MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei 1106a chromosome I

Total Repeats: 129087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
129001	NC_009076	CGA	2	6	3985364	3985369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129002	NC_009076	TCG	2	6	3985436	3985441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129003	NC_009076	CG	3	6	3985452	3985457	0 %	0 %	50 %	50 %	126451506
129004	NC_009076	GCG	2	6	3985514	3985519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126451506
129005	NC_009076	AC	3	6	3985520	3985525	50 %	0 %	0 %	50 %	126451506
129006	NC_009076	CAATCG	2	12	3985546	3985557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126451506
129007	NC_009076	CGC	2	6	3985558	3985563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
129008	NC_009076	TCG	2	6	3985591	3985596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129009	NC_009076	GCC	2	6	3985605	3985610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
129010	NC_009076	GTCG	2	8	3985620	3985627	0 %	25 %	50 %	25 %	126451506
129011	NC_009076	CGC	2	6	3985665	3985670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
129012	NC_009076	GC	3	6	3985669	3985674	0 %	0 %	50 %	50 %	126451506
129013	NC_009076	CGAG	2	8	3985715	3985722	25 %	0 %	50 %	25 %	126451506
129014	NC_009076	CCG	2	6	3985723	3985728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
129015	NC_009076	TCG	2	6	3985735	3985740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129016	NC_009076	GCG	2	6	3985754	3985759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126451506
129017	NC_009076	GCA	2	6	3985772	3985777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129018	NC_009076	CGCGC	2	10	3985822	3985831	0 %	0 %	40 %	60 %	126451506
129019	NC_009076	CGA	2	6	3985844	3985849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451506
129020	NC_009076	CG	3	6	3985851	3985856	0 %	0 %	50 %	50 %	126451506
129021	NC_009076	CGC	2	6	3985875	3985880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
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129030	NC_009076	CG	4	8	3986217	3986224	0 %	0 %	50 %	50 %	126451506
129031	NC_009076	CGC	2	6	3986288	3986293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126451506
129032	NC_009076	GCC	2	6	3986329	3986334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129033	NC_009076	GCA	2	6	3986369	3986374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129034	NC_009076	CGG	2	6	3986423	3986428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129035	NC_009076	CG	3	6	3986495	3986500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129036	NC_009076	CGC	3	9	3986517	3986525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129037	NC_009076	CGC	2	6	3986528	3986533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129038	NC_009076	TGCCC	2	10	3986539	3986548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129039	NC_009076	GC	3	6	3986590	3986595	0 %	0 %	50 %	50 %	126453019
129040	NC_009076	CG	3	6	3986713	3986718	0 %	0 %	50 %	50 %	126453019
129041	NC_009076	CGCC	2	8	3986808	3986815	0 %	0 %	25 %	75 %	126453019
129042	NC_009076	CAT	2	6	3986845	3986850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126453019
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129047	NC_009076	CG	3	6	3986969	3986974	0 %	0 %	50 %	50 %	126453019
129048	NC_009076	CGA	2	6	3987033	3987038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126453019
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129063	NC_009076	TCG	2	6	3987554	3987559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126451989
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129073	NC_009076	AGC	3	9	3987794	3987802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126451989
129074	NC_009076	GCCG	2	8	3987958	3987965	0 %	0 %	50 %	50 %	126454858
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129079	NC_009076	GAAC	2	8	3988201	3988208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129080	NC_009076	TG	3	6	3988209	3988214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129081	NC_009076	CCG	2	6	3988229	3988234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129082	NC_009076	A	6	6	3988249	3988254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129083	NC_009076	GCG	2	6	3988328	3988333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129084	NC_009076	CGG	2	6	3988357	3988362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129085	NC_009076	ACT	3	9	3988373	3988381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129086	NC_009076	ATACGT	2	12	3988390	3988401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129087	NC_009076	TAAACC	2	12	3988407	3988418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.