MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 1687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	ATT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATC	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008564	AAC	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008564	TAT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008564	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008564	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	AAT	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	T	6	6	189	194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	TTAA	2	8	211	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008564	TAT	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008564	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	CTT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008564	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008564	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	T	7	7	427	433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008564	TAA	2	6	442	447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	CAT	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008564	ATAA	2	8	482	489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	ACA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008564	T	6	6	520	525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008564	A	7	7	526	532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008564	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008564	CT	3	6	608	613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008564	TAA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008564	T	6	6	645	650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008564	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008564	GTT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	TAT	2	6	702	707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008564	T	7	7	722	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	AAAATT	2	12	747	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008564	TAG	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008564	AAT	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621571
35	NC_008564	TTG	2	6	827	832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621571
36	NC_008564	CCT	2	6	845	850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621571
37	NC_008564	CAA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
38	NC_008564	GAA	2	6	903	908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621571
39	NC_008564	ATC	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
40	NC_008564	T	6	6	975	980	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
41	NC_008564	TTA	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621571
42	NC_008564	CTC	2	6	1052	1057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621571
43	NC_008564	T	6	6	1119	1124	0 %	100 %	0 %	0 %	117621571
44	NC_008564	AT	3	6	1152	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	117621571
45	NC_008564	CAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
46	NC_008564	TCA	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
47	NC_008564	CAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
48	NC_008564	TCA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
49	NC_008564	ACT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621571
50	NC_008564	A	7	7	1244	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	117621571
51	NC_008564	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621571
52	NC_008564	CCAA	2	8	1320	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	117621571
53	NC_008564	CTG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008564	AT	3	6	1369	1374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008564	T	6	6	1431	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008564	AGAA	2	8	1437	1444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008564	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008564	TAA	2	6	1521	1526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008564	ATT	3	9	1531	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008564	TAT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008564	ATTA	2	8	1574	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008564	TAT	2	6	1585	1590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008564	ATTA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008564	ATTA	2	8	1624	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008564	ATTA	2	8	1657	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008564	ATATA	2	10	1696	1705	60 %	40 %	0 %	0 %	117621572
67	NC_008564	TTGT	2	8	1715	1722	0 %	75 %	25 %	0 %	117621572
68	NC_008564	A	7	7	1790	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
69	NC_008564	A	6	6	1811	1816	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
70	NC_008564	AGA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
71	NC_008564	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
72	NC_008564	AGA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
73	NC_008564	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
74	NC_008564	TGA	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621572
75	NC_008564	A	6	6	1918	1923	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
76	NC_008564	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
77	NC_008564	A	8	8	1962	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
78	NC_008564	AGA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
79	NC_008564	TCA	2	6	2033	2038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621572
80	NC_008564	AAAC	2	8	2084	2091	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
81	NC_008564	ATA	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621572
82	NC_008564	GTA	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621572
83	NC_008564	AAAC	2	8	2159	2166	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
84	NC_008564	GCT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621572
85	NC_008564	GAC	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621572
86	NC_008564	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	117621572
87	NC_008564	TTG	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621572
88	NC_008564	ATT	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621572
89	NC_008564	TTA	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621572
90	NC_008564	AAG	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621572
91	NC_008564	TACAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	0 %	20 %	117621572
92	NC_008564	GTAT	2	8	2501	2508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008564	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008564	A	6	6	2575	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008564	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008564	TAA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008564	ATT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008564	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008564	ATTA	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008564	TAAAT	2	10	2728	2737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008564	TAA	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008564	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008564	TA	3	6	2793	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	117621573
104	NC_008564	GTA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621573
105	NC_008564	GAAA	2	8	2874	2881	75 %	0 %	25 %	0 %	117621573
106	NC_008564	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	117621573
107	NC_008564	T	6	6	2910	2915	0 %	100 %	0 %	0 %	117621573
108	NC_008564	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621573
109	NC_008564	TTA	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008564	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008564	T	7	7	3131	3137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008564	TAT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008564	TTA	3	9	3198	3206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008564	ATA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008564	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
116	NC_008564	CA	3	6	3278	3283	50 %	0 %	0 %	50 %	117621574
117	NC_008564	TAA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621574
118	NC_008564	GAGAAA	2	12	3333	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621574
119	NC_008564	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
120	NC_008564	ATTT	2	8	3373	3380	25 %	75 %	0 %	0 %	117621574
121	NC_008564	AAG	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621574
122	NC_008564	TGG	3	9	3422	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621574
123	NC_008564	ATTTA	2	10	3443	3452	40 %	60 %	0 %	0 %	117621574
124	NC_008564	ATT	2	6	3480	3485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
125	NC_008564	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
126	NC_008564	A	7	7	3615	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
127	NC_008564	A	7	7	3693	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	117621574
128	NC_008564	TTA	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621574
129	NC_008564	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008564	AATT	2	8	3746	3753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008564	AAG	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008564	TAA	3	9	3788	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008564	TAAT	2	8	3804	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008564	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008564	CAT	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008564	TAAT	2	8	3840	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008564	ATTAT	2	10	3849	3858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008564	TAAT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008564	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008564	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008564	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008564	TAA	2	6	3916	3921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008564	ACT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008564	A	7	7	3952	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	117621575
145	NC_008564	ATT	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621575
146	NC_008564	ACAA	2	8	4000	4007	75 %	0 %	0 %	25 %	117621575
147	NC_008564	AAT	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621575
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