MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 1

Total Repeats: 101381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010551	CA	3	6	24412	24417	50 %	0 %	0 %	50 %	172059080
502	NC_010551	CCA	2	6	24459	24464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172059080
503	NC_010551	CCA	2	6	24492	24497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172059080
504	NC_010551	ACA	2	6	24513	24518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172059080
505	NC_010551	ATC	2	6	24527	24532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172059080
506	NC_010551	GCA	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059080
507	NC_010551	CGT	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059080
508	NC_010551	TCA	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172059080
509	NC_010551	CCGCG	2	10	24612	24621	0 %	0 %	40 %	60 %	172059081
510	NC_010551	CGC	2	6	24672	24677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059081
511	NC_010551	CGC	2	6	24684	24689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059081
512	NC_010551	TCG	2	6	24812	24817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059081
513	NC_010551	TGCGC	2	10	24818	24827	0 %	20 %	40 %	40 %	172059081
514	NC_010551	TCG	2	6	24839	24844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059081
515	NC_010551	CGT	2	6	24845	24850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059081
516	NC_010551	CAG	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059081
517	NC_010551	CTG	2	6	24930	24935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059081
518	NC_010551	GCCG	2	8	24975	24982	0 %	0 %	50 %	50 %	172059081
519	NC_010551	ACG	2	6	24994	24999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059081
520	NC_010551	CACCG	2	10	25003	25012	20 %	0 %	20 %	60 %	172059081
521	NC_010551	CGA	2	6	25034	25039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059081
522	NC_010551	TAA	2	6	25060	25065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059081
523	NC_010551	GC	3	6	25136	25141	0 %	0 %	50 %	50 %	172059081
524	NC_010551	CCGG	2	8	25190	25197	0 %	0 %	50 %	50 %	172059081
525	NC_010551	CGGTG	2	10	25287	25296	0 %	20 %	60 %	20 %	172059081
526	NC_010551	GCT	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059081
527	NC_010551	CCCG	2	8	25350	25357	0 %	0 %	25 %	75 %	172059081
528	NC_010551	ACC	2	6	25375	25380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172059081
529	NC_010551	GAA	2	6	25398	25403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059081
530	NC_010551	GC	3	6	25496	25501	0 %	0 %	50 %	50 %	172059081
531	NC_010551	CGC	3	9	25499	25507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059081
532	NC_010551	CGA	2	6	25526	25531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059081
533	NC_010551	AGCC	2	8	25561	25568	25 %	0 %	25 %	50 %	172059081
534	NC_010551	CGC	2	6	25607	25612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059081
535	NC_010551	CCA	2	6	25629	25634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172059081
536	NC_010551	CG	3	6	25649	25654	0 %	0 %	50 %	50 %	172059081
537	NC_010551	GCG	3	9	25652	25660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172059081
538	NC_010551	AAG	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059081
539	NC_010551	CGC	2	6	25727	25732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_010551	CGC	2	6	25736	25741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_010551	GAA	2	6	25752	25757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010551	GCG	2	6	25782	25787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010551	CGA	3	9	25857	25865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059082
544	NC_010551	CTGG	2	8	25908	25915	0 %	25 %	50 %	25 %	172059082
545	NC_010551	CG	3	6	25916	25921	0 %	0 %	50 %	50 %	172059082
546	NC_010551	GC	4	8	25962	25969	0 %	0 %	50 %	50 %	172059082
547	NC_010551	GCC	2	6	25985	25990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059082
548	NC_010551	CGA	2	6	25992	25997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059082
549	NC_010551	AGCGC	2	10	26054	26063	20 %	0 %	40 %	40 %	172059082
550	NC_010551	CGA	4	12	26097	26108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059082
551	NC_010551	CCG	2	6	26123	26128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059082
552	NC_010551	CG	3	6	26142	26147	0 %	0 %	50 %	50 %	172059082
553	NC_010551	GCC	2	6	26168	26173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059082
554	NC_010551	CGA	2	6	26178	26183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059082
555	NC_010551	GCAGC	2	10	26184	26193	20 %	0 %	40 %	40 %	172059082
556	NC_010551	CTG	3	9	26194	26202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059082
557	NC_010551	TCG	2	6	26204	26209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059082
558	NC_010551	GCT	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059082
559	NC_010551	CG	4	8	26287	26294	0 %	0 %	50 %	50 %	172059082
560	NC_010551	TC	3	6	26338	26343	0 %	50 %	0 %	50 %	172059082
561	NC_010551	TGA	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059082
562	NC_010551	AAC	2	6	26358	26363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172059082
563	NC_010551	CGA	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059083
564	NC_010551	CGA	3	9	26411	26419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059083
565	NC_010551	GCA	2	6	26486	26491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059083
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569	NC_010551	TTCG	2	8	26618	26625	0 %	50 %	25 %	25 %	172059083
570	NC_010551	GC	3	6	26664	26669	0 %	0 %	50 %	50 %	172059083
571	NC_010551	GCC	2	6	26684	26689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059083
572	NC_010551	GAT	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059083
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574	NC_010551	CGA	2	6	26767	26772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059083
575	NC_010551	TGC	2	6	26840	26845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059083
576	NC_010551	GGCG	2	8	26862	26869	0 %	0 %	75 %	25 %	172059083
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579	NC_010551	CGGA	2	8	26927	26934	25 %	0 %	50 %	25 %	172059083
580	NC_010551	GCT	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059083
581	NC_010551	CGG	2	6	26983	26988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172059083
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584	NC_010551	GA	3	6	27119	27124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010551	GCG	2	6	27129	27134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010551	GGCC	2	8	27153	27160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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588	NC_010551	GC	3	6	27184	27189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010551	CG	3	6	27200	27205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_010551	GGGC	2	8	27230	27237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
591	NC_010551	TCG	2	6	27240	27245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_010551	GTT	2	6	27435	27440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010551	AGC	2	6	27472	27477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010551	TCCC	2	8	27520	27527	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
595	NC_010551	CTT	2	6	27552	27557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059084
596	NC_010551	GCT	2	6	27617	27622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059084
597	NC_010551	TCG	2	6	27632	27637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059084
598	NC_010551	CCCT	2	8	27658	27665	0 %	25 %	0 %	75 %	172059084
599	NC_010551	CCG	2	6	27830	27835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059084
600	NC_010551	CCA	2	6	27968	27973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_010551	ACA	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010551	CAC	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172059085
603	NC_010551	CCG	2	6	28265	28270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059085
604	NC_010551	TCT	2	6	28278	28283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059085
605	NC_010551	CGCAC	2	10	28298	28307	20 %	0 %	20 %	60 %	172059085
606	NC_010551	CGT	2	6	28365	28370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059085
607	NC_010551	ATGTC	2	10	28437	28446	20 %	40 %	20 %	20 %	172059085
608	NC_010551	TCG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010551	CCG	2	6	28522	28527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_010551	ACC	2	6	28666	28671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_010551	GCA	2	6	28740	28745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010551	AAC	2	6	28749	28754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010551	GC	4	8	28935	28942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_010551	A	6	6	28954	28959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010551	CTC	2	6	28980	28985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_010551	CT	3	6	28993	28998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_010551	CTT	2	6	29010	29015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010551	CAC	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010551	TGG	2	6	29054	29059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010551	GCAT	2	8	29211	29218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_010551	AGC	2	6	29272	29277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010551	GC	3	6	29276	29281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010551	CGA	2	6	29369	29374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059086
624	NC_010551	CGT	2	6	29381	29386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059086
625	NC_010551	GTC	2	6	29401	29406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059086
626	NC_010551	TGA	2	6	29453	29458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059086
627	NC_010551	CG	3	6	29463	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	172059086
628	NC_010551	AAC	2	6	29494	29499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172059086
629	NC_010551	TCA	2	6	29522	29527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172059086
630	NC_010551	CG	3	6	29562	29567	0 %	0 %	50 %	50 %	172059086
631	NC_010551	GCC	3	9	29571	29579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059086
632	NC_010551	CGC	2	6	29633	29638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059086
633	NC_010551	CGC	2	6	29646	29651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172059086
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672	NC_010551	GGC	2	6	30973	30978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_010551	CGT	2	6	34216	34221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172059091
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762	NC_010551	GCAGC	2	10	34283	34292	20 %	0 %	40 %	40 %	172059091
763	NC_010551	ATTG	2	8	34311	34318	25 %	50 %	25 %	0 %	172059091
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1000	NC_010551	GCG	2	6	42644	42649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172059097

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