MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia mallei NCTC 10247 chromosome II

Total Repeats: 3042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009079	TGCGC	2	10	1183	1192	0 %	20 %	40 %	40 %	126447264
2	NC_009079	GTGCG	2	10	2638	2647	0 %	20 %	60 %	20 %	126446250
3	NC_009079	GCGCC	2	10	2977	2986	0 %	0 %	40 %	60 %	126446250
4	NC_009079	CGGCA	2	10	3665	3674	20 %	0 %	40 %	40 %	126445889
5	NC_009079	CGGGC	2	10	6100	6109	0 %	0 %	60 %	40 %	126445944
6	NC_009079	CGCAT	2	10	7185	7194	20 %	20 %	20 %	40 %	126447550
7	NC_009079	TCGAA	2	10	8340	8349	40 %	20 %	20 %	20 %	126447201
8	NC_009079	ACGCG	2	10	8737	8746	20 %	0 %	40 %	40 %	126447201
9	NC_009079	CGACG	2	10	11278	11287	20 %	0 %	40 %	40 %	126446469
10	NC_009079	GTGCC	2	10	11504	11513	0 %	20 %	40 %	40 %	126446469
11	NC_009079	GCACG	2	10	11653	11662	20 %	0 %	40 %	40 %	126446469
12	NC_009079	CAGCG	2	10	15569	15578	20 %	0 %	40 %	40 %	126446619
13	NC_009079	CGGCG	2	10	15612	15621	0 %	0 %	60 %	40 %	126446619
14	NC_009079	CGCGG	2	10	16519	16528	0 %	0 %	60 %	40 %	126446617
15	NC_009079	TGCGA	2	10	20547	20556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009079	GCGCG	2	10	20564	20573	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009079	CGATG	2	10	20692	20701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009079	ACGCG	2	10	20746	20755	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009079	CGCGC	2	10	21158	21167	0 %	0 %	40 %	60 %	126447929
20	NC_009079	CGATT	2	10	24169	24178	20 %	40 %	20 %	20 %	126447071
21	NC_009079	GCCGC	2	10	24773	24782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009079	CGCGG	2	10	25810	25819	0 %	0 %	60 %	40 %	126445725
23	NC_009079	CGCAA	2	10	26069	26078	40 %	0 %	20 %	40 %	126445725
24	NC_009079	GCCGC	2	10	28387	28396	0 %	0 %	40 %	60 %	126446727
25	NC_009079	CGCGC	2	10	29830	29839	0 %	0 %	40 %	60 %	126447570
26	NC_009079	GCCGA	2	10	30846	30855	20 %	0 %	40 %	40 %	126447011
27	NC_009079	CGAGC	2	10	31576	31585	20 %	0 %	40 %	40 %	126447426
28	NC_009079	TCGCC	2	10	32441	32450	0 %	20 %	20 %	60 %	126446632
29	NC_009079	GCGTG	2	10	32656	32665	0 %	20 %	60 %	20 %	126446632
30	NC_009079	AGGCG	2	10	33361	33370	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009079	GCGCC	2	10	35456	35465	0 %	0 %	40 %	60 %	126445650
32	NC_009079	GGCGC	2	10	36934	36943	0 %	0 %	60 %	40 %	126446035
33	NC_009079	GCGAC	2	10	37989	37998	20 %	0 %	40 %	40 %	126445595
34	NC_009079	CACGG	2	10	40373	40382	20 %	0 %	40 %	40 %	126446738
35	NC_009079	GCCGC	2	10	43030	43039	0 %	0 %	40 %	60 %	126445866
36	NC_009079	GTGCG	2	10	43303	43312	0 %	20 %	60 %	20 %	126445866
37	NC_009079	ATTGC	2	10	43604	43613	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009079	CGGAT	2	10	44119	44128	20 %	20 %	40 %	20 %	126446347
39	NC_009079	AGGCG	2	10	45307	45316	20 %	0 %	60 %	20 %	126445823
40	NC_009079	CGACG	2	10	46469	46478	20 %	0 %	40 %	40 %	126446639
41	NC_009079	CGCAC	2	10	47065	47074	20 %	0 %	20 %	60 %	126446175
42	NC_009079	CGACG	2	10	47717	47726	20 %	0 %	40 %	40 %	126446175
43	NC_009079	GCGCG	2	10	48052	48061	0 %	0 %	60 %	40 %	126447451
44	NC_009079	GCGCA	2	10	49152	49161	20 %	0 %	40 %	40 %	126446920
45	NC_009079	GCATC	2	10	49302	49311	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009079	ACGCG	2	10	50233	50242	20 %	0 %	40 %	40 %	126446443
47	NC_009079	CGATC	2	10	50996	51005	20 %	20 %	20 %	40 %	126447758
48	NC_009079	CGGGC	2	10	51673	51682	0 %	0 %	60 %	40 %	126447180
49	NC_009079	ATCGT	2	10	53326	53335	20 %	40 %	20 %	20 %	126447187
50	NC_009079	GCCGC	2	10	55062	55071	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009079	GCGTC	2	10	56555	56564	0 %	20 %	40 %	40 %	126446799
52	NC_009079	CGGAC	2	10	57136	57145	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009079	TGCGT	2	10	58577	58586	0 %	40 %	40 %	20 %	126447920
54	NC_009079	CGCGG	2	10	59183	59192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009079	GGCGC	2	10	59816	59825	0 %	0 %	60 %	40 %	126447204
56	NC_009079	CGTCG	2	10	59828	59837	0 %	20 %	40 %	40 %	126447204
57	NC_009079	TCGAA	2	10	60406	60415	40 %	20 %	20 %	20 %	126447204
58	NC_009079	CCCGG	2	10	61035	61044	0 %	0 %	40 %	60 %	126447204
59	NC_009079	GCGCA	2	10	64776	64785	20 %	0 %	40 %	40 %	126447204
60	NC_009079	CGCGG	2	10	64828	64837	0 %	0 %	60 %	40 %	126447204
61	NC_009079	GGCTT	2	10	66239	66248	0 %	40 %	40 %	20 %	126447156
62	NC_009079	GCGCA	2	10	66355	66364	20 %	0 %	40 %	40 %	126447156
63	NC_009079	CGGCG	2	10	69159	69168	0 %	0 %	60 %	40 %	126446216
64	NC_009079	GGCGT	2	10	70541	70550	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009079	CGGGA	2	10	72357	72366	20 %	0 %	60 %	20 %	126447915
66	NC_009079	GATTC	2	10	72986	72995	20 %	40 %	20 %	20 %	126447915
67	NC_009079	TCGCG	2	10	72998	73007	0 %	20 %	40 %	40 %	126447915
68	NC_009079	GGCAT	2	10	73127	73136	20 %	20 %	40 %	20 %	126447915
69	NC_009079	TCCGC	2	10	73719	73728	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_009079	CTTTT	2	10	73903	73912	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009079	GCCGA	2	10	74445	74454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009079	ACACG	2	10	75109	75118	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009079	TCGAT	2	10	77248	77257	20 %	40 %	20 %	20 %	126447300
74	NC_009079	GCACG	2	10	77925	77934	20 %	0 %	40 %	40 %	126447750
75	NC_009079	CGGCT	2	10	78025	78034	0 %	20 %	40 %	40 %	126447750
76	NC_009079	CTTCC	2	10	78290	78299	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_009079	TGCGC	2	10	79985	79994	0 %	20 %	40 %	40 %	126445709
78	NC_009079	GGCAA	2	10	81407	81416	40 %	0 %	40 %	20 %	126446054
79	NC_009079	GCGCC	2	10	82087	82096	0 %	0 %	40 %	60 %	126446183
80	NC_009079	TGTCG	2	10	83321	83330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009079	GGCGG	2	10	83433	83442	0 %	0 %	80 %	20 %	126445975
82	NC_009079	GCGGG	2	10	83496	83505	0 %	0 %	80 %	20 %	126445975
83	NC_009079	GCGCG	2	10	84074	84083	0 %	0 %	60 %	40 %	126445975
84	NC_009079	GCGCC	2	10	87469	87478	0 %	0 %	40 %	60 %	126447371
85	NC_009079	GCCGA	2	10	87567	87576	20 %	0 %	40 %	40 %	126447371
86	NC_009079	CAGAT	2	10	87600	87609	40 %	20 %	20 %	20 %	126447371
87	NC_009079	CGCGT	2	10	88934	88943	0 %	20 %	40 %	40 %	126446199
88	NC_009079	AGCAG	2	10	89703	89712	40 %	0 %	40 %	20 %	126445699
89	NC_009079	CGGCG	2	10	90220	90229	0 %	0 %	60 %	40 %	126445699
90	NC_009079	GCCGC	2	10	90515	90524	0 %	0 %	40 %	60 %	126445699
91	NC_009079	GGAAC	2	10	92693	92702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009079	ACGTC	2	10	93460	93469	20 %	20 %	20 %	40 %	126447458
93	NC_009079	AATTG	2	10	95991	96000	40 %	40 %	20 %	0 %	126445974
94	NC_009079	GCGTC	2	10	96906	96915	0 %	20 %	40 %	40 %	126447734
95	NC_009079	GCCGC	2	10	97842	97851	0 %	0 %	40 %	60 %	126447734
96	NC_009079	GCCGG	2	10	98869	98878	0 %	0 %	60 %	40 %	126446394
97	NC_009079	CGCGC	2	10	98998	99007	0 %	0 %	40 %	60 %	126446394
98	NC_009079	CGGGC	2	10	99572	99581	0 %	0 %	60 %	40 %	126446929
99	NC_009079	GCCGC	2	10	100526	100535	0 %	0 %	40 %	60 %	126446870
100	NC_009079	TCGCG	2	10	100923	100932	0 %	20 %	40 %	40 %	126446870
101	NC_009079	GCCGC	2	10	101711	101720	0 %	0 %	40 %	60 %	126447405
102	NC_009079	CGCGC	2	10	101846	101855	0 %	0 %	40 %	60 %	126447405
103	NC_009079	GCCGC	2	10	102492	102501	0 %	0 %	40 %	60 %	126447405
104	NC_009079	GCGCG	2	10	103045	103054	0 %	0 %	60 %	40 %	126446762
105	NC_009079	CGGCG	2	10	103232	103241	0 %	0 %	60 %	40 %	126446762
106	NC_009079	GGCGC	2	10	105337	105346	0 %	0 %	60 %	40 %	126445978
107	NC_009079	ACGCT	2	10	105760	105769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009079	TTCGA	2	10	106183	106192	20 %	40 %	20 %	20 %	126446856
109	NC_009079	ATGCG	2	10	106763	106772	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009079	GCGAT	2	10	107158	107167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009079	AGCGC	2	10	107266	107275	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009079	CCATC	2	10	108481	108490	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_009079	CGTGT	2	10	111589	111598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009079	GGCGC	2	10	111960	111969	0 %	0 %	60 %	40 %	126445926
115	NC_009079	TGCGC	2	10	112512	112521	0 %	20 %	40 %	40 %	126445926
116	NC_009079	GCGCG	2	10	112539	112548	0 %	0 %	60 %	40 %	126445926
117	NC_009079	CGGCG	2	10	113411	113420	0 %	0 %	60 %	40 %	126447250
118	NC_009079	CGCGG	2	10	113727	113736	0 %	0 %	60 %	40 %	126446615
119	NC_009079	GCCGT	2	10	113891	113900	0 %	20 %	40 %	40 %	126446615
120	NC_009079	GCTGC	2	10	115393	115402	0 %	20 %	40 %	40 %	126446308
121	NC_009079	GATGC	2	10	118120	118129	20 %	20 %	40 %	20 %	126446913
122	NC_009079	TCGCG	2	10	118868	118877	0 %	20 %	40 %	40 %	126446913
123	NC_009079	CGGCG	2	10	119656	119665	0 %	0 %	60 %	40 %	126447423
124	NC_009079	ACGTC	2	10	119754	119763	20 %	20 %	20 %	40 %	126447423
125	NC_009079	CAGAT	2	10	120041	120050	40 %	20 %	20 %	20 %	126447423
126	NC_009079	TGCGC	2	10	120732	120741	0 %	20 %	40 %	40 %	126447423
127	NC_009079	GCGTG	2	10	121253	121262	0 %	20 %	60 %	20 %	126447423
128	NC_009079	GCGCG	2	10	121755	121764	0 %	0 %	60 %	40 %	126446164
129	NC_009079	GCGCC	2	10	121835	121844	0 %	0 %	40 %	60 %	126446164
130	NC_009079	CGGCG	2	10	122025	122034	0 %	0 %	60 %	40 %	126446164
131	NC_009079	CGGCG	2	10	124095	124104	0 %	0 %	60 %	40 %	126446256
132	NC_009079	GCCGA	2	10	124882	124891	20 %	0 %	40 %	40 %	126447718
133	NC_009079	CCGCG	2	10	125135	125144	0 %	0 %	40 %	60 %	126447718
134	NC_009079	CGGCG	2	10	125258	125267	0 %	0 %	60 %	40 %	126445777
135	NC_009079	CGATG	2	10	127525	127534	20 %	20 %	40 %	20 %	126447307
136	NC_009079	CGGCG	2	10	128316	128325	0 %	0 %	60 %	40 %	126447933
137	NC_009079	CGCGC	3	15	128380	128394	0 %	0 %	40 %	60 %	126447933
138	NC_009079	ACGCG	2	10	128465	128474	20 %	0 %	40 %	40 %	126447933
139	NC_009079	GCGCG	2	10	128646	128655	0 %	0 %	60 %	40 %	126447933
140	NC_009079	CGCGG	2	10	128691	128700	0 %	0 %	60 %	40 %	126447933
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270	NC_009079	GCGCG	2	10	220395	220404	0 %	0 %	60 %	40 %	126447289
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272	NC_009079	GCGCG	2	10	221278	221287	0 %	0 %	60 %	40 %	126447289
273	NC_009079	GCGAC	2	10	221433	221442	20 %	0 %	40 %	40 %	126447289
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275	NC_009079	GGCGA	2	10	223625	223634	20 %	0 %	60 %	20 %	126445704
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282	NC_009079	TGCGC	2	10	227217	227226	0 %	20 %	40 %	40 %	126445753
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392	NC_009079	TCGAA	2	10	323435	323444	40 %	20 %	20 %	20 %	126447021
393	NC_009079	ACGCG	2	10	324932	324941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
394	NC_009079	CCGGG	2	10	325675	325684	0 %	0 %	60 %	40 %	126446032
395	NC_009079	CCGCG	2	10	326480	326489	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
396	NC_009079	GCGCG	2	10	327596	327605	0 %	0 %	60 %	40 %	126446300
397	NC_009079	TATAA	2	10	329086	329095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_009079	GCGCC	2	10	332257	332266	0 %	0 %	40 %	60 %	126446419
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402	NC_009079	GCGCG	2	10	335377	335386	0 %	0 %	60 %	40 %	126446894
403	NC_009079	CGGCG	2	10	335713	335722	0 %	0 %	60 %	40 %	126446894
404	NC_009079	ATGGC	2	10	336695	336704	20 %	20 %	40 %	20 %	126446894
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