MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia mallei NCTC 10229 chromosome I

Total Repeats: 4091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008836	CGAAG	2	10	314	323	40 %	0 %	40 %	20 %	124384050
2	NC_008836	CTGGG	2	10	453	462	0 %	20 %	60 %	20 %	124384050
3	NC_008836	GGGCG	2	10	797	806	0 %	0 %	80 %	20 %	124384050
4	NC_008836	GCCGC	2	10	939	948	0 %	0 %	40 %	60 %	124384050
5	NC_008836	AGGCG	2	10	1766	1775	20 %	0 %	60 %	20 %	124385536
6	NC_008836	TCACA	2	10	1868	1877	40 %	20 %	0 %	40 %	124385536
7	NC_008836	AATCG	2	10	2829	2838	40 %	20 %	20 %	20 %	124385320
8	NC_008836	GCTCG	2	10	3588	3597	0 %	20 %	40 %	40 %	124385320
9	NC_008836	GATCG	2	10	6396	6405	20 %	20 %	40 %	20 %	124385202
10	NC_008836	CGACG	2	10	8459	8468	20 %	0 %	40 %	40 %	124383804
11	NC_008836	CGGCT	2	10	9678	9687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008836	GCGCG	2	10	10420	10429	0 %	0 %	60 %	40 %	124386484
13	NC_008836	TCGAG	2	10	11755	11764	20 %	20 %	40 %	20 %	124383888
14	NC_008836	GCCGA	2	10	12191	12200	20 %	0 %	40 %	40 %	124383888
15	NC_008836	CGCGC	2	10	12955	12964	0 %	0 %	40 %	60 %	124384607
16	NC_008836	GCCGA	2	10	13513	13522	20 %	0 %	40 %	40 %	124386023
17	NC_008836	CGCGT	2	10	14653	14662	0 %	20 %	40 %	40 %	124383514
18	NC_008836	GCCAC	2	10	14916	14925	20 %	0 %	20 %	60 %	124383514
19	NC_008836	CGAGC	2	10	14928	14937	20 %	0 %	40 %	40 %	124383514
20	NC_008836	AGGAA	2	10	15397	15406	60 %	0 %	40 %	0 %	124383514
21	NC_008836	GCGCG	2	10	17581	17590	0 %	0 %	60 %	40 %	124383526
22	NC_008836	GCGCG	2	10	17605	17614	0 %	0 %	60 %	40 %	124383526
23	NC_008836	CTCGT	2	10	18096	18105	0 %	40 %	20 %	40 %	124383807
24	NC_008836	GCATC	2	10	18624	18633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008836	GCCGG	2	10	22673	22682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008836	CCGGC	2	10	22924	22933	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008836	CCCAC	2	10	23347	23356	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_008836	CGGCT	2	10	24003	24012	0 %	20 %	40 %	40 %	124384914
29	NC_008836	CGACG	2	10	24050	24059	20 %	0 %	40 %	40 %	124384914
30	NC_008836	CGGCG	2	10	24236	24245	0 %	0 %	60 %	40 %	124384914
31	NC_008836	CGCGC	2	10	24434	24443	0 %	0 %	40 %	60 %	124384914
32	NC_008836	CGCAG	2	10	25946	25955	20 %	0 %	40 %	40 %	124386131
33	NC_008836	CGCGC	2	10	27007	27016	0 %	0 %	40 %	60 %	124384987
34	NC_008836	CGCGC	2	10	27592	27601	0 %	0 %	40 %	60 %	124385885
35	NC_008836	CTGCA	2	10	28119	28128	20 %	20 %	20 %	40 %	124385885
36	NC_008836	CGAGC	2	10	28214	28223	20 %	0 %	40 %	40 %	124385885
37	NC_008836	CCGAG	2	10	30231	30240	20 %	0 %	40 %	40 %	124386247
38	NC_008836	TGCCG	2	10	31299	31308	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_008836	GCGAC	2	10	31752	31761	20 %	0 %	40 %	40 %	124384343
40	NC_008836	GGCGG	2	10	32357	32366	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008836	CCCGC	2	10	32711	32720	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
42	NC_008836	GACGC	2	10	33215	33224	20 %	0 %	40 %	40 %	124385828
43	NC_008836	CGCGC	2	10	34741	34750	0 %	0 %	40 %	60 %	124383703
44	NC_008836	CGGCG	2	10	34855	34864	0 %	0 %	60 %	40 %	124383703
45	NC_008836	CCGGC	2	10	36021	36030	0 %	0 %	40 %	60 %	124385132
46	NC_008836	TCGAG	2	10	40082	40091	20 %	20 %	40 %	20 %	124385334
47	NC_008836	GCGAC	2	10	40343	40352	20 %	0 %	40 %	40 %	124385334
48	NC_008836	GCTTC	2	10	41978	41987	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008836	CGGCA	2	10	41994	42003	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008836	TCGCT	2	10	42109	42118	0 %	40 %	20 %	40 %	124386554
51	NC_008836	ACGCG	2	10	43460	43469	20 %	0 %	40 %	40 %	124386554
52	NC_008836	CCGCG	2	10	43540	43549	0 %	0 %	40 %	60 %	124386554
53	NC_008836	CGCGC	2	10	43820	43829	0 %	0 %	40 %	60 %	124386554
54	NC_008836	GATCA	2	10	45271	45280	40 %	20 %	20 %	20 %	124385650
55	NC_008836	GGCGA	2	10	45448	45457	20 %	0 %	60 %	20 %	124385650
56	NC_008836	CGCGC	2	10	45632	45641	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008836	CGATC	2	10	46440	46449	20 %	20 %	20 %	40 %	124384295
58	NC_008836	GCGCC	2	10	48030	48039	0 %	0 %	40 %	60 %	124386039
59	NC_008836	GCGCC	2	10	49178	49187	0 %	0 %	40 %	60 %	124385128
60	NC_008836	GCGCG	2	10	49266	49275	0 %	0 %	60 %	40 %	124385128
61	NC_008836	TCGTG	2	10	51005	51014	0 %	40 %	40 %	20 %	124384361
62	NC_008836	GATGC	3	15	51482	51496	20 %	20 %	40 %	20 %	124384361
63	NC_008836	CCGTC	2	10	51707	51716	0 %	20 %	20 %	60 %	124383859
64	NC_008836	CGGCG	2	10	52170	52179	0 %	0 %	60 %	40 %	124383859
65	NC_008836	CGGCG	2	10	52258	52267	0 %	0 %	60 %	40 %	124383859
66	NC_008836	CCGTT	2	10	52466	52475	0 %	40 %	20 %	40 %	124383859
67	NC_008836	CGTCC	2	10	52478	52487	0 %	20 %	20 %	60 %	124383859
68	NC_008836	CGCGC	2	10	52620	52629	0 %	0 %	40 %	60 %	124385031
69	NC_008836	TGCGC	2	10	56187	56196	0 %	20 %	40 %	40 %	124383540
70	NC_008836	CGCGC	2	10	56271	56280	0 %	0 %	40 %	60 %	124383540
71	NC_008836	CGTGC	2	10	56367	56376	0 %	20 %	40 %	40 %	124383540
72	NC_008836	TGCCG	2	10	58208	58217	0 %	20 %	40 %	40 %	124385778
73	NC_008836	TCGGC	2	10	58558	58567	0 %	20 %	40 %	40 %	124385778
74	NC_008836	GCCGC	2	10	59218	59227	0 %	0 %	40 %	60 %	124385778
75	NC_008836	CGCGC	2	10	59796	59805	0 %	0 %	40 %	60 %	124385953
76	NC_008836	TCGCC	2	10	61041	61050	0 %	20 %	20 %	60 %	124385333
77	NC_008836	AACTT	2	10	61303	61312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008836	GCGAA	2	10	64716	64725	40 %	0 %	40 %	20 %	124386447
79	NC_008836	GCGCC	2	10	65622	65631	0 %	0 %	40 %	60 %	124386447
80	NC_008836	TCGGG	2	10	66292	66301	0 %	20 %	60 %	20 %	124384316
81	NC_008836	AGCGG	2	10	68135	68144	20 %	0 %	60 %	20 %	124385774
82	NC_008836	CGCGC	2	10	69481	69490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_008836	GGCGC	2	10	71659	71668	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008836	CGGCA	2	10	72336	72345	20 %	0 %	40 %	40 %	124385081
85	NC_008836	GCTCG	2	10	72512	72521	0 %	20 %	40 %	40 %	124385081
86	NC_008836	TCGCG	2	10	74699	74708	0 %	20 %	40 %	40 %	124384978
87	NC_008836	CCGCG	2	10	74948	74957	0 %	0 %	40 %	60 %	124384978
88	NC_008836	CGCGG	2	10	75191	75200	0 %	0 %	60 %	40 %	124384978
89	NC_008836	GAACG	2	10	76176	76185	40 %	0 %	40 %	20 %	124384978
90	NC_008836	GGGGC	2	10	79644	79653	0 %	0 %	80 %	20 %	124384589
91	NC_008836	GCTCA	2	10	79995	80004	20 %	20 %	20 %	40 %	124384405
92	NC_008836	GCGCC	2	10	80225	80234	0 %	0 %	40 %	60 %	124384405
93	NC_008836	CACGG	2	10	82338	82347	20 %	0 %	40 %	40 %	124386252
94	NC_008836	CGGCC	2	10	82610	82619	0 %	0 %	40 %	60 %	124386252
95	NC_008836	CGGCG	2	10	82947	82956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008836	CCCGG	2	10	83477	83486	0 %	0 %	40 %	60 %	124383320
97	NC_008836	CGTCG	2	10	83639	83648	0 %	20 %	40 %	40 %	124383320
98	NC_008836	TCGTG	2	10	84280	84289	0 %	40 %	40 %	20 %	124383320
99	NC_008836	GCCCG	2	10	84755	84764	0 %	0 %	40 %	60 %	124383320
100	NC_008836	GCGCC	2	10	85693	85702	0 %	0 %	40 %	60 %	124384894
101	NC_008836	GGCGA	2	10	90092	90101	20 %	0 %	60 %	20 %	124385617
102	NC_008836	TGACG	2	10	90643	90652	20 %	20 %	40 %	20 %	124385617
103	NC_008836	GCGAT	2	10	90675	90684	20 %	20 %	40 %	20 %	124385617
104	NC_008836	CGACG	2	10	90805	90814	20 %	0 %	40 %	40 %	124385617
105	NC_008836	AGAGA	2	10	91060	91069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008836	TCGCG	2	10	91694	91703	0 %	20 %	40 %	40 %	124385106
107	NC_008836	GCGCG	2	10	91884	91893	0 %	0 %	60 %	40 %	124385106
108	NC_008836	CTCGT	2	10	91909	91918	0 %	40 %	20 %	40 %	124385106
109	NC_008836	CGCGG	2	10	92303	92312	0 %	0 %	60 %	40 %	124384061
110	NC_008836	ATCGC	2	10	95989	95998	20 %	20 %	20 %	40 %	124385381
111	NC_008836	GGCCG	2	10	96970	96979	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008836	CGCGC	2	10	97862	97871	0 %	0 %	40 %	60 %	124385968
113	NC_008836	GATCG	2	10	98852	98861	20 %	20 %	40 %	20 %	124384909
114	NC_008836	CGCGA	2	10	99681	99690	20 %	0 %	40 %	40 %	124385936
115	NC_008836	CGCGG	2	10	99810	99819	0 %	0 %	60 %	40 %	124385936
116	NC_008836	GGCGC	2	10	100727	100736	0 %	0 %	60 %	40 %	124385936
117	NC_008836	GCGCC	2	10	100978	100987	0 %	0 %	40 %	60 %	124385936
118	NC_008836	CGTGC	2	10	101591	101600	0 %	20 %	40 %	40 %	124385936
119	NC_008836	CACGG	2	10	103228	103237	20 %	0 %	40 %	40 %	124384967
120	NC_008836	TGGAT	2	10	103316	103325	20 %	40 %	40 %	0 %	124384967
121	NC_008836	GGCCG	2	10	103734	103743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008836	GTTCG	2	10	103750	103759	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008836	GGCGA	2	10	103832	103841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008836	GCCGG	2	10	104536	104545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_008836	CCGGC	2	10	104667	104676	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_008836	CGACG	2	10	105916	105925	20 %	0 %	40 %	40 %	124386485
127	NC_008836	CGCAT	2	10	106775	106784	20 %	20 %	20 %	40 %	124384337
128	NC_008836	GCACC	2	10	107580	107589	20 %	0 %	20 %	60 %	124384337
129	NC_008836	CGTTG	2	10	109025	109034	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008836	CGGCG	2	10	109800	109809	0 %	0 %	60 %	40 %	124386018
131	NC_008836	GCGAT	2	10	109886	109895	20 %	20 %	40 %	20 %	124386018
132	NC_008836	TGCCG	2	10	112815	112824	0 %	20 %	40 %	40 %	124384807
133	NC_008836	GCGCG	2	10	114899	114908	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008836	GCGCC	2	10	115671	115680	0 %	0 %	40 %	60 %	124386170
135	NC_008836	CGCGC	3	15	117165	117179	0 %	0 %	40 %	60 %	124383829
136	NC_008836	GCGCG	2	10	117291	117300	0 %	0 %	60 %	40 %	124384304
137	NC_008836	GCGCC	2	10	117904	117913	0 %	0 %	40 %	60 %	124385109
138	NC_008836	GCCGC	2	10	118626	118635	0 %	0 %	40 %	60 %	124385109
139	NC_008836	ACGGC	2	10	119104	119113	20 %	0 %	40 %	40 %	124383520
140	NC_008836	GCTCG	2	10	120425	120434	0 %	20 %	40 %	40 %	124384374
141	NC_008836	AGCCG	2	10	120559	120568	20 %	0 %	40 %	40 %	124384374
142	NC_008836	GCGCC	2	10	121320	121329	0 %	0 %	40 %	60 %	124384374
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145	NC_008836	GCGCT	2	10	130145	130154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008836	GCGTC	2	10	132328	132337	0 %	20 %	40 %	40 %	124384533
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152	NC_008836	CCGCG	2	10	136633	136642	0 %	0 %	40 %	60 %	124383582
153	NC_008836	CGTTG	2	10	137005	137014	0 %	40 %	40 %	20 %	124383582
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177	NC_008836	GCGCC	2	10	159441	159450	0 %	0 %	40 %	60 %	124386477
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197	NC_008836	CGTGC	2	10	174977	174986	0 %	20 %	40 %	40 %	124384081
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234	NC_008836	CGAGC	2	10	205828	205837	20 %	0 %	40 %	40 %	124386013
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236	NC_008836	TCGCC	2	10	207621	207630	0 %	20 %	20 %	60 %	124384579
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239	NC_008836	CGCTG	2	10	209682	209691	0 %	20 %	40 %	40 %	124384513
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241	NC_008836	GATGC	2	10	212960	212969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
242	NC_008836	CGATC	2	10	213701	213710	20 %	20 %	20 %	40 %	124385818
243	NC_008836	CGAAC	2	10	213870	213879	40 %	0 %	20 %	40 %	124385818
244	NC_008836	TCGAT	2	10	214460	214469	20 %	40 %	20 %	20 %	124385818
245	NC_008836	GCCGC	2	10	215379	215388	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
246	NC_008836	CGCCC	2	10	215644	215653	0 %	0 %	20 %	80 %	124385843
247	NC_008836	GATCG	2	10	215780	215789	20 %	20 %	40 %	20 %	124385843
248	NC_008836	CGCGA	2	10	217200	217209	20 %	0 %	40 %	40 %	124385843
249	NC_008836	CGGCA	2	10	218750	218759	20 %	0 %	40 %	40 %	124384119
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251	NC_008836	TTGAC	2	10	219396	219405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_008836	CGGCG	2	10	220454	220463	0 %	0 %	60 %	40 %	124386275
253	NC_008836	GCCGC	2	10	220575	220584	0 %	0 %	40 %	60 %	124386275
254	NC_008836	CCGCA	2	10	220814	220823	20 %	0 %	20 %	60 %	124386275
255	NC_008836	CACGC	2	10	221408	221417	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
256	NC_008836	CCGCG	2	10	221477	221486	0 %	0 %	40 %	60 %	124385543
257	NC_008836	CCGGG	2	10	222146	222155	0 %	0 %	60 %	40 %	124383994
258	NC_008836	CGGCG	2	10	222190	222199	0 %	0 %	60 %	40 %	124383994
259	NC_008836	ATCGC	2	10	223260	223269	20 %	20 %	20 %	40 %	124383490
260	NC_008836	GCCGC	2	10	226487	226496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
261	NC_008836	ATTTC	2	10	226573	226582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_008836	ATCGA	2	10	226778	226787	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_008836	CCATT	2	10	226963	226972	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_008836	TCGCC	2	10	227961	227970	0 %	20 %	20 %	60 %	124383990
265	NC_008836	TCCCG	2	10	229606	229615	0 %	20 %	20 %	60 %	124383974
266	NC_008836	CGTGG	2	10	229853	229862	0 %	20 %	60 %	20 %	124383974
267	NC_008836	CGCGC	2	10	231800	231809	0 %	0 %	40 %	60 %	124385071
268	NC_008836	CTGAA	2	10	234090	234099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_008836	ATCGG	2	10	237226	237235	20 %	20 %	40 %	20 %	124385738
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477	NC_008836	GCCGC	2	10	394477	394486	0 %	0 %	40 %	60 %	124383677
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499	NC_008836	GGCGC	2	10	409213	409222	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
500	NC_008836	CGGCG	2	10	409898	409907	0 %	0 %	60 %	40 %	124384200

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