MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 210096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009485	TCACCA	2	12	19354	19365	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148251642
502	NC_009485	TCA	2	6	19453	19458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251642
503	NC_009485	AGC	2	6	19479	19484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251642
504	NC_009485	GCA	2	6	19490	19495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251642
505	NC_009485	GCAT	2	8	19570	19577	25 %	25 %	25 %	25 %	148251643
506	NC_009485	CGG	2	6	19637	19642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
507	NC_009485	GC	3	6	19664	19669	0 %	0 %	50 %	50 %	148251643
508	NC_009485	GATGAC	2	12	19691	19702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148251643
509	NC_009485	GAA	2	6	19727	19732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251643
510	NC_009485	CG	3	6	19738	19743	0 %	0 %	50 %	50 %	148251643
511	NC_009485	GCCA	2	8	19744	19751	25 %	0 %	25 %	50 %	148251643
512	NC_009485	GCG	2	6	19874	19879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
513	NC_009485	GCC	2	6	19880	19885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251643
514	NC_009485	GAC	2	6	19886	19891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
515	NC_009485	CGT	2	6	19894	19899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251643
516	NC_009485	CG	3	6	19930	19935	0 %	0 %	50 %	50 %	148251643
517	NC_009485	CGG	2	6	19972	19977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
518	NC_009485	GCA	2	6	20052	20057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
519	NC_009485	GCC	2	6	20060	20065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251643
520	NC_009485	GCG	2	6	20067	20072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
521	NC_009485	CGT	2	6	20107	20112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251643
522	NC_009485	CGC	2	6	20165	20170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251643
523	NC_009485	CGA	2	6	20182	20187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
524	NC_009485	ACA	2	6	20218	20223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251643
525	NC_009485	GCA	2	6	20269	20274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
526	NC_009485	TGGCG	2	10	20290	20299	0 %	20 %	60 %	20 %	148251643
527	NC_009485	GATC	2	8	20302	20309	25 %	25 %	25 %	25 %	148251643
528	NC_009485	TGCG	2	8	20496	20503	0 %	25 %	50 %	25 %	148251643
529	NC_009485	CGG	2	6	20510	20515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
530	NC_009485	GCG	3	9	20547	20555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
531	NC_009485	CGGC	2	8	20608	20615	0 %	0 %	50 %	50 %	148251643
532	NC_009485	GCA	2	6	20619	20624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
533	NC_009485	GAG	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251643
534	NC_009485	CAG	2	6	20777	20782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
535	NC_009485	AC	3	6	20858	20863	50 %	0 %	0 %	50 %	148251643
536	NC_009485	CGCGGG	2	12	20902	20913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
537	NC_009485	CGACGG	2	12	20914	20925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148251643
538	NC_009485	GTG	3	9	20940	20948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251643
539	NC_009485	CAG	2	6	20963	20968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251643
540	NC_009485	GCG	3	9	20969	20977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251643
541	NC_009485	CGG	2	6	20993	20998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009485	GAC	2	6	21011	21016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_009485	GCG	2	6	21023	21028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009485	TCG	2	6	21061	21066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009485	CGC	2	6	21128	21133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
546	NC_009485	GCG	2	6	21146	21151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251644
547	NC_009485	CATC	2	8	21223	21230	25 %	25 %	0 %	50 %	148251644
548	NC_009485	GCT	2	6	21314	21319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251644
549	NC_009485	GCC	2	6	21352	21357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
550	NC_009485	TGG	2	6	21385	21390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251644
551	NC_009485	CGC	2	6	21500	21505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
552	NC_009485	CAG	2	6	21578	21583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
553	NC_009485	ACC	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251644
554	NC_009485	CGC	2	6	21620	21625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
555	NC_009485	TGA	2	6	21628	21633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251644
556	NC_009485	CCG	3	9	21654	21662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
557	NC_009485	GCA	2	6	21676	21681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
558	NC_009485	CGC	2	6	21691	21696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
559	NC_009485	CGA	2	6	21796	21801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
560	NC_009485	CAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
561	NC_009485	TTG	2	6	21819	21824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251644
562	NC_009485	CGA	2	6	21826	21831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
563	NC_009485	TCG	2	6	21939	21944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251644
564	NC_009485	GC	3	6	21949	21954	0 %	0 %	50 %	50 %	148251644
565	NC_009485	GAC	2	6	21971	21976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251644
566	NC_009485	GGC	2	6	21980	21985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251644
567	NC_009485	GCC	2	6	22034	22039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
568	NC_009485	GCC	2	6	22062	22067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251644
569	NC_009485	GCCG	2	8	22093	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	148251644
570	NC_009485	TTGC	2	8	22106	22113	0 %	50 %	25 %	25 %	148251644
571	NC_009485	GCAA	2	8	22146	22153	50 %	0 %	25 %	25 %	148251644
572	NC_009485	GGC	2	6	22160	22165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251644
573	NC_009485	GCC	2	6	22272	22277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_009485	GCT	2	6	22304	22309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009485	CG	3	6	22315	22320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_009485	GGA	2	6	22332	22337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009485	ATCG	2	8	22356	22363	25 %	25 %	25 %	25 %	148251645
578	NC_009485	CCT	2	6	22385	22390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251645
579	NC_009485	CG	3	6	22456	22461	0 %	0 %	50 %	50 %	148251645
580	NC_009485	GCG	2	6	22473	22478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251645
581	NC_009485	GGTC	2	8	22485	22492	0 %	25 %	50 %	25 %	148251645
582	NC_009485	TCT	2	6	22499	22504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251645
583	NC_009485	CCGCAT	2	12	22558	22569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148251645
584	NC_009485	CAT	2	6	22608	22613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251645
585	NC_009485	TGA	2	6	22667	22672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251645
586	NC_009485	CCG	2	6	22673	22678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251645
587	NC_009485	CG	4	8	22851	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	148251645
588	NC_009485	GTC	2	6	22948	22953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251645
589	NC_009485	GAG	2	6	22972	22977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251645
590	NC_009485	CG	3	6	22978	22983	0 %	0 %	50 %	50 %	148251645
591	NC_009485	TCG	2	6	22991	22996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251645
592	NC_009485	CG	4	8	23013	23020	0 %	0 %	50 %	50 %	148251645
593	NC_009485	GCT	2	6	23040	23045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251645
594	NC_009485	GAT	2	6	23097	23102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251645
595	NC_009485	GGC	2	6	23110	23115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251645
596	NC_009485	TGG	2	6	23143	23148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251645
597	NC_009485	TCGTC	2	10	23153	23162	0 %	40 %	20 %	40 %	148251645
598	NC_009485	CGC	2	6	23214	23219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251645
599	NC_009485	GCCC	2	8	23292	23299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
600	NC_009485	CGA	2	6	23379	23384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251646
601	NC_009485	TGC	3	9	23390	23398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251646
602	NC_009485	ACC	2	6	23401	23406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251646
603	NC_009485	CGT	2	6	23427	23432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251646
604	NC_009485	CGT	2	6	23508	23513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251646
605	NC_009485	CAC	2	6	23518	23523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251646
606	NC_009485	ATC	2	6	23548	23553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251646
607	NC_009485	CGC	2	6	23573	23578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251646
608	NC_009485	CG	3	6	23599	23604	0 %	0 %	50 %	50 %	148251646
609	NC_009485	TC	3	6	23658	23663	0 %	50 %	0 %	50 %	148251646
610	NC_009485	GGAA	2	8	23675	23682	50 %	0 %	50 %	0 %	148251646
611	NC_009485	AGC	2	6	23711	23716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251646
612	NC_009485	GGT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251646
613	NC_009485	CGA	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251646
614	NC_009485	CG	4	8	23867	23874	0 %	0 %	50 %	50 %	148251646
615	NC_009485	CAT	3	9	23913	23921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251646
616	NC_009485	CAT	2	6	23964	23969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251646
617	NC_009485	CGA	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251646
618	NC_009485	TGA	2	6	23984	23989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251646
619	NC_009485	CAGCCG	2	12	24037	24048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148251646
620	NC_009485	AGC	2	6	24059	24064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251646
621	NC_009485	GGCC	2	8	24096	24103	0 %	0 %	50 %	50 %	148251646
622	NC_009485	CCG	3	9	24124	24132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251646
623	NC_009485	CCA	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251646
624	NC_009485	CGG	2	6	24184	24189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251646
625	NC_009485	TGC	2	6	24221	24226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009485	CTGG	2	8	24236	24243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_009485	TCT	2	6	24264	24269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009485	CT	3	6	24310	24315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_009485	GCG	2	6	24338	24343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_009485	GAC	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009485	GA	3	6	24504	24509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009485	GCA	2	6	24554	24559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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757	NC_009485	CGG	2	6	29944	29949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251653
758	NC_009485	GCG	3	9	30034	30042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251653
759	NC_009485	CG	3	6	30062	30067	0 %	0 %	50 %	50 %	148251653
760	NC_009485	GC	3	6	30106	30111	0 %	0 %	50 %	50 %	148251653
761	NC_009485	CGC	2	6	30134	30139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251653
762	NC_009485	GCT	3	9	30203	30211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251653
763	NC_009485	GGC	2	6	30331	30336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251654
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765	NC_009485	CG	5	10	30395	30404	0 %	0 %	50 %	50 %	148251654
766	NC_009485	GGC	2	6	30449	30454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251654
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769	NC_009485	GC	3	6	30574	30579	0 %	0 %	50 %	50 %	148251654
770	NC_009485	CCG	2	6	30647	30652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251654
771	NC_009485	TTC	2	6	30677	30682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251654
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773	NC_009485	CTC	2	6	30719	30724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251654
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778	NC_009485	CAT	2	6	30938	30943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251654
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780	NC_009485	GGCCTG	2	12	30996	31007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_009485	GC	3	6	31028	31033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
782	NC_009485	CGC	2	6	31061	31066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_009485	TCT	2	6	31082	31087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_009485	CTG	2	6	31124	31129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_009485	GGC	2	6	31164	31169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_009485	ATTGA	2	10	31191	31200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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792	NC_009485	CGA	2	6	31474	31479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251655
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883	NC_009485	TGA	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251657
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