MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 93741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010170	GTC	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854305
2	NC_010170	ACG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854305
3	NC_010170	CCA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854305
4	NC_010170	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
5	NC_010170	GCG	2	6	245	250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
6	NC_010170	CGG	2	6	266	271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
7	NC_010170	CCG	2	6	308	313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854305
8	NC_010170	GCC	2	6	319	324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854305
9	NC_010170	GCC	2	6	364	369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854305
10	NC_010170	GGC	3	9	372	380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
11	NC_010170	GTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854305
12	NC_010170	GCG	3	9	484	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
13	NC_010170	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
14	NC_010170	TGG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854305
15	NC_010170	GTG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854305
16	NC_010170	CGA	2	6	687	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854305
17	NC_010170	CTA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854305
18	NC_010170	CTG	3	9	721	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854305
19	NC_010170	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854305
20	NC_010170	GAA	2	6	772	777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854305
21	NC_010170	TTC	2	6	778	783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854305
22	NC_010170	ATC	3	9	820	828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854305
23	NC_010170	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854305
24	NC_010170	GCC	2	6	915	920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854305
25	NC_010170	CTG	2	6	946	951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854305
26	NC_010170	CTT	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854305
27	NC_010170	GCA	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854305
28	NC_010170	AAG	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854305
29	NC_010170	CTG	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854305
30	NC_010170	AGA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854305
31	NC_010170	CGG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854305
32	NC_010170	TCG	2	6	1501	1506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854306
33	NC_010170	CAA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854306
34	NC_010170	CAC	2	6	1601	1606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854306
35	NC_010170	CCA	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854306
36	NC_010170	GCT	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854306
37	NC_010170	CAA	3	9	1721	1729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854306
38	NC_010170	GGC	2	6	1775	1780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854306
39	NC_010170	GCA	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854306
40	NC_010170	CTA	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854306
41	NC_010170	TGC	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854306
42	NC_010170	CGG	2	6	1990	1995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854306
43	NC_010170	CGA	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854306
44	NC_010170	CCA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854306
45	NC_010170	ACC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854306
46	NC_010170	AAG	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854306
47	NC_010170	GAA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854306
48	NC_010170	GCT	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854306
49	NC_010170	CGA	3	9	2504	2512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854306
50	NC_010170	CGT	2	6	2525	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854306
51	NC_010170	GCC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010170	CGC	2	6	2590	2595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010170	GCC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010170	CAG	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
55	NC_010170	CAC	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854307
56	NC_010170	CGA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
57	NC_010170	CGA	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
58	NC_010170	CGG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854307
59	NC_010170	CCG	2	6	3074	3079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
60	NC_010170	CAC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854307
61	NC_010170	CAT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854307
62	NC_010170	CAA	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854307
63	NC_010170	ACG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
64	NC_010170	TGC	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
65	NC_010170	CGG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854307
66	NC_010170	CAA	2	6	3491	3496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854307
67	NC_010170	GGC	2	6	3513	3518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854307
68	NC_010170	TCA	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854307
69	NC_010170	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854307
70	NC_010170	CGA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
71	NC_010170	CAG	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
72	NC_010170	GAA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854307
73	NC_010170	GCT	2	6	3761	3766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
74	NC_010170	ACG	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
75	NC_010170	TCG	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
76	NC_010170	GCG	2	6	3813	3818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854307
77	NC_010170	GCC	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
78	NC_010170	CGC	2	6	3858	3863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
79	NC_010170	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
80	NC_010170	CCG	2	6	3961	3966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
81	NC_010170	ACC	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854307
82	NC_010170	ATC	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854307
83	NC_010170	GCT	2	6	4214	4219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
84	NC_010170	GCC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
85	NC_010170	GAC	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
86	NC_010170	GAA	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854307
87	NC_010170	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
88	NC_010170	GCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854307
89	NC_010170	GCC	2	6	4542	4547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
90	NC_010170	GGT	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854307
91	NC_010170	CGA	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
92	NC_010170	AAC	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854307
93	NC_010170	CTG	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854307
94	NC_010170	AGC	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
95	NC_010170	AGC	2	6	4921	4926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
96	NC_010170	ACC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854307
97	NC_010170	GCC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854307
98	NC_010170	CGA	2	6	4997	5002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
99	NC_010170	CAC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854307
100	NC_010170	CGA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854307
101	NC_010170	AAT	2	6	5166	5171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010170	AAT	2	6	5186	5191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010170	GCT	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854308
104	NC_010170	CGA	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854308
105	NC_010170	GCG	3	9	5354	5362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854308
106	NC_010170	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854308
107	NC_010170	TGC	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854308
108	NC_010170	CAT	3	9	5461	5469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854308
109	NC_010170	GCC	2	6	5697	5702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854309
110	NC_010170	CGC	2	6	5703	5708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854309
111	NC_010170	CTG	2	6	5821	5826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854309
112	NC_010170	GCG	2	6	5884	5889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854309
113	NC_010170	TGC	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854309
114	NC_010170	TGG	2	6	6047	6052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854309
115	NC_010170	TGG	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854309
116	NC_010170	CGC	2	6	6187	6192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854309
117	NC_010170	TGC	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854309
118	NC_010170	CCG	2	6	6276	6281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854309
119	NC_010170	TGC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854309
120	NC_010170	GAA	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854309
121	NC_010170	GCG	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854309
122	NC_010170	CGA	2	6	6618	6623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854309
123	NC_010170	CGC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854309
124	NC_010170	TTG	2	6	6877	6882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854309
125	NC_010170	CGG	2	6	6901	6906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010170	CGC	3	9	6987	6995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010170	GTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854310
128	NC_010170	GGC	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854310
129	NC_010170	ACG	2	6	7219	7224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854310
130	NC_010170	CTT	2	6	7238	7243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854310
131	NC_010170	GAT	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854310
132	NC_010170	GCT	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854310
133	NC_010170	TGG	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854310
134	NC_010170	TGG	2	6	7463	7468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854310
135	NC_010170	GTT	2	6	7509	7514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854310
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140	NC_010170	CGG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010170	TCG	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854311
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259	NC_010170	TGC	2	6	14214	14219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854317
260	NC_010170	CAA	2	6	14279	14284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_010170	AAC	2	6	14297	14302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163854318
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287	NC_010170	CGA	2	6	15571	15576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_010170	ATC	2	6	16460	16465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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368	NC_010170	ACG	2	6	20420	20425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854322
369	NC_010170	GGA	2	6	20577	20582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
370	NC_010170	TGC	2	6	20632	20637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854323
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378	NC_010170	CGG	2	6	21419	21424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_010170	GCT	2	6	21447	21452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_010170	GCG	2	6	21471	21476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854324
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500	NC_010170	CCG	2	6	28341	28346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854330

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