MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TC	3	6	107	112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008598	CA	3	6	459	464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008598	TA	3	6	1199	1204	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
4	NC_008598	TA	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
5	NC_008598	TA	3	6	2054	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008598	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
7	NC_008598	TA	3	6	2766	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
8	NC_008598	CT	3	6	3011	3016	0 %	50 %	0 %	50 %	118445182
9	NC_008598	TA	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	118445182
10	NC_008598	CT	3	6	3685	3690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008598	TA	3	6	3767	3772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008598	TC	3	6	4231	4236	0 %	50 %	0 %	50 %	118445183
13	NC_008598	TA	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008598	AT	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
15	NC_008598	AT	3	6	4528	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
16	NC_008598	AT	3	6	4742	4747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008598	AG	3	6	4842	4847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008598	AG	3	6	5150	5155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008598	CT	3	6	5163	5168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008598	AG	3	6	5437	5442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008598	CT	3	6	5972	5977	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
22	NC_008598	TC	3	6	6121	6126	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
23	NC_008598	CT	3	6	7025	7030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008598	TC	3	6	7101	7106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008598	GT	3	6	7185	7190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008598	CA	3	6	7773	7778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008598	TA	3	6	7933	7938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008598	AT	3	6	7974	7979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008598	TA	3	6	8100	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008598	TC	3	6	9501	9506	0 %	50 %	0 %	50 %	118445188
31	NC_008598	GT	3	6	10221	10226	0 %	50 %	50 %	0 %	118445190
32	NC_008598	TA	3	6	11382	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	118445193
33	NC_008598	CT	3	6	12078	12083	0 %	50 %	0 %	50 %	118445194
34	NC_008598	TC	3	6	12553	12558	0 %	50 %	0 %	50 %	118445196
35	NC_008598	AC	3	6	12627	12632	50 %	0 %	0 %	50 %	118445196
36	NC_008598	CA	3	6	12694	12699	50 %	0 %	0 %	50 %	118445196
37	NC_008598	CA	3	6	12992	12997	50 %	0 %	0 %	50 %	118445197
38	NC_008598	TC	3	6	14514	14519	0 %	50 %	0 %	50 %	118445199
39	NC_008598	AT	3	6	15565	15570	50 %	50 %	0 %	0 %	118445201
40	NC_008598	CT	3	6	15900	15905	0 %	50 %	0 %	50 %	118445201
41	NC_008598	TA	3	6	16323	16328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008598	CA	3	6	16350	16355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008598	TG	3	6	17202	17207	0 %	50 %	50 %	0 %	118445202
44	NC_008598	AG	3	6	17981	17986	50 %	0 %	50 %	0 %	118445204
45	NC_008598	TA	3	6	18085	18090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008598	AT	7	14	18372	18385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008598	TC	3	6	18552	18557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008598	AT	3	6	18745	18750	50 %	50 %	0 %	0 %	118445205
49	NC_008598	AT	3	6	18839	18844	50 %	50 %	0 %	0 %	118445205
50	NC_008598	CT	3	6	19003	19008	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
51	NC_008598	CT	3	6	19061	19066	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
52	NC_008598	CA	3	6	19258	19263	50 %	0 %	0 %	50 %	118445205
53	NC_008598	CA	3	6	19564	19569	50 %	0 %	0 %	50 %	118445205
54	NC_008598	TC	3	6	19602	19607	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
55	NC_008598	TA	3	6	20015	20020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008598	GA	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	118445241
57	NC_008598	AT	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	118445241
58	NC_008598	CT	3	6	20658	20663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008598	CT	3	6	21879	21884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008598	AT	3	6	21956	21961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008598	AT	3	6	22010	22015	50 %	50 %	0 %	0 %	118445207
62	NC_008598	TA	3	6	22701	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008598	AT	3	6	24152	24157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008598	TA	3	6	24363	24368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008598	TA	3	6	24404	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008598	AT	3	6	24789	24794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008598	TA	3	6	24914	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008598	TC	3	6	25167	25172	0 %	50 %	0 %	50 %	118445209
69	NC_008598	CA	3	6	25234	25239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008598	TA	3	6	25352	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008598	TA	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008598	TA	3	6	27851	27856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008598	CT	4	8	28411	28418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008598	AT	3	6	29255	29260	50 %	50 %	0 %	0 %	118445211
75	NC_008598	GT	3	6	29458	29463	0 %	50 %	50 %	0 %	118445211
76	NC_008598	TA	3	6	29905	29910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008598	AT	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	118445215
78	NC_008598	TA	3	6	31730	31735	50 %	50 %	0 %	0 %	118445215
79	NC_008598	AT	3	6	31946	31951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008598	TC	3	6	32139	32144	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
81	NC_008598	CT	3	6	32950	32955	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
82	NC_008598	CT	3	6	33051	33056	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
83	NC_008598	TA	3	6	34111	34116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008598	AT	3	6	34461	34466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008598	TA	3	6	34550	34555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008598	TA	3	6	34844	34849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008598	AT	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	118445219
88	NC_008598	AT	3	6	37761	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	118445222
89	NC_008598	CT	3	6	39171	39176	0 %	50 %	0 %	50 %	118445224
90	NC_008598	AC	3	6	40459	40464	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
91	NC_008598	AT	3	6	40712	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	118445226
92	NC_008598	CA	3	6	40762	40767	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
93	NC_008598	CA	3	6	41827	41832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008598	AC	3	6	43619	43624	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
95	NC_008598	AC	3	6	43814	43819	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
96	NC_008598	TG	3	6	43858	43863	0 %	50 %	50 %	0 %	118445227
97	NC_008598	AT	3	6	44079	44084	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
98	NC_008598	TA	3	6	44257	44262	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
99	NC_008598	TA	3	6	44681	44686	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
100	NC_008598	TC	3	6	45233	45238	0 %	50 %	0 %	50 %	118445229
101	NC_008598	TG	3	6	47507	47512	0 %	50 %	50 %	0 %	118445229
102	NC_008598	TC	3	6	47519	47524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008598	TG	3	6	48120	48125	0 %	50 %	50 %	0 %	118445231
104	NC_008598	AT	3	6	48531	48536	50 %	50 %	0 %	0 %	118445232
105	NC_008598	AT	3	6	49302	49307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008598	TA	3	6	49808	49813	50 %	50 %	0 %	0 %	118445234
107	NC_008598	AG	3	6	50371	50376	50 %	0 %	50 %	0 %	118445235
108	NC_008598	AT	3	6	51614	51619	50 %	50 %	0 %	0 %	118445237
109	NC_008598	AG	3	6	52025	52030	50 %	0 %	50 %	0 %	118445238
110	NC_008598	AT	3	6	52496	52501	50 %	50 %	0 %	0 %	118445238
111	NC_008598	AT	3	6	52933	52938	50 %	50 %	0 %	0 %	118445239
112	NC_008598	CT	3	6	52978	52983	0 %	50 %	0 %	50 %	118445239
113	NC_008598	CG	3	6	53005	53010	0 %	0 %	50 %	50 %	118445239
114	NC_008598	CT	3	6	53224	53229	0 %	50 %	0 %	50 %	118445239
115	NC_008598	TC	3	6	54674	54679	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240
116	NC_008598	TA	3	6	54930	54935	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
117	NC_008598	CT	3	6	55234	55239	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240
118	NC_008598	AT	3	6	55459	55464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008598	TA	3	6	55576	55581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008598	AT	3	6	55933	55938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.