %	0 %	0 %	50 %	172064660
3093	NC_010553	CGA	2	6	142095	142100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064660
3094	NC_010553	GACGG	2	10	142136	142145	20 %	0 %	60 %	20 %	172064660
3095	NC_010553	CGC	2	6	142165	142170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064660
3096	NC_010553	AAG	2	6	142178	142183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064660
3097	NC_010553	CGG	2	6	142192	142197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
3098	NC_010553	GGC	2	6	142273	142278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
3099	NC_010553	AAC	2	6	142304	142309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064660
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3102	NC_010553	CGAC	2	8	142467	142474	25 %	0 %	25 %	50 %	172064660
3103	NC_010553	CCGA	2	8	142527	142534	25 %	0 %	25 %	50 %	172064660
3104	NC_010553	GCG	2	6	142536	142541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
3105	NC_010553	CG	3	6	142551	142556	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
3106	NC_010553	AAG	2	6	142589	142594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064660
3107	NC_010553	AAC	2	6	142607	142612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064660
3108	NC_010553	AAC	2	6	142637	142642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064660
3109	NC_010553	GCCG	2	8	142646	142653	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
3110	NC_010553	GTG	2	6	142685	142690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064660
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3112	NC_010553	CCG	2	6	142794	142799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064660
3113	NC_010553	GC	3	6	142807	142812	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
3114	NC_010553	T	6	6	142874	142879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010553	CGC	2	6	142908	142913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_010553	CTG	2	6	142929	142934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_010553	CTG	2	6	142970	142975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_010553	CTT	2	6	142980	142985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_010553	GAA	2	6	142995	143000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010553	CGCA	2	8	143026	143033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_010553	GTC	2	6	143088	143093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_010553	TCG	2	6	143099	143104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_010553	CTCGG	2	10	143105	143114	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3124	NC_010553	GTA	2	6	143167	143172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010553	CCG	2	6	143176	143181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_010553	ACTA	2	8	143200	143207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_010553	CGG	2	6	143209	143214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010553	CAA	2	6	143283	143288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_010553	GCCAA	2	10	143314	143323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_010553	CGG	2	6	143387	143392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_010553	GGA	2	6	143409	143414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010553	CGA	2	6	143507	143512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_010553	CCA	2	6	143525	143530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_010553	CGAT	2	8	143633	143640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_010553	AC	3	6	143670	143675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_010553	CGG	2	6	143694	143699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_010553	GAT	2	6	143795	143800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_010553	GCAG	2	8	143891	143898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3140	NC_010553	CTCG	2	8	143954	143961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_010553	ATCA	2	8	143966	143973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3142	NC_010553	GGT	2	6	144016	144021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_010553	CCG	2	6	144050	144055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_010553	CGC	2	6	144060	144065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3145	NC_010553	GC	3	6	144087	144092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3146	NC_010553	CGGT	2	8	144095	144102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3147	NC_010553	CGG	2	6	144122	144127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3149	NC_010553	GCTC	2	8	144247	144254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3150	NC_010553	GCT	2	6	144273	144278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_010553	GCA	2	6	144475	144480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3156	NC_010553	TCG	2	6	144493	144498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_010553	GCG	2	6	144517	144522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_010553	ACC	2	6	144547	144552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3159	NC_010553	GAT	2	6	144553	144558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3162	NC_010553	CGG	2	6	144623	144628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3165	NC_010553	CGG	2	6	144785	144790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_010553	CGGC	2	8	144821	144828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_010553	CGGC	2	8	144842	144849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3213	NC_010553	TGGGT	2	10	146883	146892	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3245	NC_010553	ACG	2	6	147946	147951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_010553	TGCGC	2	10	147968	147977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3247	NC_010553	GGC	2	6	148000	148005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_010553	CG	3	6	148012	148017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3249	NC_010553	CG	3	6	148086	148091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_010553	GAC	2	6	148152	148157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_010553	AGG	2	6	148173	148178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_010553	GT	3	6	148181	148186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_010553	ACC	2	6	148190	148195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_010553	GCA	2	6	148382	148387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_010553	CGTTGG	2	12	148442	148453	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3256	NC_010553	CG	3	6	148482	148487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_010553	TGT	2	6	148633	148638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_010553	GCC	2	6	148663	148668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_010553	GTG	2	6	148721	148726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_010553	CGG	2	6	148731	148736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_010553	G	6	6	148735	148740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_010553	AACC	2	8	148743	148750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_010553	CAG	2	6	148773	148778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3265	NC_010553	CCCG	2	8	148841	148848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3266	NC_010553	GC	3	6	148850	148855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3267	NC_010553	GC	3	6	148962	148967	0 %	0 %	50 %	50 %	172064663
3268	NC_010553	AGC	2	6	149031	149036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064663
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3271	NC_010553	ACGG	2	8	149193	149200	25 %	0 %	50 %	25 %	172064663
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3275	NC_010553	GCT	2	6	149311	149316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064663
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3281	NC_010553	GGC	2	6	149625	149630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3282	NC_010553	CGC	2	6	149643	149648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3283	NC_010553	CGAT	2	8	149655	149662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3284	NC_010553	GCG	2	6	149759	149764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3285	NC_010553	ATG	2	6	149794	149799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3287	NC_010553	CGC	2	6	149864	149869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3288	NC_010553	GCCG	2	8	149895	149902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3289	NC_010553	AGG	2	6	149926	149931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3291	NC_010553	ATG	2	6	150015	150020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064664
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3293	NC_010553	GGA	2	6	150074	150079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064664
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3312	NC_010553	GCG	2	6	150891	150896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064664
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3351	NC_010553	CTG	2	6	152512	152517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3352	NC_010553	TCC	2	6	152533	152538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064665
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3357	NC_010553	CTT	2	6	152702	152707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064665
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3367	NC_010553	GCG	2	6	153032	153037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064665
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3372	NC_010553	CG	3	6	153225	153230	0 %	0 %	50 %	50 %	172064665
3373	NC_010553	GCC	2	6	153241	153246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064665
3374	NC_010553	GATC	2	8	153338	153345	25 %	25 %	25 %	25 %	172064665
3375	NC_010553	GGC	2	6	153361	153366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064665
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