MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia mallei SAVP1 chromosome I

Total Repeats: 114107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_008785	CGGCG	2	10	3494018	3494027	0 %	0 %	60 %	40 %	121598874
114002	NC_008785	GCCG	2	8	3494048	3494055	0 %	0 %	50 %	50 %	121598874
114003	NC_008785	ATC	2	6	3494070	3494075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121598874
114004	NC_008785	CGC	2	6	3494090	3494095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121598874
114005	NC_008785	CG	3	6	3494129	3494134	0 %	0 %	50 %	50 %	121600948
114006	NC_008785	CG	3	6	3494136	3494141	0 %	0 %	50 %	50 %	121600948
114007	NC_008785	CGGG	2	8	3494147	3494154	0 %	0 %	75 %	25 %	121600948
114008	NC_008785	CG	3	6	3494158	3494163	0 %	0 %	50 %	50 %	121600948
114009	NC_008785	GAAAG	2	10	3494174	3494183	60 %	0 %	40 %	0 %	121600948
114010	NC_008785	GAC	2	6	3494228	3494233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121600948
114011	NC_008785	GCC	2	6	3494249	3494254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121600948
114012	NC_008785	GCTT	2	8	3494280	3494287	0 %	50 %	25 %	25 %	121600948
114013	NC_008785	GCG	2	6	3494288	3494293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121600948
114014	NC_008785	CG	3	6	3494301	3494306	0 %	0 %	50 %	50 %	121600948
114015	NC_008785	CGG	3	9	3494355	3494363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121600948
114016	NC_008785	GCG	2	6	3494364	3494369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121600948
114017	NC_008785	GCC	2	6	3494412	3494417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121600948
114018	NC_008785	CGAT	3	12	3494468	3494479	25 %	25 %	25 %	25 %	121600948
114019	NC_008785	GGCGAC	2	12	3494611	3494622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121600948
114020	NC_008785	GCCC	2	8	3494664	3494671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114021	NC_008785	CG	3	6	3494710	3494715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114022	NC_008785	CG	3	6	3494719	3494724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114023	NC_008785	CG	3	6	3494805	3494810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114024	NC_008785	GGC	2	6	3494814	3494819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114025	NC_008785	GC	3	6	3494862	3494867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114026	NC_008785	TCTT	2	8	3494878	3494885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114027	NC_008785	CTG	2	6	3494974	3494979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114028	NC_008785	CG	3	6	3494994	3494999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114029	NC_008785	CTT	2	6	3495004	3495009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114030	NC_008785	GCG	3	9	3495018	3495026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114031	NC_008785	CGA	2	6	3495078	3495083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114032	NC_008785	GCG	2	6	3495092	3495097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114033	NC_008785	CG	3	6	3495104	3495109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114034	NC_008785	GC	3	6	3495151	3495156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114035	NC_008785	GC	4	8	3495198	3495205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114036	NC_008785	GC	4	8	3495212	3495219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114037	NC_008785	GC	3	6	3495241	3495246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114038	NC_008785	CG	3	6	3495285	3495290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114039	NC_008785	CGG	3	9	3495363	3495371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114040	NC_008785	CGCGG	2	10	3495394	3495403	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114041	NC_008785	CGC	2	6	3495418	3495423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114042	NC_008785	CG	3	6	3495460	3495465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114043	NC_008785	CAGC	2	8	3495490	3495497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114044	NC_008785	AGC	2	6	3495551	3495556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114045	NC_008785	CGA	2	6	3495579	3495584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114046	NC_008785	CGC	3	9	3495601	3495609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114047	NC_008785	TGA	2	6	3495660	3495665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114048	NC_008785	CGG	2	6	3495669	3495674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114049	NC_008785	GC	3	6	3495684	3495689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114050	NC_008785	GAC	3	9	3495694	3495702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114051	NC_008785	CGT	2	6	3495706	3495711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114052	NC_008785	TCG	2	6	3495737	3495742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114053	NC_008785	CCG	2	6	3495744	3495749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114054	NC_008785	CGG	2	6	3495816	3495821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114055	NC_008785	CGC	2	6	3495855	3495860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114056	NC_008785	AGC	2	6	3495929	3495934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114057	NC_008785	GC	3	6	3495933	3495938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114058	NC_008785	ACG	2	6	3495947	3495952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114059	NC_008785	GCC	2	6	3495958	3495963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114060	NC_008785	CG	3	6	3495988	3495993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114061	NC_008785	ATCG	2	8	3495994	3496001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114062	NC_008785	GCA	2	6	3496005	3496010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114063	NC_008785	CGG	2	6	3496024	3496029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114064	NC_008785	GC	3	6	3496032	3496037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114065	NC_008785	GCCG	2	8	3496071	3496078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114066	NC_008785	CACG	2	8	3496114	3496121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114067	NC_008785	TTG	2	6	3496130	3496135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114068	NC_008785	CG	3	6	3496179	3496184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114069	NC_008785	CGAC	2	8	3496188	3496195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114070	NC_008785	CGC	2	6	3496221	3496226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114071	NC_008785	ACG	2	6	3496253	3496258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114072	NC_008785	CCGGAT	2	12	3496266	3496277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114073	NC_008785	GCG	4	12	3496291	3496302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114074	NC_008785	TCG	2	6	3496338	3496343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114075	NC_008785	TGG	2	6	3496394	3496399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114076	NC_008785	CGT	2	6	3496434	3496439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114077	NC_008785	TCG	2	6	3496451	3496456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114078	NC_008785	ACGATC	2	12	3496460	3496471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114079	NC_008785	CCG	2	6	3496485	3496490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114080	NC_008785	GAG	2	6	3496621	3496626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114081	NC_008785	AAGT	2	8	3496637	3496644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114082	NC_008785	TCG	2	6	3496676	3496681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114083	NC_008785	CGC	2	6	3496716	3496721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114084	NC_008785	TCCA	2	8	3496751	3496758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114085	NC_008785	CG	4	8	3496792	3496799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114086	NC_008785	GTC	2	6	3496814	3496819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114087	NC_008785	CTTCG	2	10	3496897	3496906	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114088	NC_008785	GC	3	6	3496918	3496923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114089	NC_008785	CG	4	8	3496931	3496938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114090	NC_008785	GAT	2	6	3496990	3496995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114091	NC_008785	GCA	2	6	3497022	3497027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114092	NC_008785	CGC	2	6	3497055	3497060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114093	NC_008785	TCG	2	6	3497075	3497080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114094	NC_008785	CG	3	6	3497094	3497099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114095	NC_008785	ACC	2	6	3497171	3497176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114096	NC_008785	TCG	2	6	3497183	3497188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114097	NC_008785	CG	4	8	3497193	3497200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114098	NC_008785	GC	3	6	3497208	3497213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114099	NC_008785	CG	3	6	3497267	3497272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114100	NC_008785	GTC	3	9	3497278	3497286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114101	NC_008785	CGA	2	6	3497298	3497303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114102	NC_008785	GCC	2	6	3497332	3497337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114103	NC_008785	GC	3	6	3497353	3497358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114104	NC_008785	GCG	2	6	3497361	3497366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114105	NC_008785	CG	3	6	3497395	3497400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114106	NC_008785	GAG	2	6	3497434	3497439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114107	NC_008785	GC	3	6	3497440	3497445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.