MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	TA	3	6	451	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008569	TA	3	6	1209	1214	50 %	50 %	0 %	0 %	117621835
3	NC_008569	TC	3	6	1566	1571	0 %	50 %	0 %	50 %	117621836
4	NC_008569	CT	3	6	1591	1596	0 %	50 %	0 %	50 %	117621836
5	NC_008569	TA	3	6	2932	2937	50 %	50 %	0 %	0 %	117621837
6	NC_008569	AC	3	6	3001	3006	50 %	0 %	0 %	50 %	117621837
7	NC_008569	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	117621838
8	NC_008569	CT	3	6	4147	4152	0 %	50 %	0 %	50 %	117621839
9	NC_008569	CT	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	117621839
10	NC_008569	TA	4	8	4572	4579	50 %	50 %	0 %	0 %	117621839
11	NC_008569	AT	3	6	5291	5296	50 %	50 %	0 %	0 %	117621839
12	NC_008569	GA	3	6	7747	7752	50 %	0 %	50 %	0 %	117621843
13	NC_008569	AC	3	6	8320	8325	50 %	0 %	0 %	50 %	117621843
14	NC_008569	AT	3	6	10376	10381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008569	CT	3	6	10659	10664	0 %	50 %	0 %	50 %	117621845
16	NC_008569	AT	3	6	12081	12086	50 %	50 %	0 %	0 %	117621848
17	NC_008569	GA	5	10	13091	13100	50 %	0 %	50 %	0 %	117621850
18	NC_008569	TA	3	6	13925	13930	50 %	50 %	0 %	0 %	117621851
19	NC_008569	AC	3	6	15133	15138	50 %	0 %	0 %	50 %	117621852
20	NC_008569	AT	3	6	15981	15986	50 %	50 %	0 %	0 %	117621854
21	NC_008569	AT	3	6	16786	16791	50 %	50 %	0 %	0 %	117621855
22	NC_008569	TA	3	6	16881	16886	50 %	50 %	0 %	0 %	117621855
23	NC_008569	AT	3	6	16992	16997	50 %	50 %	0 %	0 %	117621855
24	NC_008569	TA	3	6	17605	17610	50 %	50 %	0 %	0 %	117621856
25	NC_008569	AT	3	6	18000	18005	50 %	50 %	0 %	0 %	117621857
26	NC_008569	AT	3	6	18257	18262	50 %	50 %	0 %	0 %	117621857
27	NC_008569	AT	3	6	18298	18303	50 %	50 %	0 %	0 %	117621857
28	NC_008569	AT	3	6	18383	18388	50 %	50 %	0 %	0 %	117621857
29	NC_008569	TA	3	6	18548	18553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008569	AT	3	6	18839	18844	50 %	50 %	0 %	0 %	117621858
31	NC_008569	TA	3	6	19488	19493	50 %	50 %	0 %	0 %	117621859
32	NC_008569	TA	3	6	19521	19526	50 %	50 %	0 %	0 %	117621859
33	NC_008569	TC	3	6	19955	19960	0 %	50 %	0 %	50 %	117621860
34	NC_008569	AT	3	6	20707	20712	50 %	50 %	0 %	0 %	117621861
35	NC_008569	AT	3	6	20814	20819	50 %	50 %	0 %	0 %	117621861
36	NC_008569	AT	3	6	21683	21688	50 %	50 %	0 %	0 %	117621861
37	NC_008569	AT	3	6	22290	22295	50 %	50 %	0 %	0 %	117621861
38	NC_008569	GA	3	6	23199	23204	50 %	0 %	50 %	0 %	117621862
39	NC_008569	TG	3	6	23241	23246	0 %	50 %	50 %	0 %	117621862
40	NC_008569	AT	3	6	24085	24090	50 %	50 %	0 %	0 %	117621863
41	NC_008569	AT	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008569	TA	3	6	24586	24591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008569	TA	3	6	24630	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.