MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 4869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009475	GAGG	2	8	142744	142751	25 %	0 %	75 %	0 %	148241018
3002	NC_009475	CAAG	2	8	142752	142759	50 %	0 %	25 %	25 %	148241018
3003	NC_009475	TGT	2	6	142767	142772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241018
3004	NC_009475	CCT	2	6	142773	142778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241019
3005	NC_009475	ACG	2	6	142785	142790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3006	NC_009475	CAC	2	6	142801	142806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241019
3007	NC_009475	CAT	2	6	142819	142824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241019
3008	NC_009475	CGT	2	6	142903	142908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3009	NC_009475	CTT	2	6	142933	142938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241019
3010	NC_009475	GAT	2	6	142998	143003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3011	NC_009475	TCA	2	6	143004	143009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241019
3012	NC_009475	TGA	2	6	143019	143024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3013	NC_009475	GAT	2	6	143137	143142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3014	NC_009475	GC	3	6	143217	143222	0 %	0 %	50 %	50 %	148241019
3015	NC_009475	GATCG	2	10	143236	143245	20 %	20 %	40 %	20 %	148241019
3016	NC_009475	CTG	2	6	143254	143259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3017	NC_009475	TGC	2	6	143321	143326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3018	NC_009475	TTG	2	6	143334	143339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241019
3019	NC_009475	TGG	2	6	143357	143362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241019
3020	NC_009475	TTTC	2	8	143418	143425	0 %	75 %	0 %	25 %	148241019
3021	NC_009475	CGG	2	6	143500	143505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241019
3022	NC_009475	CGC	3	9	143580	143588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241019
3023	NC_009475	ATCGCC	2	12	143648	143659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148241019
3024	NC_009475	GCG	2	6	143784	143789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241019
3025	NC_009475	GTG	2	6	143814	143819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241019
3026	NC_009475	CGA	2	6	143862	143867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3027	NC_009475	TCGG	2	8	143885	143892	0 %	25 %	50 %	25 %	148241019
3028	NC_009475	CGC	2	6	144060	144065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241019
3029	NC_009475	CCT	2	6	144204	144209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241019
3030	NC_009475	GCT	2	6	144274	144279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3031	NC_009475	T	6	6	144283	144288	0 %	100 %	0 %	0 %	148241019
3032	NC_009475	TGA	2	6	144297	144302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3033	NC_009475	CGTC	2	8	144318	144325	0 %	25 %	25 %	50 %	148241019
3034	NC_009475	AAT	2	6	144388	144393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241019
3035	NC_009475	G	6	6	144396	144401	0 %	0 %	100 %	0 %	148241019
3036	NC_009475	TC	3	6	144492	144497	0 %	50 %	0 %	50 %	148241019
3037	NC_009475	GGC	2	6	144554	144559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241019
3038	NC_009475	ATGG	2	8	144577	144584	25 %	25 %	50 %	0 %	148241019
3039	NC_009475	TCA	2	6	144593	144598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241019
3040	NC_009475	TGA	2	6	144615	144620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3041	NC_009475	CCTT	2	8	144632	144639	0 %	50 %	0 %	50 %	148241019
3042	NC_009475	TGA	2	6	144672	144677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241019
3043	NC_009475	GCT	2	6	144760	144765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241019
3044	NC_009475	ATGC	2	8	144814	144821	25 %	25 %	25 %	25 %	148241019
3045	NC_009475	C	7	7	144824	144830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3046	NC_009475	AGCGT	2	10	144876	144885	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3047	NC_009475	TC	3	6	144952	144957	0 %	50 %	0 %	50 %	148241020
3048	NC_009475	GC	3	6	144985	144990	0 %	0 %	50 %	50 %	148241020
3049	NC_009475	AT	3	6	145004	145009	50 %	50 %	0 %	0 %	148241020
3050	NC_009475	GCC	2	6	145084	145089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241021
3051	NC_009475	GCT	2	6	145106	145111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241021
3052	NC_009475	GCC	2	6	145140	145145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241021
3053	NC_009475	GTC	2	6	145267	145272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241021
3054	NC_009475	CTGA	2	8	145300	145307	25 %	25 %	25 %	25 %	148241021
3055	NC_009475	GAC	3	9	145310	145318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241021
3056	NC_009475	ATT	2	6	145346	145351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241021
3057	NC_009475	GC	3	6	145443	145448	0 %	0 %	50 %	50 %	148241021
3058	NC_009475	TCG	2	6	145452	145457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241021
3059	NC_009475	TCC	2	6	145568	145573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241021
3060	NC_009475	GC	3	6	145579	145584	0 %	0 %	50 %	50 %	148241021
3061	NC_009475	CAC	2	6	145587	145592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241021
3062	NC_009475	TC	3	6	145609	145614	0 %	50 %	0 %	50 %	148241021
3063	NC_009475	CCG	2	6	145694	145699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241021
3064	NC_009475	GAA	2	6	145737	145742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241021
3065	NC_009475	CAA	2	6	145874	145879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_009475	ATG	2	6	145894	145899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241022
3067	NC_009475	AACC	2	8	145904	145911	50 %	0 %	0 %	50 %	148241022
3068	NC_009475	CCGG	2	8	145981	145988	0 %	0 %	50 %	50 %	148241022
3069	NC_009475	CAT	2	6	146002	146007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241022
3070	NC_009475	CAT	2	6	146017	146022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241022
3071	NC_009475	G	8	8	146032	146039	0 %	0 %	100 %	0 %	148241022
3072	NC_009475	TGG	2	6	146042	146047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241022
3073	NC_009475	GC	3	6	146052	146057	0 %	0 %	50 %	50 %	148241022
3074	NC_009475	GCG	2	6	146105	146110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241022
3075	NC_009475	A	6	6	146140	146145	100 %	0 %	0 %	0 %	148241022
3076	NC_009475	AGC	2	6	146290	146295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241022
3077	NC_009475	GC	3	6	146341	146346	0 %	0 %	50 %	50 %	148241022
3078	NC_009475	CGG	2	6	146427	146432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241022
3079	NC_009475	GT	3	6	146481	146486	0 %	50 %	50 %	0 %	148241022
3080	NC_009475	TA	3	6	146586	146591	50 %	50 %	0 %	0 %	148241022
3081	NC_009475	TCG	2	6	146601	146606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241022
3082	NC_009475	CAC	2	6	146617	146622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241022
3083	NC_009475	CTT	2	6	146659	146664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241022
3084	NC_009475	CAG	2	6	146715	146720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241023
3085	NC_009475	ACA	2	6	146743	146748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241023
3086	NC_009475	CG	3	6	146789	146794	0 %	0 %	50 %	50 %	148241023
3087	NC_009475	CGA	2	6	146828	146833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241023
3088	NC_009475	TCAA	2	8	146851	146858	50 %	25 %	0 %	25 %	148241023
3089	NC_009475	CCA	2	6	146891	146896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241023
3090	NC_009475	GCT	2	6	146917	146922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241023
3091	NC_009475	CAGG	2	8	146990	146997	25 %	0 %	50 %	25 %	148241023
3092	NC_009475	CAC	4	12	147021	147032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241023
3093	NC_009475	AGA	2	6	147139	147144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241023
3094	NC_009475	GATA	2	8	147206	147213	50 %	25 %	25 %	0 %	148241023
3095	NC_009475	GCG	3	9	147235	147243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241023
3096	NC_009475	TG	3	6	147288	147293	0 %	50 %	50 %	0 %	148241023
3097	NC_009475	CGA	2	6	147378	147383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241024
3098	NC_009475	CTT	2	6	147453	147458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241024
3099	NC_009475	CG	3	6	147517	147522	0 %	0 %	50 %	50 %	148241024
3100	NC_009475	AAT	2	6	147528	147533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241024
3101	NC_009475	GCG	2	6	147588	147593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3102	NC_009475	CGGA	2	8	147660	147667	25 %	0 %	50 %	25 %	148241024
3103	NC_009475	GCTC	2	8	147705	147712	0 %	25 %	25 %	50 %	148241024
3104	NC_009475	GGC	2	6	147731	147736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3105	NC_009475	AAG	2	6	147802	147807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241024
3106	NC_009475	CTT	2	6	147808	147813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241024
3107	NC_009475	CAT	2	6	147823	147828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241024
3108	NC_009475	CGG	2	6	147832	147837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3109	NC_009475	GATG	2	8	147846	147853	25 %	25 %	50 %	0 %	148241024
3110	NC_009475	GATT	2	8	147897	147904	25 %	50 %	25 %	0 %	148241024
3111	NC_009475	GCC	2	6	147935	147940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241024
3112	NC_009475	GCC	2	6	147953	147958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241024
3113	NC_009475	GCG	2	6	147976	147981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3114	NC_009475	GTC	2	6	148022	148027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
3115	NC_009475	TC	3	6	148050	148055	0 %	50 %	0 %	50 %	148241024
3116	NC_009475	TCG	2	6	148070	148075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
3117	NC_009475	GGC	2	6	148087	148092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3118	NC_009475	CGC	3	9	148113	148121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241024
3119	NC_009475	GTC	2	6	148259	148264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
3120	NC_009475	GAT	2	6	148289	148294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241024
3121	NC_009475	CGG	2	6	148335	148340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3122	NC_009475	CAC	2	6	148386	148391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241024
3123	NC_009475	TCG	2	6	148430	148435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
3124	NC_009475	GGC	2	6	148441	148446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3125	NC_009475	GGC	2	6	148520	148525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3126	NC_009475	CCG	2	6	148527	148532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241024
3127	NC_009475	AGA	2	6	148582	148587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241024
3128	NC_009475	CGG	2	6	148597	148602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
3129	NC_009475	GGT	2	6	148603	148608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241024
3130	NC_009475	GCG	2	6	148646	148651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
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3132	NC_009475	CG	3	6	148678	148683	0 %	0 %	50 %	50 %	148241024
3133	NC_009475	CCA	2	6	148731	148736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241024
3134	NC_009475	GCG	2	6	148854	148859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241024
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3136	NC_009475	CGT	2	6	148882	148887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
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3140	NC_009475	GC	3	6	149029	149034	0 %	0 %	50 %	50 %	148241024
3141	NC_009475	GCT	2	6	149055	149060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241024
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3144	NC_009475	GCC	3	9	149125	149133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241024
3145	NC_009475	CAT	2	6	149149	149154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241024
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3147	NC_009475	GGC	2	6	149255	149260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_009475	GAT	2	6	149301	149306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_009475	CGA	2	6	149334	149339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3151	NC_009475	TGT	2	6	149368	149373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_009475	GCC	2	6	149447	149452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3153	NC_009475	CGT	2	6	149524	149529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_009475	C	6	6	149534	149539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3155	NC_009475	CTC	2	6	149609	149614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241025
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3161	NC_009475	CAT	2	6	150032	150037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241025
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3165	NC_009475	GTA	2	6	150293	150298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_009475	GTC	2	6	150307	150312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3197	NC_009475	TCG	2	6	152017	152022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241026
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3215	NC_009475	GCC	2	6	152904	152909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3216	NC_009475	TTGG	2	8	152910	152917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3217	NC_009475	GGC	2	6	152963	152968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3218	NC_009475	GAC	2	6	153118	153123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3219	NC_009475	CAC	2	6	153135	153140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3220	NC_009475	ACA	2	6	153285	153290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3221	NC_009475	CGATC	2	10	153344	153353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3222	NC_009475	TG	4	8	153381	153388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_009475	ACGC	2	8	153468	153475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3224	NC_009475	TCGC	2	8	153493	153500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3225	NC_009475	CAG	2	6	153501	153506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3228	NC_009475	TCT	2	6	153702	153707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241028
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3232	NC_009475	TCGT	2	8	153947	153954	0 %	50 %	25 %	25 %	148241028
3233	NC_009475	ACC	2	6	153967	153972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241028
3234	NC_009475	TC	3	6	154025	154030	0 %	50 %	0 %	50 %	148241028
3235	NC_009475	GCC	2	6	154085	154090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241028
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3239	NC_009475	CTT	2	6	154287	154292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241028
3240	NC_009475	CCA	2	6	154293	154298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241028
3241	NC_009475	CGA	2	6	154305	154310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241028
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3243	NC_009475	ATG	2	6	154432	154437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241028
3244	NC_009475	GAC	2	6	154501	154506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241028
3245	NC_009475	TAT	2	6	154591	154596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241028
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3247	NC_009475	GC	3	6	154647	154652	0 %	0 %	50 %	50 %	148241028
3248	NC_009475	GGC	3	9	154686	154694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241028
3249	NC_009475	GCCT	2	8	154699	154706	0 %	25 %	25 %	50 %	148241028
3250	NC_009475	CGA	2	6	154716	154721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241028
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3347	NC_009475	TAT	2	6	159724	159729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3494	NC_009475	CTT	2	6	167896	167901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_009475	A	6	6	167939	167944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_009475	GCT	3	9	167973	167981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_009475	CGA	2	6	167987	167992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_009475	CAG	2	6	168002	168007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_009475	CGC	2	6	168114	168119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3500	NC_009475	TCT	2	6	168124	168129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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