MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	A	6	6	666	671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008569	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	117621835
3	NC_008569	A	7	7	1989	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	117621836
4	NC_008569	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	117621836
5	NC_008569	T	6	6	2830	2835	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
6	NC_008569	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
7	NC_008569	T	9	9	3059	3067	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
8	NC_008569	T	6	6	3185	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
9	NC_008569	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	117621837
10	NC_008569	T	8	8	3227	3234	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
11	NC_008569	T	6	6	3308	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
12	NC_008569	A	6	6	3315	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	117621837
13	NC_008569	T	6	6	3327	3332	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
14	NC_008569	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
15	NC_008569	T	7	7	3392	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008569	T	8	8	3715	3722	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
17	NC_008569	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
18	NC_008569	T	8	8	3806	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
19	NC_008569	T	6	6	3937	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
20	NC_008569	T	6	6	4023	4028	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
21	NC_008569	T	6	6	4035	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
22	NC_008569	G	7	7	4041	4047	0 %	0 %	100 %	0 %	117621839
23	NC_008569	T	6	6	4113	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
24	NC_008569	T	7	7	4553	4559	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
25	NC_008569	T	7	7	4729	4735	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
26	NC_008569	T	7	7	4992	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
27	NC_008569	T	7	7	5145	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
28	NC_008569	T	6	6	5198	5203	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
29	NC_008569	T	6	6	5360	5365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008569	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008569	A	7	7	5456	5462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008569	T	8	8	5465	5472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008569	T	7	7	5612	5618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008569	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008569	A	8	8	5661	5668	100 %	0 %	0 %	0 %	117621840
36	NC_008569	A	6	6	6006	6011	100 %	0 %	0 %	0 %	117621840
37	NC_008569	T	6	6	6057	6062	0 %	100 %	0 %	0 %	117621841
38	NC_008569	A	7	7	6090	6096	100 %	0 %	0 %	0 %	117621841
39	NC_008569	A	6	6	6742	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	117621842
40	NC_008569	A	6	6	6809	6814	100 %	0 %	0 %	0 %	117621842
41	NC_008569	A	7	7	6921	6927	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
42	NC_008569	A	6	6	7113	7118	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
43	NC_008569	T	6	6	7277	7282	0 %	100 %	0 %	0 %	117621843
44	NC_008569	A	6	6	7458	7463	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
45	NC_008569	A	6	6	7787	7792	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
46	NC_008569	T	6	6	8259	8264	0 %	100 %	0 %	0 %	117621843
47	NC_008569	T	7	7	8407	8413	0 %	100 %	0 %	0 %	117621843
48	NC_008569	A	8	8	8425	8432	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
49	NC_008569	A	7	7	9071	9077	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
50	NC_008569	A	8	8	9079	9086	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
51	NC_008569	A	7	7	9574	9580	100 %	0 %	0 %	0 %	117621844
52	NC_008569	A	6	6	9636	9641	100 %	0 %	0 %	0 %	117621844
53	NC_008569	T	7	7	9755	9761	0 %	100 %	0 %	0 %	117621844
54	NC_008569	A	6	6	10191	10196	100 %	0 %	0 %	0 %	117621844
55	NC_008569	A	6	6	10751	10756	100 %	0 %	0 %	0 %	117621846
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57	NC_008569	A	8	8	11160	11167	100 %	0 %	0 %	0 %	117621847
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59	NC_008569	A	6	6	12120	12125	100 %	0 %	0 %	0 %	117621848
60	NC_008569	A	6	6	12284	12289	100 %	0 %	0 %	0 %	117621848
61	NC_008569	A	6	6	12567	12572	100 %	0 %	0 %	0 %	117621849
62	NC_008569	A	8	8	12644	12651	100 %	0 %	0 %	0 %	117621849
63	NC_008569	A	6	6	12818	12823	100 %	0 %	0 %	0 %	117621849
64	NC_008569	A	9	9	12850	12858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008569	A	8	8	13191	13198	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
66	NC_008569	A	6	6	14338	14343	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
67	NC_008569	A	6	6	14359	14364	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
68	NC_008569	A	6	6	14522	14527	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
69	NC_008569	A	6	6	14564	14569	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
70	NC_008569	A	6	6	14852	14857	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
71	NC_008569	A	8	8	14975	14982	100 %	0 %	0 %	0 %	117621851
72	NC_008569	A	6	6	15075	15080	100 %	0 %	0 %	0 %	117621852
73	NC_008569	A	6	6	15653	15658	100 %	0 %	0 %	0 %	117621854
74	NC_008569	A	7	7	15690	15696	100 %	0 %	0 %	0 %	117621854
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77	NC_008569	A	7	7	16247	16253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008569	A	6	6	16258	16263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_008569	A	7	7	16558	16564	100 %	0 %	0 %	0 %	117621855
81	NC_008569	A	7	7	16748	16754	100 %	0 %	0 %	0 %	117621855
82	NC_008569	A	8	8	16905	16912	100 %	0 %	0 %	0 %	117621855
83	NC_008569	A	6	6	16948	16953	100 %	0 %	0 %	0 %	117621855
84	NC_008569	A	6	6	17006	17011	100 %	0 %	0 %	0 %	117621855
85	NC_008569	A	8	8	17089	17096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_008569	A	6	6	17231	17236	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
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89	NC_008569	A	6	6	17285	17290	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
90	NC_008569	T	7	7	17331	17337	0 %	100 %	0 %	0 %	117621856
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92	NC_008569	A	7	7	17408	17414	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
93	NC_008569	T	8	8	17501	17508	0 %	100 %	0 %	0 %	117621856
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95	NC_008569	A	7	7	17631	17637	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
96	NC_008569	A	9	9	17647	17655	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
97	NC_008569	A	6	6	17760	17765	100 %	0 %	0 %	0 %	117621856
98	NC_008569	A	6	6	17856	17861	100 %	0 %	0 %	0 %	117621857
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100	NC_008569	T	6	6	17951	17956	0 %	100 %	0 %	0 %	117621857
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104	NC_008569	A	6	6	18676	18681	100 %	0 %	0 %	0 %	117621858
105	NC_008569	A	6	6	18746	18751	100 %	0 %	0 %	0 %	117621858
106	NC_008569	T	6	6	19053	19058	0 %	100 %	0 %	0 %	117621858
107	NC_008569	A	6	6	19115	19120	100 %	0 %	0 %	0 %	117621858
108	NC_008569	T	6	6	19728	19733	0 %	100 %	0 %	0 %	117621859
109	NC_008569	T	7	7	19761	19767	0 %	100 %	0 %	0 %	117621859
110	NC_008569	T	7	7	19829	19835	0 %	100 %	0 %	0 %	117621859
111	NC_008569	T	8	8	19907	19914	0 %	100 %	0 %	0 %	117621860
112	NC_008569	T	6	6	20110	20115	0 %	100 %	0 %	0 %	117621860
113	NC_008569	A	7	7	20146	20152	100 %	0 %	0 %	0 %	117621860
114	NC_008569	A	8	8	20209	20216	100 %	0 %	0 %	0 %	117621860
115	NC_008569	T	6	6	20222	20227	0 %	100 %	0 %	0 %	117621860
116	NC_008569	T	9	9	20259	20267	0 %	100 %	0 %	0 %	117621860
117	NC_008569	T	6	6	20331	20336	0 %	100 %	0 %	0 %	117621860
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119	NC_008569	T	7	7	20492	20498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_008569	A	6	6	20700	20705	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
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125	NC_008569	A	6	6	20913	20918	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
126	NC_008569	A	7	7	20932	20938	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
127	NC_008569	A	7	7	21104	21110	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
128	NC_008569	A	6	6	21121	21126	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
129	NC_008569	T	6	6	21477	21482	0 %	100 %	0 %	0 %	117621861
130	NC_008569	A	8	8	21546	21553	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
131	NC_008569	A	6	6	21592	21597	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
132	NC_008569	A	6	6	21861	21866	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
133	NC_008569	A	6	6	21905	21910	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
134	NC_008569	A	6	6	22139	22144	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
135	NC_008569	A	6	6	22148	22153	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
136	NC_008569	A	7	7	22632	22638	100 %	0 %	0 %	0 %	117621861
137	NC_008569	T	6	6	23061	23066	0 %	100 %	0 %	0 %	117621862
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144	NC_008569	T	7	7	24338	24344	0 %	100 %	0 %	0 %	117621863
145	NC_008569	T	6	6	24426	24431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008569	T	7	7	24721	24727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.