MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 210096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009485	GGC	2	6	213172	213177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5502	NC_009485	CGC	2	6	213198	213203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251824
5503	NC_009485	CGG	2	6	213220	213225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5504	NC_009485	GCG	2	6	213234	213239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5505	NC_009485	GCCA	2	8	213330	213337	25 %	0 %	25 %	50 %	148251824
5506	NC_009485	GAA	2	6	213343	213348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251824
5507	NC_009485	CCG	2	6	213369	213374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251824
5508	NC_009485	GCC	2	6	213430	213435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251824
5509	NC_009485	CAC	3	9	213460	213468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251824
5510	NC_009485	GCG	2	6	213473	213478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5511	NC_009485	TCG	2	6	213536	213541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251824
5512	NC_009485	TGA	2	6	213546	213551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251824
5513	NC_009485	CCG	2	6	213642	213647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251824
5514	NC_009485	CGG	3	9	213655	213663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5515	NC_009485	CGG	2	6	213693	213698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5516	NC_009485	CAGC	2	8	213713	213720	25 %	0 %	25 %	50 %	148251824
5517	NC_009485	TGA	2	6	213746	213751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251824
5518	NC_009485	GCC	2	6	213866	213871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251824
5519	NC_009485	CGG	2	6	213900	213905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251824
5520	NC_009485	TGC	2	6	213912	213917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251824
5521	NC_009485	GCCG	2	8	213922	213929	0 %	0 %	50 %	50 %	148251824
5522	NC_009485	CAG	2	6	214055	214060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_009485	GGC	2	6	214078	214083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_009485	CGGT	2	8	214094	214101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_009485	GC	3	6	214151	214156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_009485	CTG	2	6	214185	214190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_009485	TA	3	6	214256	214261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_009485	CCG	2	6	214389	214394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251825
5529	NC_009485	GC	3	6	214396	214401	0 %	0 %	50 %	50 %	148251825
5530	NC_009485	GAG	3	9	214418	214426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251825
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5532	NC_009485	TTG	2	6	214569	214574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251826
5533	NC_009485	GCC	2	6	214587	214592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251826
5534	NC_009485	CGA	2	6	214621	214626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251826
5535	NC_009485	TGA	3	9	214639	214647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251826
5536	NC_009485	CTT	2	6	214702	214707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251826
5537	NC_009485	GCG	3	9	214729	214737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251826
5538	NC_009485	CGT	2	6	214814	214819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251826
5539	NC_009485	CG	3	6	214882	214887	0 %	0 %	50 %	50 %	148251826
5540	NC_009485	GAA	2	6	214899	214904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251826
5541	NC_009485	CGCC	2	8	214931	214938	0 %	0 %	25 %	75 %	148251826
5542	NC_009485	ATC	2	6	215016	215021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251826
5543	NC_009485	GGTCG	2	10	215024	215033	0 %	20 %	60 %	20 %	148251826
5544	NC_009485	GCC	3	9	215056	215064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251826
5545	NC_009485	CGA	2	6	215107	215112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251826
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5548	NC_009485	CCA	2	6	215272	215277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251826
5549	NC_009485	TGA	2	6	215368	215373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251826
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5553	NC_009485	GCC	2	6	215560	215565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_009485	CTT	2	6	215568	215573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_009485	ATG	2	6	215584	215589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009485	TTG	2	6	215654	215659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009485	GCG	2	6	215667	215672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_009485	CGC	2	6	215740	215745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251827
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5562	NC_009485	CGC	3	9	215862	215870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251827
5563	NC_009485	CGC	2	6	215872	215877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251827
5564	NC_009485	TCG	2	6	215879	215884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251827
5565	NC_009485	GTC	2	6	215899	215904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251827
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5570	NC_009485	GGGGTC	2	12	216034	216045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148251827
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5580	NC_009485	GC	3	6	216320	216325	0 %	0 %	50 %	50 %	148251827
5581	NC_009485	CGG	2	6	216449	216454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251827
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5595	NC_009485	GCGA	2	8	217078	217085	25 %	0 %	50 %	25 %	148251827
5596	NC_009485	GTC	2	6	217097	217102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251827
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5599	NC_009485	TTTG	2	8	217245	217252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_009485	CGG	2	6	217654	217659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251828
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5612	NC_009485	TCG	2	6	217766	217771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251828
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5620	NC_009485	TCC	2	6	218210	218215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5622	NC_009485	GAA	2	6	218473	218478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251829
5623	NC_009485	CG	3	6	218495	218500	0 %	0 %	50 %	50 %	148251829
5624	NC_009485	GGC	2	6	218517	218522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251829
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5626	NC_009485	CGG	2	6	218542	218547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251829
5627	NC_009485	CGC	2	6	218565	218570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251829
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5689	NC_009485	CAG	2	6	220554	220559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251830
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5703	NC_009485	TCG	2	6	221026	221031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251830
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5728	NC_009485	TCGA	2	8	221810	221817	25 %	25 %	25 %	25 %	148251831
5729	NC_009485	GA	3	6	221825	221830	50 %	0 %	50 %	0 %	148251831
5730	NC_009485	GTC	3	9	221847	221855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251831
5731	NC_009485	GA	3	6	221875	221880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5732	NC_009485	CCCCA	2	10	221882	221891	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5733	NC_009485	CTG	2	6	221928	221933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5734	NC_009485	TCC	2	6	221969	221974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251832
5735	NC_009485	CAGC	2	8	222017	222024	25 %	0 %	25 %	50 %	148251832
5736	NC_009485	ATGCCC	2	12	222090	222101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148251832
5737	NC_009485	TCG	2	6	222120	222125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251832
5738	NC_009485	GC	3	6	222141	222146	0 %	0 %	50 %	50 %	148251832
5739	NC_009485	CCAG	2	8	222184	222191	25 %	0 %	25 %	50 %	148251832
5740	NC_009485	CCTCGC	2	12	222193	222204	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148251832
5741	NC_009485	CGG	2	6	222228	222233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251832
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5743	NC_009485	GAA	2	6	222314	222319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251832
5744	NC_009485	TGG	2	6	222396	222401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251832
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5991	NC_009485	CGC	2	6	231411	231416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251842
5992	NC_009485	CGG	2	6	231470	231475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251842
5993	NC_009485	GC	3	6	231485	231490	0 %	0 %	50 %	50 %	148251842
5994	NC_009485	GCC	3	9	231510	231518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251842
5995	NC_009485	CCG	2	6	231643	231648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5996	NC_009485	TCG	2	6	231667	231672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_009485	CCG	2	6	231684	231689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5998	NC_009485	GCCG	2	8	231699	231706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5999	NC_009485	CGCCAA	2	12	231742	231753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148251843
6000	NC_009485	CGA	2	6	231781	231786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251843

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