MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 3

Total Repeats: 34197

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_010512	GC	3	6	1218237	1218242	0 %	0 %	50 %	50 %	170735566
34002	NC_010512	CGT	2	6	1218248	1218253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735566
34003	NC_010512	CG	3	6	1218264	1218269	0 %	0 %	50 %	50 %	170735566
34004	NC_010512	GTCG	2	8	1218276	1218283	0 %	25 %	50 %	25 %	170735566
34005	NC_010512	CG	3	6	1218282	1218287	0 %	0 %	50 %	50 %	170735566
34006	NC_010512	GCA	2	6	1218347	1218352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735566
34007	NC_010512	CGA	2	6	1218354	1218359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735566
34008	NC_010512	CGC	2	6	1218369	1218374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735566
34009	NC_010512	GAA	2	6	1218375	1218380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170735566
34010	NC_010512	TGG	2	6	1218398	1218403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170735566
34011	NC_010512	TGGT	2	8	1218508	1218515	0 %	50 %	50 %	0 %	170735566
34012	NC_010512	TGCG	2	8	1218553	1218560	0 %	25 %	50 %	25 %	170735566
34013	NC_010512	CG	3	6	1218576	1218581	0 %	0 %	50 %	50 %	170735566
34014	NC_010512	GC	3	6	1218584	1218589	0 %	0 %	50 %	50 %	170735566
34015	NC_010512	CCG	2	6	1218595	1218600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735566
34016	NC_010512	TCCG	2	8	1218718	1218725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34017	NC_010512	CGGA	2	8	1218727	1218734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34018	NC_010512	GTT	2	6	1218769	1218774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_010512	CTT	2	6	1218787	1218792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735567
34020	NC_010512	GAC	2	6	1218800	1218805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34021	NC_010512	CGC	2	6	1218820	1218825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34022	NC_010512	GCG	2	6	1218828	1218833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34023	NC_010512	GTC	2	6	1218850	1218855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34024	NC_010512	CTG	3	9	1218867	1218875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34025	NC_010512	GGC	2	6	1218880	1218885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34026	NC_010512	ACTTC	2	10	1218969	1218978	20 %	40 %	0 %	40 %	170735567
34027	NC_010512	CG	4	8	1219092	1219099	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34028	NC_010512	CGA	2	6	1219137	1219142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34029	NC_010512	GCG	3	9	1219175	1219183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34030	NC_010512	CAC	2	6	1219189	1219194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735567
34031	NC_010512	TGT	2	6	1219227	1219232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735567
34032	NC_010512	TCG	2	6	1219262	1219267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34033	NC_010512	GC	3	6	1219345	1219350	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34034	NC_010512	ATG	2	6	1219376	1219381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735567
34035	NC_010512	CGC	2	6	1219384	1219389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34036	NC_010512	GAT	3	9	1219408	1219416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735567
34037	NC_010512	CGT	2	6	1219464	1219469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34038	NC_010512	GCA	3	9	1219479	1219487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34039	NC_010512	TCG	2	6	1219520	1219525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34040	NC_010512	GCG	2	6	1219546	1219551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34041	NC_010512	GCC	2	6	1219573	1219578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34042	NC_010512	TCG	2	6	1219580	1219585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34043	NC_010512	GCG	2	6	1219602	1219607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34044	NC_010512	CG	3	6	1219619	1219624	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34045	NC_010512	GAT	2	6	1219663	1219668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735567
34046	NC_010512	TCG	2	6	1219676	1219681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34047	NC_010512	GC	3	6	1219787	1219792	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34048	NC_010512	ACC	2	6	1219820	1219825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735567
34049	NC_010512	GCT	2	6	1219857	1219862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34050	NC_010512	CAG	2	6	1219873	1219878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34051	NC_010512	CAT	2	6	1220002	1220007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735567
34052	NC_010512	TCG	2	6	1220009	1220014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34053	NC_010512	TTC	2	6	1220041	1220046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735567
34054	NC_010512	GCTTC	2	10	1220052	1220061	0 %	40 %	20 %	40 %	170735567
34055	NC_010512	CG	4	8	1220169	1220176	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34056	NC_010512	CGG	2	6	1220247	1220252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34057	NC_010512	CGA	2	6	1220256	1220261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34058	NC_010512	CGT	2	6	1220265	1220270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34059	NC_010512	TGG	2	6	1220285	1220290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170735567
34060	NC_010512	GCG	2	6	1220374	1220379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34061	NC_010512	GCG	2	6	1220387	1220392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34062	NC_010512	CGT	2	6	1220425	1220430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34063	NC_010512	CGC	2	6	1220451	1220456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34064	NC_010512	GC	3	6	1220455	1220460	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34065	NC_010512	GCC	2	6	1220494	1220499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34066	NC_010512	CGC	3	9	1220502	1220510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34067	NC_010512	CGA	2	6	1220523	1220528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34068	NC_010512	TCG	2	6	1220540	1220545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34069	NC_010512	TCG	2	6	1220582	1220587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34070	NC_010512	GCT	2	6	1220592	1220597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34071	NC_010512	CG	3	6	1220599	1220604	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34072	NC_010512	CGC	2	6	1220616	1220621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34073	NC_010512	CCA	2	6	1220637	1220642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735567
34074	NC_010512	CGA	2	6	1220661	1220666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34075	NC_010512	GCA	2	6	1220679	1220684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34076	NC_010512	CGA	2	6	1220727	1220732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34077	NC_010512	GTT	2	6	1220773	1220778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735567
34078	NC_010512	CTT	2	6	1220779	1220784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735567
34079	NC_010512	GCG	2	6	1220785	1220790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34080	NC_010512	CG	3	6	1220789	1220794	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34081	NC_010512	GC	3	6	1220823	1220828	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34082	NC_010512	GC	3	6	1220857	1220862	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34083	NC_010512	TCC	2	6	1220930	1220935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170735567
34084	NC_010512	ACC	2	6	1220948	1220953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735567
34085	NC_010512	CAG	2	6	1221001	1221006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34086	NC_010512	CAG	2	6	1221046	1221051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34087	NC_010512	CG	3	6	1221084	1221089	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34088	NC_010512	CTT	2	6	1221115	1221120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735567
34089	NC_010512	CG	3	6	1221123	1221128	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34090	NC_010512	GCG	2	6	1221150	1221155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34091	NC_010512	CAG	2	6	1221235	1221240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34092	NC_010512	CAG	2	6	1221274	1221279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34093	NC_010512	GCG	2	6	1221301	1221306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34094	NC_010512	CG	3	6	1221328	1221333	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34095	NC_010512	GCA	2	6	1221336	1221341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34096	NC_010512	GTCG	2	8	1221367	1221374	0 %	25 %	50 %	25 %	170735567
34097	NC_010512	CG	3	6	1221387	1221392	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34098	NC_010512	CGG	2	6	1221399	1221404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34099	NC_010512	GCG	2	6	1221408	1221413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735567
34100	NC_010512	GTC	2	6	1221415	1221420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34101	NC_010512	GCC	2	6	1221427	1221432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735567
34102	NC_010512	CGA	2	6	1221439	1221444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34103	NC_010512	CAG	2	6	1221460	1221465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735567
34104	NC_010512	AGATCG	2	12	1221525	1221536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170735567
34105	NC_010512	GC	4	8	1221566	1221573	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34106	NC_010512	CGGC	2	8	1221576	1221583	0 %	0 %	50 %	50 %	170735567
34107	NC_010512	TGG	2	6	1221615	1221620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170735567
34108	NC_010512	TGCGG	2	10	1221664	1221673	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34109	NC_010512	CG	3	6	1221678	1221683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34110	NC_010512	ACG	2	6	1221700	1221705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34111	NC_010512	CGG	2	6	1221722	1221727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34112	NC_010512	CG	3	6	1221728	1221733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34113	NC_010512	GC	4	8	1221757	1221764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34114	NC_010512	CGGTCG	2	12	1221777	1221788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34115	NC_010512	GAG	2	6	1221811	1221816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34116	NC_010512	GCCGG	2	10	1221885	1221894	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34117	NC_010512	CGG	2	6	1221928	1221933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34118	NC_010512	CG	7	14	1221947	1221960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34119	NC_010512	GCGCG	2	10	1221974	1221983	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34120	NC_010512	GC	3	6	1222018	1222023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34121	NC_010512	GC	3	6	1222036	1222041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34122	NC_010512	GC	3	6	1222098	1222103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34123	NC_010512	CG	3	6	1222106	1222111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34124	NC_010512	CGCA	2	8	1222142	1222149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34125	NC_010512	TG	3	6	1222160	1222165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34126	NC_010512	GGA	2	6	1222184	1222189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34127	NC_010512	GTG	2	6	1222225	1222230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34128	NC_010512	GGC	2	6	1222363	1222368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735568
34129	NC_010512	ACG	2	6	1222390	1222395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735568
34130	NC_010512	CGG	2	6	1222406	1222411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735568
34131	NC_010512	TCGCGT	2	12	1222430	1222441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735568
34132	NC_010512	GACG	2	8	1222464	1222471	25 %	0 %	50 %	25 %	170735568
34133	NC_010512	ATTCG	2	10	1222494	1222503	20 %	40 %	20 %	20 %	170735568
34134	NC_010512	TCC	2	6	1222513	1222518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34135	NC_010512	CGA	2	6	1222540	1222545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34136	NC_010512	CGGC	2	8	1222551	1222558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34137	NC_010512	CG	4	8	1222570	1222577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34138	NC_010512	CGGG	2	8	1222583	1222590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34139	NC_010512	GC	4	8	1222593	1222600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34140	NC_010512	GGC	2	6	1222616	1222621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735569
34141	NC_010512	CTCG	2	8	1222655	1222662	0 %	25 %	25 %	50 %	170735569
34142	NC_010512	GAACGT	2	12	1222673	1222684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170735569
34143	NC_010512	CGC	3	9	1222768	1222776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735569
34144	NC_010512	GCC	2	6	1222793	1222798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735569
34145	NC_010512	GAT	2	6	1222817	1222822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735569
34146	NC_010512	CGC	2	6	1222825	1222830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735569
34147	NC_010512	CG	3	6	1222873	1222878	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34148	NC_010512	CCG	2	6	1222996	1223001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735569
34149	NC_010512	CGG	2	6	1223013	1223018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735569
34150	NC_010512	CGA	2	6	1223041	1223046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735569
34151	NC_010512	GCCG	2	8	1223048	1223055	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34152	NC_010512	CTTC	2	8	1223110	1223117	0 %	50 %	0 %	50 %	170735569
34153	NC_010512	CG	4	8	1223137	1223144	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34154	NC_010512	TCGCG	2	10	1223164	1223173	0 %	20 %	40 %	40 %	170735569
34155	NC_010512	CGA	2	6	1223200	1223205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735569
34156	NC_010512	GC	3	6	1223210	1223215	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34157	NC_010512	CG	3	6	1223226	1223231	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34158	NC_010512	CG	3	6	1223242	1223247	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34159	NC_010512	CGG	2	6	1223299	1223304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735569
34160	NC_010512	CGTCGA	2	12	1223308	1223319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170735569
34161	NC_010512	CGG	2	6	1223325	1223330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735569
34162	NC_010512	GC	3	6	1223354	1223359	0 %	0 %	50 %	50 %	170735569
34163	NC_010512	TCC	2	6	1223364	1223369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170735569
34164	NC_010512	GGC	2	6	1223384	1223389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735569
34165	NC_010512	CGA	2	6	1223390	1223395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735569
34166	NC_010512	ATT	2	6	1223420	1223425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170735569
34167	NC_010512	CGC	2	6	1223473	1223478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735570
34168	NC_010512	CGG	2	6	1223522	1223527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735570
34169	NC_010512	GCG	2	6	1223528	1223533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735570
34170	NC_010512	GAA	2	6	1223577	1223582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170735570
34171	NC_010512	CG	3	6	1223598	1223603	0 %	0 %	50 %	50 %	170735570
34172	NC_010512	CGG	2	6	1223634	1223639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735570
34173	NC_010512	CGA	2	6	1223645	1223650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34174	NC_010512	GC	3	6	1223688	1223693	0 %	0 %	50 %	50 %	170735570
34175	NC_010512	TGT	2	6	1223747	1223752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735570
34176	NC_010512	GCC	2	6	1223775	1223780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735570
34177	NC_010512	TCG	2	6	1223782	1223787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34178	NC_010512	ACG	2	6	1223813	1223818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34179	NC_010512	GAT	2	6	1223865	1223870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735570
34180	NC_010512	GCC	2	6	1223946	1223951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735570
34181	NC_010512	TCG	2	6	1223968	1223973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34182	NC_010512	CGA	2	6	1224026	1224031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34183	NC_010512	ATC	2	6	1224037	1224042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735570
34184	NC_010512	GC	3	6	1224043	1224048	0 %	0 %	50 %	50 %	170735570
34185	NC_010512	TCG	2	6	1224076	1224081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34186	NC_010512	GCA	2	6	1224164	1224169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34187	NC_010512	CGCGAC	2	12	1224186	1224197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170735570
34188	NC_010512	CACG	2	8	1224291	1224298	25 %	0 %	25 %	50 %	170735570
34189	NC_010512	GCC	2	6	1224306	1224311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735570
34190	NC_010512	CCGA	2	8	1224325	1224332	25 %	0 %	25 %	50 %	170735570
34191	NC_010512	GCG	2	6	1224343	1224348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735570
34192	NC_010512	CGC	2	6	1224353	1224358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735570
34193	NC_010512	TCG	2	6	1224401	1224406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735570
34194	NC_010512	GAG	2	6	1224464	1224469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170735570
34195	NC_010512	GTCA	2	8	1224492	1224499	25 %	25 %	25 %	25 %	170735570
34196	NC_010512	GACG	2	8	1224506	1224513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34197	NC_010512	GC	3	6	1224530	1224535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.