MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 1279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008598	TCT	2	6	21343	21348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445206
502	NC_008598	CTG	2	6	21403	21408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445206
503	NC_008598	ATG	2	6	21444	21449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445206
504	NC_008598	AAATT	2	10	21457	21466	60 %	40 %	0 %	0 %	118445206
505	NC_008598	TGG	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008598	TAT	2	6	21549	21554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008598	TTA	2	6	21571	21576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008598	GGT	2	6	21580	21585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008598	AAG	2	6	21687	21692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008598	ATG	2	6	21715	21720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008598	GCT	2	6	21727	21732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008598	TGG	2	6	21735	21740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008598	ATTT	2	8	21741	21748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008598	TTC	2	6	21760	21765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008598	TAT	3	9	21779	21787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008598	CT	3	6	21879	21884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_008598	T	7	7	21884	21890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008598	AAT	2	6	21916	21921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008598	TAT	2	6	21941	21946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008598	AT	3	6	21956	21961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008598	AT	3	6	22010	22015	50 %	50 %	0 %	0 %	118445207
522	NC_008598	TTCT	2	8	22043	22050	0 %	75 %	0 %	25 %	118445207
523	NC_008598	T	7	7	22053	22059	0 %	100 %	0 %	0 %	118445207
524	NC_008598	AAG	2	6	22108	22113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445207
525	NC_008598	A	7	7	22157	22163	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
526	NC_008598	A	6	6	22224	22229	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
527	NC_008598	CGG	2	6	22235	22240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118445207
528	NC_008598	TAG	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445207
529	NC_008598	TGG	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445207
530	NC_008598	AGA	2	6	22310	22315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445207
531	NC_008598	AAC	2	6	22462	22467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445207
532	NC_008598	A	7	7	22518	22524	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
533	NC_008598	A	7	7	22545	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008598	AGGGAA	2	12	22556	22567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008598	AAT	2	6	22578	22583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008598	TCTTT	2	10	22628	22637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
537	NC_008598	TA	3	6	22701	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008598	T	6	6	22712	22717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008598	ATTC	2	8	22725	22732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_008598	TAAA	2	8	22772	22779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008598	ATA	2	6	22825	22830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008598	ATT	2	6	22853	22858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008598	GGA	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008598	T	7	7	22903	22909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008598	TGC	2	6	22980	22985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008598	TAT	2	6	23064	23069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008598	TGT	2	6	23141	23146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008598	T	6	6	23165	23170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008598	A	7	7	23174	23180	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
550	NC_008598	CAA	2	6	23269	23274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445208
551	NC_008598	AAAC	2	8	23285	23292	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
552	NC_008598	ATC	2	6	23320	23325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445208
553	NC_008598	ATA	2	6	23352	23357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445208
554	NC_008598	TAA	2	6	23361	23366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445208
555	NC_008598	A	7	7	23413	23419	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
556	NC_008598	A	6	6	23441	23446	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
557	NC_008598	GAA	2	6	23465	23470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445208
558	NC_008598	TAA	2	6	23508	23513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445208
559	NC_008598	ACA	2	6	23520	23525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445208
560	NC_008598	A	6	6	23529	23534	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
561	NC_008598	ACA	2	6	23548	23553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445208
562	NC_008598	CAAA	2	8	23559	23566	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
563	NC_008598	AATC	2	8	23573	23580	50 %	25 %	0 %	25 %	118445208
564	NC_008598	CCA	2	6	23615	23620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445208
565	NC_008598	CAG	2	6	23622	23627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445208
566	NC_008598	ATG	2	6	23634	23639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445208
567	NC_008598	ATTTA	2	10	23647	23656	40 %	60 %	0 %	0 %	118445208
568	NC_008598	CGT	2	6	23761	23766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445208
569	NC_008598	ATA	2	6	23856	23861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445208
570	NC_008598	AATA	2	8	23929	23936	75 %	25 %	0 %	0 %	118445208
571	NC_008598	A	6	6	23955	23960	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
572	NC_008598	TGC	2	6	24004	24009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445208
573	NC_008598	ATG	2	6	24075	24080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445208
574	NC_008598	A	10	10	24129	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
575	NC_008598	AT	3	6	24152	24157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008598	T	6	6	24165	24170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008598	TAA	2	6	24214	24219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008598	TTA	2	6	24220	24225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008598	TTA	2	6	24247	24252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008598	ATT	2	6	24312	24317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008598	TTA	2	6	24318	24323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008598	TCTTAT	2	12	24324	24335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
583	NC_008598	ATAA	2	8	24340	24347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008598	TA	3	6	24363	24368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008598	AAAAT	2	10	24369	24378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008598	TA	3	6	24404	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008598	TTA	2	6	24430	24435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008598	T	6	6	24457	24462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008598	TAA	2	6	24502	24507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008598	TTA	2	6	24531	24536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008598	TTG	2	6	24561	24566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008598	ATT	2	6	24639	24644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008598	CAG	2	6	24675	24680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008598	AT	3	6	24789	24794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008598	GGA	2	6	24801	24806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008598	GCT	2	6	24819	24824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008598	T	6	6	24824	24829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008598	T	6	6	24859	24864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008598	ATT	2	6	24881	24886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008598	TA	3	6	24914	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008598	AGA	2	6	24926	24931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008598	GGT	2	6	24969	24974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008598	T	6	6	24991	24996	0 %	100 %	0 %	0 %	118445209
604	NC_008598	TCT	2	6	25062	25067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445209
605	NC_008598	AGC	2	6	25117	25122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445209
606	NC_008598	TAAAT	2	10	25132	25141	60 %	40 %	0 %	0 %	118445209
607	NC_008598	CCT	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445209
608	NC_008598	TC	3	6	25167	25172	0 %	50 %	0 %	50 %	118445209
609	NC_008598	TACA	2	8	25220	25227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_008598	CA	3	6	25234	25239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_008598	TTA	2	6	25243	25248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008598	AAT	2	6	25265	25270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008598	TA	3	6	25352	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008598	T	6	6	25363	25368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008598	ATTC	2	8	25376	25383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_008598	ATA	2	6	25476	25481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008598	ATT	2	6	25504	25509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008598	GGA	2	6	25531	25536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008598	TCTTT	2	10	25552	25561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_008598	ACTA	2	8	25565	25572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_008598	A	6	6	25572	25577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008598	TTC	2	6	25622	25627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445210
623	NC_008598	GTT	2	6	25665	25670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445210
624	NC_008598	ATTT	2	8	25699	25706	25 %	75 %	0 %	0 %	118445210
625	NC_008598	T	6	6	25744	25749	0 %	100 %	0 %	0 %	118445210
626	NC_008598	ATGT	2	8	25769	25776	25 %	50 %	25 %	0 %	118445210
627	NC_008598	A	6	6	25787	25792	100 %	0 %	0 %	0 %	118445210
628	NC_008598	ATAA	2	8	25812	25819	75 %	25 %	0 %	0 %	118445210
629	NC_008598	TCT	2	6	26093	26098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445210
630	NC_008598	TTA	2	6	26127	26132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445210
631	NC_008598	TTC	2	6	26134	26139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445210
632	NC_008598	TTTG	2	8	26141	26148	0 %	75 %	25 %	0 %	118445210
633	NC_008598	CTT	2	6	26190	26195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445210
634	NC_008598	CTT	2	6	26227	26232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445210
635	NC_008598	ATA	2	6	26265	26270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445210
636	NC_008598	CCG	2	6	26273	26278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118445210
637	NC_008598	TCA	2	6	26315	26320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445210
638	NC_008598	GTT	2	6	26382	26387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445210
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