MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pBMUL01

Total Repeats: 3721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010070	AAG	2	6	156396	156401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161506620
3502	NC_010070	GCG	3	9	156420	156428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506620
3503	NC_010070	AGCACG	2	12	156432	156443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3504	NC_010070	CAG	2	6	156449	156454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3505	NC_010070	ATG	2	6	156583	156588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506620
3506	NC_010070	AGC	2	6	156621	156626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3507	NC_010070	GAC	2	6	156635	156640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3508	NC_010070	GTC	2	6	156645	156650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3509	NC_010070	TGC	2	6	156751	156756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3510	NC_010070	CGG	2	6	156769	156774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506620
3511	NC_010070	AAGC	2	8	156778	156785	50 %	0 %	25 %	25 %	161506620
3512	NC_010070	GCA	2	6	156823	156828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3513	NC_010070	ACTC	2	8	156940	156947	25 %	25 %	0 %	50 %	161506620
3514	NC_010070	GC	3	6	156952	156957	0 %	0 %	50 %	50 %	161506620
3515	NC_010070	ACA	2	6	156973	156978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161506620
3516	NC_010070	GAGCA	2	10	156986	156995	40 %	0 %	40 %	20 %	161506620
3517	NC_010070	CG	4	8	157063	157070	0 %	0 %	50 %	50 %	161506620
3518	NC_010070	CTG	2	6	157080	157085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3519	NC_010070	CGT	2	6	157162	157167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506620
3520	NC_010070	GTAC	2	8	157189	157196	25 %	25 %	25 %	25 %	161506621
3521	NC_010070	ACG	2	6	157268	157273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506621
3522	NC_010070	CG	3	6	157284	157289	0 %	0 %	50 %	50 %	161506621
3523	NC_010070	TTTC	2	8	157314	157321	0 %	75 %	0 %	25 %	161506621
3524	NC_010070	GCG	2	6	157472	157477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506621
3525	NC_010070	TTG	2	6	157547	157552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010070	GAA	2	6	157561	157566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010070	GTC	2	6	157603	157608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506622
3528	NC_010070	GAC	2	6	157625	157630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506622
3529	NC_010070	CGA	2	6	157657	157662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506622
3530	NC_010070	TGC	2	6	157822	157827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506622
3531	NC_010070	CTTTG	2	10	157842	157851	0 %	60 %	20 %	20 %	161506622
3532	NC_010070	TTC	2	6	157947	157952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506622
3533	NC_010070	TGA	2	6	157976	157981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010070	TTG	2	6	158008	158013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_010070	GCC	2	6	158143	158148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506623
3536	NC_010070	TCA	2	6	158181	158186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506623
3537	NC_010070	GT	3	6	158193	158198	0 %	50 %	50 %	0 %	161506623
3538	NC_010070	CATCTC	2	12	158212	158223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161506623
3539	NC_010070	TGC	2	6	158241	158246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3540	NC_010070	TTG	2	6	158273	158278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506623
3541	NC_010070	GTG	2	6	158350	158355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506623
3542	NC_010070	CGG	2	6	158394	158399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506623
3543	NC_010070	GC	3	6	158411	158416	0 %	0 %	50 %	50 %	161506623
3544	NC_010070	CGGC	2	8	158460	158467	0 %	0 %	50 %	50 %	161506623
3545	NC_010070	GCC	2	6	158476	158481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506623
3546	NC_010070	TCGTCA	2	12	158532	158543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161506623
3547	NC_010070	CAG	2	6	158695	158700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3548	NC_010070	CAT	2	6	158764	158769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506623
3549	NC_010070	CGGG	2	8	158862	158869	0 %	0 %	75 %	25 %	161506623
3550	NC_010070	GCC	2	6	158887	158892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506623
3551	NC_010070	AGC	2	6	158915	158920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3552	NC_010070	GTG	2	6	158939	158944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506623
3553	NC_010070	TTG	2	6	158957	158962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506623
3554	NC_010070	TCG	2	6	159003	159008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3555	NC_010070	ACG	2	6	159071	159076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3556	NC_010070	TTC	2	6	159110	159115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161506623
3557	NC_010070	GT	3	6	159156	159161	0 %	50 %	50 %	0 %	161506623
3558	NC_010070	GCG	2	6	159186	159191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506623
3559	NC_010070	TCG	2	6	159198	159203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506623
3560	NC_010070	AGGC	2	8	159361	159368	25 %	0 %	50 %	25 %	161506624
3561	NC_010070	CCGG	2	8	159370	159377	0 %	0 %	50 %	50 %	161506624
3562	NC_010070	TGCGG	2	10	159399	159408	0 %	20 %	60 %	20 %	161506624
3563	NC_010070	AGT	2	6	159502	159507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506624
3564	NC_010070	CG	3	6	159550	159555	0 %	0 %	50 %	50 %	161506624
3565	NC_010070	TCG	2	6	159645	159650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3566	NC_010070	CGT	2	6	159667	159672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3567	NC_010070	CG	3	6	159770	159775	0 %	0 %	50 %	50 %	161506624
3568	NC_010070	GTT	2	6	159860	159865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506624
3569	NC_010070	TGA	2	6	159889	159894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506624
3570	NC_010070	ACG	2	6	159919	159924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3571	NC_010070	TGC	2	6	160113	160118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3572	NC_010070	GGC	2	6	160127	160132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506624
3573	NC_010070	CGCC	2	8	160298	160305	0 %	0 %	25 %	75 %	161506624
3574	NC_010070	CGG	2	6	160312	160317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506624
3575	NC_010070	GTT	2	6	160562	160567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506624
3576	NC_010070	CAG	2	6	160568	160573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3577	NC_010070	TTCGC	2	10	160627	160636	0 %	40 %	20 %	40 %	161506624
3578	NC_010070	CGA	2	6	160703	160708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506624
3579	NC_010070	GGT	2	6	160739	160744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506624
3580	NC_010070	CAGC	2	8	160746	160753	25 %	0 %	25 %	50 %	161506624
3581	NC_010070	ATG	2	6	160764	160769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506624
3582	NC_010070	TCA	2	6	160807	160812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506624
3583	NC_010070	TGC	2	6	160829	160834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506625
3584	NC_010070	GCC	2	6	160876	160881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506625
3585	NC_010070	GCC	2	6	160894	160899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506625
3586	NC_010070	GCC	2	6	160909	160914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506625
3587	NC_010070	TTGA	2	8	160939	160946	25 %	50 %	25 %	0 %	161506625
3588	NC_010070	GTT	2	6	160947	160952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506625
3589	NC_010070	CGT	2	6	160971	160976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506625
3590	NC_010070	GTCGG	2	10	161042	161051	0 %	20 %	60 %	20 %	161506625
3591	NC_010070	TGG	2	6	161061	161066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506625
3592	NC_010070	GCC	2	6	161090	161095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506625
3593	NC_010070	AGC	2	6	161102	161107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506625
3594	NC_010070	TCG	2	6	161136	161141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_010070	ATC	2	6	161145	161150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010070	GAG	2	6	161232	161237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161506626
3597	NC_010070	GACAC	2	10	161264	161273	40 %	0 %	20 %	40 %	161506626
3598	NC_010070	GGT	2	6	161293	161298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161506626
3599	NC_010070	CGA	2	6	161314	161319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506626
3600	NC_010070	ACG	3	9	161321	161329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506626
3601	NC_010070	AGC	2	6	161358	161363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506626
3602	NC_010070	TGA	2	6	161393	161398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506626
3603	NC_010070	CCG	3	9	161399	161407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161506626
3604	NC_010070	GTC	2	6	161425	161430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506626
3605	NC_010070	CATG	2	8	161448	161455	25 %	25 %	25 %	25 %	161506626
3606	NC_010070	GAT	2	6	161460	161465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161506626
3607	NC_010070	ACG	3	9	161585	161593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506626
3608	NC_010070	GAC	2	6	161721	161726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010070	T	6	6	161748	161753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_010070	GCG	2	6	161760	161765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_010070	A	6	6	161805	161810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_010070	T	6	6	161828	161833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_010070	GC	3	6	161834	161839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_010070	AGCGC	2	10	161858	161867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3615	NC_010070	TCG	2	6	162046	162051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506627
3616	NC_010070	CG	3	6	162105	162110	0 %	0 %	50 %	50 %	161506627
3617	NC_010070	TGCTGA	2	12	162127	162138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161506627
3618	NC_010070	CCGC	2	8	162139	162146	0 %	0 %	25 %	75 %	161506627
3619	NC_010070	GAC	2	6	162189	162194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506627
3620	NC_010070	CGCA	2	8	162230	162237	25 %	0 %	25 %	50 %	161506627
3621	NC_010070	CGTT	2	8	162240	162247	0 %	50 %	25 %	25 %	161506627
3622	NC_010070	GC	3	6	162254	162259	0 %	0 %	50 %	50 %	161506627
3623	NC_010070	CCT	2	6	162308	162313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161506627
3624	NC_010070	GCG	2	6	162317	162322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506627
3625	NC_010070	TTG	2	6	162372	162377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161506627
3626	NC_010070	GC	3	6	162494	162499	0 %	0 %	50 %	50 %	161506627
3627	NC_010070	GGC	2	6	162586	162591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161506628
3628	NC_010070	GTC	2	6	162632	162637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161506628
3629	NC_010070	CGA	2	6	162706	162711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161506628
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3633	NC_010070	CGAC	2	8	163041	163048	25 %	0 %	25 %	50 %	161506628
3634	NC_010070	CTGG	2	8	163084	163091	0 %	25 %	50 %	25 %	161506628
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3651	NC_010070	CGTCA	2	10	163827	163836	20 %	20 %	20 %	40 %	161506628
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3655	NC_010070	AGG	2	6	164110	164115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3656	NC_010070	TCA	2	6	164152	164157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161506629
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3663	NC_010070	ACC	2	6	164533	164538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.