MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TGA	2	6	94	99	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	TAA	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008568	AAT	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008568	GAT	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	ACT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008568	ATC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
7	NC_008568	TAC	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
8	NC_008568	TAA	2	6	479	484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621800
9	NC_008568	ATT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	ATT	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621801
12	NC_008568	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621801
13	NC_008568	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
14	NC_008568	ATA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
15	NC_008568	TAT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008568	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008568	TAA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	TAC	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008568	AAT	2	6	1194	1199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	ATT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008568	ATC	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008568	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008568	ATA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	TAT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
26	NC_008568	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
27	NC_008568	TAA	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621802
28	NC_008568	CAT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621802
29	NC_008568	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621802
30	NC_008568	ATA	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
31	NC_008568	TCT	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
32	NC_008568	TAA	2	6	1972	1977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
33	NC_008568	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
34	NC_008568	ATC	2	6	2081	2086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621803
35	NC_008568	TCT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
36	NC_008568	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621803
37	NC_008568	TAG	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008568	CTA	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008568	AGT	3	9	2879	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008568	TTA	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008568	TAT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008568	ACA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008568	CTT	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008568	TAT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008568	ACT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008568	CAA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008568	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008568	CTA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008568	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008568	TTA	3	9	3512	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008568	ATC	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008568	CAA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008568	AGT	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008568	TAA	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008568	TAT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008568	TAC	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008568	TTA	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008568	CTT	2	6	3985	3990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008568	TTA	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008568	TAT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008568	TAA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008568	TCT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008568	TAC	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008568	AAT	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008568	ATT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008568	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008568	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008568	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008568	ACA	2	6	4773	4778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008568	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008568	ACA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621804
72	NC_008568	AAT	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
73	NC_008568	ACG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621804
74	NC_008568	ACC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621804
75	NC_008568	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621804
76	NC_008568	GAA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
77	NC_008568	ATA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
78	NC_008568	AAG	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
79	NC_008568	ATT	3	9	5600	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008568	ATA	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008568	CTT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008568	TAA	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008568	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008568	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008568	AAT	2	6	5948	5953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008568	ATT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008568	ATT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008568	TAA	2	6	6029	6034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008568	TAT	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008568	AAT	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008568	ATT	2	6	6360	6365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008568	ATA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008568	TAA	2	6	6692	6697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
94	NC_008568	TCA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
95	NC_008568	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
96	NC_008568	TAC	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
97	NC_008568	ATA	2	6	6949	6954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
98	NC_008568	GAA	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621805
99	NC_008568	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008568	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008568	TAA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008568	ATT	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008568	CCA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621806
104	NC_008568	GTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621806
105	NC_008568	ATC	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
106	NC_008568	TTA	2	6	7295	7300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
107	NC_008568	CAT	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
108	NC_008568	TAT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
109	NC_008568	CAA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621806
110	NC_008568	AAT	2	6	7396	7401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
111	NC_008568	TAA	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
112	NC_008568	AAT	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
113	NC_008568	ATA	2	6	7874	7879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008568	TAT	3	9	7936	7944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008568	GTT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008568	ATT	2	6	8058	8063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
117	NC_008568	ATT	2	6	8196	8201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
118	NC_008568	GAA	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
119	NC_008568	ATG	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621807
120	NC_008568	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
121	NC_008568	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
122	NC_008568	TAA	2	6	8453	8458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
123	NC_008568	AAC	2	6	8484	8489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
124	NC_008568	TTA	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
125	NC_008568	TAA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
126	NC_008568	CAA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
127	NC_008568	TAC	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621807
128	NC_008568	GAA	2	6	8670	8675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
129	NC_008568	CAA	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
130	NC_008568	AGG	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621807
131	NC_008568	AGA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
132	NC_008568	ATT	2	6	9043	9048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008568	CTA	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008568	AGA	2	6	9196	9201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
135	NC_008568	AGA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
136	NC_008568	AGA	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
137	NC_008568	ATT	2	6	9519	9524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008568	AAT	2	6	9562	9567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008568	ACA	2	6	9587	9592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008568	ATA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.