MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009445	CCG	2	6	19984	19989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337189
502	NC_009445	CAG	2	6	20043	20048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337189
503	NC_009445	CGG	2	6	20122	20127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337189
504	NC_009445	GC	3	6	20128	20133	0 %	0 %	50 %	50 %	146337189
505	NC_009445	CG	3	6	20162	20167	0 %	0 %	50 %	50 %	146337189
506	NC_009445	GGT	2	6	20258	20263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337189
507	NC_009445	GAG	2	6	20283	20288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337189
508	NC_009445	TCG	2	6	20302	20307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337189
509	NC_009445	GAGATC	2	12	20313	20324	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146337189
510	NC_009445	GC	3	6	20325	20330	0 %	0 %	50 %	50 %	146337189
511	NC_009445	CTG	2	6	20352	20357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337189
512	NC_009445	GAT	2	6	20408	20413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337189
513	NC_009445	CGG	2	6	20420	20425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337189
514	NC_009445	TGG	2	6	20454	20459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337189
515	NC_009445	TCC	2	6	20469	20474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337189
516	NC_009445	CGC	2	6	20525	20530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337189
517	NC_009445	GCACGA	2	12	20537	20548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337189
518	NC_009445	CGA	2	6	20687	20692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337190
519	NC_009445	TGC	3	9	20698	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337190
520	NC_009445	ACC	2	6	20709	20714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337190
521	NC_009445	CGT	2	6	20735	20740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337190
522	NC_009445	CGT	2	6	20816	20821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337190
523	NC_009445	ATC	2	6	20856	20861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337190
524	NC_009445	CGA	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337190
525	NC_009445	TC	3	6	20966	20971	0 %	50 %	0 %	50 %	146337190
526	NC_009445	GGAA	2	8	20983	20990	50 %	0 %	50 %	0 %	146337190
527	NC_009445	GGT	2	6	21134	21139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337190
528	NC_009445	CGA	2	6	21143	21148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337190
529	NC_009445	CG	4	8	21175	21182	0 %	0 %	50 %	50 %	146337190
530	NC_009445	CG	4	8	21206	21213	0 %	0 %	50 %	50 %	146337190
531	NC_009445	CAT	3	9	21221	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337190
532	NC_009445	CAT	2	6	21272	21277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337190
533	NC_009445	CGA	2	6	21284	21289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337190
534	NC_009445	TGA	2	6	21292	21297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337190
535	NC_009445	TCG	2	6	21306	21311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337190
536	NC_009445	CAGCCG	2	12	21345	21356	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337190
537	NC_009445	AGC	2	6	21367	21372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337190
538	NC_009445	GCCG	2	8	21405	21412	0 %	0 %	50 %	50 %	146337190
539	NC_009445	CGC	4	12	21430	21441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337190
540	NC_009445	GTA	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009445	GC	3	6	21573	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_009445	TCC	2	6	21616	21621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_009445	GC	3	6	21686	21691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_009445	CT	4	8	21711	21718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_009445	TCCCC	2	10	21721	21730	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
546	NC_009445	GGGGGT	2	12	21747	21758	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009445	TCA	2	6	21772	21777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009445	GCTG	2	8	21870	21877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_009445	CGG	2	6	21912	21917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009445	CAC	2	6	21919	21924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_009445	CCCT	2	8	21947	21954	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
552	NC_009445	ATCGC	2	10	22040	22049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
553	NC_009445	GAC	2	6	22176	22181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009445	TTGT	2	8	22274	22281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009445	TTC	2	6	22295	22300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337191
556	NC_009445	ACTC	2	8	22330	22337	25 %	25 %	0 %	50 %	146337191
557	NC_009445	GCCG	2	8	22353	22360	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
558	NC_009445	TGA	2	6	22378	22383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337191
559	NC_009445	CGC	2	6	22393	22398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337191
560	NC_009445	GCA	2	6	22417	22422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
561	NC_009445	GCC	2	6	22432	22437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337191
562	NC_009445	CGA	2	6	22459	22464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
563	NC_009445	CGATGC	2	12	22480	22491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337191
564	NC_009445	GCA	2	6	22507	22512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
565	NC_009445	CGGTC	2	10	22538	22547	0 %	20 %	40 %	40 %	146337191
566	NC_009445	ATG	2	6	22628	22633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337191
567	NC_009445	CGG	2	6	22645	22650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337191
568	NC_009445	CGGC	2	8	22658	22665	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
569	NC_009445	CCA	2	6	22693	22698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337191
570	NC_009445	ACG	2	6	22735	22740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
571	NC_009445	GCG	2	6	22752	22757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337191
572	NC_009445	AGC	2	6	22860	22865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
573	NC_009445	CG	3	6	22918	22923	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
574	NC_009445	CG	4	8	22939	22946	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
575	NC_009445	CCT	2	6	22957	22962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337191
576	NC_009445	GCA	2	6	22972	22977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337191
577	NC_009445	GC	4	8	22979	22986	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
578	NC_009445	CG	3	6	23052	23057	0 %	0 %	50 %	50 %	146337191
579	NC_009445	TCC	2	6	23067	23072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337191
580	NC_009445	CTG	2	6	23272	23277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009445	GA	3	6	23291	23296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009445	CGT	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
583	NC_009445	CGG	2	6	23340	23345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
584	NC_009445	GCCTC	2	10	23360	23369	0 %	20 %	20 %	60 %	146337192
585	NC_009445	CGC	2	6	23382	23387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337192
586	NC_009445	CCA	2	6	23486	23491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337192
587	NC_009445	CGG	3	9	23568	23576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
588	NC_009445	TGC	2	6	23582	23587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
589	NC_009445	AGC	2	6	23606	23611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
590	NC_009445	GAC	2	6	23617	23622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
591	NC_009445	GCT	2	6	23676	23681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
592	NC_009445	CGCC	2	8	23735	23742	0 %	0 %	25 %	75 %	146337192
593	NC_009445	GTGC	2	8	23773	23780	0 %	25 %	50 %	25 %	146337192
594	NC_009445	CG	3	6	23784	23789	0 %	0 %	50 %	50 %	146337192
595	NC_009445	TCG	2	6	23867	23872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
596	NC_009445	CGC	2	6	23889	23894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337192
597	NC_009445	GCA	3	9	23895	23903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
598	NC_009445	GCT	2	6	23907	23912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
599	NC_009445	CGA	2	6	23958	23963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
600	NC_009445	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
601	NC_009445	CGA	2	6	23994	23999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192
602	NC_009445	TCG	2	6	24029	24034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
603	NC_009445	AAGC	2	8	24057	24064	50 %	0 %	25 %	25 %	146337192
604	NC_009445	TCA	2	6	24185	24190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337193
605	NC_009445	TCT	2	6	24205	24210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337193
606	NC_009445	GC	3	6	24256	24261	0 %	0 %	50 %	50 %	146337193
607	NC_009445	TCG	2	6	24282	24287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
608	NC_009445	CGT	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
609	NC_009445	GGCG	2	8	24349	24356	0 %	0 %	75 %	25 %	146337193
610	NC_009445	TTCGTC	2	12	24383	24394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146337193
611	NC_009445	TCG	2	6	24498	24503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337193
612	NC_009445	CG	3	6	24514	24519	0 %	0 %	50 %	50 %	146337193
613	NC_009445	CGG	2	6	24540	24545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337193
614	NC_009445	GC	3	6	24624	24629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009445	GCG	2	6	24674	24679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009445	GCC	2	6	24707	24712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_009445	GGC	2	6	24716	24721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009445	ACT	2	6	24760	24765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337194
619	NC_009445	ATG	2	6	24870	24875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
620	NC_009445	CGG	2	6	24883	24888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337194
621	NC_009445	ACG	2	6	24909	24914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
622	NC_009445	ATG	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
623	NC_009445	TGA	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
624	NC_009445	CG	3	6	24958	24963	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
625	NC_009445	GGC	2	6	24968	24973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337194
626	NC_009445	GTC	2	6	24987	24992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
627	NC_009445	GTC	2	6	25016	25021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
628	NC_009445	GAT	2	6	25052	25057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
629	NC_009445	GCA	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
630	NC_009445	GTC	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
631	NC_009445	GC	3	6	25124	25129	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
632	NC_009445	TGC	2	6	25182	25187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
633	NC_009445	CG	3	6	25216	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	146337194
634	NC_009445	TGA	2	6	25288	25293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337194
635	NC_009445	CGA	2	6	25322	25327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337194
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637	NC_009445	TGC	2	6	25402	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337194
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640	NC_009445	TCCGGT	2	12	25488	25499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_009445	AGAT	2	8	25873	25880	50 %	25 %	25 %	0 %	146337195
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659	NC_009445	CG	3	6	26367	26372	0 %	0 %	50 %	50 %	146337196
660	NC_009445	CGT	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337196
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684	NC_009445	CAC	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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686	NC_009445	CAG	3	9	27246	27254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
687	NC_009445	GGAA	2	8	27278	27285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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710	NC_009445	CG	4	8	27922	27929	0 %	0 %	50 %	50 %	146337197
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746	NC_009445	CCG	2	6	29157	29162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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758	NC_009445	AGC	2	6	29533	29538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337199
759	NC_009445	CG	3	6	29606	29611	0 %	0 %	50 %	50 %	146337199
760	NC_009445	GC	3	6	29656	29661	0 %	0 %	50 %	50 %	146337199
761	NC_009445	CAGC	2	8	29670	29677	25 %	0 %	25 %	50 %	146337199
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766	NC_009445	GCC	2	6	29843	29848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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877	NC_009445	GCG	3	9	34396	34404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337202
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881	NC_009445	GC	3	6	34547	34552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
882	NC_009445	CGT	2	6	34561	34566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
883	NC_009445	GCCGC	2	10	34579	34588	0 %	0 %	40 %	60 %	146337203
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