MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 1279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008598	CCAT	2	8	43275	43282	25 %	25 %	0 %	50 %	118445227
1002	NC_008598	CTT	2	6	43283	43288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445227
1003	NC_008598	CTT	2	6	43340	43345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445227
1004	NC_008598	CAC	2	6	43496	43501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445227
1005	NC_008598	AGCA	2	8	43580	43587	50 %	0 %	25 %	25 %	118445227
1006	NC_008598	TTC	2	6	43611	43616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445227
1007	NC_008598	AC	3	6	43619	43624	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
1008	NC_008598	TCA	2	6	43639	43644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445227
1009	NC_008598	CAG	2	6	43670	43675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445227
1010	NC_008598	TTC	2	6	43699	43704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445227
1011	NC_008598	AAC	2	6	43710	43715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445227
1012	NC_008598	ATC	2	6	43734	43739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445227
1013	NC_008598	AGG	2	6	43794	43799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445227
1014	NC_008598	AC	3	6	43814	43819	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
1015	NC_008598	TTC	3	9	43833	43841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445227
1016	NC_008598	GTT	2	6	43852	43857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445227
1017	NC_008598	TG	3	6	43858	43863	0 %	50 %	50 %	0 %	118445227
1018	NC_008598	TACA	2	8	43890	43897	50 %	25 %	0 %	25 %	118445227
1019	NC_008598	GTA	2	6	43916	43921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445228
1020	NC_008598	TTG	2	6	43942	43947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445228
1021	NC_008598	CTT	2	6	44006	44011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445228
1022	NC_008598	A	6	6	44022	44027	100 %	0 %	0 %	0 %	118445228
1023	NC_008598	CCTA	2	8	44039	44046	25 %	25 %	0 %	50 %	118445228
1024	NC_008598	AAT	2	6	44063	44068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445228
1025	NC_008598	AT	3	6	44079	44084	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
1026	NC_008598	TTG	2	6	44098	44103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445228
1027	NC_008598	CTG	2	6	44140	44145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445228
1028	NC_008598	TA	3	6	44257	44262	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
1029	NC_008598	TGA	2	6	44345	44350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445228
1030	NC_008598	CTG	2	6	44380	44385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445228
1031	NC_008598	TCG	2	6	44507	44512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445228
1032	NC_008598	ATC	2	6	44547	44552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445228
1033	NC_008598	TAA	2	6	44585	44590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445228
1034	NC_008598	TAAAA	2	10	44602	44611	80 %	20 %	0 %	0 %	118445228
1035	NC_008598	TTC	2	6	44656	44661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445228
1036	NC_008598	TA	3	6	44681	44686	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
1037	NC_008598	CATT	2	8	44764	44771	25 %	50 %	0 %	25 %	118445228
1038	NC_008598	CCT	2	6	44800	44805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445229
1039	NC_008598	AAC	2	6	44878	44883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445229
1040	NC_008598	TTG	2	6	44986	44991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445229
1041	NC_008598	TGA	2	6	45001	45006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445229
1042	NC_008598	ATAC	2	8	45021	45028	50 %	25 %	0 %	25 %	118445229
1043	NC_008598	CTA	2	6	45072	45077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1044	NC_008598	GAA	2	6	45087	45092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445229
1045	NC_008598	CAG	2	6	45141	45146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1046	NC_008598	TC	3	6	45233	45238	0 %	50 %	0 %	50 %	118445229
1047	NC_008598	TTA	2	6	45326	45331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445229
1048	NC_008598	TAA	2	6	45351	45356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1049	NC_008598	TTG	2	6	45370	45375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445229
1050	NC_008598	ACCC	2	8	45434	45441	25 %	0 %	0 %	75 %	118445229
1051	NC_008598	ATT	2	6	45457	45462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445229
1052	NC_008598	ATTTT	2	10	45464	45473	20 %	80 %	0 %	0 %	118445229
1053	NC_008598	CAA	2	6	45504	45509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445229
1054	NC_008598	GAA	2	6	45574	45579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445229
1055	NC_008598	CAT	2	6	45600	45605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1056	NC_008598	TCT	2	6	45612	45617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445229
1057	NC_008598	GAA	2	6	45794	45799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445229
1058	NC_008598	A	6	6	45798	45803	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
1059	NC_008598	TAA	2	6	45885	45890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1060	NC_008598	TAT	2	6	45940	45945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445229
1061	NC_008598	CAA	2	6	45962	45967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445229
1062	NC_008598	GCTT	2	8	46076	46083	0 %	50 %	25 %	25 %	118445229
1063	NC_008598	AAC	2	6	46102	46107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445229
1064	NC_008598	TTG	2	6	46116	46121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445229
1065	NC_008598	TAA	2	6	46144	46149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1066	NC_008598	TCA	2	6	46166	46171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1067	NC_008598	AAC	2	6	46178	46183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445229
1068	NC_008598	A	7	7	46217	46223	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
1069	NC_008598	ATGAT	2	10	46266	46275	40 %	40 %	20 %	0 %	118445229
1070	NC_008598	GCT	2	6	46457	46462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1071	NC_008598	TAA	2	6	46512	46517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1072	NC_008598	AGC	2	6	46528	46533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1073	NC_008598	TAA	2	6	46555	46560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1074	NC_008598	GCA	2	6	46581	46586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1075	NC_008598	CAT	2	6	46612	46617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1076	NC_008598	CAT	2	6	46765	46770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1077	NC_008598	TAA	2	6	46896	46901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445229
1078	NC_008598	ACT	2	6	46972	46977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1079	NC_008598	TGC	2	6	47008	47013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1080	NC_008598	TGT	2	6	47083	47088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445229
1081	NC_008598	TCA	2	6	47159	47164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445229
1082	NC_008598	AGC	2	6	47248	47253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1083	NC_008598	TTC	2	6	47284	47289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445229
1084	NC_008598	GTT	2	6	47313	47318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445229
1085	NC_008598	ACG	2	6	47437	47442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445229
1086	NC_008598	TTC	2	6	47500	47505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445229
1087	NC_008598	TG	3	6	47507	47512	0 %	50 %	50 %	0 %	118445229
1088	NC_008598	TC	3	6	47519	47524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_008598	CCT	2	6	47525	47530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_008598	T	6	6	47586	47591	0 %	100 %	0 %	0 %	118445230
1091	NC_008598	ATG	2	6	47677	47682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445230
1092	NC_008598	CAT	2	6	47695	47700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445230
1093	NC_008598	TTTG	2	8	47717	47724	0 %	75 %	25 %	0 %	118445230
1094	NC_008598	TCA	2	6	47729	47734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445230
1095	NC_008598	ATC	2	6	47756	47761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445230
1096	NC_008598	AAT	2	6	47807	47812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445230
1097	NC_008598	TTG	2	6	47833	47838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008598	TTC	2	6	47874	47879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445231
1099	NC_008598	CAT	2	6	47910	47915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445231
1100	NC_008598	GCT	2	6	47929	47934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445231
1101	NC_008598	CTT	2	6	47958	47963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445231
1102	NC_008598	T	6	6	47980	47985	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
1103	NC_008598	ACC	2	6	48016	48021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445231
1104	NC_008598	TTC	2	6	48033	48038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445231
1105	NC_008598	CTT	2	6	48113	48118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445231
1106	NC_008598	TG	3	6	48120	48125	0 %	50 %	50 %	0 %	118445231
1107	NC_008598	CAA	2	6	48149	48154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445231
1108	NC_008598	T	6	6	48213	48218	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
1109	NC_008598	AAGT	2	8	48242	48249	50 %	25 %	25 %	0 %	118445231
1110	NC_008598	GAA	2	6	48453	48458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445232
1111	NC_008598	AAG	2	6	48466	48471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445232
1112	NC_008598	GCTTCT	2	12	48489	48500	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118445232
1113	NC_008598	AT	3	6	48531	48536	50 %	50 %	0 %	0 %	118445232
1114	NC_008598	CAG	2	6	48562	48567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445232
1115	NC_008598	ATA	2	6	48569	48574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445232
1116	NC_008598	GAAC	2	8	48602	48609	50 %	0 %	25 %	25 %	118445232
1117	NC_008598	TTTCT	2	10	48613	48622	0 %	80 %	0 %	20 %	118445232
1118	NC_008598	ATCT	2	8	48643	48650	25 %	50 %	0 %	25 %	118445232
1119	NC_008598	TCA	2	6	48669	48674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445232
1120	NC_008598	CTAA	2	8	48714	48721	50 %	25 %	0 %	25 %	118445232
1121	NC_008598	AGC	2	6	48752	48757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445232
1122	NC_008598	ATA	2	6	48759	48764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445232
1123	NC_008598	TCA	2	6	48768	48773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445232
1124	NC_008598	TTG	2	6	48847	48852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445233
1125	NC_008598	GTT	2	6	48902	48907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445233
1126	NC_008598	AAAT	2	8	48917	48924	75 %	25 %	0 %	0 %	118445233
1127	NC_008598	TTA	2	6	48989	48994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445233
1128	NC_008598	CTT	2	6	49008	49013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445233
1129	NC_008598	TGT	2	6	49027	49032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445233
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1131	NC_008598	TAC	2	6	49048	49053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445233
1132	NC_008598	ATC	2	6	49093	49098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445233
1133	NC_008598	ATA	2	6	49117	49122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445233
1134	NC_008598	TTC	2	6	49141	49146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445233
1135	NC_008598	CATA	2	8	49227	49234	50 %	25 %	0 %	25 %	118445233
1136	NC_008598	AT	3	6	49302	49307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008598	GAC	2	6	49331	49336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_008598	CAT	2	6	49359	49364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_008598	CTG	2	6	49434	49439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_008598	CCAT	2	8	49440	49447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_008598	CCA	2	6	49498	49503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_008598	TCT	2	6	49557	49562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_008598	AATGA	2	10	49579	49588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_008598	GCTT	2	8	49623	49630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1145	NC_008598	TAC	2	6	49787	49792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445234
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1149	NC_008598	TGT	2	6	49893	49898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445234
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1162	NC_008598	CTT	2	6	50543	50548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445236
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1167	NC_008598	TAAG	2	8	50755	50762	50 %	25 %	25 %	0 %	118445237
1168	NC_008598	TAGCA	2	10	50872	50881	40 %	20 %	20 %	20 %	118445237
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1184	NC_008598	TCC	2	6	51625	51630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1251	NC_008598	AGTA	2	8	54746	54753	50 %	25 %	25 %	0 %	118445240
1252	NC_008598	TCTTT	2	10	54789	54798	0 %	80 %	0 %	20 %	118445240
1253	NC_008598	TTAA	2	8	54817	54824	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
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1261	NC_008598	GTC	2	6	55068	55073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445240
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1279	NC_008598	AT	3	6	55933	55938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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