MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 6708

< Previous1234567891011121314Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010553	GTC	2	6	90880	90885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064619
2002	NC_010553	CCGGAT	2	12	90888	90899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172064619
2003	NC_010553	GGCG	2	8	90912	90919	0 %	0 %	75 %	25 %	172064619
2004	NC_010553	CGC	2	6	90942	90947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064619
2005	NC_010553	CCG	2	6	90987	90992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064619
2006	NC_010553	CGCGG	2	10	91030	91039	0 %	0 %	60 %	40 %	172064619
2007	NC_010553	TCGACG	2	12	91052	91063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172064619
2008	NC_010553	GGT	2	6	91071	91076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064619
2009	NC_010553	GCG	2	6	91088	91093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064619
2010	NC_010553	CGC	2	6	91136	91141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064619
2011	NC_010553	CGA	2	6	91149	91154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064619
2012	NC_010553	AGCGCC	2	12	91256	91267	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	172064619
2013	NC_010553	GGT	2	6	91296	91301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064619
2014	NC_010553	CG	3	6	91352	91357	0 %	0 %	50 %	50 %	172064619
2015	NC_010553	CGG	2	6	91389	91394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064619
2016	NC_010553	GTG	2	6	91417	91422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064619
2017	NC_010553	CTG	2	6	91635	91640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2018	NC_010553	CTCG	2	8	91646	91653	0 %	25 %	25 %	50 %	172064620
2019	NC_010553	GGC	2	6	91658	91663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064620
2020	NC_010553	CCG	2	6	91722	91727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064620
2021	NC_010553	TCG	2	6	91731	91736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2022	NC_010553	TCGACA	2	12	91765	91776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	172064620
2023	NC_010553	GC	3	6	91792	91797	0 %	0 %	50 %	50 %	172064620
2024	NC_010553	ATGC	2	8	91800	91807	25 %	25 %	25 %	25 %	172064620
2025	NC_010553	TCG	2	6	91879	91884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2026	NC_010553	GTCG	2	8	91886	91893	0 %	25 %	50 %	25 %	172064620
2027	NC_010553	CCG	2	6	91900	91905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064620
2028	NC_010553	TAC	2	6	91938	91943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064620
2029	NC_010553	CGC	2	6	91948	91953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064620
2030	NC_010553	GTC	2	6	91962	91967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2031	NC_010553	GACGC	2	10	91989	91998	20 %	0 %	40 %	40 %	172064620
2032	NC_010553	CGG	2	6	91999	92004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064620
2033	NC_010553	TGG	2	6	92089	92094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064620
2034	NC_010553	GC	3	6	92132	92137	0 %	0 %	50 %	50 %	172064620
2035	NC_010553	CCG	2	6	92170	92175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064620
2036	NC_010553	TCG	2	6	92221	92226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2037	NC_010553	TCG	2	6	92236	92241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2038	NC_010553	ACG	2	6	92244	92249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2039	NC_010553	GCT	2	6	92264	92269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2040	NC_010553	GCA	2	6	92318	92323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064620
2041	NC_010553	CG	3	6	92349	92354	0 %	0 %	50 %	50 %	172064620
2042	NC_010553	GAA	2	6	92378	92383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064620
2043	NC_010553	TGA	2	6	92406	92411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064620
2044	NC_010553	GCAGGC	2	12	92434	92445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	172064621
2045	NC_010553	CGAA	2	8	92452	92459	50 %	0 %	25 %	25 %	172064621
2046	NC_010553	GCA	2	6	92497	92502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2047	NC_010553	CTG	2	6	92516	92521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2048	NC_010553	GGCG	2	8	92587	92594	0 %	0 %	75 %	25 %	172064621
2049	NC_010553	CG	3	6	92616	92621	0 %	0 %	50 %	50 %	172064621
2050	NC_010553	CCG	2	6	92631	92636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064621
2051	NC_010553	TGC	2	6	92685	92690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2052	NC_010553	GGC	2	6	92702	92707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064621
2053	NC_010553	GCC	2	6	92729	92734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064621
2054	NC_010553	TGCA	2	8	92745	92752	25 %	25 %	25 %	25 %	172064621
2055	NC_010553	CCG	2	6	92775	92780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064621
2056	NC_010553	TAC	2	6	92810	92815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064621
2057	NC_010553	CG	3	6	92850	92855	0 %	0 %	50 %	50 %	172064621
2058	NC_010553	GGC	2	6	92866	92871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064621
2059	NC_010553	GC	4	8	92870	92877	0 %	0 %	50 %	50 %	172064621
2060	NC_010553	CGC	2	6	92906	92911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064621
2061	NC_010553	CGT	2	6	92950	92955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2062	NC_010553	AAC	2	6	92957	92962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064621
2063	NC_010553	TGC	2	6	92970	92975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2064	NC_010553	ACG	2	6	93012	93017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064621
2065	NC_010553	CTGC	2	8	93078	93085	0 %	25 %	25 %	50 %	172064621
2066	NC_010553	CG	3	6	93127	93132	0 %	0 %	50 %	50 %	172064621
2067	NC_010553	GCT	2	6	93204	93209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064622
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2069	NC_010553	CCG	2	6	93251	93256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064622
2070	NC_010553	TGC	2	6	93275	93280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064622
2071	NC_010553	TGC	2	6	93299	93304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064622
2072	NC_010553	TGC	2	6	93464	93469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064622
2073	NC_010553	CG	4	8	93599	93606	0 %	0 %	50 %	50 %	172064622
2074	NC_010553	TGC	2	6	93683	93688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064622
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2078	NC_010553	CG	3	6	93838	93843	0 %	0 %	50 %	50 %	172064622
2079	NC_010553	GCG	2	6	93849	93854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064622
2080	NC_010553	GCCGCT	2	12	93873	93884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	172064622
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2082	NC_010553	TGC	2	6	94123	94128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064623
2083	NC_010553	CGT	2	6	94133	94138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064623
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2086	NC_010553	GC	3	6	94179	94184	0 %	0 %	50 %	50 %	172064623
2087	NC_010553	GCGG	2	8	94187	94194	0 %	0 %	75 %	25 %	172064623
2088	NC_010553	CGG	2	6	94256	94261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064623
2089	NC_010553	CAG	3	9	94263	94271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064623
2090	NC_010553	CG	3	6	94283	94288	0 %	0 %	50 %	50 %	172064623
2091	NC_010553	GCT	2	6	94313	94318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064623
2092	NC_010553	CGA	2	6	94322	94327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064623
2093	NC_010553	GAT	2	6	94406	94411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064623
2094	NC_010553	CGT	2	6	94412	94417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064623
2095	NC_010553	CACG	2	8	94418	94425	25 %	0 %	25 %	50 %	172064623
2096	NC_010553	CG	4	8	94436	94443	0 %	0 %	50 %	50 %	172064623
2097	NC_010553	GGA	3	9	94484	94492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064623
2098	NC_010553	CG	3	6	94501	94506	0 %	0 %	50 %	50 %	172064623
2099	NC_010553	GCGG	2	8	94528	94535	0 %	0 %	75 %	25 %	172064623
2100	NC_010553	CGG	2	6	94553	94558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064623
2101	NC_010553	CGG	3	9	94576	94584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_010553	CGTGTA	2	12	94752	94763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	172064624
2103	NC_010553	GTC	2	6	94902	94907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064624
2104	NC_010553	CTG	2	6	94921	94926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064624
2105	NC_010553	TTC	2	6	94972	94977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064624
2106	NC_010553	ACA	2	6	95030	95035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064624
2107	NC_010553	GGC	2	6	95045	95050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064624
2108	NC_010553	GAA	2	6	95055	95060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064624
2109	NC_010553	ATC	2	6	95065	95070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064624
2110	NC_010553	AAC	2	6	95131	95136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064624
2111	NC_010553	ACT	2	6	95189	95194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064624
2112	NC_010553	GGA	2	6	95220	95225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064624
2113	NC_010553	CGC	2	6	95292	95297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064624
2114	NC_010553	CTT	2	6	95298	95303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064624
2115	NC_010553	GCCGA	2	10	95305	95314	20 %	0 %	40 %	40 %	172064624
2116	NC_010553	GCG	2	6	95327	95332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064624
2117	NC_010553	CCG	2	6	95341	95346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064624
2118	NC_010553	CGA	2	6	95406	95411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064624
2119	NC_010553	TCG	3	9	95483	95491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064624
2120	NC_010553	CCG	2	6	95504	95509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064624
2121	NC_010553	GAG	2	6	95662	95667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064624
2122	NC_010553	GCG	2	6	95690	95695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064624
2123	NC_010553	CAG	2	6	95710	95715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064624
2124	NC_010553	CGC	2	6	95730	95735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064624
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2244	NC_010553	GGCC	2	8	100622	100629	0 %	0 %	50 %	50 %	172064627
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2249	NC_010553	G	6	6	100856	100861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2252	NC_010553	TCGC	2	8	101107	101114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2253	NC_010553	GAC	2	6	101172	101177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2285	NC_010553	GCGA	2	8	102819	102826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2366	NC_010553	CGA	2	6	106886	106891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064631
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2368	NC_010553	GTCGC	2	10	106996	107005	0 %	20 %	40 %	40 %	172064631
2369	NC_010553	TCGACG	2	12	107014	107025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172064631
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2373	NC_010553	GTC	2	6	107127	107132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064631
2374	NC_010553	GTCGC	2	10	107188	107197	0 %	20 %	40 %	40 %	172064631
2375	NC_010553	TCGACG	2	12	107206	107217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172064631
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2482	NC_010553	TGGG	2	8	111363	111370	0 %	25 %	75 %	0 %	172064635
2483	NC_010553	TCAC	2	8	111386	111393	25 %	25 %	0 %	50 %	172064635
2484	NC_010553	TCGA	2	8	111411	111418	25 %	25 %	25 %	25 %	172064635
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2487	NC_010553	TGCA	2	8	111499	111506	25 %	25 %	25 %	25 %	172064635
2488	NC_010553	AG	3	6	111585	111590	50 %	0 %	50 %	0 %	172064635
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2496	NC_010553	GA	3	6	111859	111864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_010553	TCA	2	6	111892	111897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_010553	GAT	2	6	111916	111921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064636
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