MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 210096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009485	ATC	2	6	39758	39763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251661
1002	NC_009485	CGG	2	6	39780	39785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1003	NC_009485	TCG	2	6	39834	39839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251661
1004	NC_009485	GGC	2	6	39890	39895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1005	NC_009485	TGA	2	6	39975	39980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251661
1006	NC_009485	CGATC	2	10	39988	39997	20 %	20 %	20 %	40 %	148251661
1007	NC_009485	CGCGAC	2	12	40039	40050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251661
1008	NC_009485	GCTG	2	8	40065	40072	0 %	25 %	50 %	25 %	148251661
1009	NC_009485	GCC	2	6	40076	40081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251661
1010	NC_009485	TTC	2	6	40121	40126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251661
1011	NC_009485	GC	3	6	40153	40158	0 %	0 %	50 %	50 %	148251661
1012	NC_009485	GCG	2	6	40173	40178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1013	NC_009485	CGG	2	6	40233	40238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1014	NC_009485	GGC	3	9	40351	40359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1015	NC_009485	GCG	2	6	40370	40375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1016	NC_009485	CGC	2	6	40429	40434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251661
1017	NC_009485	CGG	2	6	40453	40458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251661
1018	NC_009485	GCT	2	6	40480	40485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251661
1019	NC_009485	CGT	2	6	40498	40503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251661
1020	NC_009485	CCG	2	6	40542	40547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251661
1021	NC_009485	ACG	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_009485	CAT	2	6	40594	40599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_009485	CCG	2	6	40786	40791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251662
1024	NC_009485	CGC	2	6	40832	40837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251662
1025	NC_009485	GAA	2	6	40850	40855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251662
1026	NC_009485	CG	3	6	40922	40927	0 %	0 %	50 %	50 %	148251662
1027	NC_009485	GGCT	2	8	40932	40939	0 %	25 %	50 %	25 %	148251662
1028	NC_009485	GGC	2	6	41024	41029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251662
1029	NC_009485	AGC	2	6	41080	41085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251662
1030	NC_009485	CAA	2	6	41120	41125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251662
1031	NC_009485	TCA	2	6	41194	41199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251662
1032	NC_009485	AAG	2	6	41241	41246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251662
1033	NC_009485	GACG	2	8	41288	41295	25 %	0 %	50 %	25 %	148251662
1034	NC_009485	CCGA	2	8	41352	41359	25 %	0 %	25 %	50 %	148251662
1035	NC_009485	TCG	2	6	41398	41403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251662
1036	NC_009485	GCA	2	6	41428	41433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251662
1037	NC_009485	GGC	2	6	41457	41462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251662
1038	NC_009485	CGC	2	6	41525	41530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251662
1039	NC_009485	GGC	2	6	41586	41591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251662
1040	NC_009485	GCA	2	6	41610	41615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251662
1041	NC_009485	GGC	2	6	41627	41632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251662
1042	NC_009485	TCG	2	6	41641	41646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251662
1043	NC_009485	GCA	2	6	41755	41760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009485	GCA	3	9	41777	41785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009485	TGGTCG	2	12	41848	41859	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148251663
1046	NC_009485	CG	3	6	41880	41885	0 %	0 %	50 %	50 %	148251663
1047	NC_009485	GC	4	8	41910	41917	0 %	0 %	50 %	50 %	148251663
1048	NC_009485	GCG	2	6	41920	41925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251663
1049	NC_009485	TGC	2	6	41935	41940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251663
1050	NC_009485	GGA	2	6	41954	41959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251663
1051	NC_009485	GC	3	6	41996	42001	0 %	0 %	50 %	50 %	148251663
1052	NC_009485	GCG	2	6	42024	42029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251663
1053	NC_009485	GCT	2	6	42047	42052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251663
1054	NC_009485	GTC	2	6	42053	42058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251663
1055	NC_009485	ACCGG	2	10	42074	42083	20 %	0 %	40 %	40 %	148251663
1056	NC_009485	CAC	2	6	42104	42109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251663
1057	NC_009485	GCT	2	6	42149	42154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251663
1058	NC_009485	GGC	2	6	42161	42166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251663
1059	NC_009485	GGGCCG	2	12	42183	42194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251663
1060	NC_009485	CGCCGA	2	12	42263	42274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251663
1061	NC_009485	CG	3	6	42339	42344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_009485	GGCC	2	8	42368	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_009485	CGT	2	6	42461	42466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1064	NC_009485	GGC	2	6	42503	42508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251664
1065	NC_009485	GGC	2	6	42546	42551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251664
1066	NC_009485	TCA	2	6	42580	42585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251664
1067	NC_009485	ACG	2	6	42598	42603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1068	NC_009485	GCA	2	6	42611	42616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1069	NC_009485	GCT	2	6	42671	42676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1070	NC_009485	GCC	2	6	42690	42695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251664
1071	NC_009485	GAC	2	6	42699	42704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1072	NC_009485	GAC	2	6	42717	42722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1073	NC_009485	GAT	2	6	42758	42763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251664
1074	NC_009485	CGG	2	6	42793	42798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251664
1075	NC_009485	ATG	2	6	42805	42810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251664
1076	NC_009485	GCG	2	6	42811	42816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251664
1077	NC_009485	GCA	2	6	42905	42910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1078	NC_009485	CTG	2	6	42924	42929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251664
1079	NC_009485	GGT	2	6	42947	42952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251664
1080	NC_009485	AG	3	6	42986	42991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009485	CAT	3	9	43018	43026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009485	GCT	2	6	43033	43038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251665
1083	NC_009485	CGT	2	6	43044	43049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251665
1084	NC_009485	GAT	2	6	43072	43077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251665
1085	NC_009485	CG	3	6	43134	43139	0 %	0 %	50 %	50 %	148251665
1086	NC_009485	TGC	2	6	43189	43194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251665
1087	NC_009485	TGA	2	6	43220	43225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251665
1088	NC_009485	GC	3	6	43256	43261	0 %	0 %	50 %	50 %	148251665
1089	NC_009485	ATC	2	6	43288	43293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251665
1090	NC_009485	GC	3	6	43298	43303	0 %	0 %	50 %	50 %	148251665
1091	NC_009485	CG	3	6	43334	43339	0 %	0 %	50 %	50 %	148251665
1092	NC_009485	CGG	2	6	43370	43375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009485	GCA	2	6	43460	43465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009485	CG	3	6	43511	43516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_009485	CG	3	6	43578	43583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_009485	CAA	2	6	43588	43593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_009485	GCC	2	6	43651	43656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251666
1098	NC_009485	CCG	2	6	43673	43678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251666
1099	NC_009485	GCA	2	6	43755	43760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251666
1100	NC_009485	TCG	2	6	43793	43798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251666
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1103	NC_009485	GAC	2	6	43893	43898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251666
1104	NC_009485	GGT	2	6	43920	43925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251666
1105	NC_009485	CGAT	2	8	43958	43965	25 %	25 %	25 %	25 %	148251666
1106	NC_009485	CTA	2	6	43983	43988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251666
1107	NC_009485	CGA	2	6	44010	44015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251666
1108	NC_009485	CGA	2	6	44043	44048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251666
1109	NC_009485	CG	3	6	44061	44066	0 %	0 %	50 %	50 %	148251666
1110	NC_009485	GCCGC	2	10	44071	44080	0 %	0 %	40 %	60 %	148251666
1111	NC_009485	TCG	2	6	44084	44089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251666
1112	NC_009485	CCG	2	6	44123	44128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251666
1113	NC_009485	GTGG	2	8	44178	44185	0 %	25 %	75 %	0 %	148251666
1114	NC_009485	GCG	2	6	44197	44202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251666
1115	NC_009485	TGCG	2	8	44240	44247	0 %	25 %	50 %	25 %	148251666
1116	NC_009485	CGG	2	6	44264	44269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251666
1117	NC_009485	GCG	2	6	44272	44277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251666
1118	NC_009485	GCC	2	6	44355	44360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251667
1119	NC_009485	CGC	2	6	44372	44377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251667
1120	NC_009485	GCGTC	2	10	44486	44495	0 %	20 %	40 %	40 %	148251667
1121	NC_009485	CGA	2	6	44525	44530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251667
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1123	NC_009485	GAG	2	6	44655	44660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251667
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1125	NC_009485	CG	3	6	44672	44677	0 %	0 %	50 %	50 %	148251667
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1251	NC_009485	TCG	2	6	49766	49771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251673
1252	NC_009485	CGA	2	6	49797	49802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1254	NC_009485	CGA	2	6	49863	49868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1263	NC_009485	CGA	3	9	50184	50192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251673
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1372	NC_009485	CGG	2	6	55217	55222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1373	NC_009485	CAT	2	6	55308	55313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1374	NC_009485	T	6	6	55360	55365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_009485	CCG	2	6	55381	55386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1376	NC_009485	GCAA	2	8	55433	55440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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