MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 2402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TAGCCG	2	12	808	819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475779
2	NC_008600	AAAGGC	2	12	1268	1279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475779
3	NC_008600	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008600	TGGCGA	2	12	3555	3566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475782
5	NC_008600	TCTTTG	2	12	3656	3667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118475782
6	NC_008600	TGAAGA	2	12	8083	8094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475784
7	NC_008600	ATTCTT	2	12	8431	8442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118475784
8	NC_008600	TTTCGT	2	12	10906	10917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008600	AACTGG	2	12	17752	17763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475787
10	NC_008600	AAAGAT	2	12	18031	18042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475787
11	NC_008600	GACAGG	2	12	20959	20970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118475790
12	NC_008600	TTTCGT	2	12	30706	30717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008600	AAATGA	2	12	37837	37848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475804
14	NC_008600	TGTAGA	2	12	37942	37953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475804
15	NC_008600	GAAAAT	2	12	38608	38619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475805
16	NC_008600	TTGAAA	2	12	40105	40116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475808
17	NC_008600	TTTAAA	2	12	41445	41456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008600	GCACGT	2	12	52464	52475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475820
19	NC_008600	ATTAAC	2	12	56856	56867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475824
20	NC_008600	TTTTAA	2	12	60475	60486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475826
21	NC_008600	TATTGA	2	12	66455	66466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475833
22	NC_008600	CAGGTA	2	12	70224	70235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475836
23	NC_008600	AGCGTT	2	12	72555	72566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475838
24	NC_008600	GTTGGT	2	12	73006	73017	0 %	50 %	50 %	0 %	118475838
25	NC_008600	CTGGTG	2	12	74062	74073	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118475839
26	NC_008600	CTTTTT	2	12	74476	74487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008600	AAAAAG	2	12	75083	75094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475840
28	NC_008600	GTATCT	2	12	79264	79275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118475846
29	NC_008600	CAGTTA	2	12	79813	79824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475847
30	NC_008600	TTATAT	2	12	82139	82150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008600	TATATT	2	12	82234	82245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008600	AGTCAA	2	12	93111	93122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008600	AGAAGC	2	12	100015	100026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475854
34	NC_008600	TTTAAT	2	12	100847	100858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475855
35	NC_008600	GCAGTA	2	12	103641	103652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475858
36	NC_008600	GAACAA	2	12	104115	104126	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475858
37	NC_008600	CTAGCG	2	12	107502	107513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475862
38	NC_008600	GTAGAA	2	12	110119	110130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475865
39	NC_008600	TTCTGG	2	12	110262	110273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118475865
40	NC_008600	TCTGGT	2	12	110949	110960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118475866
41	NC_008600	GAAGCT	2	12	111549	111560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475867
42	NC_008600	ATGCGA	2	12	120985	120996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475872
43	NC_008600	GGAGAG	2	12	122756	122767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	GCAAGA	2	12	123066	123077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475876
45	NC_008600	AGTAGA	2	12	123171	123182	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475876
46	NC_008600	GCAGTA	2	12	123208	123219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475876
47	NC_008600	AGCGTG	2	12	123944	123955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475876
48	NC_008600	ATTCGA	2	12	124464	124475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475876
49	NC_008600	AAGTTG	2	12	124718	124729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
50	NC_008600	GCTAAA	2	12	125104	125115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475877
51	NC_008600	GAAACT	2	12	125311	125322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475877
52	NC_008600	CAAGCT	2	12	125905	125916	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475877
53	NC_008600	AACTGA	2	12	127149	127160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475879
54	NC_008600	TAAAGG	2	12	127371	127382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475879
55	NC_008600	GAAATC	2	12	128575	128586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475881
56	NC_008600	ACAAGC	2	12	130924	130935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118475886
57	NC_008600	TTGAAG	2	12	134103	134114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475894
58	NC_008600	AAAGGT	2	12	134213	134224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475894
59	NC_008600	TAGTTG	2	12	134800	134811	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118475896
60	NC_008600	CTGAAA	2	12	137343	137354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475900
61	NC_008600	TAAACA	2	12	139030	139041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008600	TTAGGT	2	12	140951	140962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118475905
63	NC_008600	ATTTTT	2	12	143303	143314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118475909
64	NC_008600	ATATCC	2	12	144370	144381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475910
65	NC_008600	TGCAAT	2	12	147407	147418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475914
66	NC_008600	TACAAG	2	12	148929	148940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475915
67	NC_008600	TTAGAT	2	12	158997	159008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475920
68	NC_008600	CCTGAA	2	12	161632	161643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475922
69	NC_008600	AGGAAC	2	12	161663	161674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475922
70	NC_008600	AAGAAA	3	18	161687	161704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475922
71	NC_008600	GGTGAC	2	12	162482	162493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475923
72	NC_008600	CGCATC	2	12	163843	163854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118475924
73	NC_008600	AAAAGA	2	12	165504	165515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475925
74	NC_008600	AAATAC	2	12	169248	169259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008600	GTATGT	2	12	184231	184242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008600	CAAAGA	2	12	185625	185636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475944
77	NC_008600	CAAAAT	2	12	187040	187051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118475945
78	NC_008600	GTATGT	2	12	190071	190082	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008600	CGGTAT	2	12	190933	190944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475948
80	NC_008600	AGAGCA	2	12	191969	191980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475949
81	NC_008600	ATTTTG	2	12	192998	193009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118475950
82	NC_008600	CAACGT	2	12	196145	196156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475953
83	NC_008600	CAAATT	2	12	196238	196249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475953
84	NC_008600	AAATTG	2	12	198716	198727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008600	GTGGTT	2	12	202110	202121	0 %	50 %	50 %	0 %	118475959
86	NC_008600	GTGGTT	2	12	204138	204149	0 %	50 %	50 %	0 %	118475960
87	NC_008600	ATCTGG	2	12	205818	205829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475961
88	NC_008600	TGATTA	2	12	207596	207607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475963
89	NC_008600	TTCTTT	2	12	210761	210772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118475967
90	NC_008600	TATGAA	2	12	218898	218909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475974
91	NC_008600	AAAATA	2	12	219120	219131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008600	AAGGGG	2	12	219204	219215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008600	AGAGGT	2	12	224174	224185	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008600	GAAAGA	2	12	233217	233228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475985
95	NC_008600	GAGAAT	2	12	234278	234289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475986
96	NC_008600	CAACGT	2	12	234432	234443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475986
97	NC_008600	TTTCAT	2	12	238461	238472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008600	TGTAGC	2	12	241976	241987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475991
99	NC_008600	ATTTTT	2	12	242262	242273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008600	TGAAAA	2	12	247988	247999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475995
101	NC_008600	GTAATC	2	12	248194	248205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475995
102	NC_008600	CATCTC	2	12	248551	248562	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118475996
103	NC_008600	ATAAAG	2	12	248980	248991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475996
104	NC_008600	CATAAT	2	12	249952	249963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475997
105	NC_008600	AAAACA	2	12	251013	251024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118475999
106	NC_008600	ATAAAA	2	12	253032	253043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008600	AGCTGA	2	12	264434	264445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118476006
108	NC_008600	TAATTG	2	12	267897	267908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118476009
109	NC_008600	GGATAT	2	12	268663	268674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118476010
110	NC_008600	GCAACT	2	12	269415	269426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118476011
111	NC_008600	GGCATG	2	12	272400	272411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118476013
112	NC_008600	AGCAGA	2	12	273878	273889	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118476015
113	NC_008600	GTTTTT	2	12	279613	279624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118476020
114	NC_008600	CCATTT	2	12	286532	286543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118476027
115	NC_008600	TTATAT	2	12	300884	300895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008600	GTTTTA	2	12	309083	309094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118476033
117	NC_008600	TTTTGA	2	12	309818	309829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118476034
118	NC_008600	TAGAAA	2	12	310220	310231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118476035
119	NC_008600	TAGTTC	2	12	311332	311343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118476036
120	NC_008600	AAGATG	2	12	319363	319374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008600	AGTAAT	2	12	324359	324370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008600	TGTACG	2	12	330964	330975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118476045
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