MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	CAA	2	6	24	29	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008566	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008566	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	CTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008566	CAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008566	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008566	CAA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008566	TCA	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008566	ACT	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008566	AAC	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008566	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008566	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008566	TAA	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	ATT	3	9	696	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	TAT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	GAG	2	6	908	913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008566	AGA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
20	NC_008566	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
21	NC_008566	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
22	NC_008566	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
23	NC_008566	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621707
24	NC_008566	AGA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
25	NC_008566	ATA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
26	NC_008566	TGT	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
27	NC_008566	CTT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621707
28	NC_008566	GAC	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621707
29	NC_008566	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
30	NC_008566	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
31	NC_008566	TTA	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
32	NC_008566	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
33	NC_008566	AGA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
34	NC_008566	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
35	NC_008566	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008566	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	ATT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008566	TCT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008566	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	TTA	2	6	2069	2074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008566	TTA	2	6	2095	2100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	TGG	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008566	GTA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008566	ATA	2	6	2224	2229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008566	TTA	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008566	AAT	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	TAC	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008566	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621708
50	NC_008566	TAT	3	9	2703	2711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008566	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008566	TTC	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008566	TAT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008566	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008566	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008566	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008566	AAG	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008566	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621709
59	NC_008566	TAT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621709
60	NC_008566	TAA	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621709
61	NC_008566	CTG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621709
62	NC_008566	CAT	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
63	NC_008566	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
64	NC_008566	AAC	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
65	NC_008566	ACC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621710
66	NC_008566	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
67	NC_008566	TTA	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
68	NC_008566	TTA	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
69	NC_008566	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008566	TAT	3	9	3945	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	GAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	TTA	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008566	TTG	2	6	4319	4324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621712
74	NC_008566	TCA	4	12	4362	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
75	NC_008566	TTA	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
76	NC_008566	TTA	2	6	4665	4670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
77	NC_008566	TCA	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
78	NC_008566	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008566	CAA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008566	TAT	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	TAA	2	6	4919	4924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008566	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008566	TTA	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	TAA	2	6	5124	5129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	TAA	2	6	5220	5225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621713
86	NC_008566	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621713
87	NC_008566	GTG	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621713
88	NC_008566	ATA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	ATT	2	6	5611	5616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008566	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
91	NC_008566	AGA	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621714
92	NC_008566	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
93	NC_008566	GTA	3	9	5717	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
94	NC_008566	TTA	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
95	NC_008566	TAG	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
96	NC_008566	ATG	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
97	NC_008566	AAT	2	6	5907	5912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621714
98	NC_008566	GCT	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008566	ATT	2	6	6301	6306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008566	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	ATA	2	6	6318	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008566	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008566	TAA	3	9	6610	6618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008566	TAA	2	6	6621	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	AGC	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008566	ACA	2	6	6758	6763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008566	TAA	2	6	6764	6769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008566	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008566	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
110	NC_008566	TAA	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
111	NC_008566	TCA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
112	NC_008566	TCA	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
113	NC_008566	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
114	NC_008566	ATC	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
115	NC_008566	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
116	NC_008566	TTA	2	6	7538	7543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
117	NC_008566	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
118	NC_008566	CTT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
119	NC_008566	ACT	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
120	NC_008566	CTT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
121	NC_008566	TTA	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
122	NC_008566	AAT	2	6	7730	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
123	NC_008566	ATA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008566	ATT	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008566	TAT	3	9	7905	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008566	TTA	2	6	7937	7942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008566	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008566	TAT	3	9	8147	8155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008566	ATA	2	6	8201	8206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008566	TCT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008566	AGA	2	6	8383	8388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008566	TAT	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008566	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008566	ATA	2	6	8551	8556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008566	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008566	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621716
137	NC_008566	AGA	2	6	8698	8703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621716
138	NC_008566	ACT	2	6	8799	8804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008566	ATG	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621717
140	NC_008566	GAA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621717
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