MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 6708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010553	GGT	2	6	200553	200558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064696
4502	NC_010553	CGT	2	6	200619	200624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064696
4503	NC_010553	GGCGT	2	10	200647	200656	0 %	20 %	60 %	20 %	172064696
4504	NC_010553	GCCG	2	8	200667	200674	0 %	0 %	50 %	50 %	172064696
4505	NC_010553	GC	3	6	200719	200724	0 %	0 %	50 %	50 %	172064696
4506	NC_010553	AGC	2	6	200744	200749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064696
4507	NC_010553	CGC	2	6	200766	200771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064696
4508	NC_010553	GC	3	6	200879	200884	0 %	0 %	50 %	50 %	172064696
4509	NC_010553	ATGA	2	8	200891	200898	50 %	25 %	25 %	0 %	172064696
4510	NC_010553	GCA	3	9	200928	200936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_010553	AAT	2	6	200940	200945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_010553	TCC	2	6	200993	200998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_010553	TCA	2	6	201070	201075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_010553	CAG	2	6	201080	201085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_010553	GCG	2	6	201100	201105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_010553	CCG	2	6	201177	201182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_010553	TCG	2	6	201225	201230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_010553	GC	4	8	201269	201276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_010553	GCG	2	6	201460	201465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_010553	GCACGC	2	12	201493	201504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_010553	GGC	2	6	201563	201568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_010553	ACG	2	6	201613	201618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_010553	CGG	2	6	201629	201634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_010553	GGC	2	6	201639	201644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_010553	GCA	2	6	201683	201688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_010553	CGG	2	6	201702	201707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_010553	AGC	2	6	201739	201744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_010553	CGGAT	2	10	201861	201870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4529	NC_010553	GGC	2	6	201910	201915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_010553	AAT	2	6	201949	201954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_010553	CGA	2	6	201990	201995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_010553	ACGA	2	8	202022	202029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_010553	CCGA	2	8	202060	202067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_010553	GCA	2	6	202080	202085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_010553	GCG	2	6	202145	202150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_010553	GCATC	2	10	202151	202160	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4537	NC_010553	TCGCGA	2	12	202166	202177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_010553	GGCG	2	8	202197	202204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_010553	CGG	2	6	202224	202229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_010553	TCA	2	6	202295	202300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_010553	GCCGGC	2	12	202345	202356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_010553	CAT	2	6	202391	202396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_010553	ACA	2	6	202462	202467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064697
4544	NC_010553	TTC	2	6	202512	202517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064697
4545	NC_010553	GGCC	2	8	202526	202533	0 %	0 %	50 %	50 %	172064697
4546	NC_010553	CGT	2	6	202573	202578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064697
4547	NC_010553	GGA	2	6	202619	202624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064697
4548	NC_010553	ACG	2	6	202629	202634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064697
4549	NC_010553	CATC	2	8	202762	202769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_010553	GGC	2	6	202821	202826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_010553	GAC	2	6	202879	202884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_010553	CCGA	2	8	203055	203062	25 %	0 %	25 %	50 %	172064698
4553	NC_010553	GTT	2	6	203066	203071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064698
4554	NC_010553	GGA	2	6	203109	203114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064698
4555	NC_010553	ATG	2	6	203116	203121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064698
4556	NC_010553	CTT	2	6	203144	203149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064698
4557	NC_010553	TTG	2	6	203154	203159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064698
4558	NC_010553	TCT	2	6	203220	203225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_010553	CGA	2	6	203263	203268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_010553	ACA	2	6	203279	203284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_010553	GCGG	2	8	203347	203354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_010553	ATT	2	6	203420	203425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_010553	TGT	2	6	203458	203463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_010553	CTTC	2	8	203726	203733	0 %	50 %	0 %	50 %	172064699
4565	NC_010553	TGCG	2	8	203877	203884	0 %	25 %	50 %	25 %	172064699
4566	NC_010553	CGT	2	6	204002	204007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064700
4567	NC_010553	CAT	2	6	204041	204046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064700
4568	NC_010553	CG	3	6	204068	204073	0 %	0 %	50 %	50 %	172064700
4569	NC_010553	GCT	2	6	204090	204095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064700
4570	NC_010553	TCC	2	6	204214	204219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064700
4571	NC_010553	GAC	2	6	204290	204295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064700
4572	NC_010553	TCG	2	6	204376	204381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064700
4573	NC_010553	TCC	2	6	204388	204393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064700
4574	NC_010553	GCC	2	6	204426	204431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064700
4575	NC_010553	CAC	2	6	204495	204500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064700
4576	NC_010553	TGT	2	6	204506	204511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064700
4577	NC_010553	GCG	2	6	204525	204530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_010553	GCG	2	6	204568	204573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_010553	AGC	2	6	204699	204704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_010553	TTC	2	6	204711	204716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_010553	CAG	2	6	204731	204736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_010553	AGC	2	6	204771	204776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_010553	GCCGC	2	10	204797	204806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4584	NC_010553	GC	3	6	204839	204844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_010553	CAGA	2	8	205029	205036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_010553	CAA	2	6	205093	205098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_010553	GCTA	2	8	205117	205124	25 %	25 %	25 %	25 %	172064701
4588	NC_010553	TCG	2	6	205170	205175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064701
4589	NC_010553	ATC	2	6	205200	205205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064701
4590	NC_010553	CGACCC	2	12	205240	205251	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	172064701
4591	NC_010553	TC	3	6	205328	205333	0 %	50 %	0 %	50 %	172064701
4592	NC_010553	TCT	2	6	205349	205354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064701
4593	NC_010553	TCA	2	6	205396	205401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064701
4594	NC_010553	TCA	2	6	205437	205442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064701
4595	NC_010553	GCG	2	6	205462	205467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064701
4596	NC_010553	GCA	2	6	205477	205482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064701
4597	NC_010553	A	7	7	205484	205490	100 %	0 %	0 %	0 %	172064701
4598	NC_010553	AACC	2	8	205504	205511	50 %	0 %	0 %	50 %	172064701
4599	NC_010553	TC	3	6	205518	205523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_010553	CAA	2	6	205527	205532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_010553	CTA	2	6	205542	205547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_010553	A	7	7	205558	205564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_010553	CAG	2	6	205754	205759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4604	NC_010553	TGC	2	6	205761	205766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4605	NC_010553	AGC	3	9	205828	205836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4606	NC_010553	GCT	2	6	205909	205914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4607	NC_010553	TCAAAA	2	12	205934	205945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	172064702
4608	NC_010553	AT	3	6	206044	206049	50 %	50 %	0 %	0 %	172064702
4609	NC_010553	ACGCC	2	10	206069	206078	20 %	0 %	20 %	60 %	172064702
4610	NC_010553	CAAC	2	8	206096	206103	50 %	0 %	0 %	50 %	172064702
4611	NC_010553	TTC	2	6	206104	206109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172064702
4612	NC_010553	CGT	2	6	206142	206147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4613	NC_010553	GGCGA	2	10	206205	206214	20 %	0 %	60 %	20 %	172064702
4614	NC_010553	GGT	2	6	206220	206225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064702
4615	NC_010553	ACA	2	6	206312	206317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064702
4616	NC_010553	CAG	2	6	206391	206396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4617	NC_010553	GCC	2	6	206440	206445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064702
4618	NC_010553	TGC	2	6	206448	206453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4619	NC_010553	GA	3	6	206484	206489	50 %	0 %	50 %	0 %	172064702
4620	NC_010553	AG	3	6	206499	206504	50 %	0 %	50 %	0 %	172064702
4621	NC_010553	CGA	2	6	206510	206515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4622	NC_010553	ATCAA	2	10	206527	206536	60 %	20 %	0 %	20 %	172064702
4623	NC_010553	AGC	2	6	206635	206640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4624	NC_010553	AGCCA	2	10	206655	206664	40 %	0 %	20 %	40 %	172064702
4625	NC_010553	GAA	2	6	206676	206681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064702
4626	NC_010553	ACCG	2	8	206742	206749	25 %	0 %	25 %	50 %	172064702
4627	NC_010553	GAC	2	6	206775	206780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4628	NC_010553	GCA	2	6	206827	206832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064702
4629	NC_010553	CGC	2	6	206849	206854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064702
4630	NC_010553	GCG	2	6	206857	206862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064702
4631	NC_010553	GGA	2	6	206894	206899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064702
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4650	NC_010553	ACG	2	6	207700	207705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4742	NC_010553	T	6	6	213075	213080	0 %	100 %	0 %	0 %	172064710
4743	NC_010553	GGTC	2	8	213104	213111	0 %	25 %	50 %	25 %	172064710
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4747	NC_010553	GGCGA	2	10	213258	213267	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4748	NC_010553	CGGGC	2	10	213332	213341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4749	NC_010553	ACTC	2	8	213428	213435	25 %	25 %	0 %	50 %	172064711
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4752	NC_010553	CACGTT	2	12	213500	213511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172064711
4753	NC_010553	TGA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064711
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4755	NC_010553	CGT	2	6	213611	213616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064711
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4757	NC_010553	CCG	2	6	213744	213749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4760	NC_010553	CGC	2	6	213781	213786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4769	NC_010553	GGT	2	6	214331	214336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4771	NC_010553	GC	3	6	214407	214412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4772	NC_010553	CGC	2	6	214436	214441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4777	NC_010553	TCG	2	6	214634	214639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4784	NC_010553	GTA	2	6	215026	215031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4851	NC_010553	AG	3	6	218331	218336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4852	NC_010553	TCT	2	6	218373	218378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4853	NC_010553	CG	3	6	218398	218403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4863	NC_010553	GTCG	2	8	218774	218781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4864	NC_010553	CA	3	6	218869	218874	50 %	0 %	0 %	50 %	172064721
4865	NC_010553	GCCG	2	8	218877	218884	0 %	0 %	50 %	50 %	172064721
4866	NC_010553	CGTT	2	8	218996	219003	0 %	50 %	25 %	25 %	172064721
4867	NC_010553	GCA	2	6	219028	219033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4869	NC_010553	GCTCG	2	10	219114	219123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4870	NC_010553	GC	3	6	219153	219158	0 %	0 %	50 %	50 %	172064722
4871	NC_010553	TTG	2	6	219211	219216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064722
4872	NC_010553	T	6	6	219250	219255	0 %	100 %	0 %	0 %	172064722
4873	NC_010553	ATT	2	6	219273	219278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172064722
4874	NC_010553	TCA	2	6	219389	219394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4875	NC_010553	CGT	2	6	219423	219428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4876	NC_010553	TGC	2	6	219440	219445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4877	NC_010553	CCG	2	6	219609	219614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064723
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4879	NC_010553	GATG	2	8	219697	219704	25 %	25 %	50 %	0 %	172064723
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4995	NC_010553	TCGAG	2	10	225720	225729	20 %	20 %	40 %	20 %	172064735
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4999	NC_010553	GCC	2	6	226032	226037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064735
5000	NC_010553	CG	3	6	226050	226055	0 %	0 %	50 %	50 %	172064735

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