MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 21529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	GTGG	2	8	137	144	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009485	CGCC	2	8	836	843	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
3	NC_009485	GCCA	2	8	937	944	25 %	0 %	25 %	50 %	148251627
4	NC_009485	CCGC	2	8	1383	1390	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
5	NC_009485	CCGC	2	8	1806	1813	0 %	0 %	25 %	75 %	148251627
6	NC_009485	GTCC	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009485	CGGG	2	8	2279	2286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009485	GTGC	2	8	2396	2403	0 %	25 %	50 %	25 %	148251628
9	NC_009485	GCCG	2	8	2597	2604	0 %	0 %	50 %	50 %	148251628
10	NC_009485	ATCT	2	8	2768	2775	25 %	50 %	0 %	25 %	148251628
11	NC_009485	CGAC	2	8	2820	2827	25 %	0 %	25 %	50 %	148251628
12	NC_009485	CGAG	2	8	3132	3139	25 %	0 %	50 %	25 %	148251628
13	NC_009485	CCAT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009485	TGGA	2	8	4528	4535	25 %	25 %	50 %	0 %	148251630
15	NC_009485	GCTC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	148251630
16	NC_009485	CGGC	2	8	5161	5168	0 %	0 %	50 %	50 %	148251631
17	NC_009485	GGCG	2	8	5638	5645	0 %	0 %	75 %	25 %	148251632
18	NC_009485	CCGC	2	8	6208	6215	0 %	0 %	25 %	75 %	148251633
19	NC_009485	CGGG	2	8	6695	6702	0 %	0 %	75 %	25 %	148251633
20	NC_009485	GCCG	2	8	6796	6803	0 %	0 %	50 %	50 %	148251633
21	NC_009485	GCCC	2	8	7444	7451	0 %	0 %	25 %	75 %	148251633
22	NC_009485	AGCG	2	8	7576	7583	25 %	0 %	50 %	25 %	148251633
23	NC_009485	GCCG	2	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	148251633
24	NC_009485	CGGC	2	8	7896	7903	0 %	0 %	50 %	50 %	148251633
25	NC_009485	CCGG	2	8	8052	8059	0 %	0 %	50 %	50 %	148251633
26	NC_009485	CCCG	2	8	8427	8434	0 %	0 %	25 %	75 %	148251634
27	NC_009485	TCCG	2	8	9554	9561	0 %	25 %	25 %	50 %	148251634
28	NC_009485	CGGC	2	8	9742	9749	0 %	0 %	50 %	50 %	148251634
29	NC_009485	TCGA	2	8	9909	9916	25 %	25 %	25 %	25 %	148251634
30	NC_009485	ACCG	2	8	10580	10587	25 %	0 %	25 %	50 %	148251634
31	NC_009485	GCCG	2	8	10629	10636	0 %	0 %	50 %	50 %	148251634
32	NC_009485	CAAG	2	8	11073	11080	50 %	0 %	25 %	25 %	148251635
33	NC_009485	GTCG	2	8	11724	11731	0 %	25 %	50 %	25 %	148251636
34	NC_009485	CGGG	2	8	11789	11796	0 %	0 %	75 %	25 %	148251636
35	NC_009485	GCCT	2	8	12079	12086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009485	TCGG	2	8	12359	12366	0 %	25 %	50 %	25 %	148251637
37	NC_009485	CGAC	2	8	12603	12610	25 %	0 %	25 %	50 %	148251637
38	NC_009485	GGCC	2	8	13101	13108	0 %	0 %	50 %	50 %	148251637
39	NC_009485	ATCT	2	8	14017	14024	25 %	50 %	0 %	25 %	148251638
40	NC_009485	GATC	2	8	14769	14776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009485	GATG	2	8	15044	15051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009485	CGAC	2	8	15680	15687	25 %	0 %	25 %	50 %	148251640
43	NC_009485	CGGC	2	8	15699	15706	0 %	0 %	50 %	50 %	148251640
44	NC_009485	GGCC	2	8	15870	15877	0 %	0 %	50 %	50 %	148251640
45	NC_009485	GCCG	2	8	16941	16948	0 %	0 %	50 %	50 %	148251641
46	NC_009485	CGAG	2	8	17054	17061	25 %	0 %	50 %	25 %	148251641
47	NC_009485	GCAA	2	8	17509	17516	50 %	0 %	25 %	25 %	148251641
48	NC_009485	CCCG	2	8	18047	18054	0 %	0 %	25 %	75 %	148251641
49	NC_009485	CTCA	2	8	18080	18087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009485	CCCG	2	8	18257	18264	0 %	0 %	25 %	75 %	148251642
51	NC_009485	CGGC	2	8	18385	18392	0 %	0 %	50 %	50 %	148251642
52	NC_009485	GCCG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	148251642
53	NC_009485	GGCA	2	8	18677	18684	25 %	0 %	50 %	25 %	148251642
54	NC_009485	GCAT	2	8	19570	19577	25 %	25 %	25 %	25 %	148251643
55	NC_009485	GCCA	2	8	19744	19751	25 %	0 %	25 %	50 %	148251643
56	NC_009485	GATC	2	8	20302	20309	25 %	25 %	25 %	25 %	148251643
57	NC_009485	TGCG	2	8	20496	20503	0 %	25 %	50 %	25 %	148251643
58	NC_009485	CGGC	2	8	20608	20615	0 %	0 %	50 %	50 %	148251643
59	NC_009485	CATC	2	8	21223	21230	25 %	25 %	0 %	50 %	148251644
60	NC_009485	GCCG	2	8	22093	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	148251644
61	NC_009485	TTGC	2	8	22106	22113	0 %	50 %	25 %	25 %	148251644
62	NC_009485	GCAA	2	8	22146	22153	50 %	0 %	25 %	25 %	148251644
63	NC_009485	ATCG	2	8	22356	22363	25 %	25 %	25 %	25 %	148251645
64	NC_009485	GGTC	2	8	22485	22492	0 %	25 %	50 %	25 %	148251645
65	NC_009485	GCCC	2	8	23292	23299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009485	GGAA	2	8	23675	23682	50 %	0 %	50 %	0 %	148251646
67	NC_009485	GGCC	2	8	24096	24103	0 %	0 %	50 %	50 %	148251646
68	NC_009485	CTGG	2	8	24236	24243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009485	ATCA	2	8	24636	24643	50 %	25 %	0 %	25 %	148251647
70	NC_009485	GATC	2	8	24677	24684	25 %	25 %	25 %	25 %	148251647
71	NC_009485	AATG	2	8	25136	25143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009485	CGAA	2	8	25411	25418	50 %	0 %	25 %	25 %	148251648
73	NC_009485	TGCC	2	8	25466	25473	0 %	25 %	25 %	50 %	148251648
74	NC_009485	CGCC	2	8	26342	26349	0 %	0 %	25 %	75 %	148251649
75	NC_009485	TTGT	2	8	26574	26581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009485	GAAG	2	8	27671	27678	50 %	0 %	50 %	0 %	148251651
77	NC_009485	CCGG	2	8	27929	27936	0 %	0 %	50 %	50 %	148251651
78	NC_009485	TTCG	2	8	27941	27948	0 %	50 %	25 %	25 %	148251651
79	NC_009485	GCAC	2	8	28853	28860	25 %	0 %	25 %	50 %	148251652
80	NC_009485	GCCC	2	8	28862	28869	0 %	0 %	25 %	75 %	148251652
81	NC_009485	ATCG	2	8	28870	28877	25 %	25 %	25 %	25 %	148251652
82	NC_009485	GGAA	2	8	29192	29199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009485	ATCG	2	8	29222	29229	25 %	25 %	25 %	25 %	148251653
84	NC_009485	GGCG	2	8	29487	29494	0 %	0 %	75 %	25 %	148251653
85	NC_009485	CGGC	2	8	29714	29721	0 %	0 %	50 %	50 %	148251653
86	NC_009485	CTGG	2	8	29867	29874	0 %	25 %	50 %	25 %	148251653
87	NC_009485	GGGC	2	8	30700	30707	0 %	0 %	75 %	25 %	148251654
88	NC_009485	CCAG	2	8	30954	30961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009485	CTGG	2	8	31895	31902	0 %	25 %	50 %	25 %	148251655
90	NC_009485	CGAT	2	8	31984	31991	25 %	25 %	25 %	25 %	148251655
91	NC_009485	CGGC	2	8	32240	32247	0 %	0 %	50 %	50 %	148251655
92	NC_009485	GCTC	2	8	32569	32576	0 %	25 %	25 %	50 %	148251655
93	NC_009485	CGGC	2	8	33898	33905	0 %	0 %	50 %	50 %	148251656
94	NC_009485	CAGC	2	8	35119	35126	25 %	0 %	25 %	50 %	148251657
95	NC_009485	CGGT	2	8	35740	35747	0 %	25 %	50 %	25 %	148251657
96	NC_009485	CGGC	2	8	36916	36923	0 %	0 %	50 %	50 %	148251659
97	NC_009485	GCAT	2	8	37250	37257	25 %	25 %	25 %	25 %	148251659
98	NC_009485	GGCC	2	8	37611	37618	0 %	0 %	50 %	50 %	148251659
99	NC_009485	GATC	2	8	37638	37645	25 %	25 %	25 %	25 %	148251659
100	NC_009485	CGGA	2	8	37764	37771	25 %	0 %	50 %	25 %	148251659
101	NC_009485	CCGT	2	8	38606	38613	0 %	25 %	25 %	50 %	148251660
102	NC_009485	GTCA	2	8	38929	38936	25 %	25 %	25 %	25 %	148251660
103	NC_009485	GCAG	2	8	39235	39242	25 %	0 %	50 %	25 %	148251661
104	NC_009485	GCCG	2	8	39251	39258	0 %	0 %	50 %	50 %	148251661
105	NC_009485	GCTG	2	8	40065	40072	0 %	25 %	50 %	25 %	148251661
106	NC_009485	GGCT	2	8	40932	40939	0 %	25 %	50 %	25 %	148251662
107	NC_009485	GACG	2	8	41288	41295	25 %	0 %	50 %	25 %	148251662
108	NC_009485	CCGA	2	8	41352	41359	25 %	0 %	25 %	50 %	148251662
109	NC_009485	GGCC	2	8	42368	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009485	CGAT	2	8	43958	43965	25 %	25 %	25 %	25 %	148251666
111	NC_009485	GTGG	2	8	44178	44185	0 %	25 %	75 %	0 %	148251666
112	NC_009485	TGCG	2	8	44240	44247	0 %	25 %	50 %	25 %	148251666
113	NC_009485	ACGC	2	8	45364	45371	25 %	0 %	25 %	50 %	148251669
114	NC_009485	CGGC	2	8	45794	45801	0 %	0 %	50 %	50 %	148251669
115	NC_009485	CGCT	2	8	45968	45975	0 %	25 %	25 %	50 %	148251669
116	NC_009485	GGCG	2	8	46162	46169	0 %	0 %	75 %	25 %	148251670
117	NC_009485	GCCG	2	8	46415	46422	0 %	0 %	50 %	50 %	148251670
118	NC_009485	CAGC	2	8	47185	47192	25 %	0 %	25 %	50 %	148251670
119	NC_009485	GACG	2	8	47277	47284	25 %	0 %	50 %	25 %	148251670
120	NC_009485	GATG	2	8	48128	48135	25 %	25 %	50 %	0 %	148251671
121	NC_009485	ACGC	2	8	48203	48210	25 %	0 %	25 %	50 %	148251671
122	NC_009485	AGCA	2	8	48498	48505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009485	GACG	2	8	48712	48719	25 %	0 %	50 %	25 %	148251672
124	NC_009485	GCCG	2	8	49119	49126	0 %	0 %	50 %	50 %	148251673
125	NC_009485	GCCG	2	8	49134	49141	0 %	0 %	50 %	50 %	148251673
126	NC_009485	CGAG	2	8	49157	49164	25 %	0 %	50 %	25 %	148251673
127	NC_009485	ACGC	2	8	49287	49294	25 %	0 %	25 %	50 %	148251673
128	NC_009485	CATC	2	8	49689	49696	25 %	25 %	0 %	50 %	148251673
129	NC_009485	TCGA	2	8	49741	49748	25 %	25 %	25 %	25 %	148251673
130	NC_009485	CCGC	2	8	50197	50204	0 %	0 %	25 %	75 %	148251673
131	NC_009485	AGCC	2	8	50214	50221	25 %	0 %	25 %	50 %	148251673
132	NC_009485	AGCG	2	8	50663	50670	25 %	0 %	50 %	25 %	148251674
133	NC_009485	ACGA	2	8	51528	51535	50 %	0 %	25 %	25 %	148251674
134	NC_009485	GATC	2	8	51650	51657	25 %	25 %	25 %	25 %	148251674
135	NC_009485	TAGT	2	8	51973	51980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009485	TCCT	2	8	52274	52281	0 %	50 %	0 %	50 %	148251675
137	NC_009485	GCAT	2	8	52910	52917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009485	CCGG	2	8	53155	53162	0 %	0 %	50 %	50 %	148251676
139	NC_009485	TCGA	2	8	53283	53290	25 %	25 %	25 %	25 %	148251676
140	NC_009485	CCGC	2	8	53861	53868	0 %	0 %	25 %	75 %	148251676
141	NC_009485	TCGC	2	8	53916	53923	0 %	25 %	25 %	50 %	148251676
142	NC_009485	TCGA	2	8	54069	54076	25 %	25 %	25 %	25 %	148251676
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