MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 127151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008600	AATT	2	8	136279	136286	50 %	50 %	0 %	0 %	118475899
3002	NC_008600	TTAT	2	8	136307	136314	25 %	75 %	0 %	0 %	118475899
3003	NC_008600	ACTG	2	8	136328	136335	25 %	25 %	25 %	25 %	118475899
3004	NC_008600	TGG	2	6	136415	136420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475899
3005	NC_008600	GTT	2	6	136542	136547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475899
3006	NC_008600	TTCA	2	8	136560	136567	25 %	50 %	0 %	25 %	118475899
3007	NC_008600	AGG	2	6	136613	136618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475899
3008	NC_008600	TGG	2	6	136622	136627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475899
3009	NC_008600	AC	3	6	136645	136650	50 %	0 %	0 %	50 %	118475899
3010	NC_008600	TTC	2	6	136737	136742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475899
3011	NC_008600	ATG	2	6	136750	136755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475899
3012	NC_008600	ATT	2	6	136767	136772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475899
3013	NC_008600	AT	3	6	136809	136814	50 %	50 %	0 %	0 %	118475899
3014	NC_008600	AAAC	2	8	136889	136896	75 %	0 %	0 %	25 %	118475899
3015	NC_008600	AGC	2	6	136994	136999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475899
3016	NC_008600	TCC	2	6	137042	137047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118475899
3017	NC_008600	AGC	2	6	137110	137115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475899
3018	NC_008600	TTG	2	6	137280	137285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475900
3019	NC_008600	CTGAAA	2	12	137343	137354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475900
3020	NC_008600	TCGT	2	8	137421	137428	0 %	50 %	25 %	25 %	118475900
3021	NC_008600	AAG	2	6	137442	137447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475900
3022	NC_008600	CTT	2	6	137461	137466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118475900
3023	NC_008600	A	7	7	137534	137540	100 %	0 %	0 %	0 %	118475900
3024	NC_008600	GTT	2	6	137575	137580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475900
3025	NC_008600	GTGCG	2	10	137617	137626	0 %	20 %	60 %	20 %	118475900
3026	NC_008600	TGG	2	6	137680	137685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475900
3027	NC_008600	TGA	2	6	137704	137709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475900
3028	NC_008600	GAA	2	6	137714	137719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475900
3029	NC_008600	GAG	2	6	137780	137785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475900
3030	NC_008600	CTC	2	6	137888	137893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118475901
3031	NC_008600	TCA	2	6	137940	137945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475901
3032	NC_008600	ACA	2	6	137955	137960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475901
3033	NC_008600	ATC	2	6	138139	138144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475901
3034	NC_008600	GA	3	6	138292	138297	50 %	0 %	50 %	0 %	118475901
3035	NC_008600	CCA	2	6	138424	138429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118475901
3036	NC_008600	TGA	2	6	138516	138521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475901
3037	NC_008600	TGA	2	6	138666	138671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008600	GAT	2	6	138696	138701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475902
3039	NC_008600	ATA	2	6	138902	138907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475902
3040	NC_008600	AGG	2	6	138927	138932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008600	TAAACA	2	12	139030	139041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3042	NC_008600	AGG	2	6	139060	139065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008600	GTT	2	6	139118	139123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475903
3044	NC_008600	CTG	2	6	139161	139166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475903
3045	NC_008600	A	6	6	139167	139172	100 %	0 %	0 %	0 %	118475903
3046	NC_008600	GAA	2	6	139196	139201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475903
3047	NC_008600	ATC	2	6	139250	139255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475903
3048	NC_008600	TCG	2	6	139282	139287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475903
3049	NC_008600	CGT	2	6	139349	139354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475903
3050	NC_008600	CGT	2	6	139412	139417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475903
3051	NC_008600	ATA	2	6	139438	139443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475903
3052	NC_008600	AGG	2	6	139449	139454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008600	AAAC	2	8	139476	139483	75 %	0 %	0 %	25 %	118475904
3054	NC_008600	A	6	6	139490	139495	100 %	0 %	0 %	0 %	118475904
3055	NC_008600	CAA	2	6	139546	139551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118475904
3056	NC_008600	GCT	2	6	139661	139666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475904
3057	NC_008600	CTG	2	6	139671	139676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475904
3058	NC_008600	GTC	2	6	139827	139832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475904
3059	NC_008600	CGT	3	9	139841	139849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475904
3060	NC_008600	GT	3	6	139848	139853	0 %	50 %	50 %	0 %	118475904
3061	NC_008600	ATG	2	6	139895	139900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008600	TTG	2	6	139933	139938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008600	AGG	2	6	140021	140026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008600	TAC	2	6	140134	140139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475905
3065	NC_008600	CGT	2	6	140156	140161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475905
3066	NC_008600	GTA	2	6	140246	140251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475905
3067	NC_008600	ATC	2	6	140267	140272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475905
3068	NC_008600	GAA	2	6	140309	140314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475905
3069	NC_008600	GCT	2	6	140360	140365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475905
3070	NC_008600	AAG	2	6	140655	140660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475905
3071	NC_008600	TTG	2	6	140706	140711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475905
3072	NC_008600	TGA	2	6	140719	140724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475905
3073	NC_008600	GAAG	2	8	140752	140759	50 %	0 %	50 %	0 %	118475905
3074	NC_008600	GAA	2	6	140795	140800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475905
3075	NC_008600	GTTC	2	8	140813	140820	0 %	50 %	25 %	25 %	118475905
3076	NC_008600	AGA	3	9	140878	140886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475905
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3079	NC_008600	TTAGGT	2	12	140951	140962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118475905
3080	NC_008600	GAC	2	6	140972	140977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475905
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3082	NC_008600	AGG	2	6	141001	141006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008600	A	6	6	141149	141154	100 %	0 %	0 %	0 %	118475906
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3088	NC_008600	A	6	6	141485	141490	100 %	0 %	0 %	0 %	118475907
3089	NC_008600	AT	3	6	141510	141515	50 %	50 %	0 %	0 %	118475907
3090	NC_008600	ATT	2	6	141634	141639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475907
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3092	NC_008600	TTG	2	6	141765	141770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475907
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3094	NC_008600	TGG	2	6	141910	141915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475907
3095	NC_008600	AGC	2	6	141921	141926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118475907
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3101	NC_008600	GAAAT	2	10	142242	142251	60 %	20 %	20 %	0 %	118475907
3102	NC_008600	GAAC	2	8	142291	142298	50 %	0 %	25 %	25 %	118475907
3103	NC_008600	ATG	2	6	142370	142375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475908
3104	NC_008600	TAT	2	6	142402	142407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475908
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3106	NC_008600	GAAA	3	12	142520	142531	75 %	0 %	25 %	0 %	118475908
3107	NC_008600	A	7	7	142529	142535	100 %	0 %	0 %	0 %	118475908
3108	NC_008600	CTA	2	6	142631	142636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475908
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3110	NC_008600	GTG	2	6	142739	142744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118475908
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3112	NC_008600	ATA	2	6	142910	142915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475908
3113	NC_008600	GGA	2	6	142917	142922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118475908
3114	NC_008600	TGC	2	6	142923	142928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475908
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3118	NC_008600	ATT	2	6	143181	143186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475908
3119	NC_008600	TCA	2	6	143216	143221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475909
3120	NC_008600	GCT	2	6	143240	143245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118475909
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3122	NC_008600	AAT	2	6	143283	143288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475909
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3375	NC_008600	GA	3	6	154611	154616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_008600	CT	3	6	154728	154733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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