MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009445	TGC	2	6	229268	229273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6002	NC_009445	GCT	2	6	229278	229283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6003	NC_009445	CGC	2	6	229295	229300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337385
6004	NC_009445	TCA	2	6	229316	229321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337385
6005	NC_009445	AAG	2	6	229378	229383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337385
6006	NC_009445	GGCC	2	8	229440	229447	0 %	0 %	50 %	50 %	146337385
6007	NC_009445	GC	4	8	229458	229465	0 %	0 %	50 %	50 %	146337385
6008	NC_009445	GATC	2	8	229515	229522	25 %	25 %	25 %	25 %	146337385
6009	NC_009445	TCG	2	6	229538	229543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6010	NC_009445	TGC	2	6	229556	229561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6011	NC_009445	GACCG	2	10	229563	229572	20 %	0 %	40 %	40 %	146337385
6012	NC_009445	CG	3	6	229577	229582	0 %	0 %	50 %	50 %	146337385
6013	NC_009445	GGT	2	6	229599	229604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337385
6014	NC_009445	CTT	2	6	229611	229616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337385
6015	NC_009445	TGC	2	6	229652	229657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6016	NC_009445	GCT	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6017	NC_009445	GCCACC	2	12	229756	229767	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	146337385
6018	NC_009445	GCGATC	2	12	229768	229779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337385
6019	NC_009445	ACA	2	6	229811	229816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337385
6020	NC_009445	GAA	2	6	229851	229856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337385
6021	NC_009445	GCG	2	6	229890	229895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337385
6022	NC_009445	TGATG	2	10	229955	229964	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009445	ACGG	2	8	230077	230084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_009445	CAC	2	6	230113	230118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_009445	GAA	2	6	230155	230160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009445	TAC	2	6	230189	230194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_009445	GCC	2	6	230209	230214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6028	NC_009445	TGCCG	2	10	230218	230227	0 %	20 %	40 %	40 %	146337386
6029	NC_009445	CCG	2	6	230361	230366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6030	NC_009445	GCG	2	6	230407	230412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6031	NC_009445	ATCAGG	2	12	230443	230454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146337386
6032	NC_009445	GC	3	6	230475	230480	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6033	NC_009445	ATG	2	6	230529	230534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337386
6034	NC_009445	CAG	2	6	230547	230552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6035	NC_009445	CGG	2	6	230631	230636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6036	NC_009445	CCATCG	5	30	230680	230709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337386
6037	NC_009445	CG	4	8	230723	230730	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6038	NC_009445	GCGA	2	8	230731	230738	25 %	0 %	50 %	25 %	146337386
6039	NC_009445	GC	3	6	230743	230748	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6040	NC_009445	CGT	2	6	230832	230837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6041	NC_009445	GCC	2	6	230840	230845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6042	NC_009445	CGC	2	6	230876	230881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6043	NC_009445	CAT	2	6	230888	230893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337386
6044	NC_009445	GCA	2	6	230924	230929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6045	NC_009445	GC	3	6	230969	230974	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6046	NC_009445	CGG	2	6	231017	231022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6047	NC_009445	CGC	2	6	231080	231085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6048	NC_009445	CGCCGG	2	12	231128	231139	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6049	NC_009445	GCTC	2	8	231140	231147	0 %	25 %	25 %	50 %	146337386
6050	NC_009445	GCC	2	6	231162	231167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6051	NC_009445	GCC	2	6	231213	231218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6052	NC_009445	CG	3	6	231226	231231	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6053	NC_009445	GTC	2	6	231237	231242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6054	NC_009445	CGG	2	6	231281	231286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6055	NC_009445	CGATGC	2	12	231287	231298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6056	NC_009445	CGC	2	6	231362	231367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
6057	NC_009445	AGC	2	6	231406	231411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6058	NC_009445	GC	3	6	231423	231428	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6059	NC_009445	GCT	2	6	231485	231490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6060	NC_009445	GC	4	8	231497	231504	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6061	NC_009445	AGC	2	6	231511	231516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6062	NC_009445	AAT	2	6	231593	231598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146337386
6063	NC_009445	AGC	2	6	231601	231606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6064	NC_009445	GC	3	6	231640	231645	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6065	NC_009445	GTC	2	6	231661	231666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6066	NC_009445	GCG	2	6	231680	231685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6067	NC_009445	AGC	3	9	231691	231699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6068	NC_009445	GCG	2	6	231725	231730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337386
6069	NC_009445	TGGC	2	8	231742	231749	0 %	25 %	50 %	25 %	146337386
6070	NC_009445	CG	3	6	231797	231802	0 %	0 %	50 %	50 %	146337386
6071	NC_009445	CTCGGT	2	12	231819	231830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
6072	NC_009445	CGGT	2	8	231832	231839	0 %	25 %	50 %	25 %	146337386
6073	NC_009445	GCA	2	6	231860	231865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337386
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6075	NC_009445	TGC	2	6	232016	232021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
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6077	NC_009445	CTG	2	6	232119	232124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337386
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6079	NC_009445	CTT	2	6	232215	232220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337386
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6081	NC_009445	GCC	2	6	232359	232364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337386
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6083	NC_009445	AGA	2	6	232376	232381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337386
6084	NC_009445	TCA	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337386
6085	NC_009445	TGA	2	6	232414	232419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337386
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6087	NC_009445	GCC	2	6	232506	232511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_009445	CAT	2	6	232515	232520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_009445	CGG	2	6	232714	232719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337387
6093	NC_009445	CGT	2	6	232732	232737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337387
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6098	NC_009445	TGA	3	9	233110	233118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_009445	GCCG	2	8	233253	233260	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
6100	NC_009445	GC	3	6	233293	233298	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
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6104	NC_009445	GCA	2	6	233358	233363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337388
6105	NC_009445	GTC	2	6	233395	233400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337388
6106	NC_009445	CGG	3	9	233406	233414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
6107	NC_009445	GCG	3	9	233483	233491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
6108	NC_009445	GCG	2	6	233498	233503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
6109	NC_009445	CGG	2	6	233508	233513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
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6111	NC_009445	CGG	2	6	233527	233532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
6112	NC_009445	CGG	2	6	233544	233549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
6113	NC_009445	CGG	2	6	233556	233561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337388
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6116	NC_009445	GC	3	6	233747	233752	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
6117	NC_009445	CG	3	6	233802	233807	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
6118	NC_009445	TCG	2	6	233825	233830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337388
6119	NC_009445	GCC	3	9	233884	233892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337388
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6121	NC_009445	GCC	2	6	233937	233942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337388
6122	NC_009445	GC	3	6	233952	233957	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
6123	NC_009445	ATC	2	6	233987	233992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337388
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6135	NC_009445	CGGC	2	8	234516	234523	0 %	0 %	50 %	50 %	146337388
6136	NC_009445	GCGCC	2	10	234541	234550	0 %	0 %	40 %	60 %	146337388
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6142	NC_009445	GTG	2	6	234764	234769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6145	NC_009445	GGCG	2	8	234928	234935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6245	NC_009445	GC	3	6	238254	238259	0 %	0 %	50 %	50 %	146337391
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6247	NC_009445	GTC	2	6	238276	238281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337391
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6249	NC_009445	GAC	2	6	238342	238347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337391
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6333	NC_009445	TTG	2	6	241102	241107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6334	NC_009445	GCG	2	6	241300	241305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6366	NC_009445	CGC	2	6	242537	242542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337393
6367	NC_009445	CTTCGC	2	12	242545	242556	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146337393
6368	NC_009445	GTG	2	6	242558	242563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337393
6369	NC_009445	CG	3	6	242568	242573	0 %	0 %	50 %	50 %	146337393
6370	NC_009445	CGA	2	6	242620	242625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337393
6371	NC_009445	CG	3	6	242732	242737	0 %	0 %	50 %	50 %	146337393
6372	NC_009445	GCG	2	6	242755	242760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337393
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6380	NC_009445	TCG	2	6	243012	243017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337393
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6398	NC_009445	CCG	2	6	243771	243776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337393
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6422	NC_009445	TGG	2	6	244541	244546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6486	NC_009445	GCCA	2	8	247318	247325	25 %	0 %	25 %	50 %	146337395
6487	NC_009445	TCG	3	9	247405	247413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337395
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6490	NC_009445	CGG	2	6	247494	247499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6491	NC_009445	GCC	2	6	247506	247511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337396
6492	NC_009445	GCG	3	9	247542	247550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337396
6493	NC_009445	GATGGC	2	12	247603	247614	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146337396
6494	NC_009445	GCG	2	6	247622	247627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337396
6495	NC_009445	CGG	2	6	247635	247640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337396
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6497	NC_009445	GCC	2	6	247712	247717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_009445	TCG	2	6	247795	247800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_009445	CGC	2	6	247813	247818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6500	NC_009445	AGC	2	6	247844	247849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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