MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008568	AT	3	6	15725	15730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008568	ATA	2	6	15752	15757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008568	AAATT	2	10	15771	15780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008568	TGC	2	6	15844	15849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008568	GC	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_008568	TA	3	6	15902	15907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008568	GTA	2	6	15924	15929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008568	GGT	2	6	15931	15936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008568	T	10	10	15948	15957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008568	A	7	7	16008	16014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008568	ATT	2	6	16017	16022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008568	T	7	7	16021	16027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008568	TAA	2	6	16083	16088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008568	T	7	7	16098	16104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008568	TAA	2	6	16148	16153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008568	C	6	6	16157	16162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
517	NC_008568	AT	3	6	16164	16169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008568	AT	4	8	16210	16217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008568	AGT	2	6	16219	16224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008568	ATTT	2	8	16240	16247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008568	A	6	6	16259	16264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008568	ATT	2	6	16297	16302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008568	TAAA	2	8	16303	16310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008568	CTTT	2	8	16322	16329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_008568	TTTAAA	2	12	16341	16352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008568	TTA	2	6	16361	16366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008568	AT	3	6	16368	16373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008568	T	7	7	16373	16379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008568	A	6	6	16394	16399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008568	ATCT	2	8	16406	16413	25 %	50 %	0 %	25 %	117621815
531	NC_008568	CTT	2	6	16431	16436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
532	NC_008568	GAA	2	6	16437	16442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
533	NC_008568	CTT	2	6	16459	16464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
534	NC_008568	GAA	2	6	16465	16470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
535	NC_008568	GTT	2	6	16471	16476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621815
536	NC_008568	TCCTT	2	10	16480	16489	0 %	60 %	0 %	40 %	117621815
537	NC_008568	AGA	3	9	16514	16522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
538	NC_008568	ACC	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621815
539	NC_008568	TTC	2	6	16591	16596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
540	NC_008568	T	6	6	16651	16656	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
541	NC_008568	A	6	6	16667	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	117621815
542	NC_008568	CT	3	6	16738	16743	0 %	50 %	0 %	50 %	117621815
543	NC_008568	TAA	2	6	16748	16753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621815
544	NC_008568	TTGA	2	8	16754	16761	25 %	50 %	25 %	0 %	117621815
545	NC_008568	ATTA	2	8	16766	16773	50 %	50 %	0 %	0 %	117621815
546	NC_008568	TTC	2	6	16781	16786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
547	NC_008568	T	6	6	16822	16827	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
548	NC_008568	TAT	2	6	16841	16846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621815
549	NC_008568	TTC	2	6	16855	16860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
550	NC_008568	TTA	2	6	16920	16925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621815
551	NC_008568	T	6	6	17026	17031	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
552	NC_008568	TCA	2	6	17034	17039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621815
553	NC_008568	CTT	2	6	17059	17064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
554	NC_008568	TCT	2	6	17076	17081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
555	NC_008568	ATA	2	6	17087	17092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621815
556	NC_008568	GTTT	2	8	17142	17149	0 %	75 %	25 %	0 %	117621815
557	NC_008568	T	6	6	17155	17160	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
558	NC_008568	TGT	2	6	17166	17171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621815
559	NC_008568	TCT	2	6	17190	17195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
560	NC_008568	T	7	7	17235	17241	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
561	NC_008568	T	7	7	17245	17251	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
562	NC_008568	ATA	2	6	17287	17292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621815
563	NC_008568	TAATAT	2	12	17300	17311	50 %	50 %	0 %	0 %	117621815
564	NC_008568	T	8	8	17328	17335	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
565	NC_008568	TCT	2	6	17340	17345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008568	ATTTC	2	10	17390	17399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_008568	TCT	2	6	17422	17427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008568	A	7	7	17435	17441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008568	TATCT	2	10	17448	17457	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
570	NC_008568	TTA	2	6	17458	17463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008568	ATG	2	6	17480	17485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621816
572	NC_008568	TGA	2	6	17496	17501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621816
573	NC_008568	CAA	2	6	17527	17532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621816
574	NC_008568	TAAAAT	2	12	17555	17566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621816
575	NC_008568	AAT	2	6	17593	17598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008568	ATAAA	2	10	17623	17632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008568	ATTAAT	2	12	17676	17687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008568	TAA	2	6	17700	17705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008568	AT	3	6	17716	17721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008568	TTA	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008568	AAG	2	6	17764	17769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008568	T	6	6	17793	17798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008568	A	9	9	17836	17844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008568	CTT	2	6	17861	17866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008568	TTTA	2	8	17890	17897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008568	TTC	2	6	17912	17917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008568	AGC	2	6	17925	17930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008568	AT	3	6	17950	17955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008568	ACAT	2	8	17988	17995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_008568	CAC	2	6	18029	18034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_008568	TAG	2	6	18038	18043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008568	GAG	2	6	18044	18049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008568	G	8	8	18049	18056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008568	TTC	2	6	18072	18077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621817
595	NC_008568	GAGGGG	2	12	18098	18109	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	117621817
596	NC_008568	G	7	7	18106	18112	0 %	0 %	100 %	0 %	117621817
597	NC_008568	AAT	2	6	18127	18132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621817
598	NC_008568	GTT	2	6	18193	18198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621817
599	NC_008568	TCT	2	6	18309	18314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621817
600	NC_008568	AT	3	6	18322	18327	50 %	50 %	0 %	0 %	117621817
601	NC_008568	CTT	2	6	18328	18333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621817
602	NC_008568	TAAA	2	8	18335	18342	75 %	25 %	0 %	0 %	117621817
603	NC_008568	T	6	6	18384	18389	0 %	100 %	0 %	0 %	117621817
604	NC_008568	A	7	7	18401	18407	100 %	0 %	0 %	0 %	117621817
605	NC_008568	TAA	2	6	18488	18493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621817
606	NC_008568	TAT	2	6	18514	18519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621817
607	NC_008568	T	6	6	18519	18524	0 %	100 %	0 %	0 %	117621817
608	NC_008568	ACA	2	6	18540	18545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621817
609	NC_008568	TA	3	6	18614	18619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008568	AAATTA	2	12	18620	18631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008568	TA	3	6	18640	18645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008568	TTA	2	6	18660	18665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008568	ATTT	2	8	18671	18678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008568	AATA	2	8	18687	18694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008568	ACTT	2	8	18808	18815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_008568	AT	3	6	18822	18827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008568	TA	3	6	18830	18835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008568	AT	3	6	18889	18894	50 %	50 %	0 %	0 %	117621818
619	NC_008568	A	6	6	18919	18924	100 %	0 %	0 %	0 %	117621818
620	NC_008568	ACAA	2	8	18959	18966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_008568	A	6	6	18970	18975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008568	TTA	2	6	19000	19005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008568	TAA	2	6	19130	19135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621819
624	NC_008568	ATT	2	6	19165	19170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621819
625	NC_008568	TGAT	2	8	19175	19182	25 %	50 %	25 %	0 %	117621819
626	NC_008568	TAA	2	6	19200	19205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621819
627	NC_008568	A	6	6	19211	19216	100 %	0 %	0 %	0 %	117621819
628	NC_008568	AAT	2	6	19218	19223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008568	TCT	2	6	19283	19288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008568	ATGT	2	8	19299	19306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008568	AAT	2	6	19315	19320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008568	A	6	6	19331	19336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008568	AAT	2	6	19387	19392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008568	A	7	7	19409	19415	100 %	0 %	0 %	0 %	117621820
635	NC_008568	AAAGAA	2	12	19475	19486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	117621820
636	NC_008568	A	8	8	19508	19515	100 %	0 %	0 %	0 %	117621820
637	NC_008568	T	6	6	19525	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	117621820
638	NC_008568	ATTATG	2	12	19551	19562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	117621820
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