MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	T	6	6	189	194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	T	7	7	427	433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	T	6	6	520	525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008564	A	7	7	526	532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008564	T	6	6	645	650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	T	7	7	722	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008564	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
8	NC_008564	T	6	6	1119	1124	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
9	NC_008564	A	7	7	1244	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	117621571
10	NC_008564	T	6	6	1431	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	A	7	7	1790	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
12	NC_008564	A	6	6	1811	1816	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
13	NC_008564	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
14	NC_008564	A	6	6	1918	1923	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
15	NC_008564	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
16	NC_008564	A	8	8	1962	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
17	NC_008564	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
18	NC_008564	A	6	6	2575	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008564	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	117621573
21	NC_008564	T	6	6	2910	2915	0 %	100 %	0 %	0 %	117621573
22	NC_008564	T	7	7	3131	3137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008564	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
24	NC_008564	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
25	NC_008564	A	7	7	3615	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
26	NC_008564	A	7	7	3693	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
27	NC_008564	A	7	7	3952	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	117621575
28	NC_008564	A	6	6	4345	4350	100 %	0 %	0 %	0 %	117621575
29	NC_008564	A	7	7	4501	4507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	T	6	6	4579	4584	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
31	NC_008564	T	7	7	4607	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
32	NC_008564	C	6	6	4846	4851	0 %	0 %	0 %	100 %	117621576
33	NC_008564	T	6	6	5261	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	117621576
34	NC_008564	T	6	6	5406	5411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008564	A	7	7	5467	5473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008564	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
37	NC_008564	T	6	6	5921	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
38	NC_008564	T	6	6	5973	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
39	NC_008564	T	6	6	6405	6410	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
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41	NC_008564	T	8	8	6604	6611	0 %	100 %	0 %	0 %	117621577
42	NC_008564	T	7	7	6864	6870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008564	A	7	7	6876	6882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008564	A	6	6	7002	7007	100 %	0 %	0 %	0 %	117621578
45	NC_008564	A	6	6	7140	7145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47	NC_008564	A	6	6	7441	7446	100 %	0 %	0 %	0 %	117621579
48	NC_008564	A	6	6	7656	7661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008564	T	6	6	7673	7678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008564	A	8	8	7679	7686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008564	T	9	9	7991	7999	0 %	100 %	0 %	0 %	117621580
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67	NC_008564	A	7	7	10247	10253	100 %	0 %	0 %	0 %	117621583
68	NC_008564	A	6	6	10264	10269	100 %	0 %	0 %	0 %	117621583
69	NC_008564	A	6	6	10566	10571	100 %	0 %	0 %	0 %	117621583
70	NC_008564	T	7	7	10751	10757	0 %	100 %	0 %	0 %	117621584
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72	NC_008564	A	6	6	11659	11664	100 %	0 %	0 %	0 %	117621586
73	NC_008564	A	6	6	11670	11675	100 %	0 %	0 %	0 %	117621586
74	NC_008564	T	6	6	11708	11713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008564	T	6	6	11736	11741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_008564	A	7	7	12521	12527	100 %	0 %	0 %	0 %	117621587
82	NC_008564	A	7	7	12578	12584	100 %	0 %	0 %	0 %	117621587
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112	NC_008564	A	7	7	15309	15315	100 %	0 %	0 %	0 %	117621589
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115	NC_008564	A	7	7	15529	15535	100 %	0 %	0 %	0 %	117621590
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.