MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	TGT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009475	ACA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009475	AAC	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009475	CGC	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
5	NC_009475	GAC	3	9	605	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
6	NC_009475	CCG	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
7	NC_009475	CAC	2	6	861	866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240871
8	NC_009475	GCG	2	6	887	892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
9	NC_009475	CGC	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
10	NC_009475	CGA	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
11	NC_009475	ACG	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
12	NC_009475	TCG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240871
13	NC_009475	CGG	2	6	1127	1132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
14	NC_009475	TCA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240871
15	NC_009475	ACG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
16	NC_009475	CCT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240871
17	NC_009475	CTT	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240871
18	NC_009475	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240871
19	NC_009475	TCG	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240872
20	NC_009475	GAG	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240872
21	NC_009475	GAT	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240872
22	NC_009475	CGC	2	6	1784	1789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240872
23	NC_009475	GCG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
24	NC_009475	GCA	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
25	NC_009475	CAG	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
26	NC_009475	GGC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
27	NC_009475	TCG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009475	ACG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
29	NC_009475	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
30	NC_009475	TCC	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240873
31	NC_009475	GAT	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
32	NC_009475	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
33	NC_009475	GGC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
34	NC_009475	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
35	NC_009475	CGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
36	NC_009475	TCG	2	6	3269	3274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
37	NC_009475	CAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
38	NC_009475	GAC	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
39	NC_009475	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240873
40	NC_009475	GCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
41	NC_009475	TCG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
42	NC_009475	GAG	2	6	3667	3672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240873
43	NC_009475	TCG	3	9	3707	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
44	NC_009475	CCG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
45	NC_009475	AGC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
46	NC_009475	GCT	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
47	NC_009475	TTC	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240874
48	NC_009475	TGA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
49	NC_009475	AGC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240874
50	NC_009475	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240874
51	NC_009475	TCG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
52	NC_009475	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
53	NC_009475	CTC	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009475	CAG	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009475	GGC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009475	TCG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009475	CGA	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009475	CGG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
59	NC_009475	GGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
60	NC_009475	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240875
61	NC_009475	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240875
62	NC_009475	TCG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240876
63	NC_009475	CGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
64	NC_009475	CGA	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240876
65	NC_009475	CGC	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
66	NC_009475	CCG	2	6	5075	5080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
67	NC_009475	TGC	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009475	CGG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009475	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009475	TGC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009475	GCC	2	6	5508	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009475	TTC	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240877
73	NC_009475	GCC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240877
74	NC_009475	AGA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240877
75	NC_009475	CCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009475	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240878
77	NC_009475	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240878
78	NC_009475	GAG	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240878
79	NC_009475	CGT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240879
80	NC_009475	TCC	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240879
81	NC_009475	GCA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
82	NC_009475	CGA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
83	NC_009475	CCG	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240880
84	NC_009475	GCG	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
85	NC_009475	GCG	2	6	7040	7045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
86	NC_009475	CTC	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009475	GCC	2	6	7225	7230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240881
88	NC_009475	CGC	3	9	7320	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240881
89	NC_009475	TCG	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240881
90	NC_009475	CCT	2	6	7476	7481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240881
91	NC_009475	GAG	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240881
92	NC_009475	TGA	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240882
93	NC_009475	GGC	2	6	7674	7679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
94	NC_009475	GCG	2	6	7682	7687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
95	NC_009475	GTG	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240882
96	NC_009475	CGA	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240882
97	NC_009475	CGG	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
98	NC_009475	GCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
99	NC_009475	GGA	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240882
100	NC_009475	GAA	3	9	8283	8291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240882
101	NC_009475	ATC	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240882
102	NC_009475	CGG	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
103	NC_009475	CGT	2	6	8459	8464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240882
104	NC_009475	CGT	2	6	8490	8495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240882
105	NC_009475	TCG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240882
106	NC_009475	CCG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240882
107	NC_009475	GCG	2	6	8728	8733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
108	NC_009475	GTT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240882
109	NC_009475	TGA	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240882
110	NC_009475	AAG	2	6	8823	8828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240883
111	NC_009475	CGA	2	6	8915	8920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240883
112	NC_009475	GGC	2	6	8921	8926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240883
113	NC_009475	ATC	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240883
114	NC_009475	GCC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240883
115	NC_009475	CAC	2	6	9233	9238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240883
116	NC_009475	CGA	2	6	9241	9246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240883
117	NC_009475	GCT	2	6	9323	9328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240883
118	NC_009475	TCG	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240883
119	NC_009475	TTC	2	6	9381	9386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240883
120	NC_009475	CAC	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240883
121	NC_009475	TCA	2	6	9577	9582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240883
122	NC_009475	CCG	2	6	9592	9597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240883
123	NC_009475	CGG	2	6	9641	9646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240883
124	NC_009475	AAC	2	6	9648	9653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240883
125	NC_009475	TGG	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009475	TTC	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009475	GCC	2	6	9893	9898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240884
128	NC_009475	TCA	2	6	9942	9947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240884
129	NC_009475	GAC	2	6	9973	9978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240884
130	NC_009475	GCA	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240884
131	NC_009475	GCC	2	6	10205	10210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240884
132	NC_009475	CGC	2	6	10275	10280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240884
133	NC_009475	GCT	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240884
134	NC_009475	GCC	2	6	10416	10421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240884
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153	NC_009475	TGC	2	6	11692	11697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_009475	GTG	2	6	11865	11870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009475	GCA	2	6	11953	11958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_009475	AAG	2	6	18251	18256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240894
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251	NC_009475	AAG	2	6	18994	18999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240895
252	NC_009475	GAC	2	6	19050	19055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240895
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254	NC_009475	ACT	2	6	19140	19145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240896
255	NC_009475	TGA	2	6	19219	19224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240896
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257	NC_009475	CGG	2	6	19286	19291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240896
258	NC_009475	CGG	2	6	19381	19386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240896
259	NC_009475	ATC	2	6	19481	19486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240896
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261	NC_009475	AGG	2	6	19606	19611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240896
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277	NC_009475	AAT	2	6	20406	20411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148240897
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358	NC_009475	TCG	2	6	26856	26861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
359	NC_009475	CAT	2	6	26893	26898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_009475	CAA	2	6	27204	27209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_009475	TAT	2	6	27215	27220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_009475	CCA	2	6	27286	27291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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368	NC_009475	GCG	2	6	27692	27697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240904
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