MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 2

Total Repeats: 9132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010552	TCGC	2	8	90	97	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010552	GCAC	2	8	293	300	25 %	0 %	25 %	50 %	172062143
3	NC_010552	CGGC	2	8	310	317	0 %	0 %	50 %	50 %	172062143
4	NC_010552	CAAT	2	8	1203	1210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010552	CAAG	2	8	2186	2193	50 %	0 %	25 %	25 %	172062146
6	NC_010552	GTCG	2	8	2515	2522	0 %	25 %	50 %	25 %	172062147
7	NC_010552	GAAG	2	8	2773	2780	50 %	0 %	50 %	0 %	172062147
8	NC_010552	CGGC	2	8	3392	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010552	GGGC	2	8	3433	3440	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010552	GATT	2	8	3490	3497	25 %	50 %	25 %	0 %	172062148
11	NC_010552	GTCG	2	8	3522	3529	0 %	25 %	50 %	25 %	172062148
12	NC_010552	GCCA	2	8	3550	3557	25 %	0 %	25 %	50 %	172062148
13	NC_010552	TGGC	2	8	5207	5214	0 %	25 %	50 %	25 %	172062149
14	NC_010552	TGAT	2	8	5811	5818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010552	CCAG	2	8	5847	5854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010552	ACAG	2	8	6406	6413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010552	ATCG	2	8	8219	8226	25 %	25 %	25 %	25 %	172062151
18	NC_010552	CGAT	2	8	8767	8774	25 %	25 %	25 %	25 %	172062151
19	NC_010552	TTAT	2	8	9000	9007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010552	GCCG	2	8	9067	9074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010552	GGAC	2	8	9126	9133	25 %	0 %	50 %	25 %	172062152
22	NC_010552	CATG	2	8	9533	9540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010552	CGCC	2	8	9705	9712	0 %	0 %	25 %	75 %	172062153
24	NC_010552	GCCG	2	8	10078	10085	0 %	0 %	50 %	50 %	172062153
25	NC_010552	CGAC	2	8	10301	10308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010552	GAAG	2	8	10880	10887	50 %	0 %	50 %	0 %	172062154
27	NC_010552	CGAC	2	8	10921	10928	25 %	0 %	25 %	50 %	172062154
28	NC_010552	CGCA	2	8	11493	11500	25 %	0 %	25 %	50 %	172062154
29	NC_010552	CCCG	2	8	12003	12010	0 %	0 %	25 %	75 %	172062155
30	NC_010552	CCGC	2	8	12391	12398	0 %	0 %	25 %	75 %	172062155
31	NC_010552	TCTT	2	8	12967	12974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010552	TCGC	2	8	14128	14135	0 %	25 %	25 %	50 %	172062157
33	NC_010552	CGTG	2	8	14716	14723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010552	CATC	2	8	14954	14961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010552	CCTG	2	8	15039	15046	0 %	25 %	25 %	50 %	172062158
36	NC_010552	GGCC	2	8	15311	15318	0 %	0 %	50 %	50 %	172062158
37	NC_010552	GACG	2	8	15647	15654	25 %	0 %	50 %	25 %	172062158
38	NC_010552	CGCC	2	8	15700	15707	0 %	0 %	25 %	75 %	172062158
39	NC_010552	CGGC	2	8	15711	15718	0 %	0 %	50 %	50 %	172062158
40	NC_010552	TATT	2	8	16139	16146	25 %	75 %	0 %	0 %	172062159
41	NC_010552	GCGA	2	8	17099	17106	25 %	0 %	50 %	25 %	172062159
42	NC_010552	CCGA	2	8	17251	17258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010552	CGCC	2	8	17767	17774	0 %	0 %	25 %	75 %	172062160
44	NC_010552	GCCT	2	8	17829	17836	0 %	25 %	25 %	50 %	172062160
45	NC_010552	GGCA	2	8	18049	18056	25 %	0 %	50 %	25 %	172062160
46	NC_010552	TCGT	2	8	18404	18411	0 %	50 %	25 %	25 %	172062161
47	NC_010552	GGCG	2	8	19081	19088	0 %	0 %	75 %	25 %	172062161
48	NC_010552	ACGC	2	8	19101	19108	25 %	0 %	25 %	50 %	172062161
49	NC_010552	CGGC	2	8	19127	19134	0 %	0 %	50 %	50 %	172062161
50	NC_010552	ACGC	2	8	19253	19260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010552	CGTG	2	8	19932	19939	0 %	25 %	50 %	25 %	172062163
52	NC_010552	CGGG	2	8	20445	20452	0 %	0 %	75 %	25 %	172062163
53	NC_010552	CCGA	2	8	20555	20562	25 %	0 %	25 %	50 %	172062163
54	NC_010552	TCGA	2	8	21181	21188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010552	CCTT	2	8	21525	21532	0 %	50 %	0 %	50 %	172062164
56	NC_010552	CGCC	2	8	21955	21962	0 %	0 %	25 %	75 %	172062164
57	NC_010552	GAAT	2	8	22645	22652	50 %	25 %	25 %	0 %	172062165
58	NC_010552	AATT	2	8	22923	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010552	CCGG	2	8	23161	23168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010552	CTGC	2	8	23389	23396	0 %	25 %	25 %	50 %	172062166
61	NC_010552	CGGC	2	8	23753	23760	0 %	0 %	50 %	50 %	172062166
62	NC_010552	GGGC	2	8	24137	24144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010552	ACAT	2	8	24178	24185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010552	GCCG	2	8	24560	24567	0 %	0 %	50 %	50 %	172062168
65	NC_010552	ATCG	2	8	24638	24645	25 %	25 %	25 %	25 %	172062168
66	NC_010552	ACGA	2	8	24651	24658	50 %	0 %	25 %	25 %	172062168
67	NC_010552	AGCC	2	8	25241	25248	25 %	0 %	25 %	50 %	172062169
68	NC_010552	TGCG	2	8	25320	25327	0 %	25 %	50 %	25 %	172062169
69	NC_010552	TTCA	2	8	26011	26018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010552	ATTA	2	8	26106	26113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010552	CAAA	2	8	26175	26182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010552	CGGT	2	8	26522	26529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010552	AATC	2	8	26547	26554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010552	GCGA	3	12	26582	26593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010552	GCCG	2	8	27025	27032	0 %	0 %	50 %	50 %	172062170
76	NC_010552	GCCG	2	8	27556	27563	0 %	0 %	50 %	50 %	172062170
77	NC_010552	ATCG	2	8	28443	28450	25 %	25 %	25 %	25 %	172062171
78	NC_010552	CCGG	2	8	28869	28876	0 %	0 %	50 %	50 %	172062171
79	NC_010552	GTGC	2	8	28888	28895	0 %	25 %	50 %	25 %	172062171
80	NC_010552	GCCG	2	8	29061	29068	0 %	0 %	50 %	50 %	172062171
81	NC_010552	GCGG	2	8	29181	29188	0 %	0 %	75 %	25 %	172062171
82	NC_010552	TGCG	2	8	29267	29274	0 %	25 %	50 %	25 %	172062171
83	NC_010552	TGCC	2	8	29485	29492	0 %	25 %	25 %	50 %	172062171
84	NC_010552	GCCC	2	8	29564	29571	0 %	0 %	25 %	75 %	172062171
85	NC_010552	CTGG	2	8	29652	29659	0 %	25 %	50 %	25 %	172062171
86	NC_010552	CGAC	2	8	29909	29916	25 %	0 %	25 %	50 %	172062171
87	NC_010552	GCTC	2	8	30150	30157	0 %	25 %	25 %	50 %	172062171
88	NC_010552	ACGC	2	8	30673	30680	25 %	0 %	25 %	50 %	172062171
89	NC_010552	TCGC	2	8	31057	31064	0 %	25 %	25 %	50 %	172062171
90	NC_010552	CTCG	2	8	31101	31108	0 %	25 %	25 %	50 %	172062171
91	NC_010552	CGCA	2	8	31185	31192	25 %	0 %	25 %	50 %	172062171
92	NC_010552	CGGC	2	8	31931	31938	0 %	0 %	50 %	50 %	172062172
93	NC_010552	TGCG	2	8	32124	32131	0 %	25 %	50 %	25 %	172062173
94	NC_010552	CGGC	2	8	32923	32930	0 %	0 %	50 %	50 %	172062174
95	NC_010552	TGCG	2	8	33126	33133	0 %	25 %	50 %	25 %	172062174
96	NC_010552	GCCG	2	8	34025	34032	0 %	0 %	50 %	50 %	172062174
97	NC_010552	CGTG	2	8	34033	34040	0 %	25 %	50 %	25 %	172062174
98	NC_010552	CGTG	2	8	34205	34212	0 %	25 %	50 %	25 %	172062174
99	NC_010552	GCCC	2	8	34810	34817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_010552	GCTG	2	8	35357	35364	0 %	25 %	50 %	25 %	172062175
101	NC_010552	CTCG	2	8	35728	35735	0 %	25 %	25 %	50 %	172062176
102	NC_010552	CGCC	2	8	35794	35801	0 %	0 %	25 %	75 %	172062176
103	NC_010552	TCGC	2	8	36095	36102	0 %	25 %	25 %	50 %	172062176
104	NC_010552	CGAG	2	8	36477	36484	25 %	0 %	50 %	25 %	172062176
105	NC_010552	GGCT	2	8	36933	36940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010552	ATGC	2	8	36999	37006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010552	GCGG	2	8	37169	37176	0 %	0 %	75 %	25 %	172062177
108	NC_010552	CGGG	2	8	37206	37213	0 %	0 %	75 %	25 %	172062177
109	NC_010552	GCGG	2	8	37540	37547	0 %	0 %	75 %	25 %	172062177
110	NC_010552	CGGC	2	8	37815	37822	0 %	0 %	50 %	50 %	172062177
111	NC_010552	CGCA	2	8	38180	38187	25 %	0 %	25 %	50 %	172062177
112	NC_010552	GCCC	2	8	38403	38410	0 %	0 %	25 %	75 %	172062177
113	NC_010552	CGTC	2	8	38505	38512	0 %	25 %	25 %	50 %	172062177
114	NC_010552	GGCC	2	8	38781	38788	0 %	0 %	50 %	50 %	172062178
115	NC_010552	CGAC	2	8	38852	38859	25 %	0 %	25 %	50 %	172062178
116	NC_010552	GCCG	2	8	38925	38932	0 %	0 %	50 %	50 %	172062178
117	NC_010552	GCTG	2	8	39065	39072	0 %	25 %	50 %	25 %	172062178
118	NC_010552	CAGC	2	8	39688	39695	25 %	0 %	25 %	50 %	172062178
119	NC_010552	ACGA	2	8	39997	40004	50 %	0 %	25 %	25 %	172062178
120	NC_010552	CCCG	2	8	40209	40216	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_010552	CGGG	2	8	40225	40232	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010552	GGCC	2	8	40651	40658	0 %	0 %	50 %	50 %	172062179
123	NC_010552	CCGA	2	8	40757	40764	25 %	0 %	25 %	50 %	172062179
124	NC_010552	CGAT	2	8	40812	40819	25 %	25 %	25 %	25 %	172062179
125	NC_010552	CGAG	2	8	41103	41110	25 %	0 %	50 %	25 %	172062179
126	NC_010552	ATTG	2	8	41112	41119	25 %	50 %	25 %	0 %	172062179
127	NC_010552	CGTG	2	8	41514	41521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010552	CGTG	2	8	41677	41684	0 %	25 %	50 %	25 %	172062180
129	NC_010552	GCGA	2	8	41772	41779	25 %	0 %	50 %	25 %	172062180
130	NC_010552	GGCC	2	8	42593	42600	0 %	0 %	50 %	50 %	172062181
131	NC_010552	CGAG	2	8	42671	42678	25 %	0 %	50 %	25 %	172062181
132	NC_010552	GCAC	2	8	43452	43459	25 %	0 %	25 %	50 %	172062182
133	NC_010552	CGGC	2	8	43857	43864	0 %	0 %	50 %	50 %	172062182
134	NC_010552	CGGC	2	8	44010	44017	0 %	0 %	50 %	50 %	172062182
135	NC_010552	GCTT	2	8	44993	45000	0 %	50 %	25 %	25 %	172062183
136	NC_010552	AGCC	2	8	45245	45252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010552	GCCG	2	8	45520	45527	0 %	0 %	50 %	50 %	172062184
138	NC_010552	CGAT	2	8	46943	46950	25 %	25 %	25 %	25 %	172062185
139	NC_010552	CGAT	2	8	47633	47640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010552	GACG	2	8	47693	47700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010552	CGTG	2	8	49186	49193	0 %	25 %	50 %	25 %	172062187
142	NC_010552	GGCT	2	8	49443	49450	0 %	25 %	50 %	25 %	172062187
143	NC_010552	GCGG	2	8	49535	49542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010552	GCTC	2	8	49852	49859	0 %	25 %	25 %	50 %	172062188
145	NC_010552	TGAC	2	8	50164	50171	25 %	25 %	25 %	25 %	172062188
146	NC_010552	CTGC	2	8	50271	50278	0 %	25 %	25 %	50 %	172062188
147	NC_010552	GCAT	2	8	50430	50437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010552	CGCA	2	8	50548	50555	25 %	0 %	25 %	50 %	172062189
149	NC_010552	CGTG	2	8	50603	50610	0 %	25 %	50 %	25 %	172062189
150	NC_010552	GCCG	2	8	50715	50722	0 %	0 %	50 %	50 %	172062189
151	NC_010552	TCGC	2	8	51399	51406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010552	CCGG	2	8	51620	51627	0 %	0 %	50 %	50 %	172062190
153	NC_010552	CGTG	2	8	51926	51933	0 %	25 %	50 %	25 %	172062190
154	NC_010552	ATTT	2	8	52112	52119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010552	CCGA	2	8	52412	52419	25 %	0 %	25 %	50 %	172062191
156	NC_010552	CTGC	2	8	52635	52642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_010552	CGTC	2	8	52665	52672	0 %	25 %	25 %	50 %	172062192
158	NC_010552	TCGG	2	8	53000	53007	0 %	25 %	50 %	25 %	172062192
159	NC_010552	GCCG	2	8	53613	53620	0 %	0 %	50 %	50 %	172062193
160	NC_010552	GCGA	2	8	53621	53628	25 %	0 %	50 %	25 %	172062193
161	NC_010552	GCCG	2	8	53994	54001	0 %	0 %	50 %	50 %	172062193
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163	NC_010552	CGGG	2	8	54992	54999	0 %	0 %	75 %	25 %	172062194
164	NC_010552	CGGC	2	8	55003	55010	0 %	0 %	50 %	50 %	172062194
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171	NC_010552	CCGA	2	8	56946	56953	25 %	0 %	25 %	50 %	172062196
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175	NC_010552	CCTC	2	8	59064	59071	0 %	25 %	0 %	75 %	172062199
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181	NC_010552	CTCG	2	8	60501	60508	0 %	25 %	25 %	50 %	172062200
182	NC_010552	CCGG	2	8	60607	60614	0 %	0 %	50 %	50 %	172062200
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184	NC_010552	GCTG	2	8	61083	61090	0 %	25 %	50 %	25 %	172062200
185	NC_010552	TCGA	2	8	61283	61290	25 %	25 %	25 %	25 %	172062201
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189	NC_010552	TCGT	2	8	62524	62531	0 %	50 %	25 %	25 %	172062202
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191	NC_010552	TTCG	2	8	63057	63064	0 %	50 %	25 %	25 %	172062202
192	NC_010552	CCTT	2	8	64471	64478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_010552	GAAA	2	8	64595	64602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010552	GCAT	2	8	64787	64794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_010552	CTGC	2	8	65624	65631	0 %	25 %	25 %	50 %	172062205
196	NC_010552	CCAG	2	8	65728	65735	25 %	0 %	25 %	50 %	172062205
197	NC_010552	GAAG	2	8	66262	66269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_010552	TCGC	2	8	66734	66741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
199	NC_010552	TACA	2	8	66936	66943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_010552	TTGG	2	8	67416	67423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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228	NC_010552	ACGG	2	8	79896	79903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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231	NC_010552	GATC	2	8	80659	80666	25 %	25 %	25 %	25 %	172062216
232	NC_010552	TTGA	2	8	81110	81117	25 %	50 %	25 %	0 %	172062216
233	NC_010552	CTGA	2	8	81899	81906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
234	NC_010552	GAAG	2	8	81976	81983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
235	NC_010552	TGTA	2	8	82338	82345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
236	NC_010552	GGTT	2	8	82649	82656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_010552	CGGA	2	8	85403	85410	25 %	0 %	50 %	25 %	172062223
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245	NC_010552	TGTC	2	8	86974	86981	0 %	50 %	25 %	25 %	172062224
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247	NC_010552	CGAG	2	8	88269	88276	25 %	0 %	50 %	25 %	172062225
248	NC_010552	GTCG	2	8	89252	89259	0 %	25 %	50 %	25 %	172062226
249	NC_010552	GCGG	2	8	89393	89400	0 %	0 %	75 %	25 %	172062226
250	NC_010552	ATGT	2	8	90677	90684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010552	CGAG	2	8	90703	90710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
252	NC_010552	TGCG	2	8	91344	91351	0 %	25 %	50 %	25 %	172062227
253	NC_010552	CGCC	2	8	91746	91753	0 %	0 %	25 %	75 %	172062227
254	NC_010552	TCAC	2	8	91919	91926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
255	NC_010552	GCGG	2	8	92261	92268	0 %	0 %	75 %	25 %	172062228
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258	NC_010552	GCAA	2	8	94987	94994	50 %	0 %	25 %	25 %	172062231
259	NC_010552	CGGC	2	8	95387	95394	0 %	0 %	50 %	50 %	172062231
260	NC_010552	CAGC	2	8	95602	95609	25 %	0 %	25 %	50 %	172062232
261	NC_010552	CCCG	2	8	95705	95712	0 %	0 %	25 %	75 %	172062232
262	NC_010552	TCGC	2	8	96410	96417	0 %	25 %	25 %	50 %	172062233
263	NC_010552	TTCG	2	8	96451	96458	0 %	50 %	25 %	25 %	172062233
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274	NC_010552	TCCG	2	8	98296	98303	0 %	25 %	25 %	50 %	172062235
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277	NC_010552	CGGG	2	8	98585	98592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_010552	CGCC	2	8	99151	99158	0 %	0 %	25 %	75 %	172062236
282	NC_010552	GCCC	2	8	99256	99263	0 %	0 %	25 %	75 %	172062236
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