MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 4844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010170	GACCT	2	10	433	442	20 %	20 %	20 %	40 %	163854305
2	NC_010170	TTGCC	2	10	1241	1250	0 %	40 %	20 %	40 %	163854305
3	NC_010170	ACCAC	2	10	1331	1340	40 %	0 %	0 %	60 %	163854305
4	NC_010170	CGCAG	2	10	2934	2943	20 %	0 %	40 %	40 %	163854307
5	NC_010170	GTGCT	2	10	3477	3486	0 %	40 %	40 %	20 %	163854307
6	NC_010170	GGCCT	2	10	3633	3642	0 %	20 %	40 %	40 %	163854307
7	NC_010170	CCGCG	2	10	5037	5046	0 %	0 %	40 %	60 %	163854307
8	NC_010170	CGCGG	2	10	6934	6943	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010170	GGAAT	2	10	8249	8258	40 %	20 %	40 %	0 %	163854311
10	NC_010170	GGGCC	2	10	8437	8446	0 %	0 %	60 %	40 %	163854311
11	NC_010170	GGGCT	2	10	9311	9320	0 %	20 %	60 %	20 %	163854312
12	NC_010170	GCGCC	2	10	9524	9533	0 %	0 %	40 %	60 %	163854312
13	NC_010170	TCGCG	2	10	9555	9564	0 %	20 %	40 %	40 %	163854312
14	NC_010170	GCGCG	2	10	11884	11893	0 %	0 %	60 %	40 %	163854315
15	NC_010170	CGCGG	2	10	12275	12284	0 %	0 %	60 %	40 %	163854315
16	NC_010170	GCGCG	2	10	12316	12325	0 %	0 %	60 %	40 %	163854315
17	NC_010170	GCGCC	2	10	12559	12568	0 %	0 %	40 %	60 %	163854315
18	NC_010170	TGAAA	2	10	13126	13135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010170	GGCCA	2	10	15989	15998	20 %	0 %	40 %	40 %	163854319
20	NC_010170	CCCGG	2	10	16583	16592	0 %	0 %	40 %	60 %	163854320
21	NC_010170	CTGGG	2	10	17454	17463	0 %	20 %	60 %	20 %	163854320
22	NC_010170	GCACG	2	10	19323	19332	20 %	0 %	40 %	40 %	163854322
23	NC_010170	CGCAC	2	10	19349	19358	20 %	0 %	20 %	60 %	163854322
24	NC_010170	CGGCG	2	10	20016	20025	0 %	0 %	60 %	40 %	163854322
25	NC_010170	CAAGC	2	10	20067	20076	40 %	0 %	20 %	40 %	163854322
26	NC_010170	CGGCC	2	10	20156	20165	0 %	0 %	40 %	60 %	163854322
27	NC_010170	GGCGC	2	10	20828	20837	0 %	0 %	60 %	40 %	163854323
28	NC_010170	CGGCG	2	10	20876	20885	0 %	0 %	60 %	40 %	163854323
29	NC_010170	GACCG	2	10	22360	22369	20 %	0 %	40 %	40 %	163854324
30	NC_010170	GCCCC	2	10	22410	22419	0 %	0 %	20 %	80 %	163854324
31	NC_010170	CGGCG	2	10	22525	22534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010170	CGGCC	2	10	23790	23799	0 %	0 %	40 %	60 %	163854326
33	NC_010170	CGCAG	2	10	23925	23934	20 %	0 %	40 %	40 %	163854326
34	NC_010170	CTGGA	2	10	24087	24096	20 %	20 %	40 %	20 %	163854326
35	NC_010170	GCCGG	2	10	24830	24839	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010170	GCCGC	2	10	25721	25730	0 %	0 %	40 %	60 %	163854328
37	NC_010170	CGCCC	2	10	26464	26473	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_010170	GCGCC	2	10	28348	28357	0 %	0 %	40 %	60 %	163854330
39	NC_010170	GCACG	2	10	28546	28555	20 %	0 %	40 %	40 %	163854330
40	NC_010170	GCGCG	2	10	28759	28768	0 %	0 %	60 %	40 %	163854330
41	NC_010170	GCCTG	2	10	28845	28854	0 %	20 %	40 %	40 %	163854330
42	NC_010170	CTCAA	2	10	31593	31602	40 %	20 %	0 %	40 %	163854333
43	NC_010170	CTTGC	2	10	34546	34555	0 %	40 %	20 %	40 %	163854336
44	NC_010170	GCCGC	2	10	35249	35258	0 %	0 %	40 %	60 %	163854336
45	NC_010170	GAGGT	2	10	38195	38204	20 %	20 %	60 %	0 %	163854338
46	NC_010170	CCTGG	2	10	40730	40739	0 %	20 %	40 %	40 %	163854339
47	NC_010170	CGCTG	2	10	41242	41251	0 %	20 %	40 %	40 %	163854339
48	NC_010170	CGGCG	2	10	43671	43680	0 %	0 %	60 %	40 %	163854341
49	NC_010170	GCCGC	2	10	43856	43865	0 %	0 %	40 %	60 %	163854341
50	NC_010170	GGCCG	2	10	43954	43963	0 %	0 %	60 %	40 %	163854341
51	NC_010170	AGCCC	2	10	44943	44952	20 %	0 %	20 %	60 %	163854343
52	NC_010170	GCCGA	2	10	46130	46139	20 %	0 %	40 %	40 %	163854343
53	NC_010170	TCGAA	2	10	48369	48378	40 %	20 %	20 %	20 %	163854345
54	NC_010170	GGTCC	2	10	49056	49065	0 %	20 %	40 %	40 %	163854345
55	NC_010170	CGACC	2	10	49303	49312	20 %	0 %	20 %	60 %	163854345
56	NC_010170	CGCGC	2	10	50576	50585	0 %	0 %	40 %	60 %	163854346
57	NC_010170	CGGCG	2	10	52795	52804	0 %	0 %	60 %	40 %	163854348
58	NC_010170	GCGCG	2	10	53688	53697	0 %	0 %	60 %	40 %	163854349
59	NC_010170	GCCGC	2	10	53954	53963	0 %	0 %	40 %	60 %	163854349
60	NC_010170	GGCGC	2	10	54099	54108	0 %	0 %	60 %	40 %	163854349
61	NC_010170	TGCCA	2	10	56253	56262	20 %	20 %	20 %	40 %	163854352
62	NC_010170	GCCGT	2	10	56749	56758	0 %	20 %	40 %	40 %	163854352
63	NC_010170	GCGCG	2	10	58967	58976	0 %	0 %	60 %	40 %	163854354
64	NC_010170	TGCCA	2	10	59353	59362	20 %	20 %	20 %	40 %	163854354
65	NC_010170	ATGGC	2	10	59779	59788	20 %	20 %	40 %	20 %	163854354
66	NC_010170	GCCCG	2	10	60283	60292	0 %	0 %	40 %	60 %	163854354
67	NC_010170	CGGCG	2	10	61941	61950	0 %	0 %	60 %	40 %	163854356
68	NC_010170	TGCCG	2	10	61960	61969	0 %	20 %	40 %	40 %	163854356
69	NC_010170	CATGG	2	10	63763	63772	20 %	20 %	40 %	20 %	163854358
70	NC_010170	GCGCC	2	10	63862	63871	0 %	0 %	40 %	60 %	163854358
71	NC_010170	ATGGC	2	10	65184	65193	20 %	20 %	40 %	20 %	163854359
72	NC_010170	TGCGC	2	10	66727	66736	0 %	20 %	40 %	40 %	163854360
73	NC_010170	GCGCC	2	10	67567	67576	0 %	0 %	40 %	60 %	163854360
74	NC_010170	GTGGC	2	10	68775	68784	0 %	20 %	60 %	20 %	163854361
75	NC_010170	ACACG	2	10	69553	69562	40 %	0 %	20 %	40 %	163854362
76	NC_010170	TGGCC	2	10	71425	71434	0 %	20 %	40 %	40 %	163854363
77	NC_010170	CGGCA	2	10	73967	73976	20 %	0 %	40 %	40 %	163854365
78	NC_010170	GCCCG	2	10	75296	75305	0 %	0 %	40 %	60 %	163854367
79	NC_010170	GCCAG	2	10	77038	77047	20 %	0 %	40 %	40 %	163854369
80	NC_010170	CGGCG	2	10	80507	80516	0 %	0 %	60 %	40 %	163854373
81	NC_010170	TTCCA	2	10	82136	82145	20 %	40 %	0 %	40 %	163854374
82	NC_010170	CGGCG	2	10	83558	83567	0 %	0 %	60 %	40 %	163854376
83	NC_010170	GGTGC	2	10	87323	87332	0 %	20 %	60 %	20 %	163854380
84	NC_010170	CAGGT	2	10	89185	89194	20 %	20 %	40 %	20 %	163854382
85	NC_010170	CACGA	2	10	89446	89455	40 %	0 %	20 %	40 %	163854382
86	NC_010170	AGGCC	2	10	89471	89480	20 %	0 %	40 %	40 %	163854382
87	NC_010170	GCCAG	2	10	90390	90399	20 %	0 %	40 %	40 %	163854383
88	NC_010170	TGCGG	2	10	91742	91751	0 %	20 %	60 %	20 %	163854385
89	NC_010170	CGCTG	2	10	92570	92579	0 %	20 %	40 %	40 %	163854385
90	NC_010170	GAACT	2	10	92979	92988	40 %	20 %	20 %	20 %	163854386
91	NC_010170	CCGGC	2	10	94187	94196	0 %	0 %	40 %	60 %	163854386
92	NC_010170	CGTCT	2	10	94374	94383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010170	CGTCT	2	10	94488	94497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010170	CAGCC	2	10	94519	94528	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_010170	AAAAG	2	10	94557	94566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010170	CGATG	2	10	94964	94973	20 %	20 %	40 %	20 %	163854387
97	NC_010170	CCCCG	2	10	98098	98107	0 %	0 %	20 %	80 %	163854388
98	NC_010170	CGTCG	2	10	98562	98571	0 %	20 %	40 %	40 %	163854388
99	NC_010170	AGTGC	2	10	99275	99284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010170	TCGCG	2	10	99362	99371	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010170	GCCGA	2	10	101609	101618	20 %	0 %	40 %	40 %	163854393
102	NC_010170	GCCGA	2	10	101717	101726	20 %	0 %	40 %	40 %	163854393
103	NC_010170	GGCCG	2	10	103315	103324	0 %	0 %	60 %	40 %	163854395
104	NC_010170	CGGCC	2	10	105776	105785	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_010170	AGGCG	2	10	106696	106705	20 %	0 %	60 %	20 %	163854399
106	NC_010170	CAGCG	2	10	107990	107999	20 %	0 %	40 %	40 %	163854399
107	NC_010170	CTGGC	2	10	108283	108292	0 %	20 %	40 %	40 %	163854400
108	NC_010170	AACGG	2	10	109046	109055	40 %	0 %	40 %	20 %	163854401
109	NC_010170	CCGGC	2	10	109344	109353	0 %	0 %	40 %	60 %	163854402
110	NC_010170	CCTGG	2	10	109682	109691	0 %	20 %	40 %	40 %	163854403
111	NC_010170	GCGCC	2	10	110924	110933	0 %	0 %	40 %	60 %	163854403
112	NC_010170	GCCGC	2	10	114261	114270	0 %	0 %	40 %	60 %	163854406
113	NC_010170	CTGGT	2	10	116326	116335	0 %	40 %	40 %	20 %	163854408
114	NC_010170	CGCAG	2	10	120141	120150	20 %	0 %	40 %	40 %	163854410
115	NC_010170	GCCGG	2	10	120962	120971	0 %	0 %	60 %	40 %	163854411
116	NC_010170	GCGCC	2	10	121398	121407	0 %	0 %	40 %	60 %	163854411
117	NC_010170	CAGCG	2	10	121750	121759	20 %	0 %	40 %	40 %	163854411
118	NC_010170	CGGCG	2	10	122262	122271	0 %	0 %	60 %	40 %	163854411
119	NC_010170	CGGCG	2	10	122719	122728	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010170	CGCGG	2	10	123555	123564	0 %	0 %	60 %	40 %	163854413
121	NC_010170	CGCGC	2	10	124166	124175	0 %	0 %	40 %	60 %	163854414
122	NC_010170	TGGCC	2	10	124196	124205	0 %	20 %	40 %	40 %	163854414
123	NC_010170	CGCGG	2	10	125219	125228	0 %	0 %	60 %	40 %	163854415
124	NC_010170	CGGGC	2	10	127507	127516	0 %	0 %	60 %	40 %	163854416
125	NC_010170	GATCA	2	10	131579	131588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010170	GGCGG	2	10	133764	133773	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010170	CCAGG	2	10	133898	133907	20 %	0 %	40 %	40 %	163854424
128	NC_010170	CTGAC	2	10	137118	137127	20 %	20 %	20 %	40 %	163854427
129	NC_010170	GCGCC	2	10	137570	137579	0 %	0 %	40 %	60 %	163854428
130	NC_010170	GGCGC	2	10	139445	139454	0 %	0 %	60 %	40 %	163854430
131	NC_010170	GCCAC	2	10	139645	139654	20 %	0 %	20 %	60 %	163854430
132	NC_010170	GCGAG	2	10	140398	140407	20 %	0 %	60 %	20 %	163854431
133	NC_010170	CGGCG	2	10	140629	140638	0 %	0 %	60 %	40 %	163854432
134	NC_010170	GGCGG	2	10	140681	140690	0 %	0 %	80 %	20 %	163854432
135	NC_010170	AGCGC	2	10	144701	144710	20 %	0 %	40 %	40 %	163854439
136	NC_010170	GCCCG	2	10	147146	147155	0 %	0 %	40 %	60 %	163854442
137	NC_010170	TGCGC	2	10	147529	147538	0 %	20 %	40 %	40 %	163854442
138	NC_010170	GCAGG	2	10	150039	150048	20 %	0 %	60 %	20 %	163854445
139	NC_010170	GGCCG	2	10	151771	151780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010170	CGACG	2	10	152939	152948	20 %	0 %	40 %	40 %	163854449
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147	NC_010170	CAGGC	2	10	164493	164502	20 %	0 %	40 %	40 %	163854457
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155	NC_010170	CGGCG	2	10	170755	170764	0 %	0 %	60 %	40 %	163854464
156	NC_010170	GCGCC	2	10	172094	172103	0 %	0 %	40 %	60 %	163854465
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159	NC_010170	CGGCG	2	10	175262	175271	0 %	0 %	60 %	40 %	163854466
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176	NC_010170	CTGGG	2	10	189216	189225	0 %	20 %	60 %	20 %	163854481
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210	NC_010170	TGCGC	2	10	229063	229072	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
211	NC_010170	CTTGG	2	10	230771	230780	0 %	40 %	40 %	20 %	163854513
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248	NC_010170	CGAAT	2	10	280782	280791	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
249	NC_010170	GCCAG	2	10	280891	280900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
250	NC_010170	CGGGC	2	10	282975	282984	0 %	0 %	60 %	40 %	163854560
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253	NC_010170	TGGCA	2	10	288183	288192	20 %	20 %	40 %	20 %	163854565
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265	NC_010170	CCGGC	2	10	301140	301149	0 %	0 %	40 %	60 %	163854578
266	NC_010170	CAGGG	2	10	301227	301236	20 %	0 %	60 %	20 %	163854578
267	NC_010170	GCCGA	2	10	301588	301597	20 %	0 %	40 %	40 %	163854578
268	NC_010170	TCGCC	2	10	301835	301844	0 %	20 %	20 %	60 %	163854578
269	NC_010170	CGCGG	2	10	302773	302782	0 %	0 %	60 %	40 %	163854579
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275	NC_010170	CGCTA	2	10	305204	305213	20 %	20 %	20 %	40 %	163854581
276	NC_010170	CCGTA	2	10	305615	305624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_010170	GCTGG	2	10	310557	310566	0 %	20 %	60 %	20 %	163854586
283	NC_010170	CGCCA	2	10	311766	311775	20 %	0 %	20 %	60 %	163854586
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292	NC_010170	GCCGG	2	10	321410	321419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
293	NC_010170	GGCTG	2	10	321691	321700	0 %	20 %	60 %	20 %	163854595
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363	NC_010170	CAGGT	2	10	398001	398010	20 %	20 %	40 %	20 %	163854664
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